荧光探针技术中的荧光探剂
溴化乙啶(EB)是一种常用的紫外线下观察DNA的荧光染料,属于插入染料。由于其多环结构,能与核苷酸碱基间结合。核酸和碱基本身发光效率低,因此用天然荧光检测它们比蛋白质困难得多。因此,荧光探针技术在核酸研究中尤为重要。常用的EB(又称菲啶溴红)可特异性地与DNA、RNA及双链多聚核苷酸结合,能以最低10ng/mL的浓度检测脱氧核糖核酸,并且专一性地与核酸的双链区结合。它能够区分各种构型的核酸,如天然核酸和变性核酸、线性DNA、环状DNA以及超级线团DNA等。此外,多种吖啶染料,包括吖啶橙、吖啶黄及前黄素等也是常用的探剂。
荧光分析法可分为直接测定法和间接测定法两种。直接测定法是利用物质自身发射的荧光进行测量(即“自荧光”或“内源荧光”)。然而,在自然界中,仅有少数物质在被光照后会发出荧光,并且许多物质发光较弱甚至不发光,例如蛋白质和核酸。为了充分利用荧光分析法高灵敏度的特点,需将其转化为荧光物质进行测定。此时可用某些试剂(如荧光染料)使其与荧光较弱或不显荧光的物质共价或非共价结合,以形成发荧光的结合物再进行测量,这就是所谓的“荧光探针”技术或“荧光标记”技术。
生物活性 Ethidium Bromide(EtBr)是一种嵌入剂,在分子生物学实验中经常用于琼脂糖凝胶电泳中的核酸染色。
体外研究
注意事项:乙基溴化乙啶是一种已知的诱变剂,请注意加强防护。
用途 EB不能穿过活细胞膜,但可透过破损的细胞膜对细胞核DNA进行染色。在电泳凝胶中加入游离EB可用于检测少量DNA,是高灵敏度荧光试剂和重要染料,常用于检测DNARNA。与DNA结合时,抑制了DNA复制转录。
用途 Ethidium bromide (EtBr) 是核酸PAGE或琼脂糖凝胶电泳中最常用的染色剂。当它与双链RNA结合时,荧光会增强21倍;而与双链DNA结合时则会增加25倍,因此,在低浓度染料的情况下不需要脱色背景。
用途 溴化乙锭是一种高度灵敏的荧光染色剂,用于观察琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶中的DNA。它通过标准302nm紫外光激发并放射出橙红色信号,可用Polaroid底片或带CCD成像头的凝胶成像处理系统拍摄。对于在电泳后进行凝胶染色的情况,应先将储存液样品稀释到0.5μg/mL,再将凝胶孵育15-30分钟。通常不需要脱色,但如果需要降低背景色,则可在水中脱色15分钟后再用紫外灯箱(254nm波长)检测DNA条带。也可直接在电泳缓冲液中加入溴化乙啶,并在电泳后立即显影。