N3-benzoyl-2',3',5'-O-triacetyluridine-5-malonic acid dimethyl ester | 1261157-40-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N3-benzoyl-2',3',5'-O-triacetyluridine-5-malonic acid dimethyl ester
• 英文别名: dimethyl 2-[3-benzoyl-1-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-diacetyloxy-5-(acetyloxymethyl)oxolan-2-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]propanedioate
• CAS: 1261157-40-7
• 化学式: C₂₇H₂₈N₂O₁₄
• 分子量: 604.524
• InChiKey: YAEKMFLAQYLUNA-UMCMBGNQSA-N

物化性质

• 沸点：
  682.3±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.45±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.4
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  198
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N3-benzoyl-2',3',5'-O-triacetyluridine-5-malonic acid dimethyl ester 在 sodium methylate 、 1,8-双二甲氨基萘 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 18.17h， 生成
  参考文献：
  名称：

  [EN] ALTERNATIVE NUCLEIC ACID MOLECULES AND USES THEREOF
  [FR] MOLÉCULES D'ACIDE NUCLÉIQUE ALTERNATIVES ET LEURS UTILISATIONS

  摘要：

  公开号：

  WO2015196128A3
• 作为产物：
  描述：

  2',3',5'-三乙酰尿苷 在 4-二甲氨基吡啶 、 溴 、 乙酸酐 、 溶剂黄146 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 N3-benzoyl-2',3',5'-O-triacetyluridine-5-malonic acid dimethyl ester
  参考文献：
  名称：

  [EN] MODIFIED NUCLEIC ACID MOLECULES AND USES THEREOF
  [FR] MOLÉCULES D'ACIDE NUCLÉIQUE MODIFIÉES ET LEURS UTILISATIONS

  摘要：

  本公开提供了经修改的核苷、核苷酸和核酸，以及它们的使用方法。

  公开号：

  WO2014093924A1

文献信息

• The AlkB Domain of Mammalian ABH8 Catalyzes Hydroxylation of 5-Methoxycarbonylmethyluridine at the Wobble Position of tRNA
  作者：Ye Fu、Qing Dai、Wen Zhang、Jin Ren、Tao Pan、Chuan He

  DOI：10.1002/anie.201001242

  日期：2010.11.15

  Family ties: The AlkB family of nonheme iron, α‐ketoglutarate (αKG)‐dependent dioxygenases is involved in biological processes such as DNA/RNA repair and obesity. The AlkB domain of ABH8 is shown to catalyze the hydroxylation of a modified uridine (mcm5U) into (S)‐mchm5U at the wobble position of the anticodon stem–loop in tRNA (see scheme), thereby suggesting that this protein is a tRNA hypermodification

  家族关系：非血红素铁、α-酮戊二酸 (αKG) 依赖性双加氧酶的 AlkB 家族参与 DNA/RNA 修复和肥胖等生物过程。显示 ABH8 的 AlkB 结构域在 tRNA 中反密码子茎环的摆动位置催化修饰的尿苷 (mcm 5 U)羟基化为 ( S )-mchm 5 U（参见方案），从而表明该蛋白质是一种 tRNA 超修饰酶。