ethyl 4-O-acetyl-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-1-thio-β-D-glucopyranoside | 138730-66-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: ethyl 4-O-acetyl-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-1-thio-β-D-glucopyranoside
• 英文别名: [(2R,3S,4R,5R,6S)-5-(1,3-dioxoisoindol-2-yl)-6-ethylsulfanyl-4-phenylmethoxy-2-(phenylmethoxymethyl)oxan-3-yl] acetate
• CAS: 138730-66-2
• 化学式: C₃₂H₃₃NO₇S
• 分子量: 575.683
• InChiKey: NSNZYFACOONRLY-BFGNKNHRSA-N

物化性质

• 沸点：
  696.7±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.31±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.6
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.34
• 拓扑面积：
  117
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ethyl 4-O-acetyl-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-1-thio-β-D-glucopyranoside 在 吡啶 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 氢氟酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.17h， 以92.7%的产率得到4-O-acetyl-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranosyl fluoride
  参考文献：
  名称：

  合成核心三糖作为N-聚糖和糖缀合物的通用构建基块。

  摘要：

  糖蛋白（N-聚糖）中的N-连接寡糖可通过构件方法方便地组装。核心三糖（β-甘露糖基壳二糖）的保护形式被确定为关键组成部分。核心三糖的壳二糖部分由糖基氟化物构建，该糖基氟化物用作还原性GlcNAc叠氮化物和内部GlcNAc部分的前体。β-甘露糖基化是在三糖阶段通过β-葡萄糖基壳二糖的分子内转化来完成的。β-甘露糖苷和叠氮基在核心三糖还原端的亚苄基保护可以模块化合成N-聚糖及其糖缀合物。

  DOI：

  10.1002/chem.200390156
• 作为产物：
  描述：

  乙酸酐 、 ethyl 3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-1-thio-β-D-glucopyranoside 在 吡啶 作用下， 反应 20.0h， 以100%的产率得到ethyl 4-O-acetyl-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-1-thio-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  合成核心三糖作为N-聚糖和糖缀合物的通用构建基块。

  摘要：

  糖蛋白（N-聚糖）中的N-连接寡糖可通过构件方法方便地组装。核心三糖（β-甘露糖基壳二糖）的保护形式被确定为关键组成部分。核心三糖的壳二糖部分由糖基氟化物构建，该糖基氟化物用作还原性GlcNAc叠氮化物和内部GlcNAc部分的前体。β-甘露糖基化是在三糖阶段通过β-葡萄糖基壳二糖的分子内转化来完成的。β-甘露糖苷和叠氮基在核心三糖还原端的亚苄基保护可以模块化合成N-聚糖及其糖缀合物。

  DOI：

  10.1002/chem.200390156

文献信息

• Synthesis of 2-Amino-2-deoxy-β-D-galactopyranosyl-(1→4)-2-amino-2-deoxy-β-D-galactopyranosides: Using Various 2-Deoxy-2-phthalimido-D-galactopyranosyl Donors and Acceptors
  作者：Jan Veselý、Miroslav Ledvina、Jindřich Jindřich、Tomáš Trnka、David Šaman

  DOI：10.1135/cccc20041914

  日期：——

  A systematic study is presented of the efficiency of the most common glycosylation methods using standard 2-deoxy-2-phthalimidogalactopyranosyl donors ethyl 4-O-acetyl-3,6-di-O- benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-1-thio-β-D-galactopyranoside (3a), 4-O-Acetyl-3,6-di-O-benzyl- 2-deoxy-2-phthalimido-β-D-galactopyranosyl bromide (4), 4-O-acetyl-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-galactopyranosyl fluoride (5b), O-(4-O-acetyl-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-galactopyranosyl) trichloroacetimidate (7) and ethyl 3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-1-thio-β-D-galactopyranoside (8), pent-4-enyl 3,6-di-O-benzyl- and 3-O-allyl-6-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-galactopyranoside (10a) and (10b) and pent-4-enyl 3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-4-O-(trimethylsilyl)-β-D-galactopyranoside (11) as glycosyl acceptors in the synthesis of 2-amino-2-deoxy-β-D-galactopyranosyl-(1→4)-2-amino-2-deoxy-β-D-galactopyranosides 12, 16a and 17a. It was found that due to a low reactivity of the axial OH(4) group of glycosyl acceptors, disaccharides 16b and 17b with α(1→4) bond were also formed. The unexpected intermolecular migration of ethylsufanyl group from the reducing end of glycosyl acceptor 8 the reducing end of the activated form of glycosyl donor 4 in the glycosylation step to give ethylsulfanyl derivative 3a was proved. For preparation of the glycosyl donors and glycosyl acceptors with galacto configuration an approach based on epimerization of 4-O-mesyl derivatives of appropriate synthons with gluco configuration 2a and 2b was employed.

