carbocyclic 2-amino-6-chloro-2'-deoxyadenosine | 120595-72-4

• 物质功能分类: 生物化工 - 氨基酸及其衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: carbocyclic 2-amino-6-chloro-2'-deoxyadenosine
• 英文别名: 2-amino-6-chloropurine-2'-deoxyriboside；2-Amino-6-chloro-9-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)purine；2-amino-6-chloro-9-(2’-deoxy-β-D-ribofuranosyl)purine；2-amino-6-chloro-9-[β-D-2′-deoxyribofuranosyl]purine；2-amino-6-chloro-2'-deoxyguanosine；2-Amino-6-chloro-9-(beta-D-2-deoxyribofuranosyl)purine；(2R,3S,5R)-5-(2-amino-6-chloropurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
• CAS: 120595-72-4
• 化学式: C₁₀H₁₂ClN₅O₃
• 分子量: 285.69
• InChiKey: LEDIVMUMDVEFRG-KVQBGUIXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.8
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

制备方法与用途

2-氨基-6-氯嘌呤-9-β-D-(2'-脱氧)核苷是一种嘌呤核苷类似物，具有广泛的抗肿瘤活性，尤其针对惰性淋巴系统恶性肿瘤。其抗癌机制主要依赖于抑制DNA合成和诱导细胞凋亡等作用。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  carbocyclic 2-amino-6-chloro-2'-deoxyadenosine 在 sodium hydroxide 、 Tris-HCl buffer 、 E_. coli adenosine deaminase 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 13.0h， 生成 2'-脱氧鸟苷
  参考文献：
  名称：

  用核苷脱氧核糖基转移酶-II酶促合成2'-脱氧鸟苷。

  摘要：

  瑞士乳杆菌的核苷脱氧核糖基转移酶-II（NdRT-II），其催化糖基残基从供体脱氧核糖核苷转移至受体碱基，对受体碱基具有广泛的特异性。发现六取代的嘌呤是NdRT-II的受体碱基。利用该酶的这一特性，我们建立了一种酶促合成2'-脱氧鸟苷（dGuo）的实用程序，该程序包括从胸苷到6-取代的嘌呤（2-氨基-6-氯嘌呤; ACP）而不是天然鸟嘌呤的转糖基化作用细菌腺苷脱氨酶将2-氨基-6-氯嘌呤-2'-脱氧核糖苷（ACPdR）转化为dGuo。通过连续的反应，高产率地合成了dGuo。

  DOI：

  10.1271/bbb.67.989
• 作为产物：
  描述：

  2-amino-6-chloro-9-(3’,5’-di-O-acetyl-2’-deoxy-β-dribofuranosyl)purine 在 ammonium hydroxide 作用下， 反应 15.0h， 以69%的产率得到carbocyclic 2-amino-6-chloro-2'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  用于标记ADP-核糖基转移酶靶蛋白的链终止和可点击NAD +类似物

  摘要：

  ADP-核糖基转移酶（ART）使用NAD +作为底物，并通过将多个ADP-核糖单元转移到靶蛋白上形成聚（ADP-核糖），在DNA损伤反应和细胞周期调控等众多生物学过程中发挥重要作用。 （PAR）大小可变的链。努力确定PARylation的直接靶标以及特定的ADP核糖受体位点，都必须解决PAR的复杂性。在本文中，我们报道了新的NAD +类似物，它们可以被野生型ART有效处理，并且由于缺少所需的羟基而导致链终止，从而显着降低了蛋白质修饰的复杂性。由于存在炔基，这些NAD +类似物允许通过点击化学进行后续操作，以使用染料或亲和标记物进行标记。这项研究提供了对ARTs底物范围的深入了解，并可能为进一步研究PAR代谢的化学工具铺平道路。

  DOI：

  10.1002/anie.201404431

文献信息

• Photo-cleavable nucleotides for primer free enzyme mediated DNA synthesis
  作者：Anu Stella Mathews、Haikang Yang、Carlo Montemagno

