1,3,6',3''-tetraazidokanamycin A | 1037515-73-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1,3,6',3''-tetraazidokanamycin A
• 英文别名: (2R,3S,4S,5R,6R)-2-(azidomethyl)-6-[(1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-diazido-3-[(2S,3R,4S,5S,6R)-4-azido-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]oxyoxane-3,4,5-triol
• CAS: 1037515-73-3
• 化学式: C₁₈H₂₈N₁₂O₁₁
• 分子量: 588.494
• InChiKey: HMMLVGZRVMNPNK-NOAMYHISSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.2
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  236
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  19

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,3,6',3''-tetraazidokanamycin A 在 盐酸 、 Hoveyda-Grubbs catalyst second generation 、 水 、 sodium hydride 、 对甲苯磺酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 51.16h， 生成 1,3,6',3''-tetraazido-4'',6''-O-benzylidene-3',4',2''-tri-O-benzyl-5,2'-O-(but-2-en-1,4-diyl)kanamycin A
  参考文献：
  名称：

  构象受限的卡那霉素A衍生物的设计，合成和抗菌活性

  摘要：

  设计并合成了一系列构象受限的卡那霉素A衍生物，这些衍生物在环I中具有2'-羟基，在环II中具有5-羟基，并被碳链束缚。暴露关键的5,2'-羟基，并从5，2'，4″，6″ -di- O合成卡那霉素A中间体然后通过碳酸铯介导的Williamson醚合成或闭环易位反应制备具有分子内8元，9元，10元和11元醚的环亚苄基保护的四叠氮卡那霉素A。环状卡那霉素A衍生物。测定了卡那霉素A衍生物对敏感和耐药细菌菌株的抵抗力。尽管没有一种衍生物显示出比卡那霉素A更好的抗菌活性，但是这些环状卡那霉素A衍生物的抗菌活性确实随桥的长度而变化。此外，在敏感和耐药细菌菌株之间观察到不同的活性变化。约束更严格的导数2具有一个碳桥表现出比抗敏感菌株的其他更好的活性，但它是对耐药菌株比衍生物更有效3与二碳桥和衍生物6与不饱和四碳桥。

  DOI：

  10.1021/jo302247x
• 作为产物：
  描述：

  (2R,3R,4S,5R,6R)-2-(azidomethyl)-6-(((1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-diazido-3-(((2S,3R,4S,5S,6R)-3,5-diacetoxy-6-(acetoxymethyl)-4-azidotetrahydro-2H-pyran-2-yl)oxy)-2-hydroxycyclohexyl)oxy)tetrahydro-2H-pyran-3,4,5-triyl triacetate 在 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 8.0h， 以90%的产率得到1,3,6',3''-tetraazidokanamycin A
  参考文献：
  名称：

  卡那霉素环II / III片段的合成：氨基糖苷识别的新的最小结构基序。

  摘要：

  已经建立了制备卡那霉素环II / III片段的新方案，该方案已被证明是开发新氨基糖苷的最小结构基序，基于其甚至具有抗性菌株的杀菌活性。此外，它具有作为AAC-（6'）和APH-（3'）粘合剂的功能，以及作为腐烂ANT-（4'）的不良底物的能力，使其成为设计这些抑制剂的极佳候选者氨基糖苷修饰酶。

  DOI：

  10.3390/antibiotics8030109

文献信息

• Effects of 5-<i>O</i>-Ribosylation of Aminoglycosides on Antimicrobial Activity and Selective Perturbation of Bacterial Translation
  作者：Ido M. Herzog、Sivan Louzoun Zada、Micha Fridman

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.6b00793

  日期：2016.9.8

  We studied six pairs of aminoglycosides and their corresponding ribosylated derivatives synthesized by attaching a β-O-linked ribofuranose to the 5-OH of the deoxystreptamine ring of the parent pseudo-oligosaccharide antibiotic. Ribosylation of the 4,6-disubstituted 2-deoxystreptamine aminoglycoside kanamycin B led to improved selectivity for inhibition of prokaryotic relative to cytosolic eukaryotic

  我们研究了六对通过连接β- O合成的氨基糖苷及其相应的核糖基化衍生物-呋喃核糖连接到母体假寡糖抗生素的脱氧链胺胺环的5-OH。相对于胞质真核生物体外翻译，4,6-二取代的2-脱氧链胺胺氨基糖苷卡那霉素B的核糖基化导致抑制原核生物的选择性提高。对于伪二糖氨基糖苷支架神经酰胺和神经胺，核糖基化衍生物既更有效，又对抑制原核翻译的选择性更高。根据这项研究的结果，我们建议修饰其他天然或半合成的假二糖氨基糖苷支架的链胺环的5-OH位置，该支架在2'糖位置包含赤道胺，并带有β- O连接的呋喃核糖是开发新型氨基糖苷类抗生素的一种有前途的途径，该抗生素具有更高的功效和更低的毒性。
• An Alternative and Facile Synthetic Approach for the Precursors of 3- and 6-Aminosugar Donors and Study of One-pot Glycosyltrasferation
  作者：Uddav Pandey、Yagya Prasad Subedi、Madher N. Alfindee、Taylor Shepherd、Cheng-Wei Tom Chang

  DOI：10.1246/cl.190772

  日期：2020.1.5

  3- and 6-aminosugars are common motifs in bioactive compounds playing pivotal roles in the bioactivity of the core molecules to which they are attached. However, de novo synthesis of 3- and 6-amino...

