3'-叠氮基-3'-脱氧腺苷 | 58699-62-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: 3'-叠氮基-3'-脱氧腺苷
• 英文名称: 3'-Azido-3'-deoxyadenosine
• 英文别名: (2R,3R,4S,5S)-2-(6-aminopurin-9-yl)-4-azido-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
• CAS: 58699-62-0
• 化学式: C₁₀H₁₂N₈O₃
• 分子量: 292.257
• InChiKey: HTWSTKVLFZRAPM-QYYRPYCUSA-N

物化性质

• 熔点：
  212-214 °C(Solv: water (7732-18-5))

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.6
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  134
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  9

安全信息

• 储存条件：
  存储条件：2-8°C，干燥，密闭。

制备方法与用途

3'-叠氮基-3'-脱氧腺苷是一种嘌呤核苷类似物，具有广泛的抗肿瘤活性，特别针对惰性淋巴系统恶性肿瘤。其抗癌机制主要通过抑制DNA合成和诱导细胞凋亡来实现。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-叠氮基-3'-脱氧腺苷 在 三甲基氯硅烷 、 氨 、 三苯基膦 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 12.67h， 生成 氨基核苷嘌呤霉素
  参考文献：
  名称：

  腺苷合成嘌呤霉素和结核菌素合成7-脱氮嘌呤霉素，以及7-氮杂/脱氮对的生物学比较。

  摘要：

  用叔丁基二苯基甲硅烷基氯保护2'，3'-脱水腺苷（O5'），并用二甲基溴化硼进行环氧化物开环，得到3'-溴-3'-脱氧木糖异构体，将其用异氰酸苄酯处理，得到2'-O- （N-苄基氨基甲酰基）衍生物。闭环得到恶唑烷酮，并且随后的脱保护结束了通往3'-氨基-3'-脱氧腺苷的有效途径。抗生素结核菌素的类似治疗[7-脱氮杂苷; 4-氨基-7-（β-D-呋喃呋喃糖基）吡咯并[2，3-d]嘧啶]得到3′-氨基-3′-脱氧结核精。3'-氨基官能团的三氟乙酰化，用N，N'-双[（二甲基氨基）亚甲基]肼将杂环氨基加工成（1,2,4-三唑-4-基）环，并用二甲胺进行亲核芳族取代，得到嘌呤霉素氨基核苷[9-（3-氨基-3-脱氧-β-D-呋喃呋喃糖基）-6-（二甲基氨基）嘌呤]及其7-脱氮类似物。氨基酰化[BOC-（4-甲氧基-L-苯丙氨酸）]和脱保护得到嘌呤霉素和7-脱氮嘌呤霉素。大多数反应在环境温度或低于环境

  DOI：

  10.1021/jo010935d
• 作为产物：
  描述：

  9-(2,5-di-O-tert-butyldimethylsilyl-β-D-erythro-pentofuran-3-ulosyl)adenosine 在 4-二甲氨基吡啶 、 氟化铵 、 sodium tetrahydroborate 、 sodium azide 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 3'-叠氮基-3'-脱氧腺苷
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of non-hydrolyzable substrate analogs for Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase

  摘要：

  Non-hydrolyzable substrate analogs for tRNA-dependent amidotransferase, 2'- or 3'-aspartyl or -glutamyl adenosine, were synthesized from adenosine without protection of the adenine base. The hydroxyl groups of adenosine were selectively protected, followed by a series of oxidation/reductions to alter the stereochemistry. DFT calculations revealed the driving forces for the ketone hydrate formation at C-2', but not the C-3' carbon during the oxidation step. Subsequently, triflation and azide replacement yielded azidoadenosines, which were coupled to protected amino acids after deprotection and reduction. After global deprotection, the target substrate analogs were obtained in 2-14% overall yields from adenosine. (C) 2014 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2014.09.060

文献信息

• [EN] MODIFIED OLIGONUCLEOTIDES AND METHODS OF USE<br/>[FR] OLIGONUCLÉOTIDES MODIFIÉS ET MÉTHODES D'UTILISATION
  申请人：ALIOS BIOPHARMA INC

  公开号：WO2018053185A1

  公开（公告）日：2018-03-22

  Modified oligonucleotides comprising modifications at the 2' and/or 3' positions(s) along with methods of making and use, e.g., against HBV are disclosed.

  修改的寡核苷酸包括在2'和/或3'位置进行修饰的方法以及制备和使用方法，例如用于对抗HBV的方法。
• [EN] S-ANTIGEN TRANSPORT INHIBITING OLIGONUCLEOTIDE POLYMERS AND METHODS<br/>[FR] POLYMÈRES OLIGONUCLÉOTIDIQUES INHIBANT LE TRANSPORT DE L'ANTIGÈNE S ET MÉTHODES
  申请人：ALIGOS THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2021119325A1

  公开（公告）日：2021-06-17

  Various embodiments provide STOPS™ polymers that are S-antigen transport inhibiting oligonucleotide polymers, processes for making them and methods of using them to treat diseases and conditions. In some embodiments the STOPS™ modified oligonucleotides include an at least partially phosphorothioated sequence of alternating A and C units having modifications as described herein. The sequence independent antiviral activity against hepatitis B of embodiments of STOPS™ modified oligonucleotides, as determined by HBsAg Secretion Assay, is an EC50 that is less than 100 nM.