  DOI：10.1039/c6ob01371f

  日期：——

  The synthesis, characterization and potential application of eight 3′-O modified 2′-deoxyribonucleoside triphosphates (dNTPs) are discussed. These nucleotide analogues are modified by capping the 3′-OH with a photolabile protecting group which can temporarily cease DNA strand growth and can smoothly reinitiate the growth by the photodecomposition of the protecting group and setting the 3′-OH of dNTPs

  讨论了八种3' - O修饰的2'-脱氧核糖核苷三磷酸酯（dNTPs）的合成，表征和潜在应用。这些核苷酸类似物是通过用光不稳定的保护基团封端3'-OH来修饰的，该基团可以暂时停止DNA链的生长，并可以通过光分解保护基团使dNTP的3'-OH顺畅地重新开始生长，并使其自由繁殖。3' - O-（2-硝基苄基）-2'-脱氧核糖核苷三磷酸酯（NBNB -dNTPs）和3' - O-（4,5-二甲氧基-2-硝基苄基）-2'-脱氧核糖核苷三磷酸酯（DMNB- dNTPs进行了详细讨论，并使用NMR进行了结构确认。使用LCMS和1对紫外线裂解研究进行监测和定量1 H NMR谱图。使用不依赖引物的末端脱氧核苷酸转移酶（TdT）酶，将合成的核苷酸用于终止和重新启动无模板DNA合成。在一步到位的过程中使用这种对光不稳定的核苷酸即可启动DNA合成，这是一种新颖的策略，可精确组装dNTP，并具有增强现有技术的潜力。
• Process for producing 2'-deoxyguanosine
  申请人：Noguchi Toshitada

  公开号：US20050170470A1

  公开（公告）日：2005-08-04

  The invention provides a process for producing 2′-deoxyguanosine, characterized in that the process includes reacting one compound selected from the group consisting of guanosine, guanosine 5′-monophosphate, and 2-amino-6-substituted purine with 2′-deoxynucleoside in the presence of nucleoside deoxyribosyl transferase and a hydrolase. According to the process of the present invention, 2′-deoxyguanosine can be synthesized efficiently from inexpensive and easily available starting materials. Since no guanosine, which disturbs purification, is virtually present in a reaction mixture, isolation and purification of 2′-deoxyguanosine can be performed in a very simple manner. Thus, the process for producing 2′-deoxyguanosine is practical.

  该发明提供了一种生产2'-去氧鸟苷的方法，其特征在于该方法包括在核苷酸去氧核糖转移酶和水解酶的存在下，将从鸟苷、鸟苷5'-磷酸盐和2-氨基-6-取代嘌呤中选择的一种化合物与2'-去氧核苷酸反应。根据本发明的方法，可以有效地从廉价且易获得的起始材料合成2'-去氧鸟苷。由于反应混合物中几乎没有干扰纯化的鸟苷存在，因此可以非常简单地进行2'-去氧鸟苷的分离和纯化。因此，生产2'-去氧鸟苷的方法是实用的。
• A convenient synthesis of 2′-deoxy-6-thioguanosine,<i>ara</i>-guanine,<i>ara</i>-6-thioguanine and certain related purine nucleosides by the stereospecific sodium salt glycosylation procedure
  作者：Naeem B. Hanna、Kandasamy Ramasamy、Roland K. Robins、Ganapathi R. Revankar

  DOI：10.1002/jhet.5570250653

  日期：1988.11

  A simple and high-yield synthesis of biologically significant 2′-deoxy-6-thioguanosine (11), ara-6-thioguanine (16) and araG (17) has been accomplished employing the Stereospecific sodium salt glycosylation method. Glycosylation of the sodium salt of 6-chloro- and 2-amino-6-chloropurine (1 and 2, respectively) with 1-chloro-2-deoxy-3,5-di-O-(p-toluoyl)-α-D-erythro-pentofuranose (3) gave the corresponding

