5'-(O-tert-butyldimethylsilyl)adenosine | 69530-93-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 5'-(O-tert-butyldimethylsilyl)adenosine
• 英文别名: 5'-O-TBDMS-adenosine；(2R,3R,4S,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolane-3,4-diol
• CAS: 69530-93-4
• 化学式: C₁₆H₂₇N₅O₄Si
• 分子量: 381.507
• InChiKey: CJOSHSDHCPNMOJ-SDBHATRESA-N

物化性质

• 熔点：
  178-179 °C
• 沸点：
  560.0±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.39±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.05
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-(O-tert-butyldimethylsilyl)adenosine 在 三(三甲基硅基)硅烷 、 palladium 10% on activated carbon 、 四丁基氟化铵 、 氢气 、 sodium hydroxide 、 1,1'-偶氮(氰基环己烷) 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 2',3'-双脱氧腺苷
  参考文献：
  名称：

  合成 2',3'-双脱氧核苷和 2',3'-Didehydro-2',3'-双脱氧核苷衍生物的可持续方案

  摘要：

  将核糖核苷转化为 2',3'-二脱氧核苷和 2',3'-二脱氢-2',3'-二脱氧核苷衍生物的改进方案，包括抗 HIV 药物司他夫定 (d4T)、扎西他滨 (ddC) 和去羟肌苷 (ddI) 成立。该过程涉及使用环保和低成本的试剂对黄原酸盐进行自由基脱氧。溴乙烷或 3-溴丙腈是制备核糖核苷 2',3'-双黄原酸酯的首选烷化剂。在随后的自由基脱氧反应中，三（三甲基甲硅烷基）硅烷和 1,1'-偶氮二（环己烷甲腈）分别被用来代替有害的 Bu 3 SnH 和 AIBN。此外，在 5'- O的脱保护步骤中，TBAF 取代了樟脑磺酸。-甲硅烷基醚基团和一种酶（腺苷脱氨酶）用于将 2',3'-二脱氧腺苷转化为 2',3'-二脱氧肌苷 (ddI)，产率很高。

  DOI：

  10.3390/molecules27133993
• 作为产物：
  描述：

  2'-O-tosyladenosine 在 咪唑 、 (4,8-dimethoxynaphthyl)propionic acid 、 一水合肼 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 5.7h， 生成 5'-(O-tert-butyldimethylsilyl)adenosine
  参考文献：
  名称：

  Extremely mild and selective method for hydrolysis of tosyl esters by photo-sensitized single electron transfer reactions.

  摘要：

  在光敏条件下，用紫外线（>330 纳米）照射对甲苯磺酸酯会发生水解。在肼存在的乙腈水溶液中，1.5-二甲氧基萘和 (4，8-二甲氧基萘基)丙酸对转化有效。该反应成功地应用于糖和核苷的对甲苯磺酸盐的水解。

  DOI：

  10.1248/cpb.38.2977

文献信息

• Synthesis of 2‘,3‘-Didehydro-2‘,3‘-dideoxynucleosides by Reaction of 5‘-Protected Nucleoside 2‘,3‘-Dimesylates with Telluride Dianion:  A General Route from <i>Cis</i> Vicinal Diols to Olefins
  作者：Derrick L. J. Clive、Philip L. Wickens、Paulo W. M. Sgarbi

  DOI：10.1021/jo9610570

  日期：1996.1.1

  treatment with telluride dianion in the form of the sodium or lithium salt. The method is well-suited to the preparation of unsaturated nucleosides that can be converted into compounds that are believed to be useful in the treatment of AIDS. The deoxygenation is general for vicinal dimesylates that have, or may adopt, a synperiplanar conformation. With straight chain compounds the reaction is stereospecific

  通过用钠或锂盐形式的碲化物二价阴离子处理，将5'-保护的核苷的2'，3'-二甲磺酸酯转化为相应的2'，3'-二氢-2'，3'-二脱氧化合物。该方法非常适合于不饱和核苷的制备，该不饱和核苷可以转化为据信可用于治疗艾滋病的化合物。脱氧通常用于具有或可以采用间平面构象的邻近二甲基酯。对于直链化合物，反应是立体特异性的。在某些情况下，可以用硒化物二价阴离子进行类似但较慢的脱氧。
• The invention of radical reactions. Part XXXI. Diphenylsilane: a reagent for deoxygenation of alcohols via their thiocarbonyl derivatives, deamination via isonitriles, and dehalogenation of bromo- and iodo- compounds by radical chain chemistry
  作者：Derek H.R. Barton、Doo Ok Jang、Joseph Cs. Jaszberenyi

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)87198-2

  日期：1993.8

  Various thionocarbonates and xanthates of alcohols and bis-xanthates of vic-diols are readily deoxygenated to the corresponding hydrocarbons or olefins, while bromides and iodides are dehalogenated with diphenylphenylsilane in good yield.

