((3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-benzamido-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)methyl 4-methylbenzenesulfonate | 39947-05-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: ((3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-benzamido-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)methyl 4-methylbenzenesulfonate
• 英文别名: 6-N-Benzoyl-O-2',3'-isopropyliden-O-5'-p-tosyl-adenosin；N6-benzoyl-2',3'-O-isopropylidene-5'-O-[(4-methylphenyl)sulfonyl]adenosine；N⁶-benzoyl-O^{2'_,O3'_{-isopropylidene-O}5'}-(toluene-4-sulfonyl)-adenosine；Adenosine, N-benzoyl-2a(2),3a(2)-O-(1-methylethylidene)-, 5a(2)-(4-methylbenzenesulfonate)；[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(6-benzamidopurin-9-yl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-6-yl]methyl 4-methylbenzenesulfonate
• CAS: 39947-05-2
• 化学式: C₂₇H₂₇N₅O₇S
• 分子量: 565.607
• InChiKey: WYHWWCOCEMAHCC-RKCWLVDCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.7
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  152
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ((3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-benzamido-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)methyl 4-methylbenzenesulfonate 在 palladium on activated charcoal sodium azide 、 氢气 作用下， 以 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 5-氨基-5-脱氧-2,3-O-(1-甲基亚乙基)-腺苷酸
  参考文献：
  名称：

  Deamination of 5′-substituted-2′,3′-isopropylidene adenosine derivatives catalyzed by adenosine deaminase (ADA, EC 3.5.4.4) and complementary enzymatic biotransformations catalyzed by adenylate deaminase (AMPDA, EC 3.5.4.6): a viable route for the preparation of 5′-substituted inosine derivatives

  摘要：

  Adenosine deaminase (ADA) catalyzes the deamination of 2',3'-isopropylidene adenosine and the corresponding 5'-amino derivative in a 3% dimethylsulfoxide aqueous solution. Whereas ADA is unable to convert other 5'-substituted derivatives (acetate, acetamido, azide), the enzyme adenylate deaminase (AMPDA) accepts all the above compounds as substrates for their biotransformation to the corresponding 5'-substituted inosine derivatives. (C) 2002 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(02)00575-6
• 作为产物：
  描述：

  N6-苯甲酰基腺苷 在 4-二甲氨基吡啶 、 对甲苯磺酸 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 丙酮 为溶剂， 反应 10.0h， 生成 ((3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-benzamido-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)methyl 4-methylbenzenesulfonate
  参考文献：
  名称：

  [EN] COMPOSITIONS AND METHODS OF MODULATING THE IMMUNE RESPONSE BY ACTIVATING ALPHA PROTEIN KINASE 1
  [FR] COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS DE MODULATION DE LA RÉPONSE IMMUNITAIRE PAR ACTIVATION DE LA PROTÉINE KINASE ALPHA 1

  摘要：

  该披露提供了与激活α-激酶1（ALPK1）相关的组合物和方法，用于调节免疫应答，治疗或预防癌症、感染、炎症和相关疾病和疾病，以及增强对靶抗原的免疫应答。该披露还提供了式（I）的杂环化合物作为α蛋白激酶1（ALPK1）的激动剂，并其在激活ALPK1、调节免疫应答和治疗癌症等疾病中的应用，其中A1、A2、L1、L2、L3、Z1、Z2、W1、W2、R1、R2、R3、R4、R5、R6和R7在此定义。

  公开号：

  WO2019080898A1

文献信息

• Efficient removal of sugar O-tosyl groups and heterocycle halogens from purine nucleosides with sodium naphthalenide
  作者：Elzbieta Lewandowska、Vladimir Neschadimenko、Stanislaw F. Wnuk、Morris J. Robins

  DOI：10.1016/s0040-4020(97)00313-x

  日期：1997.5

  Sodium naphthalenide effects removal of 2′-, 3′-, or 5′-O-tosyl groups from the sugar, and 2-, 6-, or 8-halogens from purine nucleosides. An improved tosyl protection strategy was developed for the synthesis of 9-(3-deoxy-3-fluoro-β-D-xylofuranosyl)adenine from 2′,5′-di-O-tosyladenosine.

  萘二甲酸钠可去除糖中的2 '-，3'-或5'- O-甲苯磺酰基，并去除嘌呤核苷中的2-，6-或8-卤素。开发了一种改进的甲苯磺酰基保护策略，用于从2'，5'-二-O-甲苯磺酰基腺苷合成9-（3-脱氧-3-氟-β-D-木呋喃糖基）腺嘌呤。
• Oligonucleotide Analogues with Integrated Bases and Backbone. Part 17
  作者：Anne Ritter、Daniel Egli、Bruno Bernet、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/hlca.200890071

  日期：2008.4

  The formation of cyclic duplexes (pairing) of known oxymethylene-linked self-complementary U*[o]A(*) dinucleosides contrasts with the absence of pairing of the ethylene-linked U*[ca]A(*) analogues. The origin of this difference, and the expected association of U*[x]A(*) and A*[x]U(*) dinucleosides with x=CH2, O, or S was analysed. According to this analysis, pairing occurs via constitutionally isomeric