  3- 和 6- 氨基糖是生物活性化合物中的常见基序，在它们所连接的核心分子的生物活性中起关键作用。然而，3-和6-氨基的从头合成...
• Divergent Synthesis of Three Classes of Antifungal Amphiphilic Kanamycin Derivatives
  作者：Qian Zhang、Madher N. Alfindee、Jaya P. Shrestha、Vincent de Paul Nzuwah Nziko、Yukie Kawasaki、Xinrui Peng、Jon Y. Takemoto、Cheng-Wei Tom Chang

  DOI：10.1021/acs.joc.6b01189

  日期：2016.11.18

  3″-tetraazidokanamycin has been developed that leads to the divergent synthesis of three classes of kanamycin A derivatives. These new amphiphilic kanamycin derivatives bearing alkyl chains length of 4, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 14, and 16 have been tested for their antibacterial and antifungal activities. The antibacterial effect of the synthesized kanamycin derivatives declines or disappears as compared to the original kanamycin

  已经开发出一种简洁新颖的方法用于1,3,6'，3''-四叠氮卡那霉素的位点选择性烷基化，从而导致三类卡那霉素A衍生物的发散合成。这些新的两亲卡那霉素衍生物的烷基链长度分别为4、6、7、8、9、10、12、14和16，已进行了抗菌和抗真菌活性测试。与原始卡那霉素A相比，合成的卡那霉素衍生物的抗菌作用减弱或消失。几种化合物，尤其是在O -4''和/或O处具有辛基链的化合物卡那霉素A环III上的-6“位置显示出非常强的抗真菌活性。另外，这些化合物对哺乳动物细胞没有毒性。最后，计算计算揭示了可能的因素，这些因素是所观察到的区域选择性的原因。化学合成的简单性和真菌的特异性使铅化合物成为开发新型抗真菌剂的理想候选者。
• Structure-Based Design of Highly Crowded Ribostamycin/Kanamycin Hybrids as a New Family of Antibiotics
  作者：Julia Revuelta、Tatiana Vacas、Francisco Corzana、Carlos Gonzalez、Agatha Bastida、Juan Luis Asensio

  DOI：10.1002/chem.200903003

  日期：2010.3.8

  Sugar sugar! The synthesis and evaluation of ribostamycin/kanamycin hybrids incorporating a highly crowded trisubstituted aminocyclitol unit that should provide maximum complementation with the RNA receptor are reported (see picture). Analysis shows that the existing conflicts between the different sugar rings can be significantly alleviated by a simple chemical modification, leading to an improvement

  糖糖！据报道，含有高度拥挤的三取代氨基环糖醇单元的核糖霉素/卡那霉素杂种的合成和评估应提供与RNA受体的最大互补性（见图）。分析表明，通过简单的化学修饰可以显着缓解不同糖环之间的现有冲突，从而改善活性。
• Inhibition of Connexin Hemichannels by New Amphiphilic Aminoglycosides without Antibiotic Activity
  作者：Madher N. AlFindee、Yagya P. Subedi、Mariana C. Fiori、Srinivasan Krishnan、Abbey Kjellgren、Guillermo A. Altenberg、Cheng-Wei T. Chang

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.8b00158

  日期：2018.7.12

  Connexins hemichannels (HCs) from adjacent cells form gap junctional channels that mediate cell-to-cell communication. Abnormal opening of "free" undocked HCs can produce cell damage and participate in the mechanism of disorders such as cardiac infarct, stroke, deafness, skin diseases, and cataracts. Therefore, inhibitors of connexin HCs have great pharmacological potential. Antibiotic aminoglycosides (AGs) have been recently identified as connexin HC inhibitors, but their antibiotic effect is an issue for the treatment of disorders where infections do not play a role. Herein, we synthesized and tested several amphiphilic AGs without antibiotic effect for their inhibition against connexin HCs, using a newly developed cell-based bacterial growth complementation assay. Several leads with superior potency than the parent compound, kanamycin A, were identified. Unlike traditional AGs, these amphiphilic AGs are not bactericidal and are not toxic to mammalian cells, making them better than traditional AGs as HC inhibitors for clinical use and other applications.