N-芴甲氧羰基-O-BETA-(2-乙酰氨基-2-脱氧-3,4,6-三-O-乙酰基-ALPHA-D-吡喃半乳糖基)-L-丝氨酸 | 120173-57-1

• 物质功能分类: 生物化工 - 氨基酸及其衍生物 - 丝氨酸类衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: N-芴甲氧羰基-O-BETA-(2-乙酰氨基-2-脱氧-3,4,6-三-O-乙酰基-ALPHA-D-吡喃半乳糖基)-L-丝氨酸
• 英文名称: N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-acetamido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-L-serine
• 英文别名: O-(2-acetamido-3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-N-(fluorenylmethoxycarbonyl)-L-serine；N-Fmoc-O-[(2-acetamido-3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)]-L-Ser；N-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-O-(2-acetamido-2-deoxy-3,4,6-tri-O-acetyl-α-D-galactopyranosyl)-L-serine；N-(9H-fluoren-9-yl)-methoxycarbonyl-O-(2-acetamido-3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-L-serine；N-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-acetamido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-L-serine；(2S)-2-[[(9H-fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl]amino]-3-((2-acetamido-2-deoxy-3,4,6-tri-Oacetyl-α-D-galactopyranosyl)oxy)propanoic acid；N^α-Fmoc-L-Ser-(3,4,6-tri-O-acetyl-α-D-GalNAc)；Fmoc-(Ac₃GalNAcα1→)Ser；Fmoc-Ser(α-D-GalNAc(OAc)3)-OH；Fmoc-Ser(Ac3-O-α-D-GalNAc)-OH；Nα-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-3-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-acetamido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-L-serine；N-(9-fluorenylmethyloxycarbonyl)-O-(2-acetamido-3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-L-serine；N-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-O-(2-acetyl-2-deoxy-3,4,6-tri-O-α-D-galactopyranosyl)-L-serine；Fmoc-L-Ser(α-D-GalNAc(Ac)₃)-OH；Fmoc-[D-GalNAc(OAc)3(α1-O)]Ser-OH；Fmoc-Ser(Ac₃GalNAcα)-OH；Fmoc-Ser(O-α-D-GalNAc(OAc)3)-OH；Fmoc-L-Tn_ser-OH；Fmoc-L-Ser(alpha-D-GalNAc(Ac)3)-OH；(2S)-3-[(2S,3R,4R,5R,6R)-3-acetamido-4,5-diacetyloxy-6-(acetyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)propanoic acid
• CAS: 120173-57-1
• 化学式: C₃₂H₃₆N₂O₁₃
• 分子量: 656.643
• InChiKey: ORICVOOXZDVFIP-VOZJJELXSA-N

物化性质

• 沸点：
  856.8±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.39±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  DMF：16mg/mL；二甲基亚砜：14mg/mL；乙醇：14mg/mL； PBS（pH 7.2）：0.3 mg/mL

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.6
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  202
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  13

安全信息

• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  2932 99 00
• 危险性防范说明：
  P264,P270,P301+P312,P330,P501,P201,P202,P308+P313
• 危险性描述：
  H302,H351
• 储存条件：
  -15°C

制备方法与用途

生物活性方面，Fmoc-Ser(O-α-D-GalNAc(OAc)₃)-OH 是一种抗肿瘤药物。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-芴甲氧羰基-O-BETA-(2-乙酰氨基-2-脱氧-3,4,6-三-O-乙酰基-ALPHA-D-吡喃半乳糖基)-L-丝氨酸 在 吗啉 、 2-乙氧基-1-乙氧碳酰基-1,2-二氢喹啉 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 20.75h， 生成 4-undecyloxymethyl-3,6-dioxaheptadecyl O-(2-acetamido-3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-L-serinamide
  参考文献：
  名称：

  Syntheses of α-d-galactosamine neoglycolipids

  摘要：

  Several N-acetyl-alpha-D-galactosamine neoglycolipids, as well as hydrophobized T and T-N antigen analogues, were prepared for embedment onto liposomes. Three different lipidic structures were used for the anchoring, that is cholesterol, 1,3-bis(undecyloxy)propan-2-ol and 1, 3-bis(3,7,11,15-tetramethyl hexadecyloxy) propan-2-ol. Oligoethyleneglycol spacers were used to link the carbohydrate and the hydrophobic moieties; their lengths were varied in order to obtain model compounds for the selective recognition by sialyl transferases involved in cancer processes. Glycosylation reactions were optimized to sluggish amphiphilic acceptor alcohols, in order to reach good 1,2-cis-stereoselectivities and acceptable yields. This aim was achieved by using 3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2deoxy-D-galactopyranosyl trichloroacetimidate as the donor, trimethylsilyl trifluoromethanesulfonate as the promoter and diethyl ether or mixtures of diethyl ether and dichloromethane as solvents. (c) 2006 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.carres.2006.02.013
• 作为产物：
  描述：

