Methyl-5-(acetylamino)-3,5-dideoxy-8,9-O-isopropyliden-β-D-glycero-D-galacto-2-nonulopyranosidonsaeure-methylester | 88481-35-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: Methyl-5-(acetylamino)-3,5-dideoxy-8,9-O-isopropyliden-β-D-glycero-D-galacto-2-nonulopyranosidonsaeure-methylester
• 英文别名: methyl (methyl 5-acetamido-3,5-dideoxy-8,9-O-isopropylidene-D-glycero-β-D-galacto-non-2-ulopyranosid)onate；methyl (methyl 5-acetamido-3,5-dideoxy-8,9-O-isopropylidene-β-D-glycero-D-galacto-2-nonulopyranosid)onate；methyl (2S,4S,5R,6R)-5-acetamido-6-[(S)-[(4R)-2,2-dimethyl-1,3-dioxolan-4-yl]-hydroxymethyl]-4-hydroxy-2-methoxyoxane-2-carboxylate
• CAS: 88481-35-0
• 化学式: C₁₆H₂₇NO₉
• 分子量: 377.392
• InChiKey: MSEJSFGFCUHMFH-OTUMZKFCSA-N

物化性质

• 沸点：
  578.9±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.32±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.88
• 拓扑面积：
  133
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Methyl-5-(acetylamino)-3,5-dideoxy-8,9-O-isopropyliden-β-D-glycero-D-galacto-2-nonulopyranosidonsaeure-methylester 在 盐酸 、 sodium hydroxide 、 dowex 50H(+) 、 三正丁基氢锡 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 xylene 为溶剂， 反应 9.5h， 生成 5-Acetamido-3,4,5,7-tetradesoxy-β-D-lyxo-2-nonulopyranosidonsaeure
  参考文献：
  名称：

  Strukturelle Abwandlungen an N-Acetylneuramins�uren, 8 Synthese von 7-, 8-, 9-Desoxy- und 4,7-Didesoxyneuramins�ure

  摘要：

  DOI：

  10.1007/bf00810094
• 作为产物：
  描述：

  N-acetyl neuraminic acid 在 对甲苯磺酸 作用下， 反应 52.0h， 生成 Methyl-5-(acetylamino)-3,5-dideoxy-8,9-O-isopropyliden-β-D-glycero-D-galacto-2-nonulopyranosidonsaeure-methylester
  参考文献：
  名称：

  对 Relenza 耐药流感病毒株出现的化学洞察

  摘要：

  合成了一个包含 10 个 4-取代 4-硝基苯基 α-D-唾液酸苷和第二个相应唾液酸糖苷的试剂组，用于探测两种神经氨酸酶的抑制机制，甲型流感病毒的 N2 酶和酶来自绿色小单孢菌。对于病毒酶，抑制常数 (Ki) 的对数与催化效率的对数 (kcat/Km) 和催化效率 (kcat/Km kun) 都不相关。这些线性自由能关系数据支持这样的观点，即这些抑制剂（包括治疗剂 Relenza）不是酶催化水解反应的过渡态模拟物。此外，对于流感酶，在抑制 (Ki) 和 Michaelis (Km) 常数的对数之间观察到相关性（斜率，0.80 ± 0.08）。我们得出结论，Relenza 与流感酶结合的自由能模拟了 Michaelis 复合物中的酶-底物相互作用。因此，对 4-取代唾液酸聚糖抑制剂的流感突变反应可以削弱抑制剂与病毒神经氨酸酶之间的相互作用，而不会同时降低酶催化水解过渡态下底物的结合自由能。目

  DOI：

  10.1021/ja405916q

文献信息

• Oxidative Deamination of <i>N</i>-Acetyl Neuraminic Acid: Substituent Effects and Mechanism
  作者：Szymon Buda、David Crich

  DOI：10.1021/jacs.5b13015

  日期：2016.1.27

  mechanism of the oxidative deamination of the N-nitroso-N-acetyl sialyl glycosides leading with overall retention of configuration to the corresponding 2-keto-3-deoxy-D-glycero-D-galacto-nonulopyranosidonic acid (KDN) glycosides is described, making use of a series of differentially O-protected N-nitroso-N-acetyl sialyl glycosides and of isotopic labeling studies. No evidence is found for stereodirecting participation

