(methyl 2,3-di-O-benzyl-β-D-glucopyranosyluronate)-O-(1→4)-1,6-anhydro-2-azido-3-O-benzyl-2-deoxy-β-D-glucopyranose | 1379585-66-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (methyl 2,3-di-O-benzyl-β-D-glucopyranosyluronate)-O-(1→4)-1,6-anhydro-2-azido-3-O-benzyl-2-deoxy-β-D-glucopyranose
• 英文别名: (methyl 2,3-di-O-benzyl-β-D-glucopyranosyluronate)-(1->4)-1,6-anhydro-2-azido-3-O-benzyl-2-deoxy-β-D-glucopyranose；methyl (2S,3S,4S,5R,6R)-6-[[(1R,2S,3R,4R,5R)-4-azido-3-phenylmethoxy-6,8-dioxabicyclo[3.2.1]octan-2-yl]oxy]-3-hydroxy-4,5-bis(phenylmethoxy)oxane-2-carboxylate
• CAS: 1379585-66-6
• 化学式: C₃₄H₃₇N₃O₁₀
• 分子量: 647.682
• InChiKey: HOTBYRSXTMACTO-HVETYWRDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.5
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  126
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (methyl 2,3-di-O-benzyl-β-D-glucopyranosyluronate)-O-(1→4)-1,6-anhydro-2-azido-3-O-benzyl-2-deoxy-β-D-glucopyranose 在 双氧水 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 18.75h， 生成 (2-azido-3-O-benzyl-2-deoxy-4-O-methyl-α-D-glucopyranosyl)-O-(1→4)-(2,3-di-O-benzyl-β-D-gluco-pyranosyluronate)-O-(1→4)-1,6-anhydro-2-azido-3-O-benzyl-2-deoxy-β-D-glucopyranose
  参考文献：
  名称：

  研究乙二醇分解肝素衍生的乙酰肝素抑制剂：合成三糖的研究。

  摘要：

  乙酰肝素酶是唯一已知的能够裂解硫酸乙酰肝素的内切糖苷酶。Roneparstat和necuparanib是从肝素中获得的乙酰肝素酶抑制剂，目前正在人类中作为潜在的抗癌药物进行测试，其结构中含有乙二醇分裂的糖醛酸部分，可能是其强大的抑制活性。我们在这里描述了三糖GlcNS6S-GlcA-1,6anGlcNS（1）及其乙二醇拆分（gs）对应物GlcNS6S-gsGlcA-1,6anGlcNS（2）的总化学合成。不出所料，在乙酰肝素酶抑制试验中，化合物2的效力比1高一个数量级。使用分子建模技术，我们创建了1和2的3D模型，并已通过NOESY NMR实验验证。纯合成寡糖已使乙二醇拆分的葡萄糖醛酸的构象得以首次深入研究。以1的结构引入乙二醇拆分单元可增加构象柔韧性，并缩短两种氨基葡萄糖动机之间的距离，从而促进与乙酰肝素酶的相互作用。然而，通过比较2和ronparstat的相对活性，我们可以得出结论，乙

  DOI：

  10.3390/molecules21111602
• 作为产物：
  描述：

  2,3,4,6-四邻乙酰基-alpha-d-吡喃葡萄糖三氯乙酰胺 在 2,2,6,6-四甲基哌啶氧化物 、 1,3-二溴-5,5-二甲基海因 、 camphor-10-sulfonic acid 、 sodium methylate 、 sodium hydride 、 碳酸氢钠 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 、 mineral oil 为溶剂， 反应 11.75h， 生成 (methyl 2,3-di-O-benzyl-β-D-glucopyranosyluronate)-O-(1→4)-1,6-anhydro-2-azido-3-O-benzyl-2-deoxy-β-D-glucopyranose
  参考文献：
  名称：

  研究乙二醇分解肝素衍生的乙酰肝素抑制剂：合成三糖的研究。

  摘要：

  乙酰肝素酶是唯一已知的能够裂解硫酸乙酰肝素的内切糖苷酶。Roneparstat和necuparanib是从肝素中获得的乙酰肝素酶抑制剂，目前正在人类中作为潜在的抗癌药物进行测试，其结构中含有乙二醇分裂的糖醛酸部分，可能是其强大的抑制活性。我们在这里描述了三糖GlcNS6S-GlcA-1,6anGlcNS（1）及其乙二醇拆分（gs）对应物GlcNS6S-gsGlcA-1,6anGlcNS（2）的总化学合成。不出所料，在乙酰肝素酶抑制试验中，化合物2的效力比1高一个数量级。使用分子建模技术，我们创建了1和2的3D模型，并已通过NOESY NMR实验验证。纯合成寡糖已使乙二醇拆分的葡萄糖醛酸的构象得以首次深入研究。以1的结构引入乙二醇拆分单元可增加构象柔韧性，并缩短两种氨基葡萄糖动机之间的距离，从而促进与乙酰肝素酶的相互作用。然而，通过比较2和ronparstat的相对活性，我们可以得出结论，乙

  DOI：

  10.3390/molecules21111602

文献信息

• Synthesis of heparan sulfate tetrasaccharide as a substrate for human heparanase
  作者：Naoko Takeda、Remina Ikeda-Matsumi、Kaoru Ebara-Nagahara、Miyuki Otaki-Nanjo、Kayo Taniguchi-Morita、Miwa Nanjo、Jun-ichi Tamura

  DOI：10.1016/j.carres.2012.03.014

  日期：2012.5

  Regiospecifically sulfated heparan sulfate tetrasaccharide, GlcA beta-GlcN(NS6S)alpha-GlcA beta-GlcN(NS6S)alpha was first synthesized as an octyl glycoside. Total synthesis was achieved effectively by coupling the corresponding disaccharide units in short steps. (C) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Investigating Glycol-Split-Heparin-Derived Inhibitors of Heparanase: A Study of Synthetic Trisaccharides
  作者：Minghong Ni、Stefano Elli、Annamaria Naggi、Marco Guerrini、Giangiacomo Torri、Maurice Petitou

  DOI：10.3390/molecules21111602

  日期：——

  structure glycol-split uronic acid moieties probably responsible for their strong inhibitory activity. We describe here the total chemical synthesis of the trisaccharide GlcNS6S-GlcA-1,6anGlcNS (1) and its glycol-split (gs) counterpart GlcNS6S-gsGlcA-1,6anGlcNS (2) from glucose. As expected, in a heparanase inhibition assay, compound 2 is one order of magnitude more potent than 1. Using molecular modeling

  乙酰肝素酶是唯一已知的能够裂解硫酸乙酰肝素的内切糖苷酶。Roneparstat和necuparanib是从肝素中获得的乙酰肝素酶抑制剂，目前正在人类中作为潜在的抗癌药物进行测试，其结构中含有乙二醇分裂的糖醛酸部分，可能是其强大的抑制活性。我们在这里描述了三糖GlcNS6S-GlcA-1,6anGlcNS（1）及其乙二醇拆分（gs）对应物GlcNS6S-gsGlcA-1,6anGlcNS（2）的总化学合成。不出所料，在乙酰肝素酶抑制试验中，化合物2的效力比1高一个数量级。使用分子建模技术，我们创建了1和2的3D模型，并已通过NOESY NMR实验验证。纯合成寡糖已使乙二醇拆分的葡萄糖醛酸的构象得以首次深入研究。以1的结构引入乙二醇拆分单元可增加构象柔韧性，并缩短两种氨基葡萄糖动机之间的距离，从而促进与乙酰肝素酶的相互作用。然而，通过比较2和ronparstat的相对活性，我们可以得出结论，乙