1-(2'-O-benzoyl-α-L-threofuranosyl)thymine | 325684-00-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1-(2'-O-benzoyl-α-L-threofuranosyl)thymine
• 英文别名: [(2R,3R,4S)-4-hydroxy-2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl] benzoate
• CAS: 325684-00-2
• 化学式: C₁₆H₁₆N₂O₆
• 分子量: 332.313
• InChiKey: VSFIFHXQOPQVKS-OUCADQQQSA-N

物化性质

• 密度：
  1.46±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.4
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  105
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(2'-O-benzoyl-α-L-threofuranosyl)thymine 在 叔丁基过氧化氢 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 双氧水 、 2H-tetrazole 作用下， 以 甲醇 、 癸烷 、 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 4.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  使用迭代磷酸化策略的无克级HPLC合成TNA三磷酸酯

  摘要：

  使用迭代磷酸化策略，以克为单位合成带有四个遗传碱基腺嘌呤（A），胞嘧啶（C），鸟嘌呤（G）和胸腺嘧啶（T）的α - 1-苏呋喃糖基核苷3'-三磷酸（tNTP）。避免了乏味的HPLC纯化。这种新的合成方法大大增加了可用于聚合酶介导的TNA合成研究的tNTP底物的生产规模。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.7b02099
• 作为产物：
  描述：

  在 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 三乙胺 、 苯磺酰氯 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 41.0h， 生成 1-(2'-O-benzoyl-α-L-threofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  脱氧苏糖核苷磷酸酯的酰胺化物前药可作为HIV和HBV复制的双重抑制剂

  摘要：

  已经进行了具有天然核碱基腺嘌呤，胸腺嘧啶，胞嘧啶和鸟苷的四个l -2'-脱氧-苏糖酸核苷膦酸酯的合成。特别是含有腺嘌呤类似物（PMDTA）被赋予有效的抗病毒活性显示EC 50 4.69μM的抗HIV-1和EC 50针对HBV 0.5μM的值，而完全缺乏细胞毒性。PMDTA的许多膦酰单酰胺酸酯和膦酰双酰胺酸酯前药的合成导致抗病毒效力的提高。最有效的同类物是l-天冬氨酸二异戊酯苯氧基前药和l-苯丙氨酸丙酯膦酰二氨基甲酸酯前药，在低纳摩尔范围内显示抗HIV和抗HBV活性，选择性指数超过300。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.6b01260

文献信息

• P(V) Reagents for the Scalable Synthesis of Natural and Modified Nucleoside Triphosphates
  作者：Jen-Yu Liao、Saikat Bala、Arlene K. Ngor、Eric J. Yik、John C. Chaput

  DOI：10.1021/jacs.9b04728

  日期：2019.8.28

  Natural and modified nucleoside triphosphates impact nearly every major aspect of healthcare research from DNA sequencing to drug discovery. However, a scalable synthetic route to these molecules has long been hindered by the need for purification by high performance liquid chromatography (HPLC). Here, we describe a fundamental-ly different approach that uses a novel P(V) pyrene pyro-phosphate reagent

  天然和修饰的三磷酸核苷几乎影响着从 DNA 测序到药物发现的医疗保健研究的每个主要方面。然而，由于需要通过高效液相色谱 (HPLC) 进行纯化，这些分子的可扩展合成路线长期以来一直受到阻碍。在这里，我们描述了一种完全不同的方法，该方法使用新型 P(V) 芘焦磷酸试剂来生成衍生物，这些衍生物通过硅胶色谱法纯化，并在远远超过 HPLC 可达到的规模上转化为所需的化合物。通过使用高效、廉价且操作简单的方案合成各种天然和非天然核苷三磷酸（dNTPs 和 xNTPs），证明了这种方法的威力。
• [EN] NOVEL ANTIVIRAL COMPOUNDS, A PROCESS FOR THEIR PREPARATION, AND THEIR USE FOR TREATING VIRAL INFECTIONS<br/>[FR] NOUVEAUX COMPOSÉS ANTIVIRAUX, PROCÉDÉ POUR LEUR PRÉPARATION, ET LEUR UTILISATION POUR LE TRAITEMENT D'INFECTIONS VIRALES
  申请人：UNIV LEUVEN KATH

  公开号：WO2016174081A1

  公开（公告）日：2016-11-03

  The present invention relates to novel pro-drugs of L-2'-deoxythreose nucleoside phosphonates, such as phosphoramidate, phosphorodiamidate and phospho-diester prodrugs. The invention also relates to a process for preparing these novel prodrugs of nucleoside phosphonates. The invention also relates to the use of these novel phosphonatemodified nucleosides to treat or prevent viral infections and their use to manufacture a medicine to treat or prevent viral infections, particularly infections with viruses belonging to the HBV family.

