p-nitrophenyl 2-acetamido-4-O-(2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-2-deoxy-β-D-glucopyranoside | 7284-16-4

• 物质功能分类: 生物化工 - 糖类化合物 - 双糖
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: p-nitrophenyl 2-acetamido-4-O-(2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-2-deoxy-β-D-glucopyranoside
• 英文别名: p-nitrophenyl β-D-N,N-diacetylchitobioside；4-nitrophenyl N,N'-diacetyl-β-D-chitobioside；4-Nitrophenyl N,N-Diacetyl-beta-D-chitobioside；N-[(2S,3R,4R,5S,6R)-2-[(2R,3S,4R,5R,6S)-5-acetamido-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)-6-(4-nitrophenoxy)oxan-3-yl]oxy-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]acetamide
• CAS: 7284-16-4
• 化学式: C₂₂H₃₁N₃O₁₃
• 分子量: 545.5
• InChiKey: HWBFEVWOQMUQIE-MVEDJEFUSA-N

物化性质

• 熔点：
  211-212°C (dec.)
• 溶解度：
  DMF：25 mg/mL，澄清，淡黄色

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.6
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  242
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  13

安全信息

• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  29329990
• 储存条件：
  2-8°C

制备方法与用途

4-硝基苯基-N,N′-二乙酰-β-D-葡聚糖被用来测量DOI（一种来自山药的新蛋白）和灰盖鬼伞ChiEn3外切酶的活性，同时也用于检测N-乙酰基-β-D-氨基葡萄糖苷酶几丁质分解酶的活性。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  p-nitrophenyl 2-acetamido-4-O-(2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-2-deoxy-β-D-glucopyranoside 在 recombinant Aspergillus niger chitin deacetylase AnCDA₉ 、 cobalt(II) chloride 作用下， 以 水 为溶剂， 以98%的产率得到p-nitrophenyl 2-acetamido-4-O-(2-amino-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-2-deoxy-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  N -d-乙酰氨基葡萄糖和d-氨基葡萄糖交替的化学酶法合成壳寡糖

  摘要：

  壳寡糖（CHOS）是N-乙酰氨基葡糖（GlcNAc，A）和d-氨基葡糖（GlcN，D）的均聚物或杂聚物。具有特定长度和糖组成的明确定义的CHOS混合物甚至纯CHOS的生产引起了极大的兴趣，因为这些寡糖具有令人感兴趣的生物活性。虽然直接化学合成CHOS并不简单，但化学酶法已显示出一定的前景。我们已经使用工程化的糖苷水解酶通过转糖基化反应来催化活化的DA结构单元的低聚。构建基块是从随时可用的（GlcNAc）2中生成的-对通过使用黑曲霉（An CDA9）重组表达的脱乙酰基酶对非还原性末端糖进行脱乙酰化而生成-硝基苯酚。该方法使用先前描述的粘质沙雷氏菌（Serratia marcescens）ChiA的超转糖基化变体（Sm ChiA）和粘粒沙雷氏菌（Serratia proteamaculans）（Sp ChiD）的几丁质酶D的新生成的糖基化变体，导致产生的CHOS包含多达十个交替的D和A单位[（

  DOI：

  10.1021/acs.biochem.0c00839
• 作为产物：
  描述：

  4-硝基苯基2-(乙酰氨基)-2-脱氧-4-O-[3,4,6-三-O-乙酰基-2-(乙酰氨基)-2-脱氧-beta-D-吡喃葡萄糖基]-beta-D-吡喃葡萄糖苷3,6-二乙酸酯 生成 p-nitrophenyl 2-acetamido-4-O-(2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-2-deoxy-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  NAGJO, FUMIO;SAKAI, KAZUO;USUI, TAICHI;TAKAI, IZUMI;ISHIDO, YOSHIHARU, J. CARBOHYDR. CHEM., 7,(1988) N 1, 67-82

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Applications of Shoda's reagent (DMC) and analogues for activation of the anomeric centre of unprotected carbohydrates
  作者：Antony J. Fairbanks

  DOI：10.1016/j.carres.2020.108197

  日期：2021.1

  its derivatives are useful for numerous synthetic transformations in which the anomeric centre of unprotected reducing sugars is selectively activated in aqueous solution. As such unprotected sugars can undergo anomeric substitution with a range of added nucleophiles, providing highly efficient routes to a range of glycosides and glycoconjugates without the need for traditional protecting group manipulations

  2-氯-1,3-二甲基咪唑啉氯化物（DMC，本文也称为 Shoda 试剂）及其衍生物可用于许多合成转化，其中未保护的还原糖的异头中心在水溶液中被选择性激活。由于此类未受保护的糖可以用一系列添加的亲核试剂进行异头取代，从而为一系列糖苷和糖缀合物提供高效途径，而无需进行传统的保护基操作。这篇简短的评论总结了 DMC 及其一些衍生物/类似物的发展，并重点介绍了保护无基团合成的最新应用。
• Scope of the DMC mediated glycosylation of unprotected sugars with phenols in aqueous solution
  作者：Xin Qiu、Antony J. Fairbanks

  DOI：10.1039/d0ob01727b

  日期：——

  sugars in aqueous solution using 2-chloro-1,3-dimethylimidazolinium chloride (DMC) and triethylamine in the presence of para-nitrophenol allows direct stereoselective conversion to the corresponding 1,2-trans para-nitrophenyl glycosides without the need for any protecting groups. The reaction is applicable to sulfated and phosphorylated sugars, but not to ketoses or uronic acids or their derivatives

