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5-乙炔-2-脱氧尿苷 | 61135-33-9

中文名称
5-乙炔-2-脱氧尿苷
中文别名
5-乙炔基-2-脱氧尿苷;5-乙炔基-2‘-去氧尿苷;5-乙炔基-2'-脱氧尿苷
英文名称
2'-deoxy-5-ethynyluridine
英文别名
5-ethynyl-2′-deoxyuridine;EdU;5-ethynyl-2’-deoxyuridine;5-Ethynyl-2'-deoxyuridine;ethynyl deoxyuridine;5-ethynyl-2‘-deoxyuridine;5-ethynyl-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
5-乙炔-2-脱氧尿苷化学式
CAS
61135-33-9
化学式
C11H12N2O5
mdl
——
分子量
252.227
InChiKey
CDEURGJCGCHYFH-DJLDLDEBSA-N
BEILSTEIN
——
EINECS
——
  • 物化性质
  • 计算性质
  • ADMET
  • 安全信息
  • SDS
  • 制备方法与用途
  • 上下游信息
  • 反应信息
  • 文献信息
  • 表征谱图
  • 同类化合物
  • 相关功能分类
  • 相关结构分类

物化性质

  • 熔点:
    199°C(lit.)
  • 密度:
    1.55±0.1 g/cm3(Predicted)
  • 溶解度:
    溶于DMSO(高达10mg/ml)。

计算性质

  • 辛醇/水分配系数(LogP):
    -1.3
  • 重原子数:
    18
  • 可旋转键数:
    3
  • 环数:
    2.0
  • sp3杂化的碳原子比例:
    0.45
  • 拓扑面积:
    99.1
  • 氢给体数:
    3
  • 氢受体数:
    5

安全信息

  • 危险性防范说明:
    P261,P305+P351+P338
  • 危险性描述:
    H315,H319,H335
  • 储存条件:
    储存温度应维持在2~8℃之间,需密封并置于干燥处。

SDS

SDS:aeb10437e3f5c3d518650bc47ad656d9
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模块 1. 化学品
1.1 产品标识符
: 5-Ethynyl-2′-deoxyuridine, (EdU)
产品名称
1.2 鉴别的其他方法
无数据资料
1.3 有关的确定了的物质或混合物的用途和建议不适合的用途
仅用于研发。不作为药品、家庭或其它用途。

模块 2. 危险性概述
2.1 GHS-分类
生殖细胞致突变性 (类别 1B)
生殖毒性 (类别 2)
2.2 GHS 标记要素,包括预防性的陈述
象形图
警示词 危险
危险申明
H340 可能导致遗传性缺陷。
H361 怀疑对生育能力或胎儿造成伤害。
警告申明
预防措施
P201 在使用前获取特别指示。
P202 在读懂所有安全防范措施之前切勿操作。
P280 戴防护手套/穿防护服/戴护目镜/戴面罩.
事故响应
P308 + P313 如接触到或有疑虑:求医/ 就诊。
安全储存
P405 存放处须加锁。
废弃处置
P501 将内容物/ 容器处理到得到批准的废物处理厂。
只限于专业使用者。
2.3 其它危害物 - 无

模块 3. 成分/组成信息
3.1 物 质
: C11H12N2O5
分子式
: 252.25 g/mol
分子量
组分 浓度或浓度范围
5-Ethynyl-2′-deoxyuridine, (EdU)
<=100%
化学文摘登记号(CAS 61135-33-9
No.)

模块 4. 急救措施
4.1 必要的急救措施描述
一般的建议
请教医生。 向到现场的医生出示此安全技术说明书。
吸入
如果吸入,请将患者移到新鲜空气处。 如呼吸停止,进行人工呼吸。 请教医生。
皮肤接触
用肥皂和大量的水冲洗。 请教医生。
眼睛接触
用水冲洗眼睛作为预防措施。
食入
切勿给失去知觉者通过口喂任何东西。 用水漱口。 请教医生。
4.2 主要症状和影响,急性和迟发效应
据我们所知,此化学,物理和毒性性质尚未经完整的研究。
4.3 及时的医疗处理和所需的特殊处理的说明和指示
无数据资料

