phenyl 2-azido-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-1-thio-β-D-glucopyranoside | 277756-84-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡喃二恶英
• 英文名称: phenyl 2-azido-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-1-thio-β-D-glucopyranoside
• 英文别名: (2R,4aR,6S,7R,8R,8aS)-7-azido-2-phenyl-6-phenylsulfanyl-4,4a,6,7,8,8a-hexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxin-8-ol
• CAS: 277756-84-0
• 化学式: C₁₉H₁₉N₃O₄S
• 分子量: 385.444
• InChiKey: HQUROUFKKPKZML-UPGMHYFXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  87.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  phenyl 2-azido-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-1-thio-β-D-glucopyranoside 在 吡啶 、 三氟甲磺酸酐 、 sodium nitrite 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 11.0h， 以78%的产率得到phenyl 4,6-O-benzylidene-2-deoxy-2-azido-1-thio-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  罕见的脱氧氨基糖结构单元的合成使得能够从Psychobacter cryohalolentis K5 T的LPS进行多糖重复单元的总合成。

  摘要：

  脂多糖（LPS）在体液免疫中起关键作用。最近，对LPS的结构嗜冷cryohalolentis K5 Ť菌株的报道。由于存在非天然氨基糖和支链，其结构是独特的。在此，我们报告了P的LPS类似物的总合成。cryohalolentis K5牛逼。克服像环的构象变化和消除三氟甲磺酸的问题之后，我们能够制定一项战略，在新报告的2,3,4- triacetamido -2,3,4-三脱氧合成升-阿拉伯糖衍生物。从非还原端到还原端，不同的供体与合适的受体偶联，并且进一步的官能团修饰递送了受保护的LPS六糖重复单元。官能团修饰后，我们无法氧化受阻伯羟基以合成目标分子。或者，除去永久性保护基团，得到了Psychobacter cryohalolentis K5 T的LPS六糖重复单元类似物。

  DOI：

  10.1021/acs.joc.8b02037
• 作为产物：
  描述：

  phenyl 2-azido-2-deoxy-1-thio-D-glucopyranoside 在 camphor-10-sulfonic acid 作用下， 以 乙醚 、 乙腈 、 Petroleum ether 为溶剂， 生成 phenyl 2-azido-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-1-thio-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  从d-氨基葡萄糖可扩展合成各向异性纯正交保护的GlcN 3和GalN 3

  摘要：

  已经开发了由廉价的d-葡糖胺合成的正交保护的d-葡糖胺和d-半乳糖胺结构单元的改进的和可扩展的合成。关键反应是转化/迁移步骤，该步骤可提供微生物寡糖合成所需的完全正交的保护基团模式。该方法可以在数克范围内进行，因为可以通过结晶纯化一些反应以得到端基纯的产物。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.6b02241

文献信息

• METHOD OF SYNTHESIZING SUGAR CHAIN
  申请人：MITSUBISHI CHEMICAL CORPORATION

  公开号：EP1640379A1

  公开（公告）日：2006-03-29

  An object of the present invention is to provide a method for efficiently chemically synthesizing biomolecules including a nucleotide (nucleic acid), a peptide (protein), or a sugar chain, as representative examples. The present invention provides a method of solid-phase synthesis of sugar chain(s) for synthesizing multiple types of sugar chains in at least one sugar chain synthesis reaction system comprising multiple types of monosaccharide units, which is characterized in that it comprises changing the temperature in the sugar chain synthesis reaction system depending on the temperature rising rate that has been determined based on a decrease in side reaction(s) in the reaction system as an indicator.

  本发明的目的是提供一种有效地化学合成生物分子的方法，包括核苷酸（核酸）、肽（蛋白质）或糖链等代表性示例。本发明提供了一种固相合成糖链的方法，用于在至少一个糖链合成反应系统中合成多种类型的糖链，其特征在于根据已确定的反应系统中副反应减少的指标，改变糖链合成反应系统中的温度上升速率。
• Synthesis and Scalable Conversion of <scp>l</scp>-Iduronamides to Heparin-Related Di- and Tetrasaccharides
  作者：Steen U. Hansen、Gavin J. Miller、Marek Baráth、Karl R. Broberg、Egle Avizienyte、Madeleine Helliwell、James Raftery、Gordon C. Jayson、John M. Gardiner

  DOI：10.1021/jo300722y

  日期：2012.9.21

  structure is also reported for the novel, 4C1-conformationally locked bicyclic 1,6-anhydro iduronate lactone along with an X-ray structures of a novel distorted 4C1 iduronate 4,6-lactone. Deuterium labeling also provides mechanistic insight into the formation of lactone products during the novel amyl nitrite-mediated hydrolysis of iduronamide into the parent iduronic acid functionality.

