2-(3,4-diaminophenyl)-6-(1-methyl-4-piperazinyl)benzimidazole | 23491-49-8

• 物质功能分类: 有机原料 - 烃类化合物及其衍生物 - 芳香烃
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: 2-(3,4-diaminophenyl)-6-(1-methyl-4-piperazinyl)benzimidazole
• 英文别名: 4-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]benzene-1,2-diamine
• CAS: 23491-49-8
• 化学式: C₁₈H₂₂N₆
• 分子量: 322.413
• InChiKey: QLNHNHONCDMJOL-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.7
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  87.2
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 海关编码：
  2933990090

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(3,4-diaminophenyl)-6-(1-methyl-4-piperazinyl)benzimidazole 在 甲醇 、 sodium methylate 、 potassium carbonate 作用下， 以 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 188.0h， 生成 4-methylamino-2-(5'-(5''-(4'''-methylpiperazin-1'''-yl)benzimidazol-2''-yl)benzimidazol-2'-yl)pyridine
  参考文献：
  名称：

  [EN] RADIOPROTECTOR COMPOUNDS AND METHODS
  [FR] COMPOSÉS RADIOPROTECTEURS ET PROCÉDÉS CORRESPONDANTS

  摘要：

  该发明涉及新化合物、其制备方法以及它们在保护生物材料免受辐射损伤（辐射防护）方面的用途。该发明的优选化合物为以下式（II）的化合物：其中W代表-N（R1R2），其中R1和R2不同时为氢，它们可以共同形成一个5、6或7元环结构，-NHN（R1R2）、NHR3N（R1R2）、-NHR3OR2、-N（R3）R3OR2、-N（R1）R3OR3OR3、OR3NR1R2、-OR3或W代表哌啶基、哌嗪基、吗啉基、硫代吗啉基或二氮杂环庚烷基，每种基可能被C1至C4烷基、C2至C4烯基、-N（CO）N（R1R2）、-N（CO）OR1、-N（CO）OR3OH、-（CO）NR1R2、-R3（CO）NR1R2、-R3OR1、-OR1、-N（R1R2）或-NH-取代；R1和R2相同或不同，选自氢、C1至C4烷基或C2至C4烯基；Z相同或不同，代表N或CH；Z'相同或不同，代表N或C；X代表CH、N或NH，其中当X为CH或N时为双键，当X为NH时为单键；X'代表N或NH，其中当X为CH或N时X'为NH，且X和X'不同，进一步当X'为N时为双键，当X'为NH时为单键；Q代表H、烷氧基、-NR1R2、F或Cl；当Z'为N时Q1不存在，当Z'为C时，Q1代表H、烷氧基、-NR1R2、F或Cl；A代表一个含有杂环N或O的五至十元单环或多环结构，位于邻位，该环包括可选的双键、取代基和/或其他杂原子及其药用可接受的衍生物。

  公开号：

  WO2011123890A1
• 作为产物：
  描述：

  4-乙酰氨苯甲腈 在 palladium on activated charcoal 盐酸 、 硫酸 、 氢气 、 potassium nitrate 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 溶剂黄146 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 10.75h， 生成 2-(3,4-diaminophenyl)-6-(1-methyl-4-piperazinyl)benzimidazole
  参考文献：
  名称：

  Kelly, David P.; Bateman, Stuart A.; Martin, Roger F., Australian Journal of Chemistry, 1994, vol. 47, # 2, p. 247 - 262

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Solid-Phase Synthesis of Positively Charged Deoxynucleic Guanidine (DNG) Tethering a Hoechst 33258 Analogue:  Triplex and Duplex Stabilization by Simultaneous Minor Groove Binding
  作者：Putta Mallikarjuna Reddy、Thomas C. Bruice

  DOI：10.1021/ja031557s

  日期：2004.3.1

  charged guanidine replaces the phosphodiester linkages, tethering to Hoechst 33258 fluorophore by varying lengths has been synthesized. A pentameric thymidine DNG was synthesized on solid phase in the 3' --> 5' direction that allowed stepwise incorporation of straight chain amino acid linkers and a bis-benzimidazole (Hoechst 33258) ligand at the 5'-terminus using PyBOP/HOBt chemistry. The stability