  各种thionocarbonates和醇的黄原酸盐和二的-xanthates VIC -diols容易脱氧成相应的烃或烯烃，而溴化物和碘化物与以良好的收率diphenylphenylsilane脱卤。
• METHOD FOR SYNTHESIZING RIBONUCLEIC ACID H-PHOSPHONATE MONOMER, AND OLIGONUCLEOTIDE SYNTHESIS IN WHICH SAID MONOMER IS USED
  申请人：GeneDesign, Inc.

  公开号：US20200331945A1

  公开（公告）日：2020-10-22

  The present invention pertains to a method for synthesizing a ribonucleic acid H-phosphonate monomer, and a method for performing oligonucleotide synthesis in which said monomer is used. The present invention pertains to a method for manufacturing an inexpensively manufacturable H-phosphonate nucleoside derivative in which selective protection is provided to position 2′ of a ribonucleoside monomer required in RNA oligonucleotide synthesis. The present invention is characterized in that: hydroxyl groups in position 2′ and position 3′, which have slightly different reactivity, are caused to react with an aromatic acyl halide at low temperature to selectively esterify position 2′; and subsequently the hydroxyl group at position 3′ in one pot is captured by a phosphityl group to prevent position 2′ and position 3′ transfer of the acyl group.

  本发明涉及一种合成核糖核酸H-膦酸酯单体的方法，以及一种在其中使用该单体的寡核苷酸合成方法。本发明涉及一种制造成本低廉的H-膦酸酯核苷衍生物的方法，其中对核糖核苷单体的2′位提供选择性保护，该单体在RNA寡核苷酸合成中所需。本发明的特点在于：在低温下使2′位和3′位的羟基（其反应性略有不同）与芳香酰卤反应，选择性地酯化2′位；随后，在同一反应容器中，通过磷酸酯基捕获3′位的羟基，以防止酰基的2′位和3′位转移。
• Synthesis and structure-activity relationships of 6-substituted 2',3'-dideoxypurine nucleosides as potential anti-human immunodeficiency virus agents
  作者：Chung K. Chu、Giliyar V. Ullas、Lak S. Jeong、Soon K. Ahn、Bogdan Doboszewski、Zhi X. Lin、J. Warren Beach、Raymond F. Schinazi

  DOI：10.1021/jm00168a006

  日期：1990.6

  In order to study the structure-activity relationships of 2',3'-dideoxypurine nucleosides as potential anti-HIV agents, various 6-substituted purine analogues have been synthesized and examined in virus-infected and uninfected human peripheral blood mononuclear cells. N6-methyl-2',3'-dideoxyadenosine (D2MeA, 7a) was initially synthesized from adenosine via 2',3'-O-bisxanthate 3. As extension of this

  为了研究2'，3'-二脱氧嘌呤核苷作为潜在的抗HIV药物的构效关系，已经合成了多种6-取代的嘌呤类似物，并在病毒感染和未感染的人外周血单核细胞中进行了研究。N6-甲基-2'，3'-二脱氧腺苷（D2MeA，7a）最初是通过2'，3'-O-双黄药3由腺苷合成的。由于该反应扩展到其他N6-取代的化合物失败，因此采用了全合成方法利用2'，3'-二脱氧核糖衍生物9合成其他嘌呤核苷。通过与N6-甲基腺嘌呤23缩合，由合适的碳水化合物24合成了N6-甲基-2'，3'-二脱氧腺苷，2'-氟阿拉伯呋喃糖基类似物32（D2MeFA）的酸稳定衍生物。N6-甲基衍生物（D2MeA）7a被证明是最有效的抗病毒药物之一。对于6个取代的化合物，其效力顺序为NHMe大于NH2大于Cl约N（Me）2大于SMe大于OH约NHEt大于SH大于NHBn约H。 2'，3'-二脱氧嘌呤核苷的6位可能决定这些化合物的抗病毒活性。发现酸
• Novel Synthetic Approach to Multibenzoylated Nucleosides
  作者：Xue‐Feng Zhu、A. Ian Scott

  DOI：10.1080/00397910801916280

  日期：2008.4

  Abstract An improved and highly efficient synthetic approach to multibenzoylated nucleosides bearing free 5′‐hydroxyl groups is described here. By employing t-butyldimethylsilyl (TBDMS) rather than the more commonly used dimethoxytrityl (DMTr) as a temporary 5′‐OH protecting group of the starting nucleoside, this methodology provides the expected products in nearly quantitative yields, thereby substantially

  摘要 这里描述了一种改进的、高效的带有游离 5'-羟基的多苯甲酰化核苷的合成方法。通过使用叔丁基二甲基甲硅烷基 (TBDMS) 而不是更常用的二甲氧基三苯甲基 (DMTr) 作为起始核苷的临时 5'-OH 保护基团，该方法以接近定量的产率提供了预期的产品，从而大大降低了成本和工作量的合成。