描述了对半胱天冬酶8具有选择性的新型荧光基四肽底物的合成,酶学评估和分子模型研究,该底物具有一般结构Ac-IETD-AXX。von Pechmann缩合反应合成了各种荧光报告基团(AXX),即3和4个取代的
香豆素和quinolin-2(1 H )-1 。随后在新开发的合成条件下将它们与caspase-8选择性四肽Ac-IETD-OH偶联,以高收率和高对映体纯度提供所需的底物。基于K M和V max值,新化合物被证明是
重组人caspase 8的优良底物。相反, K M与人半胱天冬酶3的底物相同的化合物的值大约高10–20倍。基于人半胱
氨酸
蛋白酶3和8的X射线晶体结构的分子建模研究表明,两个活性位点中都有足够的空间容纳在荧光
香豆素和
喹啉3和4位中具有中等体积取代基的底物。 2(1小时)-那些。使用程序AutoDock 3将底物自动对接至人胱天
蛋白酶3和8的活性位点,其结构类似于已公开的晶体学结