  脱氧核胍 (DNG) 是一种 DNA 类似物，其中带正电荷的胍取代了磷酸二酯键，通过不同长度与 Hoechst 33258 荧光团相连。在固相上以 3' --> 5' 方向合成了五聚体胸苷 DNG，允许使用 PyBOP/HOBt 化学在 5'-末端逐步掺入直链氨基酸接头和双苯并咪唑 (Hoechst 33258) 配体. (DNA)(2).DNG-H 三链体和 DNA.DNG-H 双链体的稳定性由 DNG 和 DNG-Hoechst 33258 (DNG-H) 偶联物​​与 30 聚体双链 (ds) DNA、d(CGCCGCGCGCGCGAAAAACCCGGCGCGCGC) 形成)/d(GCGGCGCGCGCGCTTTTTGGGCCGCGCGCG) 和单链 (ss) DNA，5'-CGCCGCGCGCGCGAAAAACCCGGCGCGCGC-3'，分别通过热熔解和荧光发射实验进行了评估。在
• Triple helix stabilization by covalently linked DNA–bisbenzimidazole conjugate synthesized by maleimide–thiol coupling chemistry
  作者：A JAIN、S AWASTHI、V TANDON

  DOI：10.1016/j.bmc.2006.05.034

  日期：2006.9.15

  Tethering of BBZPNH2, an analogue of the Hoechst 33258, with a 14 nucleotide long DNA sequence with the help of succinimidyl-4-(N-maleimidomethyl)cyclohexane-1-carboxylate (SMCC), a heterobifunctional crosslinking reagent, using DMF/ water as solvent yields a conjugate which effectively stabilizes the triple helix. The above conjugate was hybridized with 26 bp long double stranded (ds) DNA having 14

  利用DMF /水作为异双功能交联剂，通过异双功能交联剂琥珀酰亚胺基4-（N-马来酰亚胺基甲基）环己烷-1-甲酸琥珀酰亚胺酯将Hoechst 33258的类似物BBZPNH2与14个核苷酸长的DNA序列进行束缚。溶剂产生有效稳定三螺旋的缀合物。将上述缀合物与具有14bp长的聚嘌呤-聚嘧啶序列的26bp长的双链（ds）DNA杂交，以形成嘧啶基序三螺旋。上述共轭物增加了两个转变的热稳定性，即，由共轭TFO形成的三重螺旋比由非三元螺旋制成的三重螺旋形成的三重螺旋至双螺旋增加了12℃，并且三重螺旋向单链的转变增加了16℃。结合的TFO。
• MINOR GROOVE BINDER PHOSPHORAMIDITES AND METHODS OF USE
  申请人：Vorobiev Alexei

  公开号：US20130030166A1

  公开（公告）日：2013-01-31

  Minor groove binder phosphoramidites having unique structures have been synthesized according to particular methods. These minor groove binder phosphoramidites are useful in the preparation of oligonucleotide conjugates, particularly those for use as probes and primers.

  根据特定方法合成了具有独特结构的小沟结合剂磷酰胺酰胺。这些小沟结合剂磷酰胺酰胺在制备寡核苷酸共轭物中很有用，特别是用作探针和引物的情况。
• [EN] A PROCESS FOR THE SYNTHESIS OF BISBENZIMIDAZOLES AND ITS DERIVATIONS<br/>[FR] PROCESSUS DE SYNTHÈSE DE BISBENZIMIDAZOLES ET DE SES DÉRIVÉS
  申请人：UNIV DELHI

  公开号：WO2004063170A1

  公开（公告）日：2004-07-29

  A process for the synthesis of bisbenzimidazoles and its derivations comprising; (i) reacting 5 chloroaniline with zinc dust and acetic anhydride to produce 5 chloroacetanilide; (ii) reacting 5 chloroacetanilide with HN03 to produce 2-nitro-5-chloroacetanilide; (ix) adding sodium methoxide to 2-nitro-5-ch1oroaniline; (x) heating 2-nitro-5-chloroaniline, methyl piperazine, anhydrous K2CO3 and Dimethyl formamide at 100-120°C produce a mixture which is cooled by pouring ice and is filtered to obtain 5-(4'-methylpiperazin-1'-yl)-2-nitroaniline; (xi) treating 5-(4'-methylpiperazin-l'yl)-2-nitroaniline with Pd/C to produce 2-amino-4-(4'-methylpiperazin-1'-yl) aniline; (xii) refluxing a mixture of 2-amino-4-(4'-methylpiperazin-1'yl) aniline and ethyl-4-amino-3-nitrobenzenecarboximidate hydrochloride in presence of ethanol/glacial acetic acid to produce 4-[5'-(4'-methylpiperazin-1'-yl) 15 benzimidazol-2'-yl)-2-nitroaniline; (xiii) treating a solution of 4-[5'-(4'-methylpiperazin-1'-yi) benzimidazol-2'-yl)-2-nitroaniline with palladium on carbon to yield 2-amino-4-[5'-(4'-Methylpiperazin-1'-yl)benzimidazol-2'-yl]aniline; (xiv) heating 2-amino-4-[5'-(4'-Methylpiperazin-1'-yl)benzimidazol-2'-yl]aniline and 3-4-dimethoxy benzaldehyde using nitrobenzene as a solvent at 110-150°C to produce (DMA) i.e 5-(4-methylpiperazin-1-yl)-2-[2'-(3,4-dimethoxyphenyl)-5'-benzimidazolyl] benzimidazole; (ix) heating 2-amino-4-[5'-(4'-Methylpiperazin-1'-yl) benzimidazol-2'-YI] aniline and 5-Formyl-[3-methoxy-4-hydroxy benzimidazole] using nitrobenzene at 110°C to 150°C in presence of argon to produce (TBZ) i.e 5-(4-methylpiperazine-1-yl)-2-[2' (2'-(4-hydroxy-3methoxyphenyl)5'benzimidazolyl) -5'- benzimidazolyl] benzimidazole.

