3-azido-3-deoxy-1,2-isopropylidene-α-D-ribofuranuronic acid methyl amide | 331729-05-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 3-azido-3-deoxy-1,2-isopropylidene-α-D-ribofuranuronic acid methyl amide
• 英文别名: N-methyl-1,2-O-isopropylidene-3-azido-3-deoxy-α-D-ribofuranuronamide；(3aR,5S,6S,6aR)-6-azido-N,2,2-trimethyl-3a,5,6,6a-tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxole-5-carboxamide
• CAS: 331729-05-6
• 化学式: C₉H₁₄N₄O₄
• 分子量: 242.235
• InChiKey: KHQXMOIPXDFHAV-BYPJNBLXSA-N

物化性质

• 熔点：
  170-173 °C

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.6
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.89
• 拓扑面积：
  71.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-azido-3-deoxy-1,2-isopropylidene-α-D-ribofuranuronic acid methyl amide 在 三异丙基硅烷 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 N-methyl-3-azido-3-deoxy-D-ribofuranuronamide
  参考文献：
  名称：

  包含具有游离 OH 的呋喃类 β-糖氨基酸衍生物的嵌合寡肽的合成：温和但成功地从结构单元中去除 1,2-O-异亚丙基

  摘要：

  作为疏水性五元环β-氨基酸（例如ACPC）的补充，β-糖氨基酸（β-SAA）作为折叠体和α/β嵌合肽的亲水性构件的应用越来越多。 Fmoc 保护的 β-SAA [例如 Fmoc-RibAFU(ip)-OH] 确实是有用的乐高元素，可用于 SPPS。本文介绍了去除 1,2-OH 异亚丙基保护基团以增加此类 SAA 的亲水性。我们首先使用 N 3 -RibAFU(ip)-OH 模型化合物来优化温和的脱保护条件。通过RP-HPLC监测1,2-OH游离产物N 3 -RibAFU- OH及其甲基糖苷甲酯N 3 -RibAFU(Me) -OMe的形成，发现50% TFA或8当量。甲醇中的 Amberlite IR-120 H +树脂是有效脱保护的最佳试剂。然后将这些条件成功地应用于嵌合寡肽的合成：-GG- X- GG-[X=RibAFU(ip)]。我们发现所建立的条件是有效的，同时足够温和，可以去除 1

  DOI：

  10.1007/s00726-020-02923-3
• 作为产物：
  描述：

  1,2:5,6-di-O-isopropylidene-3-O-trifluoromethanesulfonyl-α-D-allofuranose 在 potassium permanganate 、 sodium periodate 、 sodium azide 、 草酰氯 、 四丁基硫酸氢铵 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 157.75h， 生成 3-azido-3-deoxy-1,2-isopropylidene-α-D-ribofuranuronic acid methyl amide
  参考文献：
  名称：

  糖氨基酸的C-3差向异构体作为foldameric的组成部分：改进的合成，有用的衍生物，偶联策略

  摘要：

  为了获得用于制备同聚寡聚体或α/β-嵌合体肽的关键糖衍生物，正在开发经济和多克级的合成方法。尽管在文献中有描述，但3-氨基-3-脱氧-呋喃呋喃糖醛酸（H– t X– OH）及其C-3异构体立体异构体3-氨基-3-脱氧-呋喃呋喃糖醛酸的制备具有成本效益。此处描述了来自d-葡萄糖的（H– C X– OH）。阐述的本合成路线是（1）适用于大规模合成；（2）降低了试剂成本（例如降低了400倍）；（3）对于所有连续六个步骤（包括– t X –或– c X），优化后的产量约为80％或更高 –和（4）反应时间缩短。因此，一种新的合成路线一步工序的产量，成本，时间和纯化优化给出既为d -xylo和d -ribo氨基furanuronic氨基酸使用可持续化学（例如用有机溶剂较少色谱;使用连续-流动反应器）。我们的研究涵盖了必要的构建基块（例如– X –OMe，– X– O i Pr，– X –NHMe，Fmoc–

  DOI：

  10.1007/s00726-016-2346-5

文献信息

• Compounds for the treatment of ischemia
  申请人：——

  公开号：US20040198693A1

  公开（公告）日：2004-10-07

  A 3 agonists, methods of using such A 3 agonists and pharmaceutical compositions containing such A 3 agonists. The A 3 agonists are useful for the reduction of tissue damage resulting from tissue ischemia or hypoxia.

  A3激动剂，使用此类A3激动剂的方法以及含有此类A3激动剂的药物组合物。这些A3激动剂对于减少由组织缺血或缺氧引起的组织损伤是有用的。
• The synthesis of highly potent, selective, and water-soluble agonists at the human adenosine A3 receptor
  作者：Michael P. DeNinno、Hiroko Masamune、Lois K. Chenard、Kenneth J. DiRico、Cynthia Eller、John B. Etienne、Jeanene E. Tickner、Scott P. Kennedy、Delvin R. Knight、Jimmy Kong、Joseph J. Oleynek、W. Ross Tracey、Roger J. Hill

  DOI：10.1016/j.bmcl.2006.01.088

  日期：2006.5

  Using a combination of parallel and directed synthesis, the discovery of a highly potent and selective series of adenosine A3 agonists was achieved. High aqueous solubility, required for the intended parenteral route of administration, was achieved by the presence of one or two basic amine functional groups.

