phenyl 2-azido-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-1-thio-β-D-glucopyranoside | 277756-87-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: phenyl 2-azido-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-1-thio-β-D-glucopyranoside
• 英文别名: (2R,3S,4R,5R,6S)-5-azido-4-phenylmethoxy-2-(phenylmethoxymethyl)-6-phenylsulfanyloxan-3-ol
• CAS: 277756-87-3
• 化学式: C₂₆H₂₇N₃O₄S
• 分子量: 477.584
• InChiKey: IZWYBMSZWMSKHY-SDVOOXDOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.4
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  87.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  phenyl 2-azido-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-1-thio-β-D-glucopyranoside 在 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 丙酮 、 mineral oil 为溶剂， 生成 2-azido-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-4-O-p-methoxybenzyl-α/β-D-glucopyranose
  参考文献：
  名称：

  l-艾杜醛酰胺合成和可扩展转化为肝素相关二糖和四糖

  摘要：

  可按千克规模制备的非对映异构纯氰醇可在一个步骤中有效转化为新型l-艾杜隆酰胺。这种艾杜糖醛酰胺的新区域选择性酰化和亚硝酸戊酯介导的新型温和酰胺水解方法能够实现短时间、可扩展的l-艾杜糖醛酸二乙酸酯 C-4 受体的合成，以及l-艾杜糖醛酸 C-4 受体硫糖苷。描述了将这些有效转化为一系列肝素相关葡萄糖-碘二糖构建块（各种 C-4 保护选项），包括对关键肝素构建块 ido-硫糖苷供体的高效多克访问。1-OAc 二糖通过分化为受体和供体二糖而转化为肝素相关四糖。1,2-二乙酰艾杜糖醛酸甲酯和类似艾杜糖酰胺的X射线和核磁共振数据表明，虽然两者在溶液中均采用1 C 4构象，但艾杜糖醛酸酯在固态时采用4 C 1构象。还报道了新型4 C 1的 X 射线结构-构象锁定双环 1,6-脱水艾糖醛酸内酯以及新型扭曲的4 C 1艾糖醛酸内酯4,6-内酯的 X 射线结构。氘标记还提供了在新型亚硝酸戊酯介导的艾杜糖醛

  DOI：

  10.1021/jo300722y
• 作为产物：
  描述：

  2-氨基-2-脱氧葡萄糖盐酸盐 在 吡啶 、 三乙基硅烷 、 1H-咪唑-1-磺酰叠氮盐酸盐 、 copper(ll) sulfate pentahydrate 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 三氟化硼乙醚 、 水 、 sodium hydride 、 potassium carbonate 、 对甲苯磺酸 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 140.17h， 生成 phenyl 2-azido-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-1-thio-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  l-艾杜醛酰胺合成和可扩展转化为肝素相关二糖和四糖

  摘要：

  可按千克规模制备的非对映异构纯氰醇可在一个步骤中有效转化为新型l-艾杜隆酰胺。这种艾杜糖醛酰胺的新区域选择性酰化和亚硝酸戊酯介导的新型温和酰胺水解方法能够实现短时间、可扩展的l-艾杜糖醛酸二乙酸酯 C-4 受体的合成，以及l-艾杜糖醛酸 C-4 受体硫糖苷。描述了将这些有效转化为一系列肝素相关葡萄糖-碘二糖构建块（各种 C-4 保护选项），包括对关键肝素构建块 ido-硫糖苷供体的高效多克访问。1-OAc 二糖通过分化为受体和供体二糖而转化为肝素相关四糖。1,2-二乙酰艾杜糖醛酸甲酯和类似艾杜糖酰胺的X射线和核磁共振数据表明，虽然两者在溶液中均采用1 C 4构象，但艾杜糖醛酸酯在固态时采用4 C 1构象。还报道了新型4 C 1的 X 射线结构-构象锁定双环 1,6-脱水艾糖醛酸内酯以及新型扭曲的4 C 1艾糖醛酸内酯4,6-内酯的 X 射线结构。氘标记还提供了在新型亚硝酸戊酯介导的艾杜糖醛

  DOI：

  10.1021/jo300722y

文献信息

• METHOD OF SYNTHESIZING SUGAR CHAIN
  申请人：MITSUBISHI CHEMICAL CORPORATION

  公开号：EP1640379A1

  公开（公告）日：2006-03-29

  An object of the present invention is to provide a method for efficiently chemically synthesizing biomolecules including a nucleotide (nucleic acid), a peptide (protein), or a sugar chain, as representative examples. The present invention provides a method of solid-phase synthesis of sugar chain(s) for synthesizing multiple types of sugar chains in at least one sugar chain synthesis reaction system comprising multiple types of monosaccharide units, which is characterized in that it comprises changing the temperature in the sugar chain synthesis reaction system depending on the temperature rising rate that has been determined based on a decrease in side reaction(s) in the reaction system as an indicator.