  一种合成双苯并咪唑及其衍生物的方法，包括：(i)将5-氯苯胺与锌粉和乙酸酐反应，生成5-氯乙酰苯胺；(ii)将5-氯乙酰苯胺与硝酸反应，生成2-硝基-5-氯乙酰苯胺；(ix)将甲醇钠加入2-硝基-5-氯苯胺；(x)将2-硝基-5-氯苯胺、甲基哌嗪、无水K2CO3和二甲基甲酰胺加热至100-120°C，冷却后加入冰并过滤，得到5-(4'-甲基哌嗪基)-2-硝基苯胺；(xi)用Pd/C处理5-(4'-甲基哌嗪基)-2-硝基苯胺，得到2-氨基-4-(4'-甲基哌嗪基)苯胺；(xii)在乙醇/冰乙酸存在下，回流2-氨基-4-(4'-甲基哌嗪基)苯胺和乙酰基-4-氨基-3-硝基苯甲酰胺混合物，生成4-[5'-(4'-甲基哌嗪基)-2-硝基苯胺；(xiii)用碳载钯处理4-[5'-(4'-甲基哌嗪基)-2-硝基苯胺的溶液，得到2-氨基-4-[5'-(4'-甲基哌嗪基)苯并咪唑-2-基]苯胺；(xiv)将2-氨基-4-[5'-(4'-甲基哌嗪基)苯并咪唑-2-基]苯胺和3-4-二甲氧基苯甲醛在110-150°C下用硝基苯作溶剂加热，生成(DMA)即5-(4-甲基哌嗪基)-2-[2'-(3,4-二甲氧基苯基)-5'-苯并咪唑基]苯并咪唑；(ix)将2-氨基-4-[5'-(4'-甲基哌嗪基)苯并咪唑-2-基]苯胺和5-甲酰基-[3-甲氧基-4-羟基苯并咪唑]在110°C至150°C下用硝基苯在氩气存在下加热，生成(TBZ)即5-(4-甲基哌嗪基)-2-[2'-(2'-(4-羟基-3-甲氧基苯基)-5'-苯并咪唑基)-5'-苯并咪唑基]苯并咪唑。
• DNA-Directed Alkylating Agents. 6. Synthesis and Antitumor Activity of DNA Minor Groove-Targeted Aniline Mustard Analogs of Pibenzimol (Hoechst 33258)
  作者：G. Lance Gravatt、Bruce C. Baguley、William R. Wilson、William A. Denny

  DOI：10.1021/jm00051a010

  日期：1994.12

  alternative synthesis was developed, involving construction of the bisbenzimidazole from the mustard terminus, via Cu(2+)-promoted oxidative coupling of the mustard aldehydes with 3,4-diaminobenzonitrile to form the monobenzimidazoles, followed by a Pinner-type reaction and condensation with 4-(1-methyl-4-piperazinyl)-o-phenylenediamine. This process gives higher yields and pure products. The mustard analogues

  已合成了一系列的DNA小沟结合荧光团苯甲酰氮的芥末氮类似物（Hoechst 33258），并评估了其抗肿瘤活性。通过两个连续的Pinner型反应，从哌嗪基末端按常规方法构建双苯并咪唑环系统，使被2-甲基类似物污染的产物收率低，这证明很难分离。已开发出另一种合成方法，包括从芥末末端构建双苯并咪唑，通过芥末醛与3,4-二氨基苄腈的Cu（2+）促进的氧化偶联反应形成单苯并咪唑，然后进行Pinner型反应和缩合反应用4-（1-甲基-4-哌嗪基）-邻苯二胺。此过程可提供更高的产量和纯净的产品。芥末类似物表现出高脱敏因子（IC50AA8 / IC50 UV4），这是DNA烷化剂的典型特征。在整个同源序列中，细胞毒性的增加很大（85倍），这不能完全由芥子反应性的变化来解释，并且可能与芥子相对于DNA的方向改变有关，从而导致烷基化的方式不同。使用单剂量方案，苯甲酸对苯二酚本身（已在临床上作为抗癌药进行评估