1-(3-O-benzyl-5-O-methanesulfonyl-4-C-methanesulfonyloxymethyl-β-D-erythro-pentofuranosyl)thymine | 293751-06-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1-(3-O-benzyl-5-O-methanesulfonyl-4-C-methanesulfonyloxymethyl-β-D-erythro-pentofuranosyl)thymine
• 英文别名: 1-(3-O-benzyl-4-C-methanesulfonoxymethyl-5-O-methanesulfonyl-β-D-ribofuranosyl)thymine；1-(3-O-Benzyl-5-O-methanesulfonyl-4-C-methanesulfonyloxymethyl-beta-D-erythro-pentofuranosyl)thymine；[(3S,4R,5R)-4-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2-(methylsulfonyloxymethyl)-3-phenylmethoxyoxolan-2-yl]methyl methanesulfonate
• CAS: 293751-06-1
• 化学式: C₂₀H₂₆N₂O₁₁S₂
• 分子量: 534.565
• InChiKey: KGOUDEBGIAOXFH-SOLBZPMBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.1
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  192
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(3-O-benzyl-5-O-methanesulfonyl-4-C-methanesulfonyloxymethyl-β-D-erythro-pentofuranosyl)thymine 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 sodium hydroxide 、 sodium azide 、 15-冠醚-5 、 硫酸 、 氨 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 三甲基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 、 乙腈 为溶剂， 反应 50.0h， 生成 (1R,3R,4R,7S)-7-benzyloxy-1-hydroxymethyl-3-(thymin-1-yl)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  合成2'-氨基-LNA：一种新策略。

  摘要：

  在本文中，我们提出了经过修订和显着改进的合成途径，以合成2'-氨基LNA（锁定核酸）。最佳途径与通过普通中间体合成LNA单体（“ 2'-氧基-LNA”）收敛，该中间体是通过轻度脱乙酰作用而释放出2'-羟基而得到的化合物23，而没有伴随的闭环提供2'-氧-LNA骨架。在颠倒C2'处的立体化学并在2'-羟基处形成三氟甲磺酸酯后，获得了新的通用中间体16，该中间体可轻松进入一系列其他类似物，例如通过引入导致2'-硫基的硫亲核试剂-LNA结构。用叠氮化物取代三氟甲磺酸酯后，碱性还原得到所需的2'-氨基-LNA结构，即化合物18。

  DOI：

  10.1039/b208864a
• 作为产物：
  描述：

  1,2-O-(1-甲基亚乙基)-4-C-[[(甲基磺酰基)氧基]甲基]-3-O-(苯基甲基)-alpha-D-赤式-呋喃戊糖 5-甲烷磺酸酯 在 吡啶 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 氨 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 62.0h， 生成 1-(3-O-benzyl-5-O-methanesulfonyl-4-C-methanesulfonyloxymethyl-β-D-erythro-pentofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  2'-氨基-LNA胸腺嘧啶和5-甲基胞嘧啶核苷的大规模合成

  摘要：

  从起始糖1分十五步以几克级（50 g，70 mmol）合成了胸腺嘧啶中间体17，总收率为73％，仅需5个纯化步骤。关键的胸腺嘧啶中间体18从一步17中以96％的产率获得，而关键的5-甲基胞嘧啶中间体20从17中分两步以58％的产率获得。这种高效的大规模路线仅需要2个和3个新步骤即可分别从这些关键中间体获得N2'-官能化的胸腺嘧啶和5-甲基胞嘧啶氨基-LNA亚磷酰胺。

  DOI：

  10.1021/jo302036h

文献信息

• [EN] SYNTHESIS OF LOCKED NUCLEIC ACID DERIVATIVES<br/>[FR] SYNTHÈSE DE DÉRIVÉS D'ACIDES NUCLÉIQUES LNA
  申请人：SANTARIS PHARMA AS

  公开号：WO2003095467A1

  公开（公告）日：2003-11-20

  The invention relates to a novel strategy for the synthesis of Locked Nucleic Acid derivatives, such as α-L-oxy-LNA, amino-LNA, α-L-amino-LNA, thio-LNA, α-L-thio-LNA, seleno-LNA and methylene LNA, which provides scalable high yielding reactions utilising intermediates that also can produce other LNA analogues such as oxy-LNA. Also, the compounds of the formula X are important intermediates that may be reacted with varieties of nucleophiles leading to a wide variety of LNA analogues. (Formula I)

  该发明涉及一种用于合成锁定核酸衍生物的新策略，例如α-L-氧基-LNA、氨基-LNA、α-L-氨基-LNA、硫基-LNA、α-L-硫基-LNA、硒基-LNA和亚甲基-LNA，该策略利用中间体进行可扩展高产率反应，这些中间体还可以产生其他LNA类似物，如氧基-LNA。此外，式X的化合物是重要的中间体，可以与多种亲核试剂发生反应，从而形成各种LNA类似物。
• Synthesis of locked nucleic acid derivatives
  申请人：——

