N-甲基-N-[3-[[[2-[(2-氧代-2,3-二氢-1H-吲哚-5-基)氨基]-5-三氟甲基嘧啶-4-基]氨基]甲基]吡啶-2-基]甲磺酰胺 | 717907-75-0

• 物质功能分类: 生物化工 - 抑制剂 - 血管生成(Angiogenesis)
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 中文名称: N-甲基-N-[3-[[[2-[(2-氧代-2,3-二氢-1H-吲哚-5-基)氨基]-5-三氟甲基嘧啶-4-基]氨基]甲基]吡啶-2-基]甲磺酰胺
• 英文名称: PF-562,271
• 英文别名: PF-00562271；VS-6062；PF-00562271 free base；N-methyl-N-[3-[[[2-[(2-oxo-1,3-dihydroindol-5-yl)amino]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl]amino]methyl]pyridin-2-yl]methanesulfonamide
• CAS: 717907-75-0
• 化学式: C₂₁H₂₀F₃N₇O₃S
• 分子量: 507.496
• InChiKey: MZDKLVOWGIOKTN-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  >204°C (dec.)
• 密度：
  1.540
• 溶解度：
  可溶于DMSO（少许）、甲醇（少许）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  138
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  12

安全信息

• 危险性防范说明：
  P280,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302
• 储存条件：
  -20°C

制备方法与用途

生物活性

PF-562271是一种有效的ATP竞争性、可逆的FAK抑制剂，IC50为1.5 nM。在无细胞试验中，它作用于FAK比作用于Pyk2选择性高约10倍，对其他蛋白激酶（除某些CDKs外）的选择性高达100倍以上。

体外研究

PF-562271会结合到ATP与FAK结合的部位，在激酶铰链区形成抑制剂与主链原子之间的两种氢键。在测量FAK磷酸化可诱导的基于细胞的分析中，其IC50为5 nM。3.3 μM的PF-562271导致PC3-M细胞周期停滞在G1期，在鸡胚绒毛尿囊膜实验中，1 nM的PF-562271可阻断bFGF刺激的血管生成。此外，PF-562271 (250 nM)能够完全抑制整体A431细胞侵入胶原蛋白。

体内研究

在携带U87MG的小鼠中，口服PF-562271 (<33 mg/kg) 抑制肿瘤中FAK磷酸化并具有时间和剂量依赖性。50 mg/kg、每日两次的PF-562271对BxPc3异种移植小鼠中肿瘤生长抑制率为86%，而对PC3-M异种移植小鼠中肿瘤生长抑制率为45%。25 mg/kg、每日两次处理的H125肺部异种移植肿瘤凋亡率提高两倍，PF-562271 (33 mg/kg, 口服) 24小时后可显著抑制小鼠中肿瘤细胞的广泛运动，并导致E-cadherin动力学的改变。在皮下局部异种移植PC3M-luc-C6的小鼠模型中，25 mg/kg、每日两次处理可使肿瘤生长率降低62%。在大鼠胫骨植入MDA-MB-231细胞后，口服PF-562271 (5 mg/kg) 会显著增加骨钙素和松质骨参数，并减缓肿瘤生长速度及骨愈合信号。

靶点

Target	IC50 (nM)
FAK	1.5

PF-562271在体外能够有效抑制FAK磷酸化，IC50为5 nM。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-甲基-N-[3-[[[2-[(2-氧代-2,3-二氢-1H-吲哚-5-基)氨基]-5-三氟甲基嘧啶-4-基]氨基]甲基]吡啶-2-基]甲磺酰胺 在 盐酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 乙醇 为溶剂， 反应 168.0h， 生成 化合物PF-562271HCL
  参考文献：
  名称：

  PYRIMIDINE DERIVATIVES FOR THE TREATMENT OF ABNORMAL CELL GROWTH

  摘要：

  本发明涉及N-[3-[[[2-[(2,3-二氢-2-氧代-1H-吲哚-5-基)氨基]-5-(三氟甲基)-4-嘧啶基]氨基]甲基]-2-吡啶基]-N-甲基甲烷磺酰胺的盐、溶剂化物和亚化学计量溶剂化物。本发明还提供包含这种复合物的药物组合物，以及通过给予本发明的复合物治疗异常细胞生长的方法。

  公开号：

  US20110033441A1
• 作为产物：
  描述：

  5-三氟甲基尿嘧啶 在 磷酸 、 二异丙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 zinc dibromide 、 三氯氧磷 作用下， 以 水 、 1,2-二氯乙烷 、 异丙醇 、 甲苯 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 28.9h， 生成 N-甲基-N-[3-[[[2-[(2-氧代-2,3-二氢-1H-吲哚-5-基)氨基]-5-三氟甲基嘧啶-4-基]氨基]甲基]吡啶-2-基]甲磺酰胺
  参考文献：
  名称：

  PYRIMIDINE DERIVATIVES FOR THE TREATMENT OF ABNORMAL CELL GROWTH

  摘要：

  本发明涉及N-[3-[[[2-[(2,3-二氢-2-氧代-1H-吲哚-5-基)氨基]-5-(三氟甲基)-4-嘧啶基]氨基]甲基]-2-吡啶基]-N-甲基甲烷磺酰胺的盐、溶剂化物和亚化学计量溶剂化物。本发明还提供包含这种复合物的药物组合物，以及通过给予本发明的复合物治疗异常细胞生长的方法。