模块 5. 消防措施
5.1 灭火介质
灭火方法及灭火剂
用水雾,抗乙醇泡沫,干粉或二氧化碳灭火。
5.2 源于此物质或混合物的特别的危害
碳氧化物, 氮氧化物
5.3 给消防员的建议
如必要的话,戴自给式呼吸器去救火。
5.4 进一步信息
无数据资料

模块 6. 泄露应急处理
6.1 作业人员防护措施、防护装备和应急处置程序
使用个人防护用品。 避免粉尘生成。 避免吸入蒸气、烟雾或气体。 保证充分的通风。
人员疏散到安全区域。 避免吸入粉尘。
6.2 环境保护措施
如能确保安全,可采取措施防止进一步的泄漏或溢出。 不要让产品进入下水道。
6.3 泄漏化学品的收容、清除方法及所使用的处置材料
收集和处置时不要产生粉尘。 扫掉和铲掉。 放入合适的封闭的容器中待处理。
6.4 参考其他部分
丢弃处理请参阅第13节。

模块 7. 操作处置与储存
7.1 安全操作的注意事项
避免接触皮肤和眼睛。 避免形成粉尘和气溶胶。避免曝露:使用前需要获得专门的指导。
在有粉尘生成的地方,提供合适的排风设备。
7.2 安全储存的条件,包括任何不兼容性
贮存在阴凉处。 使容器保持密闭,储存在干燥通风处。
7.3 特定用途
无数据资料

模块 8. 接触控制和个体防护
8.1 容许浓度
最高容许浓度
没有已知的国家规定的暴露极限。
8.2 暴露控制
适当的技术控制
根据良好的工业卫生和安全规范进行操作。 休息前和工作结束时洗手。
个体防护设备
眼/面保护
带有防护边罩的安全眼镜符合 EN166要求请使用经官方标准如NIOSH (美国) 或 EN 166(欧盟)
检测与批准的设备防护眼部。
皮肤保护
戴手套取 手套在使用前必须受检查。
请使用合适的方法脱除手套(不要接触手套外部表面),避免任何皮肤部位接触此产品.
使用后请将被污染过的手套根据相关法律法规和有效的实验室规章程序谨慎处理. 请清洗并吹干双手
所选择的保护手套必须符合EU的89/686/EEC规定和从它衍生出来的EN 376标准。
身体保护
防渗透的衣服, 防护设备的类型必须根据特定工作场所中的危险物的浓度和数量来选择。
呼吸系统防护
如危险性评测显示需要使用空气净化的防毒面具,请使用全面罩式多功能微粒防毒面具N100型(US
)或P3型(EN
143)防毒面具筒作为工程控制的候补。如果防毒面具是保护的唯一方式,则使用全面罩式送风防毒
面具。 呼吸器使用经过测试并通过政府标准如NIOSH(US)或CEN(EU)的呼吸器和零件。

模块 9. 理化特性
9.1 基本的理化特性的信息
a) 外观与性状
形状: 固体
b) 气味
无数据资料
c) 气味阈值
无数据资料
d) pH值
无数据资料
e) 熔点/凝固点
无数据资料
f) 沸点、初沸点和沸程
无数据资料
g) 闪点
无数据资料
h) 蒸发速率
无数据资料
i) 易燃性(固体,气体)
无数据资料
j) 高的/低的燃烧性或爆炸性限度 无数据资料
k) 蒸气压
无数据资料
l) 蒸汽密度
无数据资料
m) 密度/相对密度
无数据资料
n) 水溶性
无数据资料
o) n-辛醇/水分配系数
无数据资料
p) 自燃温度
无数据资料
q) 分解温度
无数据资料
r) 粘度
无数据资料

模块 10. 稳定性和反应活性
10.1 反应性
无数据资料
10.2 稳定性
无数据资料
10.3 危险反应
无数据资料
10.4 应避免的条件
无数据资料
10.5 不相容的物质
强氧化剂
10.6 危险的分解产物