  公开号：US20040014959A1

  公开（公告）日：2004-01-22

  The invention relates to a novel strategy for the synthesis of Locked Nucleic Acid derivatives, such as &agr;-L-oxy-LNA, amino-LNA, &agr;-L-amino-LNA, thio-LNA, &agr;-L-thio-LNA, seleno-LNA and methylene LNA, which provides scalable high yielding reactions utilising intermediates that also can produce other LNA analogues such as oxy-LNA. Also, the compounds of the formula X are important intermediates that may be reacted with varieties of nucleophiles leading to a wide variety of LNA analogues. 1

  该发明涉及一种用于合成锁定核酸衍生物的新策略，例如α-L-氧基-LNA、氨基-LNA、α-L-氨基-LNA、硫基-LNA、α-L-硫基-LNA、硒基-LNA和亚甲基-LNA，该策略利用中间体进行可扩展的高产率反应，这些中间体还可以产生其他LNA类似物，如氧基-LNA。另外，公式X的化合物是重要的中间体，可以与多种亲核试剂反应，生成各种LNA类似物。
• Convenient Syntheses of 7-Hydroxy-1-(hydroxymethyl)- 3-(thymin-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptanes:  α-<scp>l</scp>-Ribo- and α-<scp>l</scp>-Xylo-Configured LNA Nucleosides
  作者：Anders E. Håkansson、Alexei A. Koshkin、Mads D. Sørensen、Jesper Wengel

  DOI：10.1021/jo000232g

  日期：2000.8.1

  Synthesis of the diastereoisomeric LNA (locked nucleic acid) nucleosides 1-(2-O,4-C-methylene-alpha-L-ribofuranosyl)thymine (6) and 1-(2-O,4-C-methylene-alpha-L-xylofuranosyl)thymine (13) are reported via convenient reaction cascades from di-O-p-toluenesulfonyl and tri-O-methanesulfonyl nucleoside derivatives 3, 7, and 10.

  非对映异构LNA（锁核酸）核苷1-（2-O，4-C-亚甲基-α-L-呋喃呋喃糖基）胸腺嘧啶（6）和1-（2-O，4-C-亚甲基-α-通过二-对-甲苯磺酰基和三-O-甲磺酰基核苷衍生物3、7和10的便捷反应级联报道了L-木呋喃糖基）胸腺嘧啶（13）。
• Synthesis of [2.2.1]bicyclo nucleosides
  申请人：Exiqon A/S

  公开号：US20030092905A1

  公开（公告）日：2003-05-15

  A synthesis of [2.2.1]bicyclo nucleosides which is shorter and provides higher overall yields proceeds via the key intermediate of the general formula III, wherein R 4 and R 5 are, for instance, sulfonates and R 7 is, for instance, a halogen or an acetate. From compounds of the general formula II, such as 3-O-aryl-4-C-hydroxymethyl-1,2-O-isopropylidene-&agr;-D-ribofuranose, intermediates of the general formula III are suitable for coupling with silylated nucleobases. Upon one-pot base-induced ring-closure and desulfonation of the formed [2.2.1]bicyclo nucleoside, a short route to each the LNA (Locked Nucleic Acid) derivatives of adenosine, cytosine, uridine, thymidine and guanidine is demonstrated. The use of the 5′-sulfonated ring-closed intermediate also allows for synthesis of 5′-amino- and thio-LNAs. 1

  通过通式III的关键中间体进行合成[2.2.1]双环核苷，该方法较短且提供更高的总收率，其中R4和R5例如为磺酸盐，R7例如为卤素或醋酸盐。从通式II的化合物，例如3-O-芳基-4-C-羟甲基-1,2-O-异丙基亚-D-核糖，通式III的中间体适用于与硅化核苷碱进行偶联。通过一锅法碱催化环闭合和去磺酸化形成的[2.2.1]双环核苷，演示了腺嘌呤、胞嘧啶、尿嘧啶、胸腺嘧啶和鸟嘌呤的LNA（锁定核酸）衍生物的短路线。使用5'-磺酸化环闭合中间体还允许合成5'-氨基和硫代-LNA。
• SYNTHESIS OF LOCKED NUCLEIC ACID DERIVATIVES
  申请人：Detlef Sorensen Mads

  公开号：US20100216983A1

  公开（公告）日：2010-08-26

  The invention relates to a novel strategy for the synthesis of Locked Nucleic Acid derivatives, such as α- L -oxy-LNA, amino-LNA, α- L -amino-LNA, thio-LNA, α- L -thio-LNA, seleno-LNA and methylene LNA, which provides scalable high yielding reactions utilising intermediates that also can produce other LNA analogues such as oxy-LNA. Also, the compounds of the formula X are important intermediates that may be reacted with varieties of nucleophiles leading to a wide variety of LNA analogues.

  本发明涉及一种新的合成锁定核酸衍生物的策略，例如α-L-氧基-LNA，氨基-LNA，α-L-氨基-LNA，硫基-LNA，α-L-硫基-LNA，硒基-LNA和亚甲基LNA，它提供可扩展的高产率反应，利用中间体还可以产生其他LNA类似物，例如氧基-LNA。此外，式X的化合物是重要的中间体，可与多种亲核试剂反应，导致各种LNA类似物的广泛产生。