  使用平行和定向合成的组合，发现了高效和选择性系列的腺苷A3激动剂。预期的肠胃外给药途径所需的高水溶性是通过存在一个或两个碱性胺官能团实现的。
• Origin of problems related to Staudinger reduction in carbopeptoid syntheses
  作者：Barbara Csordás、Adrienn Nagy、Veronika Harmat、Virág Zsoldos-Mády、Ibolya Leveles、István Pintér、Viktor Farkas、András Perczel

  DOI：10.1007/s00726-016-2289-x

  日期：2016.11

  We report the solid phase synthesis of -GG-X-GG- type alpha/beta-carbopeptoids incorporating RibAFU(ip) (1a, tX) or XylAFU(ip) (2a, cX) sugar amino acids. Though coupling efficacy is moderate, both the lengthier synthetic route using Fmoc derivative (e.g., Fmoc-RibAFU(ip)-OH) and the azido derivative (e.g., N3-RibAFU(ip)-OH) via Staudinger reaction with nBu3P can be successfully applied. Both X-ray

  我们报告了结合RibAFU（ip）（1a，tX）或XylAFU（ip）（2a，cX）糖氨基酸的-GG-X-GG-型α/β-类肽的固相合成。尽管偶联效力适中，但通过Staudinger反应与nBu3P的Fmoc衍生物（例如Fmoc-RibAFU（ip）-OH）和叠氮基衍生物（例如N3-RibAFU（ip）-OH）的较长合成路线均可成功应用。X射线衍射，1H-NMR和31P-NMR以及理论（QM）数据均支持并解释了在顺式立体异构体的情况下，如果将cX连接到前面的残基上，将Ph3P作为施陶丁格试剂的应用为何“无效”的原因带有（-CONH-）肽键 N3-cX多肽链断裂的失败源于“巧合” 空间拥挤和电子效应导致准五配位三苯基膦亚胺水解过程中无法进行强制亲核攻击。尽管如此，上述α/β-嵌合体肽的合成现已通过1,2-O-异亚丙基-3-叠氮基-3-脱氧-核糖-和-二呋喃呋喃糖醛酸（H-RibAFU（ ip）-OH
• Design and synthesis of 3′-ureidoadenosine-5′-uronamides: effects of the 3′-ureido group on binding to the A3 adenosine receptor
  作者：Lak Shin Jeong、Myong Jung Kim、Hea Ok Kim、Zhan-Guo Gao、Soo-Kyung Kim、Kenneth A. Jacobson、Moon Woo Chun

  DOI：10.1016/j.bmcl.2004.07.042

  日期：2004.10

  On the basis of high binding affinity at the A(3) adenosine receptor of 3'-aminoadenosine derivatives with hydrogen bonding donor ability, novel 3'-ureidoadenosine analogues were synthesized from 1,2:5,6-di-O-isopropylidene-D-glucose in order to lead to stronger hydrogen bonding than the corresponding 3'-aminoadeno sine derivatives. However, the synthesized 3'-ureidoadenosine analogues were totally devoid of binding affinity, because 3'-urea moiety caused steric and electrostatic repulsions at the binding site of the A(3) adenosine receptor, leading to conformational distortion. (C) 2004 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Orthogonal Activation of the Reengineered A₃ Adenosine Receptor (Neoceptor) Using Tailored Nucleoside Agonists
  作者：Zhan-Guo Gao、Heng T. Duong、Tatiana Sonina、Soo-Kyung Kim、Philippe Van Rompaey、Serge Van Calenbergh、Liaman Mamedova、Hea Ok Kim、Myong Jung Kim、Ae Yil Kim、Bruce T. Liang、Lak Shin Jeong、Kenneth A. Jacobson

  DOI：10.1021/jm050968b

  日期：2006.5.1

  An alternative approach to overcome the inherent lack of specificity of conventional agonist therapy can be the reengineering of the GPCRs and their agonists. A reengineered receptor ( neoceptor) could be selectively activated by a modified agonist, but not by the endogenous agonist. Assisted by rhodopsin-based molecular modeling, we pinpointed mutations of the A(3) adenosine receptor (AR) for selective affinity enhancement following complementary modifications of adenosine. Ribose modifications examined included, at 3' : amino, aminomethyl, azido, guanidino, ureido; and at 5' : uronamido, azidodeoxy. N-6-Variations included 3-iodobenzyl, 5-chloro-2-methyloxybenzyl, and methyl. An N-6-3-iodobenzyl-3'-ureido adenosine derivative 10 activated phospholipase C in COS-7 cells (EC50 = 0.18 mu M) or phospholipase D in chick primary cardiomyocytes, both mediated by a mutant ( H272E), but not the wild-type, A(3)AR. The affinity enhancements for 10 and the corresponding 3'-acetamidomethyl analogue 6 were > 100-fold and > 20-fold, respectively. 10 concentration-dependently protected cardiomyocytes transfected with the neoceptor against hypoxia. Unlike 10, adenosine activated the wild-type A(3)AR (EC50 of 1.0 mu M), but had no effect on the H272E mutant A(3)AR (100 mu M). Compound 10 was inactive at human A(1), A(2A), and A(2B)ARs. The orthogonal pair comprising an engineered receptor and a modified agonist should be useful for elucidating signaling pathways and could be therapeutically applied to diseases following organ-targeted delivery of the neoceptor gene.