1,6-anhydro-2-azido-3-O-benzyl-2-deoxy-4-O-(β-D-glucopyranosyl)-β-D-glucopyranose | 796873-51-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1,6-anhydro-2-azido-3-O-benzyl-2-deoxy-4-O-(β-D-glucopyranosyl)-β-D-glucopyranose
• 英文别名: (2S,3R,4S,5S,6R)-2-[[(1R,2S,3R,4R,5R)-4-azido-3-phenylmethoxy-6,8-dioxabicyclo[3.2.1]octan-2-yl]oxy]-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5-triol
• CAS: 796873-51-3
• 化学式: C₁₉H₂₅N₃O₉
• 分子量: 439.422
• InChiKey: AFVPNTYIHFFDAE-JDNAYRNDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.2
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.68
• 拓扑面积：
  141
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,6-anhydro-2-azido-3-O-benzyl-2-deoxy-4-O-(β-D-glucopyranosyl)-β-D-glucopyranose 在 2,2,6,6-四甲基哌啶氧化物 、 1,3-二溴-5,5-二甲基海因 、 camphor-10-sulfonic acid 、 sodium hydride 、 碳酸氢钠 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 、 mineral oil 为溶剂， 反应 8.5h， 生成 (methyl 2,3-di-O-benzyl-β-D-glucopyranosyluronate)-O-(1→4)-1,6-anhydro-2-azido-3-O-benzyl-2-deoxy-β-D-glucopyranose
  参考文献：
  名称：

  研究乙二醇分解肝素衍生的乙酰肝素抑制剂：合成三糖的研究。

  摘要：

  乙酰肝素酶是唯一已知的能够裂解硫酸乙酰肝素的内切糖苷酶。Roneparstat和necuparanib是从肝素中获得的乙酰肝素酶抑制剂，目前正在人类中作为潜在的抗癌药物进行测试，其结构中含有乙二醇分裂的糖醛酸部分，可能是其强大的抑制活性。我们在这里描述了三糖GlcNS6S-GlcA-1,6anGlcNS（1）及其乙二醇拆分（gs）对应物GlcNS6S-gsGlcA-1,6anGlcNS（2）的总化学合成。不出所料，在乙酰肝素酶抑制试验中，化合物2的效力比1高一个数量级。使用分子建模技术，我们创建了1和2的3D模型，并已通过NOESY NMR实验验证。纯合成寡糖已使乙二醇拆分的葡萄糖醛酸的构象得以首次深入研究。以1的结构引入乙二醇拆分单元可增加构象柔韧性，并缩短两种氨基葡萄糖动机之间的距离，从而促进与乙酰肝素酶的相互作用。然而，通过比较2和ronparstat的相对活性，我们可以得出结论，乙

  DOI：

  10.3390/molecules21111602
• 作为产物：
  描述：

  2,3,4,6-四邻乙酰基-alpha-d-吡喃葡萄糖三氯乙酰胺 在 sodium methylate 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.25h， 生成 1,6-anhydro-2-azido-3-O-benzyl-2-deoxy-4-O-(β-D-glucopyranosyl)-β-D-glucopyranose
  参考文献：
  名称：

  研究乙二醇分解肝素衍生的乙酰肝素抑制剂：合成三糖的研究。

  摘要：

  乙酰肝素酶是唯一已知的能够裂解硫酸乙酰肝素的内切糖苷酶。Roneparstat和necuparanib是从肝素中获得的乙酰肝素酶抑制剂，目前正在人类中作为潜在的抗癌药物进行测试，其结构中含有乙二醇分裂的糖醛酸部分，可能是其强大的抑制活性。我们在这里描述了三糖GlcNS6S-GlcA-1,6anGlcNS（1）及其乙二醇拆分（gs）对应物GlcNS6S-gsGlcA-1,6anGlcNS（2）的总化学合成。不出所料，在乙酰肝素酶抑制试验中，化合物2的效力比1高一个数量级。使用分子建模技术，我们创建了1和2的3D模型，并已通过NOESY NMR实验验证。纯合成寡糖已使乙二醇拆分的葡萄糖醛酸的构象得以首次深入研究。以1的结构引入乙二醇拆分单元可增加构象柔韧性，并缩短两种氨基葡萄糖动机之间的距离，从而促进与乙酰肝素酶的相互作用。然而，通过比较2和ronparstat的相对活性，我们可以得出结论，乙

  DOI：

  10.3390/molecules21111602

文献信息

• Glycosidation–Anomerisation Reactions of 6,1-Anhydroglucopyranuronic Acid and Anomerisation of β-D-Glucopyranosiduronic Acids Promoted by SnCl4
  作者：Colin O'Brien、Monika Poláková、Nigel Pitt、Manuela Tosin、Paul V. Murphy

  DOI：10.1002/chem.200601111

  日期：2007.1.12

  onic acids was found to be faster, in some cases, than anomerisation of related beta-D-glucopyranosiduronic acid esters and beta-D-glucopyranoside derivatives and the rates are dependent on the structure of the aglycon. Moreover, the rates of anomerisation of beta-D-glucopyranuronic acid derivatives can be qualitatively correlated with rates of hydrolysis of beta-D-glucopyranosiduronic acids. Mechanistic