  3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranosyl bromide 在 silver perchlorate 、 silver carbonate 、 三氟乙酸 、 锌 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 溶剂黄146 、 苯甲醚 、 甲苯 为溶剂， 生成 N-芴甲氧羰基-O-BETA-(2-乙酰氨基-2-脱氧-3,4,6-三-O-乙酰基-ALPHA-D-吡喃半乳糖基)-L-丝氨酸
  参考文献：
  名称：

  上皮钙粘蛋白同源识别域的肽和糖肽部分结构的合成

  摘要：

  采用Fmoc策略，基于酸敏感Wang锚固相技术合成上皮钙粘蛋白(E-cadherin)的同源识别位点的肽和糖肽序列。制备了具有 TN-、T-、(2-6)-唾液酸 T-抗原和 β-N-乙酰氨基葡萄糖侧链的 Fmoc 丝氨酸结构单元，用于构建 E-钙粘蛋白糖肽。T-和(2-6)-唾液酸T-丝氨酸衍生物已通过带有Fmoc/叔丁酯保护基组合的TN-抗原丝氨酸衍生物的化学糖基化获得。根据 NOESY 和 ROESY NMR 实验，在 N 端未酰化的 E-钙粘蛋白（糖）肽在水中更喜欢转弯型构象。

  DOI：

  10.1055/s-2003-42429

文献信息

• Water Sculpts the Distinctive Shapes and Dynamics of the Tumor-Associated Carbohydrate Tn Antigens: Implications for Their Molecular Recognition
  作者：Iris A. Bermejo、Imanol Usabiaga、Ismael Compañón、Jorge Castro-López、Aran Insausti、José A. Fernández、Alberto Avenoza、Jesús H. Busto、Jesús Jiménez-Barbero、Juan L. Asensio、Jesús M. Peregrina、Gonzalo Jiménez-Osés、Ramón Hurtado-Guerrero、Emilio J. Cocinero、Francisco Corzana

  DOI：10.1021/jacs.8b04801

  日期：2018.8.8

  arrangement of αGalNAc- O-Thr features a water molecule bound into a "pocket" between the sugar and the threonine. This mechanism is supported by trapping, for the first time, such localized water in the crystal structures of an antibody bound to two glycopeptides that comprise fluorinated Tn antigens in their structure. According to several reported X-ray structures, installing oxygenated amino acids

  肿瘤相关碳水化合物 Tn 抗原包括两种变体，αGalNAc-O-Thr 和 αGalNAc-O-Ser。在溶液中，它们表现出不同的形状和动力学，并以不同的方式与相同的蛋白质受体结合。在这里，我们通过实验和理论上证明了它们在气相中的构象偏好高度相似，揭示了水的重要作用。我们建议水分子促进苏氨酸衍生物中糖苷键周围的旋转，屏蔽其疏水性甲基并允许抗原极性区域的最佳溶剂化。αGalNAc-O-Thr 的不寻常排列特点是水分子结合在糖和苏氨酸之间的“口袋”中。这种机制是第一次被诱捕支持，抗体晶体结构中的这种局部水与两种糖肽结合，这些糖肽在其结构中包含氟化 Tn 抗原。根据一些报道的 X 射线结构，在受体的特定区域安装含氧氨基酸，能够将桥接水分子置换到本体溶剂中，可以促进 Tn 抗原与苏氨酸的分子识别。总的来说，我们的数据还解释了水如何微调相似分子的 3D 结构特征，这反过来又是它们不同生物活性的背后。
• Multiple column solid phase glycopeptide synthesis
  作者：Stefan Peters、Tim Bielfeldt、Morten Meldal、Klaus Bock、Hans Paulsena

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)93429-4

  日期：1991.9

  The simultaneous synthesis of 40 different α-linked O-glycopeptides from human intestinal mucin and porcine submaxillary gland mucin in a manual multiple column peptide synthesizer using the new glycosylamino acid building blocks Nα-Fmoc-Ser(Ac3-α-D-GalpNAc)-OPfp (3) and Nα-Fmoc-Thr(Ac3-α-D-GalpNAc)-OPfp (4) is described.

