[(2R,3R,4R,5R,6R)-6-[[1-[(6aR,8R,9aS)-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]methoxy]-4-acetyloxy-5-[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]-2-[[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]methyl]oxan-3-yl] acetate | 285549-63-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: [(2R,3R,4R,5R,6R)-6-[[1-[(6aR,8R,9aS)-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]methoxy]-4-acetyloxy-5-[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]-2-[[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]methyl]oxan-3-yl] acetate
• CAS: 285549-63-5
• 化学式: C₃₆H₅₄F₆N₄O₁₄Si₂
• 分子量: 937.005
• InChiKey: MZWKNOWAZBXBAC-IFVSXTOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.34±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.61
• 重原子数：
  62
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  216
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  20

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(2R,3R,4R,5R,6R)-6-[[1-[(6aR,8R,9aS)-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]methoxy]-4-acetyloxy-5-[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]-2-[[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]methyl]oxan-3-yl] acetate 在 吡啶 、 四丁基氟化铵 、 溶剂黄146 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 5.5h， 生成 [(2R,3R,4R,5R,6R)-4-acetyloxy-6-[[1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]methoxy]-5-[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]-2-[[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]methyl]oxan-3-yl] acetate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Aminoglycoside-Modified Oligonucleotides

  摘要：

  [GRAPHICS]To study the structural requirements of aminoglycoside binding to nucleic acids, compound 1-an analogue of the naturally occurring nucleoside J-was synthesized, When incorporated into oligodeoxynucleotides, 1 leads to thermal stabilization of the resulting duplexes. The increase in pairing affinity is stronger with complementary RNA than with DNA.

  DOI：

  10.1021/ol005797d
• 作为产物：
  描述：

  四乙酰核糖 在 吡啶 、 二氯乙酸 、 苯磺酰胺 、 4-二甲氨基吡啶 、 吡咯 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 3 A molecular sieve 、 氰化汞 、 sodium carbonate 、 di(1H-imidazol-2-yl)methanethione 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 84.08h， 生成 [(2R,3R,4R,5R,6R)-6-[[1-[(6aR,8R,9aS)-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]methoxy]-4-acetyloxy-5-[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]-2-[[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]methyl]oxan-3-yl] acetate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Aminoglycoside-Modified Oligonucleotides

  摘要：

  [GRAPHICS]To study the structural requirements of aminoglycoside binding to nucleic acids, compound 1-an analogue of the naturally occurring nucleoside J-was synthesized, When incorporated into oligodeoxynucleotides, 1 leads to thermal stabilization of the resulting duplexes. The increase in pairing affinity is stronger with complementary RNA than with DNA.

  DOI：

  10.1021/ol005797d