  氯化锡（IV）催化的甲硅烷基化亲核试剂与6,1-脱水葡萄糖基吡喃糖醛酸（葡萄糖醛酸6,1-内酯）的反应提供了1,2-反式或1,2-顺式（脱氧）糖苷，具体取决于供体结构。对于供体与2-酰基和2-脱氧供体的反应，获得了α-糖苷，而2-脱氧-2-碘的供体给出了β-糖苷。实验证据表明，当1,2-顺式糖苷形成时，由SnCl（4）催化的最初形成的1,2-反式糖苷的异构化是可能的。在某些情况下，发现β-D-吡喃葡萄糖苷神经酸酯的异构化比相关的β-D-吡喃葡萄糖苷神经酸酯和β-D-吡喃葡萄糖苷衍生物的异构化更快，并且速率取决于糖苷配基的结构。而且，β-D-吡喃葡萄糖醛酸衍生物的异构化速率可以与β-D-吡喃葡萄糖醛糖醛酸的水解速率定性相关。考虑了反应的机械可能性。
• Synthesis of disaccharides derived from heparin and evaluation of effects on endothelial cell growth and on binding of heparin to FGF-2
  作者：Alan O’ Brien、Ciaran Lynch、Kathy M. O’ Boyle、Paul V. Murphy

  DOI：10.1016/j.carres.2004.07.018

  日期：2004.10

  The disaccharide beta-D-GlcA-(1 --> 4)-alpha-D-GlcNAc-1 --> OMe and other small nonsulfated oligosaccharides related to heparin/heparan sulfate have been shown to bind to FGF and activated the fibroblast growth factor (FGF) signalling pathway in (F32) cells expressing the FGF receptor. Synthetic routes to beta-D-GlcA-(1 --> 4)-alpha-D-GlcNAc-1 --> OMe and a glucose analogue beta-D-Glc(1 --> 4)-alpha-D-GlcNAc-1 --> OMe are described. The effects of these disaccharides on endothelial cell growth, which is relevant to angiogenesis, were evaluated and it was found they did not mimic the inhibitory effects that were observed for heparin albumin (HA) and that have also been observed by monosaccharide conjugates. They did not alter bovine aortic endothelial cell (BAEC) proliferation, in the presence of FGF-2 in serum free medium or in absence of FGF-2 in serum free and complete medium. Disaccharides (10 mug/mL) reduced by 25-31% the inhibition caused by HA (10 mug/mL) on BAEC growth in serum-free medium but had no effect in complete medium. There was no evidence obtained for the binding of these oligosaccharides to FGF-2 in competition with HA by ELISA. (C) 2004 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Synthesis of heparan sulfate tetrasaccharide as a substrate for human heparanase
  作者：Naoko Takeda、Remina Ikeda-Matsumi、Kaoru Ebara-Nagahara、Miyuki Otaki-Nanjo、Kayo Taniguchi-Morita、Miwa Nanjo、Jun-ichi Tamura

  DOI：10.1016/j.carres.2012.03.014

  日期：2012.5

  Regiospecifically sulfated heparan sulfate tetrasaccharide, GlcA beta-GlcN(NS6S)alpha-GlcA beta-GlcN(NS6S)alpha was first synthesized as an octyl glycoside. Total synthesis was achieved effectively by coupling the corresponding disaccharide units in short steps. (C) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Investigating Glycol-Split-Heparin-Derived Inhibitors of Heparanase: A Study of Synthetic Trisaccharides
  作者：Minghong Ni、Stefano Elli、Annamaria Naggi、Marco Guerrini、Giangiacomo Torri、Maurice Petitou

  DOI：10.3390/molecules21111602

  日期：——

  structure glycol-split uronic acid moieties probably responsible for their strong inhibitory activity. We describe here the total chemical synthesis of the trisaccharide GlcNS6S-GlcA-1,6anGlcNS (1) and its glycol-split (gs) counterpart GlcNS6S-gsGlcA-1,6anGlcNS (2) from glucose. As expected, in a heparanase inhibition assay, compound 2 is one order of magnitude more potent than 1. Using molecular modeling

  乙酰肝素酶是唯一已知的能够裂解硫酸乙酰肝素的内切糖苷酶。Roneparstat和necuparanib是从肝素中获得的乙酰肝素酶抑制剂，目前正在人类中作为潜在的抗癌药物进行测试，其结构中含有乙二醇分裂的糖醛酸部分，可能是其强大的抑制活性。我们在这里描述了三糖GlcNS6S-GlcA-1,6anGlcNS（1）及其乙二醇拆分（gs）对应物GlcNS6S-gsGlcA-1,6anGlcNS（2）的总化学合成。不出所料，在乙酰肝素酶抑制试验中，化合物2的效力比1高一个数量级。使用分子建模技术，我们创建了1和2的3D模型，并已通过NOESY NMR实验验证。纯合成寡糖已使乙二醇拆分的葡萄糖醛酸的构象得以首次深入研究。以1的结构引入乙二醇拆分单元可增加构象柔韧性，并缩短两种氨基葡萄糖动机之间的距离，从而促进与乙酰肝素酶的相互作用。然而，通过比较2和ronparstat的相对活性，我们可以得出结论，乙