  的40个不同的α联从人O型糖肽同时合成肠粘蛋白和猪颌下腺粘蛋白在使用新glycosylamino酸构建块N，手动多列肽合成α -Fmoc-SER（AC 3 -α-d-GalpNAc ）-OPfp（3）和N α -Fmoc-THR（AC 3 -α-d-GalpNAc）-OPfp（4）进行说明。
• Cowpea Mosaic Virus Capsid: A Promising Carrier for the Development of Carbohydrate Based Antitumor Vaccines
  作者：Adeline Miermont、Hannah Barnhill、Erica Strable、Xiaowei Lu、Katherine A. Wall、Qian Wang、M. G. Finn、Xuefei Huang

  DOI：10.1002/chem.200800203

  日期：2008.5.29

  Immunotherapy targeting tumor cell surface carbohydrates is a promising approach for cancer treatment. However, the low immunogenecity of carbohydrates presents a formidable challenge. We describe here the enhancement of carbohydrate immunogenicity by an ordered display on the surface of the cowpea mosaic virus (CPMV) capsid. The Tn glycan, which is overexpressed on numerous cancer cell surfaces, was

  针对肿瘤细胞表面碳水化合物的免疫疗法是一种有前途的癌症治疗方法。然而，碳水化合物的低免疫原性提出了巨大的挑战。我们在这里描述了通过豇豆花叶病毒（CPMV）衣壳表面的有序展示来增强碳水化合物的免疫原性。 Tn 聚糖在许多癌细胞表面过度表达，被选为我们研究的模型抗原。此前已有研究表明，针对不同载体上以多种方式呈现的单体形式的 Tn，很难诱导出强烈的 T 细胞依赖性免疫反应。在这项研究中，我们首先合成了由马来酰亚胺或溴乙酰胺部分衍生的 Tn 抗原，该部分选择性地与 CPMV 的半胱氨酸突变体缀合。然后将糖缀合物注射到小鼠体内，并通过酶联免疫吸附测定法测量免疫前和免疫后小鼠血清中的抗体水平。在免疫后第 35 天的血清中获得了高总抗体滴度，更重要的是，高 Tn 特异性 IgG 滴度，表明糖缀合物诱导了 T 细胞依赖性抗体同种型转换。生成的抗体能够识别 MCF-7 乳腺癌细胞和多药耐药乳腺癌细胞系 NCI-ADR
• In vitro synthesis of mucin-type O-glycans using saccharide primers comprising GalNAc-Ser and GalNAc-Thr residues
  作者：Ryuma Sakura、Kaori Nagai、Yuka Yagi、Yoshihisa Takahashi、Yoshimi Ide、Yuki Yagi、Daiki Yamamoto、Mamoru Mizuno、Toshinori Sato

  DOI：10.1016/j.carres.2021.108495

  日期：2022.1

  synthesized as saccharide primers to prime mucin-type O-glycan biosynthesis in cells. Upon incubating human gastric cancer MKN45 cells with the saccharide primers, 22 glycosylated products were obtained, and their structures were analyzed using liquid chromatography-mass spectrometry and enzyme digestion. The amounts of glycosylated products were dependent on the amino acid residues in the saccharide primers

  已知蛋白质中丝氨酸或苏氨酸残基的粘蛋白型O-糖基化是主要的翻译后修饰之一。在这项研究中，两种新型烷基糖苷，N α -lauryl - O -(2-acetamido-2-deoxy-α- d -galactopyranosyl ) -l -serineamide (GalNAc-Ser-C12) 和N α -lauryl - O- (2-acetamido-2-deoxy-α- d -galactopyranosyl ) -l -threonineamide (GalNAc-Thr-C12) 作为糖类引物合成O型粘蛋白-细胞中的聚糖生物合成。用糖类引物孵育人胃癌 MKN45 细胞后，获得了 22 种糖基化产物，并使用液相色谱-质谱法和酶消化法分析了它们的结构。糖基化产物的量取决于糖类引物中的氨基酸残基。例如，体外T 抗原 (Galβ1-3GalNAc)、岩藻糖基-T (Fucα1-2Galβ1-3GalNAc)
• Chemoselective Removal of Protecting Groups from <i>O</i>-Glycosyl Amino Acid and Peptide (Methoxyethoxy)ethyl Esters Using Lipases and Papain
  作者：Jörg Eberling、Peter Braun、Danuta Kowalczyk、Michael Schultz、Horst Kunz

  DOI：10.1021/jo951899j

  日期：1996.1.1

  selective C-terminal deprotection of O-glycopeptide (methoxyethoxy)ethyl esters is achieved under mild conditions (pH 6.6, 37 degrees C) by enzymatic hydrolysis using papain or lipase M from Mucor javanicus to give building blocks useful for chain-extending glycopeptide synthesis. On the other hand, the selective removal of acetyl protecting groups from the saccharide portion of glycopeptides is accomplished

  O-糖肽（甲氧基乙氧基）乙酯的选择性C末端脱保护是在温和条件下（pH 6.6，37摄氏度），通过木瓜蛋白酶或木脂酶M的脂肪酶M酶促水解实现的，从而提供了可用于扩链糖肽合成的结构单元。另一方面，从糖肽的糖部分选择性除去乙酰基保护基团是通过用脂肪酶WG从小麦胚芽中进行选择性酶水解，为酶促糖基转移反应提供模型底物来实现的，以延长这些缀合物的碳水化合物侧链。 。