琼脂糖 | 9012-36-6

• 物质功能分类: 生物化工 - 糖类化合物 - 多糖
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: 琼脂糖
• 中文别名: 琼脂糖ME
• 英文名称: Agarose
• 英文别名: (2S,3R,4S,5R,6R)-2-[[(1S,3S,4S,5S,8R)-3-[(2S,3R,4S,5S,6R)-2-[[(1S,3R,4S,5S,8R)-3,4-dihydroxy-2,6-dioxabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]oxy]-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-4-hydroxy-2,6-dioxabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]oxy]-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5-triol
• CAS: 9012-36-6
• 化学式: C₂₄H₃₈O₁₉
• 分子量: 630.5
• InChiKey: MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N

物化性质

• 熔点：
  ≤90 °C (4% in water)(lit.)
• 沸点：
  100℃
• 密度：
  1.00 g/mL at 20 °C
• 闪点：
  38 °C
• 溶解度：
  H2O：20 mg/mL 热，略微浑浊，非常淡黄色
• LogP：
  -4.988 (est)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6.5
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  285
• 氢给体数：
  10
• 氢受体数：
  19

安全信息

• TSCA：
  Yes
• 危险品标志：
  Xi
• 安全说明：
  S16,S26,S36
• 危险类别码：
  R10,R36/37/38
• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  39139000

制备方法与用途

琼脂糖简介

琼脂糖是一种由D-半乳糖和3,6-内醚-L-半乳糖构成的链状中性多糖，结构单元中含有羟基官能团。这些羟基可以与结构单元中的氢原子及链段周围的水分子形成氢键。

主要性质

在低温下，琼脂糖以双螺旋方式相互缠绕，依靠氢键作用紧密排列成凝胶，呈现白色浑浊状态；而在高温时，这种氢键被破坏，结构转变为无规线团分散于水中，溶液变得澄清透明。因此，它是一种具有特殊温度响应性的聚合物。

琼脂糖凝胶性能

琼脂糖通常在90℃以上的水温下溶解，在35-40℃时会形成良好的半固体状凝胶。这种特性是其多种用途的基础。凝胶强度越高，性能越好，质量较好的琼脂糖强度通常超过1200克/cm²（1%的胶浓度）。这些性质主要由存在的氢键决定；任何能破坏氢键的因素都会导致凝胶性的破坏。

电泳优势 操作简便

• 琼脂糖凝胶电泳操作简单，电泳速度快。样品无需事先处理即可进行电泳。

图谱清晰、分辨率高

• 琼脂糖凝胶结构均匀且含水量高（约98%-99%），类似于自由电泳；样品扩散更自由，吸附极微，因此电泳图谱清晰，分辨率高，重复性好。

易于检测与定量测定

• 透明无紫外吸收特性使得电泳过程和结果可以直接用紫外光灯检测及定量测定。

区带易染色、便于定量测定

• 电泳后区带容易染色，并且样品易于洗脱，适用于定量测定。制成干膜也可长期保存。

制备方法

一种低凝固温度琼脂糖的制备步骤如下：

1. 将4.0g琼脂糖粉末溶解于90℃、150mL去离子水中，配成琼脂糖溶液。
2. 将上述琼脂糖溶液冷却至82℃后，加入0.9mL硼氢化钠的氢氧化钠溶液（浓度为4.4mol/L，溶剂为10.0～20.0mol/LNaOH）进行还原反应15分钟。颜色由浅绿色变为无色透明时终止反应。
3. 向步骤2所得溶液中加入40mL 3.8mol/L氢氧化钠溶液用于碱化处理。
4. 将步骤3的溶液迅速冷却至5℃，边搅拌边在60min内缓慢滴加20～60%（v/v）环氧乙烷水溶液，使环氧乙烷浓度达到1.0～5.0wt%，再搅拌反应60分钟。
5. 向步骤4所得溶液中加热至70℃，边搅拌边滴加3.0mol/L乙酸调节pH值为7.2。
6. 将步骤5的溶液迅速冷却至45℃，加入热异丙醇进行醇沉分级（静置1.0～3.0小时）。
7. 离心过滤所得沉淀物，并用体积浓度为60%的异丙醇浸没后粉碎。再以异丙醇洗涤4次、压榨脱水得滤饼。
8. 将上述滤饼置于55℃空气干燥箱中恒温干燥12小时，经粉碎与200目筛网过筛即得所述低凝固温度的琼脂糖。该琼脂糖熔化温度为60.0℃、凝固温度为26.5℃、凝胶强度达265g/cm²。

用途

• 琼脂糖可用于DNA、脂蛋白和免疫电泳，以及生化研究中的底物。
• 在生物学、免疫学、生物化学及微生物学领域中应用广泛。
• 临床医学上用于乙型肝炎抗原（HAA）测定、血电泳分析、甲胎球蛋白测定等项目。
• 对于肝炎、肝癌和心血管疾病的诊断也有重要价值。

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  、 氯化钠 、 无水氯化钙 、 、 、 水 、 、 neoagarotetraose 在 琼脂糖 、 neoagarotetraose 作用下， 以 三羟甲基氨基甲烷盐酸盐 为溶剂， 反应 0.85h， 以produces 1 μmol of agarotetraose or neoagarotetraose in 10 minutes的产率得到琼脂糖
  参考文献：
  名称：

  Agarase and gene thereof

  摘要：

  高效生产琼脂低聚糖的方法；一种具有琼脂酶活性的多肽，可用于高效提取琼脂凝胶中的核酸等物质；该多肽的氨基酸序列；编码该多肽的基因；生产该多肽的方法；生产琼脂低聚糖的方法；以及从琼脂凝胶中提取核酸等物质的方法。