模块 11. 毒理学资料
11.1 毒理学影响的信息
急性毒性
无数据资料
皮肤刺激或腐蚀
无数据资料
眼睛刺激或腐蚀
无数据资料
呼吸道或皮肤过敏
无数据资料
生殖细胞致突变性
活体试验表明有致突变效应
细胞突变性-体内试验 - 阳性
致癌性
无数据资料
IARC:
此产品中没有大于或等于 0。1%含量的组分被 IARC鉴别为可能的或肯定的人类致癌物。
生殖毒性
可疑人类的生殖毒物
特异性靶器官系统毒性(一次接触)
无数据资料
特异性靶器官系统毒性(反复接触)
无数据资料
吸入危险
无数据资料
潜在的健康影响
吸入 吸入可能有害。 可能引起呼吸道刺激。
摄入 如服入是有害的。
皮肤 通过皮肤吸收可能有害。 可能引起皮肤刺激。
眼睛 可能引起眼睛刺激。
接触后的征兆和症状
据我们所知,此化学,物理和毒性性质尚未经完整的研究。
附加说明
化学物质毒性作用登记: 无数据资料

模块 12. 生态学资料
12.1 生态毒性
无数据资料
12.2 持久性和降解性
无数据资料
12.3 潜在的生物累积性
无数据资料
12.4 土壤中的迁移性
无数据资料
12.5 PBT 和 vPvB的结果评价
无数据资料
12.6 其它不良影响
无数据资料

模块 13. 废弃处置
13.1 废物处理方法
产品
与易燃溶剂相溶或者相混合,在备有燃烧后处理和洗刷作用的化学焚化炉中燃烧
受污染的容器和包装
按未用产品处置。

模块 14. 运输信息
欧洲陆运危规: - 国际海运危规: - 国际空运危规: -
14.2 联合国运输名称
欧洲陆运危规: 非危险货物
国际海运危规: 非危险货物
国际空运危规: 非危险货物
14.3 运输危险类别
欧洲陆运危规: - 国际海运危规: - 国际空运危规: -
14.4 包裹组
欧洲陆运危规: - 国际海运危规: - 国际空运危规: -
14.5 环境危险
欧洲陆运危规: 否 国际海运危规 国际空运危规: 否
海洋污染物(是/否): 否
14.6 对使用者的特别提醒
无数据资料


模块 15 - 法规信息
N/A


模块16 - 其他信息
N/A

制备方法与用途

生物活性

EdU 是一种新型胸苷(胸腺嘧啶脱氧核苷,thymidine)类似物,在 DNA 合成过程中能够替代胸苷掺入到新合成的 DNA 中。EdU 上的乙炔基可以与荧光标记的叠氮化物(如 Azide Alexa Fluor 488、Azide Alexa Fluor 555、Azide Alexa Fluor 594、Azide Alexa Fluor 647 等)或生物素标记的叠氮化物通过一价铜离子催化发生共价反应,形成稳定的三唑环。这一反应非常迅速,被称为点击反应(Click reaction)。随后检测这些叠氮化物所标记的相应物质,从而达到检测新合成 DNA 的目的。

应用

EdU 常用于替代溴脱氧尿苷(BrdU),应用于细胞增殖试剂盒中。

上下游信息

  • 上游原料
    中文名称 英文名称 CAS号 化学式 分子量
    • 1
    • 2
  • 下游产品
    中文名称 英文名称 CAS号 化学式 分子量
    • 1
    • 2
    • 3
    • 4
    • 5

反应信息

  • 作为反应物:
    描述:
    5-乙炔-2-脱氧尿苷 在 [,14-bis(diphenylphosphino)butane] (1,5-cyclooctadiene)rhodium(I) tetrafluoroborate 、 氢气 作用下, 以 氘代甲醇 为溶剂, 20.0 ℃ 、600.01 kPa 条件下, 生成 乙去氧尿啶
    参考文献:
    名称:
    标记的、靶向癌症的 DNA 适体的氢诱导极化
    摘要:
    我们通过对氢展示了癌症靶向适体 AS1411 前所未有的超极化。为此,我们筛选了合适的对位氢诱导极化 (PHIP) 标记,进行固相合成以将标记整合到 AS1411 中,并通过聚乙二醇化调整 DNA 的极性,以在不影响规范核苷酸的情况下在有机溶剂中实现高效、选择性氢化。
    DOI:
    10.1002/anie.202300531
  • 作为产物:
    参考文献:
    名称:
    通过滚环DNA扩增直接掺入和延伸荧光核苷酸,以检测microRNA 24-3P。
    摘要:
    我们从噻吩,蒽和pyr中设计并合成了几种大小不同的荧光核苷酸,并筛选了它们在DNA滚环扩增过程中的掺入和延伸能力。基于噻吩的荧光核苷酸(dUthioTP)可以高度整合并延伸到滚环DNA产品中,而其他荧光核苷酸(dUanthTP和dUpyrTP)则不能。该dUthioTP荧光核苷酸可用于检测与PRRSV相关的miRNA 24-3P。在滚环DNA扩增过程中,这种直接标记系统显示出增加的荧光信号,表明用于检测miRNA 24-3P的凝胶形成。
    DOI:
    10.1016/j.bmcl.2018.04.058
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文献信息

