3',5'-O-(di-tert-butylsilanediyl)uridine | 97219-04-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 3',5'-O-(di-tert-butylsilanediyl)uridine
• 英文别名: 1-((4AR,6R,7R,7aS)-2,2-di-tert-butyl-7-hydroxytetrahydro-4H-furo[3,2-d][1,3,2]dioxasilin-6-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione；1-[(4aR,6R,7R,7aS)-2,2-ditert-butyl-7-hydroxy-4a,6,7,7a-tetrahydro-4H-furo[3,2-d][1,3,2]dioxasilin-6-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 97219-04-0
• 化学式: C₁₇H₂₈N₂O₆Si
• 分子量: 384.505
• InChiKey: GRBQGEFUMJONLP-FMKGYKFTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.25
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.76
• 拓扑面积：
  97.3
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3',5'-O-(di-tert-butylsilanediyl)uridine 在 potassium hydrogen bifluoride 、 sodium tert-pentoxide 、 戴斯-马丁氧化剂 、 间氯过氧苯甲酸 作用下， 以 乙醚 、 二氯甲烷 、 乙二醇甲醚 、 苯 为溶剂， 反应 129.0h， 生成 3',5'-di-O-acetyl-2'-C-α-acetyloxymethyl-2,2'-anhydro-1-(β-D-arabinofuranosyl)uracil
  参考文献：
  名称：

  2'-C-β-氟甲基尿苷的合成。

  摘要：

  [反应：见正文]2'-C-β-氟甲基尿苷（17）既是潜在的重要生物剂，又是生化分析的工具。在这里，我们描述了从尿苷开始的该化合物的首次合成。关键步骤包括用甲氧基乙氧基甲基（MEM）氯化物保护尿嘧啶碱，转化为相应的2'-C-α-环氧化物，以及用氟化钾/氟化氢选择性氧化环氧乙烷环。3'-和5'-羟基的随后乙酰化使得能够使用B-溴儿茶酚硼烷去除MEM。脱乙酰基产生母体核苷2'-C-β-氟甲基尿苷。

  DOI：

  10.1021/ol027364b
• 作为产物：
  描述：

  二叔丁基氯硅烷 在 silver trifluoromethanesulfonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.07h， 生成 3',5'-O-(di-tert-butylsilanediyl)uridine
  参考文献：
  名称：

  Furusawa, Kiyotaka; Ueno, Katsuhiko; Katsura, Tatsuo, Chemistry Letters, 1990, p. 97 - 100

  摘要：

  DOI：

文献信息

• An efficient preparation of protected ribonucleosides for phosphoramidite RNA synthesis
  作者：Vladimir Serebryany、Leonid Beigelman

  DOI：10.1016/s0040-4039(02)00181-8

  日期：2002.3

  An efficient synthesis of protected ribonucleosides useful for phosphoramidite RNA synthesis is described. Di-t-butylsilylene group was employed for simultaneous protection of 3′- and 5′-hydroxyl functions of nucleoside. Subsequent silylation of free 2′-OH group followed by introduction of suitable protection on the base moiety, removal of cyclic silyl protection and tritylation of 5′-OH gave target

  描述了可用于亚磷酰胺RNA合成的受保护的核糖核苷的有效合成。二吨-butylsilylene组用于和的3'-保护同时核苷的5'位羟基的功能。随后将游离的2'-OH基团进行甲硅烷基化，然后在碱基部分上引入适当的保护，除去环甲硅烷基的保护基团并进行5'-OH的三苯甲基化反应，目标化合物的总收率为60-66％。
• Synthesis of 2′-<i>O</i>-Substituted Ribonucleosides
  作者：V. Serebryany、L. Beigelman

  DOI：10.1081/ncn-120022724

  日期：2003.10

  efficient synthesis of 2'-O-substituted ribonucleosides, including 2'-O-TBDMS and 2'-O-TOM protected as well as 2'-O-Me and 2'-O-allyl derivatives is presented. Di-t-butylsilylene group was employed for simultaneous protection of 3'- and 5'- hydroxyl functions of nucleoside on the first step. Subsequent silylation or alkylation of free 2'-OH followed by introduction of suitable protection on the base

