5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-3'-deoxy-adenosine | 862179-59-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-3'-deoxy-adenosine
• 英文别名: 3'-deoxy-5'-O-[(tertbutyl)diphenylsilyl]adenosine；(2R,3R,5S)-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxymethyl]oxolan-3-ol
• CAS: 862179-59-7
• 化学式: C₂₆H₃₁N₅O₃Si
• 分子量: 489.649
• InChiKey: SHGQGFSDBBHIGY-NXQMDHLFSA-N

物化性质

• 沸点：
  655.8±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.28±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.63
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-3'-deoxy-adenosine 在 吡啶 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 N⁴-acetyl,2'-O-acetyl,3'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  S-腺苷-L-高半胱氨酸水解酶的抗癌和抗病毒作用及灭活作用，这些酶由5'-羧醛和肟合成，这些酶由腺苷和糖修饰的类似物合成。

  摘要：

  通过Moffatt氧化（二甲基亚砜/二环己基碳二亚胺/二氯乙酸）或用Dess-Martin高碘烷试剂将选择性保护的腺嘌呤核苷转化为5'-甲醛醛类似物。5'-氟-5'-S-甲基-5'-硫代（α-氟硫醚）阿拉伯糖基衍生物的水解也得到5'-甲醛。用羟胺[或O-（甲基，乙基和苄基）羟胺]盐酸盐处理5'-甲醛，得到E / Z肟。用三氟乙酸水溶液和丙酮处理纯化的肟可实现反式肟化反应，从而提供干净的5'-甲醛样品。腺苷（Ado）-5'-甲醛及其4'-末端是S-腺苷-L-高半胱氨酸（AdoHcy）水解酶的有效抑制剂。它们与酶有效结合并在C3'处发生氧化 得到3'-酮类似物，同时降低NAD +辅因子，得到无活性的，紧密结合的NADH-酶复合物（I型辅因子耗竭抑制）。用含有核糖顺式2'，3'-乙二醇的5'-羧醛观察到了有效的I型抑制作用。它们的肟衍生物是“前抑制剂”，它们经过酶催化水解后在活性位点释放抑制剂。

  DOI：

  10.1021/jm960828p
• 作为产物：
  描述：

  1,2-O-异亚丙基-alpha-D-呋喃木糖 在 咪唑 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 偶氮二异丁腈 、 硫酸 、 氨 、 溶剂黄146 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 62.25h， 生成 5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-3'-deoxy-adenosine
  参考文献：
  名称：

  五氯化磷促进了2'-和3'-脱氧核苷的宝石二氯化。

  摘要：

  规范核苷各个位置的卤素取代产生了许多生物活性结构变体。本文中，提出了两个独特的带有宝石二氯基团的糖修饰的核苷系列的合成。合成计划要求将五氯化磷受控添加到适当保护的2'-或3'-酮脱氧核苷中间体中作为关键步骤，以促进此类功能化分子的快速构建。在相同的反应条件下，形成2'，2'-dichloro-2'，3'-二脱氧核苷的化学选择性最高，而在3'的情况下发生竞争性2'，3'-消除过程，3'-二氯对应物。

  DOI：

  10.3390/molecules23061457

文献信息

• Deoxyribosyl analogues of methionyl and isoleucyl sulfamate adenylates as inhibitors of methionyl-tRNA and isoleucyl-tRNA synthetases
  作者：Sung Eun Kim、Su Yeon Kim、Sunghoon Kim、Taehee Kang、Jeewoo Lee

  DOI：10.1016/j.bmcl.2005.05.035

  日期：2005.7

  2'-Deoxy, 3'-deoxy, and 2',3'-dideoxyribosyl surrogates of isoleucyl and methionyl sulfamate adenylates have been investigated to identify the pharmacophoric importance of the ribose group for the inhibition of Escherichia coli methionyl-tRNA (MRS) and isoleucyl-tRNA (IRS) synthetases. Molecular modeling of 2',3'-dideoxyribosyl Met-NHSO2-AMP (9) with the crystal structure of E. coli MRS revealed that

  已经研究了异亮氨酰和甲硫氨酸氨基磺酸腺苷酸的2'-脱氧，3'-脱氧和2'，3'-二脱氧核糖基替代物，以鉴定核糖基团对抑制大肠杆菌甲硫氨酸-tRNA（MRS）和异亮氨酰-tRNA（IRS）合成酶。具有大肠杆菌MRS晶体结构的2'，3'-二脱氧核糖基Met-NHSO2-AMP（9）的分子模型表明，核糖之间缺少两个氢键可弥补核糖上两个羟基的缺乏环氧和His24，导致活性降低较小。
• Inhibition of hepatitis C viral RNA-dependent RNA polymerase by α-P-boranophosphate nucleotides: Exploring a potential strategy for mechanism-based HCV drug design
  作者：Marcus Adrian Cheek、Mariam L. Sharaf、Mikhail I. Dobrikov、Barbara Ramsay Shaw