  各种实施方式提供了STOPS™聚合物，这些聚合物是S-抗原转运抑制寡核苷酸聚合物，提供了制备它们的方法以及使用它们治疗疾病和症状的方法。在某些实施方式中，STOPS™修饰的寡核苷酸包括至少部分磷硫酸酯化的交替A和C单元序列，具有如本文所述的修饰。通过HBsAg分泌测定确定的STOPS™修饰的寡核苷酸对乙型肝炎的序列无关抗病毒活性，其EC50小于100 nM。
• [EN] MODIFIED NUCLEOSIDE PHOSPHORAMIDITES<br/>[FR] PHOSPHORAMIDITES DE NUCLÉOSIDES MODIFIÉS
  申请人：ALIOS BIOPHARMA INC

  公开号：WO2019053659A1

  公开（公告）日：2019-03-21

  The present disclosure relates to compounds and compositions containing 5'-phosphoramidite nucleoside monomers of formulae (I) and (II), and methods of making and use, wherein the substituents are as defined in the appended claims.

  本发明公开涉及包含式(I)和式(II)的5'-磷酰胺基核苷单体的化合物和组合物，以及它们的制备和使用方法，其中取代基如所附权利要求中所定义。
• Investigation of reactions postulated to occur during inhibition of ribonucleotide reductases by 2′-azido-2′-deoxynucleotides
  作者：Thao P. Dang、Adam J. Sobczak、Alexander M. Mebel、Chryssostomos Chatgilialoglu、Stanislaw F. Wnuk

  DOI：10.1016/j.tet.2012.04.050

  日期：2012.7

  Reduction of the azido group occurred to give 3′-amino-3′-deoxythymidine, which was postulated to occur with thiyl radicals generated by treatment of 3′-azido-3′-deoxy-5′-O-(2,3-dimercaptopropanoyl)thymidine with 2,2′-azobis-(2-methyl-2-propionamidine) dihydrochloride. Gamma radiolysis of N2O-saturated aqueous solutions of AZT and cysteine produced 3′-amino-3′-deoxythymidine and thymine most likely by

  合成在 C2' 或 C5' 具有硫醇或连位二硫醇取代基的模型 3'-叠氮基-3'-脱氧核苷，以研究假定在 2'-叠氮基-2'-脱氧核苷酸抑制核糖核苷酸还原酶过程中发生的反应。5'-(叔丁基二苯基甲硅烷基)-3'-叠氮基-3'-脱氧腺苷和 3'-叠氮基-3'-脱氧胸苷 (AZT) 与2,3- S-异亚丙基-2,3-二巯基丙酸或N 的酯化- Boc - S -trityl-L-cysteine 和脱保护得到 3'-azido-3'-deoxy-2'- O -(2,3- dimercaptopropanoyl orcysteinyl )adenosine 和 3'-azido-3'-deoxy- 5′- O-(2,3-二巯基丙酰基或半胱氨酰基)胸苷类似物。密度泛函计算预测，生成的硫自由基与此类模型化合物上的叠氮基之间的分子内反应将放热 33.6-41.2 kcal/mol，并且具有 10.4-13
• Synthesis and Anti-HIV Activity of <i>β</i>-D-3′-Azido-2′,3′-unsaturated Nucleosides and <i>β</i>-D-3′-Azido-3′-deoxyribofuranosylnucleosides
  作者：Srinivas Gadthula、Chung K. Chu、Raymond F. Schinazi

  DOI：10.1080/15257770500267170

  日期：2005.9.1

  discovery of 3′-azido-3′-deoxythymidine (AZT) and 2′,3′-didehydro-2′,3′-dideoxythymidine (d4T) as potent and selective inhibitors of the replication of human immunodeficiency virus (HIV), there has been a growing interest for the synthesis of 2′,3′-didehydro-2′,3′-dideoxynucleosides with electron withdrawing groups on the sugar moiety. Here we described an efficient method for the synthesis of such nucleoside

  自从发现 3'-azido-3'-deoxythymidine (AZT) 和 2',3'-didehydro-2',3'-dideoxythymidine (d4T) 作为人类免疫缺陷病毒 (HIV) 复制的有效和选择性抑制剂以来，人们对合成在糖部分具有吸电子基团的 2',3'-didehydro-2',3'-dideoxynucleoside 越来越感兴趣。在这里，我们描述了一种合成具有 AZT 和 d4T 结构特征的核苷类似物的有效方法。关键中间体 3-azido-1,2-bis-O-acetyl-5-O-benzoyl-3-deoxy-D-ribofuranose, 5 由市售的 D-木糖分五步合成，其中一系列嘧啶和嘌呤核苷以高产率合成。使用适当的化学修饰将所得的受保护核苷转化为目标核苷。