  • [EN] NOVEL COMPOUNDS FOR REGENERATION OF TERMINALLY-DIFFERENTIATED CELLS AND TISSUES<br/>[FR] NOUVEAUX COMPOSÉS POUR LA RÉGÉNÉRATION DE CELLULES ET DE TISSUS AU STADE DE DIFFÉRENCIATION TERMINALE
    申请人:ACOUSIA THERAPEUTICS GMBH
    公开号:WO2015071165A1
    公开(公告)日:2015-05-21
    The present invention discloses novel compounds and their use in medicine. Preferably the compounds are applicable in the therapy of disorders associated with damaged post-mitotic tissues in mammals. The novel compounds are compounds according to formula I (I) wherein - X is O (oxygen) or S (sulphur), - R1 is a substituent selected from the group consisting of straight-chain (unbranched) or branched, unsubstituted or substituted alkyl groups, cycloalkyl groups, alkylcycloalkyl groups, aryl groups, alkylaryl groups, arylalkyl groups, cycloalkylaryl groups and arylcycloalkyl groups, which optionally contain heteroatoms, - R2 is a substituent selected from the group consisting of straight-chain (unbranched) or branched, unsubstituted or substituted C1 - C6 alkyl groups, C1 – C6 alkoxy groups, C1 – C6 alkoxy alkyl groups and C2 – C6 alkenyl groups, - R3 is a substituent selected from the group consisting of straight-chain (unbranched) or branched, unsubstituted or substituted alkyl groups, cycloalkyl groups, alkylcycloalkyl groups, aryl groups, alkylaryl groups, arylalkyl groups, cycloalkylaryl groups and arylcycloalkyl groups, which optionally contain heteroatoms, - or a stereoisomer, a tautomer, a prodrug or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
    本发明公开了新化合物及其在医学中的应用。优选地,这些化合物适用于治疗与哺乳动物中受损有丝分裂后组织相关的疾病。这些新化合物是根据式I(I)的化合物,其中- X为O(氧)或S(硫),- R1是从直链(非支链)或支链、未取代或取代的烷基基团、环烷基基团、烷基环烷基基团、芳基、烷基芳基基团、芳基烷基基团、环烷基芳基基团和芳基环烷基基团中选择的取代基,可选地含有杂原子,- R2是从直链(非支链)或支链、未取代或取代的C1-C6烷基基团、C1-C6烷氧基基团、C1-C6烷氧基烷基基团和C2-C6烯基基团中选择的取代基,- R3是从直链(非支链)或支链、未取代或取代的烷基基团、环烷基基团、烷基环烷基基团、芳基、烷基芳基基团、芳基烷基基团、环烷基芳基基团和芳基环烷基基团中选择的取代基,可选地含有杂原子,- 或其立体异构体、互变异构体、前药或其药学上可接受的盐。
  • Diverse size approach to incorporate and extend highly fluorescent unnatural nucleotides into DNA
    作者:Binh Huy Le、Ja Choon Koo、Han Na Joo、Young Jun Seo
    DOI:10.1016/j.bmc.2017.03.045
    日期:2017.7
    unnatural nucleotides containing fluorescent (dApyrTP, dUpyrTP, dUantTP, dUthiTP) and quencher (dUazoTP) units, as well as nucleotides presenting small functional groups (dAethTP, dAoctTP, dUethTP, dUiodTP), all based on deoxyadenosine and deoxyuridine, and examined their suitability for use in enzymatic incorporation and extension into DNA. We observed a size-dependence of the incorporation and extension