  已知甲醛联自身互补U *的环状双链（配对）的形成[O]甲（ * ）二核苷对比与不存在乙烯联U *的配对的并[c一一种（ * ）的类似物。分析了这种差异的起源，以及预期的U * [x] A （ * ）和A * [x] U （ * ）双核苷与x = CH 2，O或S的缔合。根据此分析，配对通过结构异构的Watson–Crick，反向Watson – Crick，Hoogsteen或反向发生Hoogsteen H键合线性双工。它们中的每一个可以产生三个非对映异构的环状双链体，并且它们中的每个可以采用三个主要的构象。分析了x = CH 2，O或S的所有构象异构体的相对稳定性。具有x = CH 2的U * [x] A （ * ）二核苷不会形成稳定的环状双链体，具有x = O的二核苷可能会形成具有关于C（4'）C（5'）键的gg构象的环状双链体， x ＝ S的二核苷可以形成关于该键具有gt-构象的环状双链体。
• Determinants of cofactor binding to DNA methyltransferases: insights from a systematic series of structural variants of S-adenosylhomocysteine
  作者：Helen M. Cohen、Andrew D. Griffiths、Dan S. Tawfik、David Loakes

  DOI：10.1039/b415446k

  日期：——

  tested them for the ability to inhibit methylation by HhaI and HaeIII DNA methyltransferase. Comparison of the Ki values highlights the structural determinants for cofactor binding, and indicates which nucleoside and amino acid functional groups contribute significantly to AdoMet binding. An understanding of the binding of AdoHyc to methyltransferases will greatly assist the design of AdoMet inhibitors

  S-腺苷甲硫氨酸（AdoMet）是一种常用的辅因子，在其参与的各种反应中仅次于ATP。它是大多数甲基转移反应中的甲基供体，包括DNA，RNA，蛋白质和小分子的甲基化。几乎所有结构特征化的甲基转移酶都具有保守的AdoMet依赖性甲基转移酶折叠，其中AdoMet以相同的方向结合。虽然辅助因子和甲基转移酶之间的潜在相互作用已从晶体结构中推断出来，但尚未系统地研究每个官能团对结合的贡献。为了探索结合相互作用，我们合成了甲基转移酶抑制剂S-腺苷同型半胱氨酸（AdoHcy）的一系列七个类似物，每个类似物包含一个修饰，并测试了它们抑制HhaI和HaeIII DNA甲基转移酶甲基化的能力。Ki值的比较突出了辅因子结合的结构决定因素，并指出了哪些核苷和氨基酸官能团对AdoMet结合起了重要作用。对AdoHyc与甲基转移酶结合的理解将大大有助于AdoMet抑制剂的设计。
• Oligonucleotide Analogues with Integrated Bases and Backbones. Part 24
  作者：Katja Chiesa、Alyena Shvoryna、Bruno Bernet、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/hlca.201000011

  日期：2010.4

  Inspection of Maruzen models and force‐field calculations suggest that oligonucleotide analogues integrating backbone and bases (ONIBs) with an aminomethylene linker form similar cyclic duplexes as the analogous oxymethylene linked dinucleosides. The self‐complementary adenosine‐ and uridine‐derived aminomethylene‐linked A*[n]U dinucleosides 15–17 were prepared by an aza‐Wittig reaction of the aldehyde

  对Maruzen模型和力场计算的检查表明，整合有骨架和碱基（ONIB）与氨基亚甲基接头的寡核苷酸类似物与甲醛与二甲基核苷类似，形成了类似的环状双链体。自身互补腺苷和尿苷衍生的氨基亚甲基联A * [ Ñ ] V二核苷15 - 17通过氮杂制备维蒂希的醛的反应10与叠氮化物衍生的亚氨基正膦6。序列异构U * [ Ñ ]甲二核苷18 - 20类似地从醛制备3和叠氮化12。的Ñ -乙胺5，乙酰胺7和14，和胺13，制备作为用于二核苷的构象分析的引用。与计算结果相反，N-乙胺5以分子内H键合的羟基亚氨基互变异构体形式存在。通过1 H-NMR和CD光谱研究了这些二核苷在CDCl 3中的缔合。A * [ n ] U二核苷16和17的缔合作用比序列异构体19和20的缔合作用更强; 16个环状双链体优先形成Watson – Crick型碱基对，而17、19和20则同时显示Watson – Crick型和Ho
• Compositions and methods of modulating the immune response by activating alpha protein kinase 1
  申请人：Shanghai Yao Yuan Biotechnology Co., Ltd.

  公开号：US11149051B2

  公开（公告）日：2021-10-19

  The disclosure provides compositions and methods related to activating alpha-kinase 1 (ALPK1) for modulating an immune response and treating or preventing cancer, infection, inflammation and related diseases and disorders as well as potentiating an immune response to a target antigen. The disclosure also provides heterocyclic compounds of formula (I) as agonists of alpha protein kinase 1 (ALPK1) and their use in activating ALPK1, modulating an immune response and treating diseases such as cancer, wherein A1, A2, L1, L2, L3, Z1, Z2, W1, W2, R1, R2, R3, R4, R5, R6 and R7 are defined herein.

  本公开提供了与激活α蛋白激酶1（ALPK1）有关的组合物和方法，用于调节免疫反应和治疗或预防癌症、感染、炎症及相关疾病和失调，以及增强对靶抗原的免疫反应。本公开还提供了作为α蛋白激酶1（ALPK1）激动剂的式(I)杂环化合物及其在激活ALPK1、调节免疫应答和治疗癌症等疾病中的用途，其中A1、A2、L1、L2、L3、Z1、Z2、W1、W2、R1、R2、R3、R4、R5、R6和R7在本文中定义。