  提出了2'-O-取代的核糖核苷的有效合成方法，包括2'-O-TBDMS和受保护的2'-O-TOM以及2'-O-Me和2'-O-烯丙基衍生物。第一步，使用二叔丁基亚甲硅烷基同时保护核苷的3'-和5'-羟基官能团。随后将游离的2'-OH进行甲硅烷基化或烷基化，然后在碱基部分上引入合适的保护基，并除去环状甲硅烷基保护基，从而以高收率得到目标化合物。
• Synthesis of Nucleosides with 2′-Fixed Lipid Anchors and Their Behavior in Phospholipid Membranes
  作者：Oliver Kaczmarek、Nicolai Brodersen、Andreas Bunge、Ludwig Löser、Daniel Huster、Andreas Herrmann、Anna Arbuzova、Jürgen Liebscher

  DOI：10.1002/ejoc.200701064

  日期：2008.4

  Various new nucleosides bearing one or two lipophilic groups at the 2′-position have been synthesized. The lipophilic substituents were attached to a 2′-hydroxy, 2′-amino, or 2′-thio function. These lipophilic nucleosides anchor in large unilamellar POPC vesicles serving as phospholipid membrane models. The insertion of these molecules into the membranes was investigated by NMR techniques. For comparison

  已经合成了各种在 2' 位带有一个或两个亲脂基团的新核苷。亲脂性取代基连接到 2'-羟基、2'-氨基或 2'-硫代官能团。这些亲脂性核苷锚定在用作磷脂膜模型的大型单层 POPC 囊泡中。通过核磁共振技术研究了这些分子插入到膜中的情况。为了进行比较，还研究了在 2'-、3'-或 5'-位置具有两个或三个亲脂基团的核苷。（© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA，69451 Weinheim，德国，2008 年）
• A post-synthetic approach for the synthesis of 2′-O-methyldithiomethyl-modified oligonucleotides responsive to a reducing environment
  作者：Yosuke Ochi、Osamu Nakagawa、Katsunori Sakaguchi、Shun-ichi Wada、Hidehito Urata

  DOI：10.1039/c3cc43725f

  日期：——

  Reducing-Environment-Dependent Uncatalyzed Chemical Transforming RNA, "REDUCT RNA", we established a post-synthetic approach for the synthesis of 2'-O-methyldithiomethyl-modified oligonucleotides from 2'-O-(2,4,6-trimethoxybenzylthiomethyl)-oligonucleotides by treatment with dimethyl(methylthio)sulfonium tetrafluoroborate. 2'-O-methyldithiomethyl oligonucleotides were easily converted into 2'-hydroxy oligonucleotides

  基于一种新颖的概念，一种还原环境相关的未催化化学转化RNA“ REDUCT RNA”，我们建立了一种从2'-O-（2合成2'-O-甲基二硫代甲基修饰的寡核苷酸的后合成方法通过用四氟硼酸二甲基（甲硫基）s处理，得到4，6-三甲氧基苄硫基甲基）-寡核苷酸。在还原条件下，例如在细胞内环境中发现的那些条件下，2'-O-甲基二硫代甲基寡核苷酸易于转化为2'-羟基寡核苷酸。
• Regioselective protection of the 2′-hydroxyl group of N-acyl-3′,5′-O-di(t-butyl)silanediylnucleoside derivatives by use of t-BuMgCl and 2-(trimethylsilyl)ethoxymethyl chloride
  作者：Takeshi Wada、Masanori Tobe、Takashi Nagayama、Kiyotaka Furusawa、Mitsuo Sekine

  DOI：10.1016/0040-4039(95)00130-5

  日期：1995.3

  Regioselective 2′-O-protection of N-protected 3′,5′-O-di(t-butyl)silanediylribonucleoside derivatives with the 2-(trimethylsilyl)ethoxymethyl (SEM) group has been achieved by use of t-BuMgCl and 2-(trimethylsilyl)ethoxymethyl chloride. The former was used as a base. The 2′-O-SEM protected ribonucleoside derivatives were converted via a three-step reaction into the corresponding phosphoramidite building

  通过使用t -BuMgCl和2实现了N保护的3'，5'- O-二（叔丁基）硅烷二基核糖核苷衍生物具有2-（三甲基甲硅烷基）乙氧基甲基（SEM）基团的区域选择性2'- O-保护。-（三甲基甲硅烷基）乙氧基甲基氯。前者被用作基础。通过三步反应将2'- O- SEM保护的核糖核苷衍生物以良好的总收率转化为相应的亚磷酰胺结构单元。