  公开号：

  US07329524B2
• 作为试剂：
  描述：

  、 氯化钠 、 无水氯化钙 、 、 、 水 、 、 neoagarotetraose 在 琼脂糖 、 neoagarotetraose 作用下， 以 三羟甲基氨基甲烷盐酸盐 为溶剂， 反应 0.85h， 以produces 1 μmol of agarotetraose or neoagarotetraose in 10 minutes的产率得到琼脂糖
  参考文献：
  名称：

  Agarase and gene thereof

  摘要：

  高效生产琼脂低聚糖的方法；一种具有琼脂酶活性的多肽，可用于高效地从琼脂凝胶中提取核酸等物质；该多肽的氨基酸序列；编码该多肽的基因；生产该多肽的方法；生产琼脂低聚糖的方法；以及从琼脂凝胶中提取核酸等物质的方法。

  公开号：

  US20040132036A1

文献信息

• AGARASE AND GENE THEREOF
  申请人：TOMONO Jun

  公开号：US20080096249A1

  公开（公告）日：2008-04-24

  Production of efficiently producing agaro-oligosaccharide; a polypeptide having an agarase activity which is usable in, for example, efficiently extracting a substance such as a nucleic acid from an agarose gel; the amino acid sequence of the polypeptide; a gene encoding the polypeptide; a process for producing the polypeptide; a process for producing agaro-oligosaccharide; and a process for extracting a substance such as a nucleic acid from an agarose gel.

  高效生产琼脂低聚糖的方法；具有琼脂酶活性的多肽，可用于例如高效地从琼脂凝胶中提取核酸等物质；多肽的氨基酸序列；编码多肽的基因；生产多肽的方法；生产琼脂低聚糖的方法；从琼脂凝胶中提取核酸等物质的方法。
• METHODS FOR PHENOTYPING OF INTACT BONES BY TISSUE CLEARING AND STAINING
  申请人：California Institute of Technology

  公开号：US20160131560A1

  公开（公告）日：2016-05-12

  In various embodiments, the present application teaches methods and kits for clearing and optionally subsequently visualizing tissue containing bone. In some embodiments, the method includes serially incubating cleared bone in refractive index matching solutions with progressively higher refractive indexes. In some embodiments, the methods teach immunolabeling and/or staining tissue containing bone and optionally visualizing the immunolabeled and/or stained tissue containing bone.

  在各种实施例中，本申请教授了清除和选择性地可视化含骨组织的方法和工具包。在某些实施例中，该方法包括将已清除的骨骼连续孵育在折射率匹配溶液中，其折射率逐渐增高。在某些实施例中，该方法教授了免疫标记和/或染色含骨组织，并可选择性地可视化免疫标记和/或染色的含骨组织。
• IgG-Fc FRAGMENT AND PROCESS FOR PRODUCING SAME
  申请人：Otsuka Chemical Co., Ltd.

  公开号：EP2397544A1

  公开（公告）日：2011-12-21

  Disclosed is a full-length IgG-Fc fragment having a substantially homogeneous sugar chain added thereto. Also disclosed is a process for producing the full-length IgG-Fc fragment. Specifically disclosed is an IgG-Fc fragment having a sugar chain added thereto, in which the sugar chain is added to the same position as that in a naturally occurring IgG-Fc fragment, any one amino acid residue selected from 1st to 30th amino acid residues from the sugar chain-added amino acid residue on the N-terminal side of the sugar chain-added amino acid residue is substituted by a Cys residue and at least one Met residue is substituted by an amino acid residue other than a Met residue. Also specifically disclosed is a process for producing the IgG-Fc fragment.

  本发明公开了一种全长 IgG-Fc 片段，该片段中添加了基本均匀的糖链。还公开了一种生产全长 IgG-Fc 片段的工艺。具体公开了一种具有糖链的 IgG-Fc 片段，其中糖链被添加到与天然存在的 IgG-Fc 片段中相同的位置，在糖链添加的氨基酸残基的 N 端侧，从糖链添加的氨基酸残基的第 1 至 30 个氨基酸残基中任选一个氨基酸残基被 Cys 残基取代，至少一个 Met 残基被 Met 残基以外的氨基酸残基取代。还特别公开了一种生产IgG-Fc片段的工艺。
• Whole-body tissue stabilization and selective extractions via tissue-hydrogel hybrids for high resolution intact circuit mapping and phenotyping
  申请人：California Institute of Technology

  公开号：US10794802B2

  公开（公告）日：2020-10-06

  In various embodiments, the present application teaches methods for tissue clearing in which tissues are rendered macromolecule-permeable and optically-transparent, thereby exposing their cellular structure with intact connectivity. In some embodiments, the present application teaches ePACT, which is a protocol for enhanced tissue clearing via expansion. In some embodiments, the present application teaches visualizing a tissue that has been expanded via ePACT.

  在各种实施方案中，本申请教导了组织清除方法，在这种方法中，组织具有大分子渗透性和光学透明性，从而暴露出具有完整连接性的细胞结构。 在一些实施方案中，本申请教导了 ePACT，这是一种通过扩张增强组织清除的方案。 在一些实施方案中，本申请教导通过 ePACT 对已扩张的组织进行可视化。
• Agrobacterium-mediated and particle bombardment transformation method for cowpea and dry bean meristem explants
  申请人：Wisconsin Alumni Research Foundation

  公开号：US11377662B2

  公开（公告）日：2022-07-05

  The present disclosure provides methods for the stable transformation of meristem explants from cowpeas (Vigna unguiculata) and dry beans (Phaseolus vulgaris).

  本公开提供了对豇豆（Vigna unguiculata）和干豆（Phaseolus vulgaris）的茎尖外植体进行稳定转化的方法。