  使用立体特异性钠盐糖基化方法已经完成了生物学上重要的2'-脱氧-6-硫鸟嘌呤（11），ara -6-硫鸟嘌呤（16）和ara G（17）的简单且高收率的合成。6-氯-和2-氨基-6-氯嘌呤（分别为1和2）的钠盐与1-氯-2-脱氧-3,5-二-O-（对甲苯甲酰基）-α-的糖基化D-赤型-五呋喃糖（3）给出了相应的N-9取代核苷，它们是具有β-端基异构体构型的主要产物（4和5，以及少量的N-7位置异构体（6和7）。在含有甲醇钠的甲醇中用硫化氢处理4，以93％的收率得到2'-deoxy-6-thioinosine（10）。类似地，将5以71％的产率转化为2'-脱氧-6-硫鸟苷（β-TGdR，11）。2的钠盐与1-氯-2,3,5-三-O-苄基-α-D-阿拉伯呋喃糖（8）的反应分别得到N-7和N-9糖基化产物13和9。9的脱苄基作用用三氯化硼在-78°下用62％的收率得到通用的中间体2-氨基-6-氯
• Structure−Activity Relationships of Bisphosphate Nucleotide Derivatives as P2Y₁ Receptor Antagonists and Partial Agonists
  作者：Erathodiyil Nandanan、Emidio Camaioni、Soo-Yeon Jang、Yong-Chul Kim、Gloria Cristalli、Piet Herdewijn、John A. Secrist、Kamal N. Tiwari、Arvind Mohanram、T. Kendall Harden、José L. Boyer、Kenneth A. Jacobson

  DOI：10.1021/jm980657j

  日期：1999.5.1

  anhydrohexitol ring modifications have been prepared and resulted in enhanced agonist properties. The 1,5-anhydrohexitol analogue 36 was a pure agonist with an EC50 of 3 microM, i.e., similar in potency to ATP. 5'-Phosphate groups have been modified in the form of triphosphate, methyl phosphate, and cyclic 3',5'-diphosphate derivatives. The carbocyclic analogue had enhanced agonist efficacy, and the 5'-O-phosphonylmethyl

  P2Y1 受体存在于心脏、骨骼和各种平滑肌以及血小板中，其激活与聚集有关。腺苷 3',5'- 和 2',5'-二磷酸已被鉴定为 P2Y1 受体的选择性拮抗剂 (Boyer et al. Mol. Pharmacol. 1996, 50, 1323-1329)，并已进行结构修饰以增加受体亲和力（Camaioni 等 J. Med. Chem. 1998, 41, 183-190）。我们将结构-活性关系扩展到一系列新的脱氧腺苷二磷酸，并在腺嘌呤碱基、核糖部分和磷酸基团中进行了取代。通过测量其刺激火鸡红细胞膜中磷脂酶 C（激动剂作用）和抑制 10 nM 2-（甲硫基）腺苷 5'-二磷酸引起的磷脂酶 C 刺激（拮抗剂作用）的能力，确定每种类似物对 P2Y1 受体的活性。 。在腺嘌呤环的 2 位上含有卤素、氨基和硫醚基团的 2'-脱氧腺苷二磷酸类似物是比在 8 位上含有各种杂原子取代的类似物更有效的
• 6-Substituted 2-Aminopurine-2′-deoxyribonucleoside 5′-Triphosphates that Trace Cytosine Methylation
  作者：Janina von Watzdorf、Andreas Marx

  DOI：10.1002/cbic.201600245

  日期：2016.8.17

  2'-deoxyguanosine triphosphate (dGTP) analogues, DNA polymerases are able to sense the presence of a single 5mC unit in a template. Here we present the synthesis and evaluation of an extended toolbox of 6-substituted 2-aminopurine-2'-deoxyribonucleoside 5'-triphosphates modified at position 6 with various functionalities. We found that sensing of 5-methylation by this class of nucleotides is more general, not

  基因表达受到基因组 DNA 中表观遗传标记 2'-脱氧 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 的出现和分布的广泛调节。由于其对肿瘤发生的影响，因此与人类健康有着重要的联系。此外，5mC 的检测可作为诊断和疾病治疗的杰出生物标志物。我们以前的研究已经表明，通过处理 O(6) -烷基化 2'-脱氧鸟苷三磷酸 (dGTP) 类似物，DNA 聚合酶能够感知模板中单个 5mC 单元的存在。在这里，我们介绍了 6-取代的 2-氨基嘌呤-2'-脱氧核糖核苷 5'-三磷酸盐的扩展工具箱的合成和评估，该工具箱在 6 位进行了修饰，具有各种功能。我们发现这类核苷酸对 5-甲基化的感知更为普遍，