  在对硝基苯酚存在下，使用 2-氯-1,3-二甲基咪唑啉 (DMC) 和三乙胺在水溶液中活化还原糖，可以直接立体选择性转化为相应的 1,2-反式对硝基苯基糖苷，而无需任何保护基团。该反应适用于硫酸化和磷酸化的糖，但不适用于酮糖或糖醛酸或其衍生物。当应用于其他酚类时，发现产物产率取决于 p K a添加的苯酚，并且该方法不太广泛适用于2-乙酰氨基糖。对于 2-乙酰氨基底物，另一种方法是预先形成糖基恶唑啉，将反应混合物冷冻干燥，然后粗产物与添加的苯酚在极性非质子溶剂系统中与微波辐射反应证明是一种有用的简化.
• Characterization of a novel Salmonella Typhimurium chitinase which hydrolyzes chitin, chitooligosaccharides and an N-acetyllactosamine conjugate
  作者：Tanja Larsen、Bent O Petersen、Birgit G Storgaard、Jens Ø Duus、Monica M Palcic、Jørgen J Leisner

  DOI：10.1093/glycob/cwq174

  日期：2011.4

  assigned to glycoside hydrolase family 18 encoded by the SL0018 (chiA) gene in Salmonella enterica Typhimurium SL1344. A C-terminal truncated form of chiA lacking a putative chitin-binding domain was amplified by PCR, cloned and expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) with an N-terminal (His)6 tag. The purified enzyme hydrolyzes 4-nitrophenyl N,N′-diacetyl-β-d-chitobioside, 4-nitrophenyl β-d-N,N′,N″-triacetylchitotriose

  沙门氏菌含有注释为几丁质酶的基因。然而，它们的几丁质分解活性从未得到证实。现在，我们证明了针对分配给鼠伤寒沙门氏菌SL1344中SL0018（chiA）基因编码的糖苷水解酶家族18的几丁质酶的这种活性。通过PCR扩增缺乏假定的几丁质结合域的chiA的C末端截短形式，克隆并在具有N末端（His）6标签的大肠杆菌BL21（DE3）中表达。纯化的酶水解4-硝基苯基N，N'-二乙酰基-β- d-壳聚糖，4-硝基苯基β- d - N，Ñ '，Ñ “-triacetylchitotriose和羧甲基甲壳素雷玛唑亮紫但不作用4-硝基苯基ñ -乙酰基β- d -glucosaminide，肽聚糖或4-硝基苯基β- d -cellobioside。酶活性的特征还在于使用1 H核磁共振直接监测产物的形成，这表明几丁质是释放N，N'-二乙酰基壳二糖的底物。水解在保留构型的情况下发生，并且该酶仅作用于壳寡糖底物的
• Direct Synthesis of <i>para</i>-Nitrophenyl Glycosides from Reducing Sugars in Water
  作者：Xin Qiu、Antony J. Fairbanks

  DOI：10.1021/acs.orglett.0c00728

  日期：2020.3.20

  be directly converted into the corresponding para-nitrophenyl (pNP) glycosides using 2-chloro-1,3-dimethylimidazolinium chloride (DMC), para-nitrophenol, and a suitable base in aqueous solution. The reaction is stereoselective for sugars with either a hydroxyl or an acetamido group at position 2, yielding the 1,2-trans pNP glycosides. A judicious choice of base allows extension to di- and oligosaccharide

  可以使用2-氯-1,3-二甲基咪唑啉鎓氯化物（DMC），对硝基苯酚和合适的碱在水溶液中将还原糖直接转化为相应的对硝基苯基（p NP）糖苷。对于在2位具有羟基或乙酰氨基的糖，该反应是立体选择性的，产生1，2-反式p NP糖苷。碱的明智选择允许扩展至二糖和寡糖底物，包括从天然来源分离的复杂的N-聚糖低聚糖，而无需任何保护基团的操作
• How Site‐Directed Mutagenesis Boosted Selectivity of a Promiscuous Enzyme
  作者：Pavlína Nekvasilová、Natalia Kulik、Nikola Rychlá、Helena Pelantová、Lucie Petrásková、Zuzana Bosáková、Josef Cvačka、Kristýna Slámová、Vladimír Křen、Pavla Bojarová

  DOI：10.1002/adsc.202000604

  日期：2020.10.6

  β‐N‐Acetylhexosaminidases (GH20; EC 3.2.1.52) are exo‐glycosidases with a dual activity for cleaving both N‐acetylglucosamine (GlcNAc) and N‐acetylgalactosamine (GalNAc) units from glycostructures. This substrate promiscuity is a hurdle in the selective synthesis of N‐acetylhexosamine oligosaccharides combining both GlcNAc and GalNAc units since there are hardly any GalNAc transferring enzymes available

  β- N-乙酰己糖胺酶（GH20； EC 3.2.1.52）是具有双重活性的外切-糖苷酶，用于从糖结构上裂解N-乙酰氨基葡糖胺（GlcNAc）和N-乙酰半乳糖胺（GalNAc）单元。由于几乎没有任何可用于合成应用的GalNAc转移酶，这种底物的混杂是选择性结合GlcNAc和GalNAc单元的N-乙酰基己糖胺寡糖选择性合成的障碍。我们在这里提出了来自Talaromyces flavus（Tf的合成有效的混杂β- N-乙酰基己糖胺酶的定点诱变（十六进制），其为野生型，其GalNAcase / GlcNAcase比率为1.2。在分子建模的基础上，我们确定了对其GalNAcase / GlcNAcase选择性负责的关键氨基酸残基。制备了六个定点突变体，它们在毕赤酵母中异源表达，纯化并进行了动力学表征。结果，获得了对GalNAc或GlcNAc底物具有高达7倍的高选择性的新型工程化酶，从而保留了野生型