N2-isobutyryl-9-(3-azido-2,3-dideoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)guanine | 719288-81-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N2-isobutyryl-9-(3-azido-2,3-dideoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)guanine
• 英文别名: N²-isobutyryl-9-(3-azido-2,3-dideoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)guanine；3'-azido-2',3'-dideoxy-N2-isobutyrylguanosine；3'-azido-N2-isobutyryl-2',3'-dideoxyguanosine；3'-(R)-(azido)(2)N-isobutyryl-deoxyguanosine；3'-(R)-(azido)N2-isobutyryl-deoxyguanosine
• CAS: 719288-81-0
• 化学式: C₁₄H₁₈N₈O₄
• 分子量: 362.348
• InChiKey: DUWXFESFUVKOED-DJLDLDEBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.67
• 重原子数：
  26.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.57
• 拓扑面积：
  170.89
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N2-isobutyryl-9-(3-azido-2,3-dideoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)guanine 在 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 以90 mg的产率得到3'-叠氮基-2',3'-二脱氧鸟苷
  参考文献：
  名称：

  Potential application of thymidylate kinase in nucleoside analogue activation in Plasmodium falciparum

  摘要：

  Plasmodium falciparum thymidylate kinase (PfTMPK) shows a broad range of substrate tolerance when compared to the corresponding human enzyme. Besides 2'-deoxythymidine monophosphate (dTMP), PfTMPK can phosphorylate 3'-azido-2',3'-dideoxythymidine monophosphate (AZTMP) very efficiently. In contrast, human thymidylate kinase (hTMPK) is 200 times less active towards AZTMP. We were interested to see if we could use PfTMPK to activate 3'-azido-2',3'-deoxythymidine (AZT) derivatives as a strategy to treat malaria. P. falciparum lacks a pyrimidine nucleoside kinase which usually activates nucleoside and nucleoside analogues to the corresponding monophosphates. Therefore, several prodrug analogues of AZT and related nucleoside monophosphates were prepared and analysed for antiparasitic activity. The prodrugs showed an increase in activity over the parent nucleoside analogues, which showed no inhibition of parasite growth at the concentration tested. The evidence here reported provides a strategy that could be exploited for further anti-malarial design. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2010.07.006
• 作为产物：
  描述：

  鸟苷 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 三甲基氯硅烷 、 叠氮化锂 、 四丁基氟化铵 、 水 、 三乙基硼氢化锂 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 49.0h， 生成 N2-isobutyryl-9-(3-azido-2,3-dideoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)guanine
  参考文献：
  名称：

  3'-叠氮基-2',3'-双脱氧鸟苷衍生物的改进和可靠合成

  摘要：

  描述了 N2-protected-3'-azido-2',3'-dideoxyguanosine 20 和 23 的改进合成。2'-O-烷基（和/或芳基）磺酰基-5'-二甲氧基三苯甲基鸟苷脱氧结合[1,2]-氢化物移位重排得到受保护的9-（2-脱氧-苏式-戊呋喃糖基）鸟嘌呤（10、12和16)。这种重排使用三异丁基硼氢化锂 (l-Selectride®) 以高收率和高立体选择性完成。化合物 10、12 和 16 被转化为 3'-O-甲磺酸盐（18 和 21），可用于 3'-取代。通过用叠氮化锂处理 18 和 21 获得 3'-叠氮基核苷。该过程具有良好的总产率，可重现。†为了纪念和庆祝 Leroy B. Townsend 教授 70 岁生日。

  DOI：

  10.1081/ncn-120027826

文献信息

• Convenient Syntheses of 3′-Amino-2′,3′-dideoxynucleosides, Their 5′-Monophosphates, and 3′-Aminoterminal Oligodeoxynucleotide Primers
  作者：Ralf Eisenhuth、Clemens Richert

  DOI：10.1021/jo8018889

  日期：2009.1.2

  5′-Protected 3′-amino-2′,3′-dideoxynucleosides containing any of the four canonical nucleobases (A/C/G/T) were prepared via azides in five to six steps, starting from deoxynucleosides. For pyrimidines, the synthetic route involved nucleophilic opening of anhydronucleosides. For purines, an in situ oxidation/reduction sequence, followed by a Mitsunobu reaction with diphenyl-2-pyridylphosphine and sodium

  从脱氧核苷开始，通过叠氮化物以五至六步制备含有四个规范核碱基（A / C / G / T）中任何一个的5'-保护的3'-氨基-2'，3'-二脱氧核苷。对于嘧啶，合成途径涉及脱水核苷的亲核打开。对于嘌呤，原位氧化/还原序列，然后与二苯基-2-吡啶基膦和叠氮化钠的Mitsunobu反应，以高收率和纯度提供了3'-叠氮核苷。对于固相合成氨基末端寡核苷酸，氨基核苷通过新型六氟戊二酸接头与受控孔玻璃相连。这些支持物通过常规的DNA链组装和氨水一步脱保护/释放，以高产率和高纯度提供了3'-氨基末端引物。如此制备的引物在无酶化学引物延伸中成功进行了测试，这是一种用于基因分型和标记的廉价方法。还制备了3'-氨基-2'，3'-二脱氧核苷的受保护的5'-单磷酸酯，为制备标记的或光敏性受保护的单体用于化学引物延伸提供了起始原料。
• Branched DNA That Forms a Solid at 95 °C
  作者：Arunoday Singh、Mariyan Tolev、Martin Meng、Konstantin Klenin、Oliver Plietzsch、Christine I. Schilling、Thierry Muller、Martin Nieger、Stefan Bräse、Wolfgang Wenzel、Clemens Richert

  DOI：10.1002/anie.201006992

  日期：2011.3.28

  At arm′s length: Branched DNA with exceptionally short sticky ends (see picture) assembles into a new material at temperatures where genomic DNA is fully denatured, if branching geometry and linker rigidity favor crystallization. The process is shown by modeling and for synthetic material assembled from dilute aqueous buffer solution.

  在臂长处：如果支链的几何形状和连接子的刚性有利于结晶，那么在基因组DNA完全变性的温度下，具有异常短粘性末端的分支DNA（参见图片）会组装成一种新材料。通过建模显示了该过程，并显示了由稀缓冲水溶液组装而成的合成材料。