  本文对使用标准2-去氧-2-邻苯二甲酰胺基半乳糖供体乙基4-O-乙酰基-3,6-双-O-苄基-2-去氧-2-邻苯二甲酰胺基-1-硫代-β-D-半乳糖苷（3a）、4-O-乙酰基-3,6-双-O-苄基-2-去氧-2-邻苯二甲酰胺基-β-D-半乳糖苷溴化物（4）、4-O-乙酰基-3,6-双-O-苄基-2-去氧-2-邻苯二甲酰胺基-β-D-半乳糖苷氟化物（5b）、O-(4-O-乙酰基-3,6-双-O-苄基-2-去氧-2-邻苯二甲酰胺基-β-D-半乳糖苷)三氯乙酰胺盐（7）和乙基3,6-双-O-苄基-2-去氧-2-邻苯二甲酰胺基-1-硫代-β-D-半乳糖苷（8）、戊-4-烯基3,6-双-O-苄基和3-O-烯基-6-O-苄基-2-去氧-2-邻苯二甲酰胺基-β-D-半乳糖苷（10a）和（10b）以及戊-4-烯基3,6-双-O-苄基-2-去氧-2-邻苯二甲酰胺基-4-O-(三甲基硅基)-β-D-半乳糖苷（11）作为糖基受体，在合成2-氨基-2-去氧-β-D-半乳糖苷-(1→4)-2-氨基-2-去氧-β-D-半乳糖苷12、16a和17a的过程中，对最常见的糖基化方法的效率进行了系统研究。由于糖基受体轴向OH(4)基团的低反应性，也形成了具有α(1→4)键的二糖16b和17b。证实了在糖基化步骤中，乙基硫基团从糖基受体8的还原端出现意外的分子间迁移，到糖基供体4的活化形式的还原端，形成乙基硫基衍生物3a。为了制备具有半乳糖构型的糖基供体和糖基受体，采用了基于4-O-甲磺基衍生物与具有葡萄糖构型的适当合成子的对映异构化的方法2a和2b。
• A convergent strategy for the preparation of N-glycan core di-, tri-, and pentasaccharide thioaldoses for the site-specific glycosylation of peptides and proteins bearing free cysteines
  作者：Gregory M. Watt、Geert-Jan Boons

  DOI：10.1016/j.carres.2003.10.029

  日期：2004.1

  to cysteine-containing peptides and proteins to give disulfide-linked neoglycoconjugates. To this end, the chemical synthesis di-, tri-, and pentasaccharide N-glycan thioaldoses was undertaken. A convergent approach was used for the preparation of the pentasaccharide containing a 'synthetically difficult' beta-mannoside linkage. This linkage was installed by forming initially the corresponding beta