  本发明的目的是提供一种有效地化学合成生物分子的方法，包括核苷酸（核酸）、肽（蛋白质）或糖链等代表性示例。本发明提供了一种固相合成糖链的方法，用于在至少一个糖链合成反应系统中合成多种类型的糖链，其特征在于根据已确定的反应系统中副反应减少的指标，改变糖链合成反应系统中的温度上升速率。
• An improved method for the synthesis of protected glycosyl fluorides from thioglycosides using N,N-diethylaminosulfur trifluoride (DAST)
  作者：Katsuhiko Suzuki、Yukishige Ito、Osamu Kanie

  DOI：10.1016/j.carres.2012.07.003

  日期：2012.10

  examined using N,N-diethylaminosulfur trifluoride (DAST). Although the reaction proceeded without N-bromosuccinimide (NBS), in some cases it was found that the electrophilicity of the Vilsmeier-type electrophilic sulfinium cation species was not sufficient for the activation of certain less-reactive thioglycosides. Here, we report the results of fluorination reactions of a series of monosaccharides using

  使用N，N-二乙基氨基三氟化硫（DAST）检查了硫糖苷直接转化为寡糖合成中常用的糖基氟化物。尽管反应在没有N-溴代琥珀酰亚胺（NBS）的情况下进行，但在某些情况下，发现Vilsmeier型亲电electro阳离子物种的亲电性不足以活化某些反应性较低的硫代糖苷。在这里，我们报告了在不存在NBS的情况下使用DAST进行的一系列单糖氟化反应的结果，并讨论了在存在二甲基（甲硫基）s三氟甲烷磺酸盐（DMTST）的情况下加速反应的过程，从而提高了产品收率。
• Mechanistic Investigation of 1,2-Diol Dehydration of Paromamine Catalyzed by the Radical <i>S</i>-Adenosyl-<scp>l</scp>-methionine Enzyme AprD4
  作者：Yu-Cheng Yeh、Hak Joong Kim、Hung-wen Liu

  DOI：10.1021/jacs.1c00076

  日期：2021.4.7

  mechanism, several substrate analogues were synthesized and their fates upon incubation with AprD4 were analyzed. The results support a mechanism involving formation of a ketyl radical intermediate followed by direct elimination of the C3′-hydroxyl group rather than that of a gem-diol intermediate generated via 1,2-migration of the C3′-hydroxyl group to C4′. The stereochemistry of hydrogen atom incorporation

  AprD4 是一种自由基S-腺苷-1-甲硫氨酸 (SAM) 酶，可催化巴马明的 C3'-脱氧以形成 4'-氧代-维生素 B。它是自由基 SAM 酶超家族中唯一已在体外被鉴定和表征的 1,2-二醇脱水酶. AprD4 催化的 1,2-二醇脱水是几种 C3'-脱氧-氨基糖苷生物合成的关键步骤。虽然已经建立了由 AprD4 催化的氢原子提取的区域化学，但后续化学转化的机制仍未完全了解。为了研究该机制，合成了几种底物类似物，并分析了它们与 AprD4 孵育后的命运。结果支持涉及形成羰基自由基中间体然后直接消除 C3'-羟基的机制，而不是通过 C3'-羟基向 C4' 的 1,2-迁移产生的偕二醇中间体的机制。还建立了自由基介导的脱水后氢原子掺入的立体化学。
• Synthesis of Rare 6-Deoxy-<scp>d</scp>-/<scp>l</scp>-Heptopyranosyl Fluorides: Assembly of a Hexasaccharide Corresponding to <i>Campylobacter jejuni</i> Strain CG8486 Capsular Polysaccharide
  作者：Tiantian Li、Jianjun Wang、Xinhao Zhu、Xin Zhou、Shaozi Sun、Peng Wang、Hongzhi Cao、Guangli Yu、Ming Li

  DOI：10.1021/jacs.1c05048

  日期：2021.7.28

  glycosylating agents. The synthesis is achieved by a C1-to-C5 switch strategy relying on radical decarboxylative fluorination of uronic acids arising from readily available allyl d-C-glycosides. To further showcase the application of this protocol, a structurally unique hexasaccharide composed of →3)-β-d-6didoHepp-(1→4)-β-d-GlcpNAc-(1→ units, corresponding to the capsular polysaccharide of C. jejuni strain

  空肠弯曲杆菌是人类腹泻病的主要原因，已被世界卫生组织指定为高度耐药病原体之一。C. jejuni荚膜多糖具有广泛存在的不常见的 6dHep p残基，并已被证明是开发创新抗菌糖结合疫苗的潜在抗原。为了解决缺乏重要的稀有 6dHep p架构的合成方法，我们在此描述了一种用于制备罕见d -/ l -6dHep p的新颖且有效的方法具有作为糖基化剂的能力的氟化物。该合成是通过 C1 到 C5 转换策略实现的，该策略依赖于由容易获得的烯丙基d - C-糖苷产生的糖醛酸的自由基脱羧氟化。为了进一步展示该协议的应用，结构上独特的六糖由 →3)-β- d -6d ido Hep p- (1→4)-β- d -Glc p NAc-(1→ 单位组成，对应于首次组装了空肠弯曲菌 CG8486 菌株的荚膜多糖，该组装的特点是高效构建了具有挑战性的 β-(1,2- cis ) -d- ido-吡喃庚糖苷通过β-(1
• Assembly of glycoamino acid building blocks: a new strategy for the straightforward synthesis of heparan sulfate mimics
  作者：Julia Revuelta、Roberto Fuentes、Laura Lagartera、María José Hernáiz、Agatha Bastida、Eduardo García-Junceda、Alfonso Fernández-Mayoralas

  DOI：10.1039/c8cc08067d

  日期：——

  A new strategy that enables a modular straightforward synthesis of heparan sulfate oligosaccharide mimics by the assembly of simple glycoamino acid building blocks is described. The coupling between units is readily carried out by an amidation reaction. Several glycoamino acid oligomers were prepared and their interaction with the FGF2 protein was analyzed.

  描述了一种新的策略，该策略可通过组装简单的糖氨基酸构件来模块化地直接合成硫酸乙酰肝素寡糖模拟物。单元之间的偶联容易通过酰胺化反应进行。制备了几种糖氨基酸低聚物，并分析了它们与FGF2蛋白的相互作用。