  本发明涉及L-2'-去氧核糖核苷膦酸酯的新型前药，如磷酰胺酯、磷酰二胺酯和磷酰二酯前药。该发明还涉及制备这些新型核苷膦酸酯前药的方法。该发明还涉及使用这些新型膦酸酯修饰的核苷来治疗或预防病毒感染，并将其用于制造用于治疗或预防病毒感染的药物，特别是治疗属于HBV家族病毒感染的药物。
• Synthesis and polymerase incorporation of β,γ-modified α-l-threofuranosyl thymine triphosphate mimics
  作者：Zhe Chen、Kirsten N. Meek、Alexandra E. Rangel、Jennifer M. Heemstra

  DOI：10.1016/j.bmcl.2016.07.008

  日期：2016.8

  Three beta,gamma-modified alpha-l-threofuranosyl nucleoside triphosphates were synthesized. The beta,gamma-modified tTTPs undergo a single incorporation event with HIV RT but undergo multiple incorporations to form full-length product with engineered thermophilic polymerases.

  合成了三种β，γ-修饰的α-1-苏呋喃糖基核苷三磷酸酯。β，γ-修饰的TT Ps与HIV RT经历了一次掺入事件，但经过多次掺入以与工程化的嗜热性聚合酶形成全长产物。
• The -L-Threofuranosyl-(3′→2′)-oligonucleotide System (‘TNA'): Synthesis and Pairing Properties
  作者：Kai-Uwe Schöning、Peter Scholz、Xiaolin Wu、Sreenivasulu Guntha、Guillermo Delgado、Ramanarayanan Krishnamurthy、Albert Eschenmoser

  DOI：10.1002/hlca.200290000

  日期：2002.12

  α-L-Threofuranosyl-(3′2′)-oligonucleotides (‘TNA') are part of a systematic experimental inquiry into the base-pairing properties of potentially natural nucleic acid alternatives taken from RNA's close structural neighborhood. TNA is an efficient Watson-Crick base-pairing system and has the capability of informational cross-pairing with both RNA and DNA. This property, together with the system's constitutional

  我们对α -L-苏呋喃糖基-（3'2'）-寡核苷酸（'TNA'）的研究是对来自RNA紧密结构邻域的潜在天然核酸替代物的碱基配对特性进行系统实验研究的一部分。TNA是高效的Watson-Crick碱基配对系统，具有与RNA和DNA进行信息交叉配对的能力。此属性，以及系统的结构和（假定的）世代简化性，在寻找有关RN​​A起源的化学线索的情况下，需要对TNA进行特殊审查。
• A Scalable Synthesis of α-<scp>l</scp>-Threose Nucleic Acid Monomers
  作者：Sujay P. Sau、Nour Eddine Fahmi、Jen-Yu. Liao、Saikat Bala、John C. Chaput

  DOI：10.1021/acs.joc.5b02768

  日期：2016.3.18

  polymers composed of TNA (α-l-threofuranosyl-(3′,2′) nucleic acid). This property, coupled with enhanced nuclease stability relative to natural DNA and RNA, warrants further investigation into the structural and functional properties of TNA as an artificial genetic polymer for synthetic biology. Here, we report a highly optimized chemical synthesis protocol for constructing multigram quantities of TNA

  聚合酶工程学的最新进展使得在DNA和由TNA（α- 1-苏呋喃呋喃糖基-（3'，2'）核酸）。这种特性，加上相对于天然DNA和RNA增强的核酸酶稳定性，值得进一步研究TNA作为合成生物学的人工遗传聚合物的结构和功能特性。在这里，我们报告了一种高度优化的化学合成方案，用于构建数克数量的TNA核苷，可以将其分别轻易地转化为2'-亚磷酰胺或3'-三磷酸核苷，分别用于固相和聚合酶介导的合成。合成方案涉及10个化学转化，包括三个结晶步骤和单个色谱纯化，根据核苷的身份（A，C，G，T），总产率为16-23％。