  可按千克规模制备的非对映异构纯氰醇可在一个步骤中有效转化为新型l-艾杜隆酰胺。这种艾杜糖醛酰胺的新区域选择性酰化和亚硝酸戊酯介导的新型温和酰胺水解方法能够实现短时间、可扩展的l-艾杜糖醛酸二乙酸酯 C-4 受体的合成，以及l-艾杜糖醛酸 C-4 受体硫糖苷。描述了将这些有效转化为一系列肝素相关葡萄糖-碘二糖构建块（各种 C-4 保护选项），包括对关键肝素构建块 ido-硫糖苷供体的高效多克访问。1-OAc 二糖通过分化为受体和供体二糖而转化为肝素相关四糖。1,2-二乙酰艾杜糖醛酸甲酯和类似艾杜糖酰胺的X射线和核磁共振数据表明，虽然两者在溶液中均采用1 C 4构象，但艾杜糖醛酸酯在固态时采用4 C 1构象。还报道了新型4 C 1的 X 射线结构-构象锁定双环 1,6-脱水艾糖醛酸内酯以及新型扭曲的4 C 1艾糖醛酸内酯4,6-内酯的 X 射线结构。氘标记还提供了在新型亚硝酸戊酯介导的艾杜糖醛
• Synthesis of the tetrasaccharide repeating unit of the O-antigen from Pseudomonas putida BIM B-1100 having rare D-Quip3NAc
  作者：Madhumita Bera、Balaram Mukhopadhyay

  DOI：10.1016/j.carres.2020.107955

  日期：2020.3

  Chemical synthesis of the complex tetrasaccharide repeating unit of the O-antigen from Pseudomonas putida BIM B-1100 is accomplished in the form of its 2-aminoethyl glycoside to leave the scope for further glycoconjugate formation without hampering the anomeric stereochemistry. A [2 + 2] strategy is followed to complete the total synthesis and a late stage TEMPO mediated oxidation is used to install

  来自恶臭假单胞菌BIM B-1100的O抗原的复杂四糖重复单元的化学合成以其2-氨基乙基糖苷的形式完成，从而为进一步的糖缀合物形成提供了范围，而不会妨碍异头异构体的立体化学。遵循[2 + 2]策略以完成总合成，并使用后期TEMPO介导的氧化来安装所需的糖醛酸。自由基介导的6-脱氧和随后的保护基操纵策略用于从合适的d-葡萄糖胺衍生物制备稀有的D-FucpNAc和D-Quip3NAc衍生物。
• Chemoselective glycosylations using sulfonium triflate activator systems
  作者：Jeroen D.C Codée、Leendert J van den Bos、Remy E.J.N Litjens、Herman S Overkleeft、Constant A.A van Boeckel、Jacques H van Boom、Gijs A van der Marel

  DOI：10.1016/j.tet.2003.11.084

  日期：2004.1

  chemoselective glycosylation sequence is described that employs the recently developed BSP/Tf2O and DPS/Tf2O reagent systems to activate thioglycosides. In the first glycosylation event a relatively armed thioglycoside is activated with the BSP/Tf2O activator system and condensed with an acceptor thioglycoside to yield the thiodisaccharide, which is activated with the more potent DPS/Tf2O activator in the

  描述了一种新颖的化学选择性糖基化序列，该序列采用了最近开发的BSP / Tf 2 O和DPS / Tf 2 O试剂系统来激活硫糖苷。在第一次糖基化事件中，相对武装的硫代糖苷被BSP / Tf 2 O活化剂系统激活，并与受体硫糖苷缩合，生成硫二糖，后者在下一次糖基化事件中被更有效的DPS / Tf 2 O活化剂激活。（N-哌啶子基）苯基（S-硫代苯基）硫化物三氟甲磺酸酯的淬灭是在亚磷酸三乙酯活化后形成的，其对于亚磷酸三乙酯的生产至关重要。
• Endocyclic Cleavage in Glycosides with 2,3-<i>trans</i> Cyclic Protecting Groups
  作者：Hiroko Satoh、Shino Manabe、Yukishige Ito、Hans P. Lüthi、Teodoro Laino、Jürg Hutter

  DOI：10.1021/ja201024a

  日期：2011.4.13

  is proposed as a reaction mechanism for the anomerization from the β (1,2-trans) to the α (1,2-cis) configuration observed in glycosides carrying 2,3-trans cyclic protecting groups. This reaction occurs in the presence of a weak Lewis or Brønsted acid, while endocyclic cleavage (endocleavage) in typical glycosides was observed only when mediated by protic media or strong Lewis acids. To rationalize

  提出了内环途径作为在携带 2,3-反式环状保护基团的糖苷中观察到的从 β（1,2-反式）到 α（1,2-顺式）构型异构化的反应机制。该反应在弱路易斯酸或布朗斯台德酸存在下发生，而典型糖苷中的环内裂解（内裂解）仅在质子介质或强路易斯酸介导时观察到。为了使这类化合物的行为合理化，使用量子力学 (QM) 计算和实验研究研究了内切的反应机制和促进因素。我们研究了携带 2,3-反式环状保护基团的硫糖苷的异构化反应，使用三氟化硼醚合物 (BF(3)·OEt(2)) 作为路易斯酸。估计的理论反应性，基于一个简单的模型来预测由稠环引起的应变的过渡态 (TS) 能量，非常接近通过内 CO 键断裂后沿 C1-C2 键旋转的 TS 搜索计算的 TS 能量。在预测的 TS 能量和实验反应性等级之间发现了极好的一致性。这一系列的计算和实验强烈支持内环而不是外环机制的优势。此外，这些研究表明内部应变是增强内切反应的主