  研究 N-亚硝基-N-乙酰基唾液酸糖苷的氧化脱氨机制，从而整体保留相应的 2-酮-3-脱氧-D-甘油-D-半乳糖-壬基吡喃糖苷酸 (KDN)利用一系列差异性 O-保护的 N-亚硝基-N-乙酰基唾液酸糖苷和同位素标记研究描述了糖苷。没有发现 4- 和 7- 位酯基参与立体定向的证据。比较了 4-氨基-4-脱氧和 2-氨基-2-脱氧吡喃己糖苷的氧化脱氨反应，并制定了一个共同机制，涉及吡喃糖苷参与后 1-氧杂双环[3.1.0]己基氧鎓离子的中介作用环氧。通过对 β-硫唾液酸苷的标记研究发现了一条次要反应途径，该途径导致 4-O-乙酰基被冰醋酸交换，冰醋酸在一般氧化脱氨过程中充当外部亲核试剂。提出了一种涉及硫代糖苷在中间体重氮烷水平参与的交换机制。
• Synthesis of C-4-disubstituted analogues of N-acetylneuraminic acid
  作者：Darrin R. Groves、Mark Von Itzstein

  DOI：10.1039/p19960002817

  日期：——

  The synthesis of some novel C-4-disubstituted analogues of N-acetylneuraminic acid has been achieved by nucleophilic opening of the epoxide ring in the acetyl-4,4′-anhydroneuraminic acid derivatives 6 and 7. This has provided the azide 8, the methyl ether 9, the nitrile 10 and the chloride 11 of the 8,9-isopropylidenated β-methyl ketoside of methyl N-acetylneuraminate in moderate to good yields.

  通过亲核打开乙酰基-4,4′-无水神经氨酸衍生物 6 和 7 中的环氧化物环，合成了一些新型的 N-乙酰基神经氨酸 C-4 二取代类似物。这样就得到了叠氮化物 8、甲基醚 9、腈 10 和 N-乙酰神经氨酸甲酯的 8,9-异亚丙基化 β-甲基酮苷的氯化物 11，收率为中等至良好。
• The Synthesis and N.M.R. Investigation of a Methyloxime Derivative of N-Acetylneuraminic Acid
  作者：DR Groves、JC Wilson、M Vonitzstein

  DOI：10.1071/ch9951217

  日期：——

  The synthesis of a novel 4-modified N-acetylneuraminic acid analogue and its structural characterization by n.m.r. spectroscopy are reported.

  报告了一种新型 4-修饰 N-乙酰神经氨酸类似物的合成及其通过 n.m.r. 光谱进行的结构表征。
• Sialic Acid Derivatives Inhibit SiaT Transporters and Delay Bacterial Growth
  作者：Tiago Bozzola、Mariafrancesca Scalise、Christer U. Larsson、Michael C. Newton-Vesty、Caterina Rovegno、Ankita Mitra、Jonathan Cramer、Weixiao Yuan Wahlgren、Partha Radhakrishnan Santhakumari、Richard E. Johnsson、Oliver Schwardt、Beat Ernst、Rosmarie Friemann、Renwick C. J. Dobson、Cesare Indiveri、Jenny Schelin、Ulf J. Nilsson、Ulf Ellervik

  DOI：10.1021/acschembio.2c00321

  日期：2022.7.15

  are urgently needed. Here, we report the structure-based drug design, synthesis, and evaluation in vitro and in cellular systems of sialic acid derivatives able to inhibit the bacterial sialic acid symporter SiaT. We designed and synthesized 21 sialic acid derivatives and screened their affinity for SiaT by a thermal shift assay and elucidated the inhibitory mechanism through binding thermodynamics

  抗生素耐药性是全球关注的主要问题，迫切需要具有机制新颖作用模式的新药。在这里，我们报告了能够抑制细菌唾液酸转运体 SiaT 的唾液酸衍生物在体外和细胞系统中的基于结构的药物设计、合成和评价。我们设计并合成了 21 种唾液酸衍生物，并通过热位移分析筛选了它们对 SiaT 的亲和力，并通过结合热力学、计算方法和抑制动力学研究阐明了抑制机制。与天然底物相比，最有效的化合物具有 180 倍的亲和力，在细菌生长试验中进行了测试，表明耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的细菌生长延迟. 这项研究代表了开发唾液酸摄取抑制剂作为新型抗菌剂的第一个例子和有希望的领先优势。
• Structural variations of N-Acetylneuraminic acid, 12: A new useful approach to 4-epi- and 8-epi-N-Acetylneuraminic acid
  作者：Michael Hartmann、Erich Zbiral

  DOI：10.1007/bf00811129

  日期：1989.10