5-乙酰氨基-3,5-二脱氧-6-(1,2,3-三羟基丙基)己-2-酮吡喃糖苷酸二甲基酯 | 6730-43-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: 5-乙酰氨基-3,5-二脱氧-6-(1,2,3-三羟基丙基)己-2-酮吡喃糖苷酸二甲基酯
• 英文名称: N-Acetyl-β-D-neuraminylsaeure-methyl-methylglycosid
• 英文别名: methyl (methyl 5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-β-D-galacto-non-2-ulopyranosid)onate；2-O-Methyl-b-D-N-acetylneuraminic acid methyl ester；methyl (2S,4S,5R,6R)-5-acetamido-4-hydroxy-2-methoxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]oxane-2-carboxylate
• CAS: 6730-43-4
• 化学式: C₁₃H₂₃NO₉
• 分子量: 337.327
• InChiKey: JKTJXQQVMKZKQA-GRRZBWEESA-N

物化性质

• 熔点：
  115-125°C
• 溶解度：
  可溶于热甲醇、水

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.6
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.85
• 拓扑面积：
  155
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-乙酰氨基-3,5-二脱氧-6-(1,2,3-三羟基丙基)己-2-酮吡喃糖苷酸二甲基酯 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 作用下， 以 吡啶 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 methyl-5-acetamido-4,7,8-tri-O-acetyl-9-O-t-butyldimethylsilyl-3,5-dideoxy-β-D-glycero-D-galacto-2-nonulopyranosidonic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  Structural variations of N-Acetylneuraminic acid, 12: A new useful approach to 4-epi- and 8-epi-N-Acetylneuraminic acid

  摘要：

  DOI：

  10.1007/bf00811129
• 作为产物：
  描述：

  N-acetyl neuraminic acid 在 Dowex-50 resin (H⁺ form) 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 24.0h， 以76%的产率得到5-乙酰氨基-3,5-二脱氧-6-(1,2,3-三羟基丙基)己-2-酮吡喃糖苷酸二甲基酯
  参考文献：
  名称：

  半合成唾液酸探针，用于挑战唾液结合途径中底物酶的混杂性

  摘要：

  使用半合成策略制备了一系列不同寻常的唾液酸类似物。截断天然N-乙酰神经氨酸后，使用Barbier型羰基化以及不同的官能团互变，进行非对映选择性碳骨架的重建，这提供了对末端碳骨架中各种功能基序的访问，包括饱和和不饱和，线性支链烷基链，部分脱氧的唾液酸，唾液酸二酸和第一个截短的军团胺酸类似物。通过脑膜炎奈瑟氏菌的CMP-唾液酸合成酶研究了合成唾液酸探针的核苷酸激活使用通用的pH位移测定进行动力学分析。一锅酶促核苷酸活化和唾液酸基转移至乳糖的方法是使用五种探针进行选择，并结合来自磷酸杆菌的工程改造的α2,3-唾液酸基转移酶，以提供GM3三糖的五种新近的类似物，最终将其用于测试两种细菌唾液酸酶的底物耐受性。获得的一组唾液酸类似物和新唾液酸共轭物为进一步的糖生物学研究提供了有趣的机会。

  DOI：

  10.1002/adsc.202000859

文献信息

• Stereoselective total syntheses of the naturally occurring enantiomers of N-acetylneuraminic acid and 3-deoxy-D-manno-2-octulosonic acid. A new and stereospecific approach to sialo and 3-deoxy-D-manno-2-octulosonic acid conjugates
  作者：Samuel J. Danishefsky、Michael P. DeNinno、Shu Hui. Chen

  DOI：10.1021/ja00220a035

  日期：1988.6

  Preparation de l'enantiomere naturel de l'acide N-acetyl neuraminique a partir du phenylseleno-2 propanal et du benzyloxy-4 [furyl-2]-1 methoxy-1 trimethylsiloxy-3 butadiene-«1,3». L'enantiomere du KDO est obtenu a partir du phenylseleno-2 propionate de methyle

  制备 de l'enantiomere naturel de l'acide N-乙酰神经氨酸 a partir du phenylseleno-2 propanal et du benzyloxy-4 [furyl-2]-1 methoxy-1 trimethylsiloxy-3 butadiene-«1,3»。L'enantiomere du KDO est obtenu a partir du phenylseleno-2 propionate demethyle
• Unique Self-Anhydride Formation in the Degradation of Cytidine-5′-monophosphosialic Acid (CMP-Neu5Ac) and Cytidine-5′-diphosphosialic Acid (CDP-Neu5Ac) and its Application in CMP-sialic Acid Analogue Synthesis
  作者：Yasuhiro Kajihara、Sachiko Nishigaki、Daisuke Hanzawa、Go Nakanishi、Ryo Okamoto、Naoki Yamamoto

  DOI：10.1002/chem.201003387

  日期：2011.6.27

  compounds except for cytidine‐5′‐monophosphosialic acid (CMP‐Neu5Ac). To obtain an insight into why cytidine‐5′‐diphosphosialic acid (CDP‐Neu5Ac) has not been used for the sialyltransferase reaction and why it is not found in biological organisms, the compound was synthesised. This synthesis provided the interesting finding that the carboxylic acid moiety of the sialic acid attacks the attached phosphate