  公开号：

  US20110033441A1

文献信息

• [EN] COMPOUNDS FOR REGULATING FAK AND/OR SRC PATHWAYS<br/>[FR] COMPOSÉS PERMETTANT DE RÉGULER LES VOIES FAK ET/OU SRC
  申请人：ASANA BIOSCIENCES LLC

  公开号：WO2015038417A1

  公开（公告）日：2015-03-19

  The present application provides novel optionally substituted fused pyridine and pyrimidine bicyclic compounds and pharmaceutically acceptable salts thereof. Also provided are methods for preparing these compounds. These compounds are useful in co-regulating FAK and/or Src activity by administering a therapeutically effective amount of one or more of the compounds to a subject. By doing so, these compounds are effective in treating conditions associated with the dysregulation of the FAK and/or Src pathway. Advantageously, these compounds perform as dual FAK and/or Src inhibitors. A variety of conditions can be treated using these compounds and include diseases which are characterized by inflammation or abnormal cellular proliferation. In one embodiment, the disease is cancer.

  本申请提供了新颖的可选择替代的融合吡啶和嘧啶双环化合物及其药用可接受盐。还提供了制备这些化合物的方法。通过向受试者投予一种或多种化合物的治疗有效量，这些化合物在共调节FAK和/或Src活性方面具有用处。通过这样做，这些化合物在治疗与FAK和/或Src途径失调相关的疾病方面具有有效性。这些化合物作为双重FAK和/或Src抑制剂表现出优势。可以使用这些化合物治疗各种疾病，包括以炎症或异常细胞增殖为特征的疾病。在一个实施例中，该疾病是癌症。
• PHOSPHOROUS DERIVATIVES AS KINASE INHIBITORS
  申请人：ARIAD PHARMACEUTICALS, INC.

  公开号：US20150225436A1

  公开（公告）日：2015-08-13

  The invention features compounds of the general formula: in which the variable groups are as defined herein, and to their preparation and use.

  该发明涉及一般式化合物：其中变量基团如本文所定义，以及它们的制备和使用。
• Pyrimidine derivatives for the treatment of abnormal cell growth
  申请人：Kath Charles John

  公开号：US20050256145A1

  公开（公告）日：2005-11-17

  The present invention relates to a compound of the formula 1 wherein R 1 -R 4 are as defined herein. Such novel pyrimidine derivatives are useful in the treatment of abnormal cell growth, such as cancer, in mammals. This invention also relates to a method of using such compounds in the treatment of abnormal cell growth in mammals, especially humans, and to pharmaceutical compositions containing such compounds.

  本发明涉及一种化合物，其化学式为1，其中R1-R4如本文所定义。这种新颖的嘧啶衍生物在哺乳动物中用于治疗异常细胞增长，如癌症。本发明还涉及一种在哺乳动物中，特别是人类中使用这种化合物治疗异常细胞增长的方法，以及含有这种化合物的药物组合物。
• Structure-kinetic relationship reveals the mechanism of selectivity of FAK inhibitors over PYK2
  作者：Benedict-Tilman Berger、Marta Amaral、Daria B. Kokh、Ariane Nunes-Alves、Djordje Musil、Timo Heinrich、Martin Schröder、Rebecca Neil、Jing Wang、Iva Navratilova、Joerg Bomke、Jonathan M. Elkins、Susanne Müller、Matthias Frech、Rebecca C. Wade、Stefan Knapp

  DOI：10.1016/j.chembiol.2021.01.003

  日期：2021.5

  There is increasing evidence of a significant correlation between prolonged drug-target residence time and increased drug efficacy. Here, we report a structural rationale for kinetic selectivity between two closely related kinases: focal adhesion kinase (FAK) and proline-rich tyrosine kinase 2 (PYK2). We found that slowly dissociating FAK inhibitors induce helical structure at the DFG motif of FAK but not

  越来越多的证据表明，延长药物靶点停留时间与提高药物疗效之间存在显着相关性。在这里，我们报告了两种密切相关激酶之间动力学选择性的结构原理：粘着斑激酶 (FAK) 和富含脯氨酸的酪氨酸激酶 2 (PYK2)。我们发现缓慢解离的 FAK 抑制剂会在 FAK 的 DFG 基序上诱导螺旋结构，但不会在 PYK2 上诱导螺旋结构。结合动力学数据、高分辨率结构和诱变数据支持抑制剂与 DFG 螺旋区域的疏水相互作用的作用，为 FAK 的缓慢解离速率和 PYK2 的动力学选择性提供了结构原理。我们的实验数据与从分子模拟计算的相对停留时间密切相关，支持合理优化配体停留时间的可行策略。我们认为蛋白质结构迁移率和配体诱导效应之间的相互作用是 FAK 与 PYK2 抑制剂的动力学选择性的关键调节剂。
• [EN] HETEROCYCLIC SPIRO COMPOUNDS AND METHODS OF USE<br/>[FR] COMPOSÉS SPIRO HÉTÉROCYCLIQUES ET PROCÉDÉS D'UTILISATION
  申请人：AMGEN INC

  公开号：WO2022093856A1

  公开（公告）日：2022-05-05

  The present disclosure provides compounds of Formula (I) having activity as inhibitors of G12C mutantKRASprotein. This disclosure also provides pharmaceutical compositions comprising the compounds, uses and methods of treating certain disorders, such as cancer, including but not limited to lung, pancreatic and colorectal cancers.

  本公开提供具有抑制G12C突变KRAS蛋白活性的式（I）化合物。本公开还提供包含该化合物的药物组合物，用途和治疗某些疾病的方法，例如癌症，包括但不限于肺癌、胰腺癌和结直肠癌。