  哺乳动物糖蛋白的生物合成产生异质范围的蛋白质，这些蛋白质具有相同的肽主链，但糖基化的性质和位点不同。该特征阻碍了开发治疗性糖蛋白以及阐明单个糖型的生物学功能的努力。我们已经开发出一种有吸引力的方法，可以通过将硫代醛糖氧化偶联到半胱氨酸的肽和蛋白质上，从而使糖蛋白的糖型明确定义为二硫键连接的新糖偶联物。为此，进行了化学合成二，三和五糖N-聚糖硫代醛糖。使用会聚方法制备含有“合成上困难的”β-甘露糖苷键的五糖。通过首先形成相应的含β-葡萄糖苷的五糖，然后在C-2处构型反转来安装该连接。该方法利用了在葡糖基供体的C-2处的乙酰丙酸酯，其指导偶联仅给出β-葡糖苷，并且可以使用乙酸肼选择性除去，而不会影响其他对碱基不稳定的功能。将得到的醇转化为三氟甲磺酸酯，将其用乙酸三正丁铵置换，得到β-甘露糖苷键。以类似方式制备三糖N-聚糖。通过用硫代乙酸酯置换过乙酰化的α-糖基氯以得到过乙酰化的β-硫代乙酸酯来
• Synthesis of 2-aminoethyl glycosides of chitooligosaccharides
  作者：O. N. Yudina、Yu. E. Tsvetkov、N. E. Nifantiev

  DOI：10.1007/s11172-015-1250-6

  日期：2015.12

  2-Aminoethyl glycosides of chitotriose, chitopentaose, and chitoheptaose were synthesized. The successive extension of the oligosaccharide chain by two monosaccharide residues was carried out using a monosaccharide acceptor and a disaccharide donor, in which amino groups were protected by phthaloyl groups, benzyl moieties were used as a permanent protection for the hydroxy groups at C(3) and C(6), and acetyl or chloroacetyl groups were employed as a temporary protection for the hydroxy group at C(4).

  合成了2-氨基乙基壳三糖、壳五糖和壳七糖。通过使用单糖受体和二糖供体，逐步将寡糖链延长两个单糖残基，其中氨基通过邻苯二甲酰基保护，C(3)和C(6)位的羟基通过苄基作为永久保护，C(4)位的羟基通过乙酰基或氯乙酰基作为临时保护。
• Chemoenzymatic Approach for the Preparation of Asymmetric Bi-, Tri-, and Tetra-Antennary <i>N</i>-Glycans from a Common Precursor
  作者：Ivan A. Gagarinov、Tiehai Li、Javier Sastre Toraño、Tomislav Caval、Apoorva D. Srivastava、John A. W. Kruijtzer、Albert J. R. Heck、Geert-Jan Boons

  DOI：10.1021/jacs.6b12080

  日期：2017.1.18

  could be obtained by removal of a terminal β-GlcNAc moiety by treatment with β-N-acetylglucosaminidase and selective extension of the other arms. The power of the methodology is demonstrated by the preparation of an asymmetric tetra-antennary N-glycan found in human breast carcinoma tissue, which represents the most complex N-glycan ever synthesized. Multistage mass spectrometry of the two isomeric triantennary

  糖科学的进展因缺乏明确的复杂寡糖标准而受到阻碍，而这些标准是制造下一代微阵列、开发分析方案以确定分离聚糖的精确结构以及阐明聚糖生物合成途径所需的。我们在这里描述了一种化学酶方法，该方法首次使得从单一前体制备任何双触角、三触角和四触角不对称 N-聚糖成为可能。它基于四触角聚糖的化学合成，该四触角聚糖具有 N-乙酰葡糖胺 (GlcNAc)、N-乙酰基乳糖胺 (LacNAc) 和非天然 Galα(1,4)-GlcNAc 和 Manβ(1,4)-GlcNAc 附属物。哺乳动物糖基转移酶仅识别末端 LacNAc 部分作为底物，因此该结构可以独特地延伸。接下来，β-GlcNAc 终端天线可以通过半乳糖基化转化为 LacNAc，然后可以通过酶促修饰成复杂的结构。非天然的 α-Gal 和 β-Man 终止触角可以依次被适当的糖苷酶脱去，以释放末端 β-GlcNAc 部分，该部分可以转化为 LacNAc，然后通过一组糖基转移酶进行加工。通过用
• Unverzagt, Carlo, Angewandte Chemie, 1994, vol. 106, # 10, p. 1170 - 1173
  作者：Unverzagt, Carlo

  DOI：——

  日期：——