    我们准备了一系列大小不一的非天然核苷酸,它们均基于荧光(dApyrTP,dUpyrTP,dUantTP,dUthiTP)和淬灭(dUazoTP)单元,以及具有小的官能团(dAethTP,dAoctTP,dUethTP,dUiodTP)的核苷酸。脱氧腺苷和脱氧尿苷,并检查了它们在酶促掺入和扩展到DNA中的适用性。我们观察到引物延伸过程中掺入和延伸能力的大小依赖性(遵循dUiodTP = dUethTP = dUthiTP> dUazoTP> dUpyrTP> dUantTP的顺序)。该结果得到圆二色性(CD)光谱的支持,圆二色性光谱揭示了不同B型DNA结构的趋势,该结构取决于脱氧尿苷5位单元的大小(dUiodTP> dUethTP> dUthiTP> dUpyrTP)。从PCR产物。有趣的是,dUthiTP可以在引物延伸甚至PCR扩增过程中掺入并延伸到长DNA链中,CD光谱证实了稳定的二级B
  • [EN] COMPOUNDS FOR TREATMENT OF ANGIOGENESIS-MEDIATED DISEASES<br/>[FR] COMPOSÉS POUR TRAITER DES MALADIES MÉDIÉES PAR L'ANGIOGENÈSE
    申请人:UNIV INDIANA RES & TECH CORP
    公开号:WO2014182695A1
    公开(公告)日:2014-11-13
    Synthetic cremastranone and cremastranone analogs are disclosed. Additionally, methods for synthesizing cremastranone and cremastranone analogs are disclosed. Methods of treating ocular neovascularization disorders and treating angiogenesis-mediated disease are also disclosed.
    披露了合成克雷马斯特罗内和克雷马斯特罗内类似物。此外,还披露了合成克雷马斯特罗内和克雷马斯特罗内类似物的方法。还披露了治疗眼部新生血管疾病和治疗血管生成介导的疾病的方法。
  • Catalysis of Michael Additions by Covalently Modified G-Quadruplex DNA
    作者:Surjendu Dey、Carmen L. Rühl、Andres Jäschke
    DOI:10.1002/chem.201700632
    日期:2017.9.7
    catalysis utilizing G‐quadruplex DNA‐based artificial metalloenzymes has emerged as a new approach in the field of aqueous‐phase homogeneous catalysis. Recently, a catalytic asymmetric Michael addition employing a covalently modified G‐quadruplex in combination with CuII ions has been reported. Here we assess, by systematic chemical variation and using various spectrometric techniques, a variety of parameters
    利用基于G-四链体DNA的人工金属酶的对映选择性催化已经成为水相均相催化领域中的一种新方法。最近,催化不对称迈克尔加成使用共价修饰的G-四链体与Cu II结合离子已被报道。在这里,我们通过系统的化学变化并使用各种光谱技术来评估控制反应速率加速和立体选择性的各种参数,例如修饰的位置,四链体的拓扑结构,配体的性质,配体与DNA之间的连接子,一价离子的化学特性和过渡金属络合物。与在位置12(dU12)衍生的DNA链相比,在10位(dU10)上用己炔基连接的bpy配体修饰的DNA四链体显示出两倍的初始反应速率。立体选择性对接头长度的依赖性截然不同,以及它们不同的光谱特性表明,dU10衍生化和dU12修饰的四链体之间催化中心的结构存在很大差异。在添加铜时II,两种类型的bpy衍生DNA链均形成了定义为1:1的Cu-DNA复合物,足以用于质谱分析,而未衍生化的DNA链则显示出弱的和非特异性的结合,并与
  • [EN] PYRROLO [2,3-B]PYRIDINE-3-CARBOXAMIDE COMPOSITIONS AND METHODS FOR AMELIORATING HEARING LOSS<br/>[FR] COMPOSITIONS DE PYRROLO [2,3-B] PYRIDINE-3-CARBOXAMIDE ET PROCÉDÉS POUR AMÉLIORER LA PERTE AUDITIVE
    申请人:GNEDEVA KSENIA
    公开号:WO2021158936A1
    公开(公告)日:2021-08-12
    N-(3-Substituted thiazol-2(3H)-ylidene)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-3-carboxamides and N-(3-substituted oxazol-2(3H)-ylidene)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-3-carboxamides (I) and (II) are disclosed. The compounds activate Yap and inhibit Lats kinases. They are therefore useful for treating hearing loss.
    N-(3-取代噻唑-2(3H)-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-羧酰胺和N-(3-取代噁唑-2(3H)-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-羧酰胺(I)和(II)已被披露。这些化合物激活Yap并抑制Lats激酶。因此,它们对治疗听力损失是有用的。
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