  唾液酸寡糖是通过各种糖基转移酶和糖核苷酸合成的。所有这些核苷酸都是二磷酸化合物，除了胞苷-5'-单磷酸（CMP-Neu5Ac）。为了了解为什么未将胞苷5'-二磷酸（CDP-Neu5Ac）用于唾液酸转移酶反应以及为什么在生物有机体中未发现胞苷，因此合成了该化合物。该合成提供了有趣的发现，即唾液酸的羧酸部分攻击连接的磷酸基团。这种相互作用在羧酸和磷酸酯基团之间产生活化的酸酐，并导致焦磷酸酯键的水解。稳定的同位素标记实验证明了该机理。这一发现表明，CMP-Neu5Ac也可能在羧酸和磷酸盐之间形成相应的酸酐结构，这似乎就是CMP-Neu5Ac相对于其他糖核苷酸酸不稳定的原因。为了确认羧酸的作用，合成了CMP‐Neu5Ac衍生物，其中唾液酸中的羧酸部分被酰胺或酯基取代。这些类似物显然显示出对酸水解的抗性。该结果表明Neu5Ac的羧酸与其在溶液中的稳定性有关。这一发现还为CMP-Neu5Ac和CMP-
• Syntheses of 2-O-glycosyl derivatives of N-acetyl-d-neuraminic acid
  作者：Haruo Ogura、Kimio Furuhata、Masayoshi Itoh、Yoshiyasu Shitori

  DOI：10.1016/0008-6215(86)84004-6

  日期：1986.12

  Abstract Syntheses of N -acetyl- d -neuraminic acid derivatives are reported. Methyl 4,7,8,9-tetra- O -acetyl- N -acetyl-2-chloro-2-deoxy-β- d -neuraminate ( 3 ) was prepared directly from methyl N -acetyl-β- d -neuraminate ( 2 ) in good yield. Koenigs-Knorr reaction of 3 with an excess of methanol gave the methyl α-glycoside of methyl N -acetyl- d -neuraminate ( 4 ). 2,3- O -Isopropylidene- d -ribono-1

  摘要报道了N-乙酰基-d-神经氨酸衍生物的合成。4,7,8,9-四-O-乙酰基-N-乙酰基-2-氯-2-脱氧-β-d-神经氨酸甲酯（3）直接由N-乙酰基-β-d-神经氨酸甲酯（3）直接制备2）收率好。3与过量甲醇的Koenigs-Knorr反应得到N-乙酰基-d-神经氨酸甲酯的甲基α-糖苷（4）。2，3-O-异亚丙基-d-核糖基-1,4-内酯，2,3-O-异亚丙基神经氨酸和5-氟-2,3-O-异亚丙基神经氨酸与3反应生成甲基N-乙炔基的端基异构体混合物-d-神经氨酸衍生物。这些化合物的立体化学由nmr和cd光谱以及糖苷键水解速率的测定证实。
• Oxidative Deamination of <i>N</i>-Acetyl Neuraminic Acid: Substituent Effects and Mechanism
  作者：Szymon Buda、David Crich

  DOI：10.1021/jacs.5b13015

  日期：2016.1.27

  mechanism of the oxidative deamination of the N-nitroso-N-acetyl sialyl glycosides leading with overall retention of configuration to the corresponding 2-keto-3-deoxy-D-glycero-D-galacto-nonulopyranosidonic acid (KDN) glycosides is described, making use of a series of differentially O-protected N-nitroso-N-acetyl sialyl glycosides and of isotopic labeling studies. No evidence is found for stereodirecting participation

  研究 N-亚硝基-N-乙酰基唾液酸糖苷的氧化脱氨机制，从而整体保留相应的 2-酮-3-脱氧-D-甘油-D-半乳糖-壬基吡喃糖苷酸 (KDN)利用一系列差异性 O-保护的 N-亚硝基-N-乙酰基唾液酸糖苷和同位素标记研究描述了糖苷。没有发现 4- 和 7- 位酯基参与立体定向的证据。比较了 4-氨基-4-脱氧和 2-氨基-2-脱氧吡喃己糖苷的氧化脱氨反应，并制定了一个共同机制，涉及吡喃糖苷参与后 1-氧杂双环[3.1.0]己基氧鎓离子的中介作用环氧。通过对 β-硫唾液酸苷的标记研究发现了一条次要反应途径，该途径导致 4-O-乙酰基被冰醋酸交换，冰醋酸在一般氧化脱氨过程中充当外部亲核试剂。提出了一种涉及硫代糖苷在中间体重氮烷水平参与的交换机制。
• The determination of complex carbohydrate structure by using carbonyl carbon resonances of peracetylated derivatives
  作者：Warren J. Goux

  DOI：10.1016/0008-6215(88)80005-3

  日期：1988.12

  purported regulation of gene expression in plants (Watkins, 1972; Darvill and Albersheim, 1984). Their physiological roles appear to be influenced by their tertiary and, ultimately, their primary structure (Brisson and Carver, 1983; Homans et al., 1986; Carver, 1984; Montreuil, 1980). Their structural complexity arises from the large number of structurally unique residues present and from the variety

  寡糖是生命系统中存在的化合物中含量最多和种类最多的一组。它们的功能范围从抗原决定簇（例如人的ABO血型决定簇）到植物中基因表达的调控（Watkins，1972； Darvill和Albersheim，1984）。它们的生理作用似乎受其三级以及最终其一级结构的影响（Brisson和Carver，1983； Homans等，1986； Carver，1984； Montreuil，1980）。它们的结构复杂性来自存在的大量结构独特的残基，以及可以与相邻残基和从相邻残基形成的各种环构型和糖苷键。