  DOI：10.1016/j.antiviral.2013.02.014

  日期：2013.5

  comparable potency shift (21-fold). These experiments also indicate that the boranophosphate analogs 5a and 5b inhibit HCV NS5B through a competitive mode of inhibition. This evidence, together with previous crystal structure data, further supports the idea that HCV NS5B (in a similar manner to HIV-1 RT) discriminates against the 3'-deoxy modification via lost interactions between the 3'-OH on the ribose

  改进慢性 HCV 感染的治疗方法仍然是一个挑战，需要新的化学策略来扩展当前的范式。HCV RNA 聚合酶 (RdR(P)) 已成为抗病毒开发的目标。我们首次表明硼酸磷酸盐 (BP) 修饰提高了 ATP 类似物转化为 HCV NS5BΔ55 RdRP 催化的 RNA 的底物效率。硼酸磷酸核苷酸含有一个硼烷 (BH₃) 基团，该基团取代了正常磷酸基团的非桥连磷酰氧，从而产生了一类能够调节遗传信息读写的修饰等电子 DNA 和 RNA 模拟物。我们确定 HCV NS5BΔ55 是一种立体特异性酶，包含 ATPαB 和两种硼酸磷酸盐类似物的 Rp 异构体：2'-O-甲基腺苷 5'-(α-P-硼烷) 三磷酸 (2'-OMe ATPαB, 5a) 和 3'-脱氧腺苷 5'-(α-P-硼烷) 三磷酸 (3'-dATPαB, 5b)。没有核糖修饰的 ATPαB (6) 的 R(p) 非对映异构体被发现是比天然
• 一种基于虫草素经衍生化具有抗肿瘤效应的化合物
  申请人：南京工业大学

  公开号：CN115181148A

  公开（公告）日：2022-10-14

  本发明公开了一种基于虫草素经衍生化具有抗肿瘤效应的化合物，其结构如式I所示。本发明所提供的虫草素衍生物及其药物组合物具有良好的抗肿瘤增殖效果。相对于母体药物，虫草素衍生物对细胞膜有更好的亲和性，使药物在体内代谢的半衰期更长，留在体内的时间更长。相对于其他的核苷类抗肿瘤药物，本发明所提供的虫草素衍生物及其药物组合物对肿瘤的种类及作用范围更广泛，包括对胃癌、胰腺癌、肝癌、小细胞肺癌、结肠直肠癌、黑色素瘤、卵巢癌等均具有优秀的抑制作用，且副作用更低，疗效更好。
• Nucleic Acid Related Compounds. 101. <i>S</i>-Adenosyl-<scp>l</scp>-homocysteine Hydrolase Does Not Hydrate (5‘-Fluoro)vinyl or (6‘-Halo)homovinyl Analogues Derived from 3‘-Deoxyadenosine or 3‘-(Chloro or Fluoro)-3‘-deoxyadenosine¹
  作者：Morris J. Robins、Vladimir Neschadimenko、Bong-Oh Ro、Chong-Sheng Yuan、Ronald T. Borchardt、Stanislaw F. Wnuk

  DOI：10.1021/jo971741u

  日期：1998.2.1

  S-Adenosyl-L-homocysteine (AdoHcy) hydrolase is crucial for the maintenance of biomethylation. The usual mechanistic sequence involves oxidation of AdoHcy at C3' followed by elimination of L-homocysteine, Michael addition of water, and reduction to give adenosine. A 6'-fluorohomovinyladenosine analogue (EDDFHA) undergoes hydration of the 5',6' double bond (hydrolytic activity) at a more rapid rate than oxidation at C3'. Three 4',5'-didehydro-5'-deoxy-5'-fluoro nucleoside analogues were prepared from 3'-deoxy- and 3'-(chloro and fluoro)-3'-deoxyadenosine via generation of the vinyl fluorides by thermolysis of 5'-fluoro-5'-thioether sulfoxides. The 3'-deoxy analogues of 6'-halohomovinyladenosines were prepared by Wittig extension with a 3'-deoxy-5'-carboxaldehyde and halodestannylation of vinyl stannanes. The 3'-hydroxyl group appears to be essential for binding to AdoHcy hydrolase. No hydrolytic activity at C5' or C6' was observed with the nonoxidizable 3'-deoxy or 3'-(chloro or fluoro) analogues in contrast with their 3'-hydroxy counterparts (ZDDFA and EDDFHA). These 3'-modified analogues cannot reduce enzyme-bound NAD(+) to NADH and do not produce time-dependent inhibition of AdoHcy hydrolase, but are weak competitive inhibitors (K-i = 150-200 mu M).
• WO2018133854A5
  申请人：——

  公开号：WO2018133854A5

  公开（公告）日：2022-05-31