1-benzyl-5'-O-benzyl-2',3'-O-isopropylideneinosine | 911430-77-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 1-benzyl-5'-O-benzyl-2',3'-O-isopropylideneinosine
• 英文别名: 9-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-dimethyl-6-(phenylmethoxymethyl)-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-1-benzylpurin-6-one
• CAS: 911430-77-8
• 化学式: C₂₇H₂₈N₄O₅
• 分子量: 488.543
• InChiKey: AMBYWRCEECAZRM-HUBRGWSESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  87.4
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-benzyl-5'-O-benzyl-2',3'-O-isopropylideneinosine 在 三氟乙酸 作用下， 反应 3.33h， 以95%的产率得到1-(2',3'-Dihydroxy-5'-O-benzyl-β-D-erythro-pentofuranosyl)-N¹-benzylinosine
  参考文献：
  名称：

  5'-O-Tritylinosine及其类似物作为人胸苷磷酸化酶的变构抑制剂。

  摘要：

  基于我们先前的发现，即5'-O-三苯甲基肌氨酸（KIN59）可以作为血管生成酶胸苷磷酸化酶（TPase）的变构抑制剂，我们已经进行了合成和酶促评估，研究了一系列在位置修饰的核苷类似物嘌呤环的1、2或6，以及先导化合物KIN59的核糖部分的5'-位置。SAR研究表明，可以在KIN59上进行相当大的结构变异，而不会影响TPase抑制作用。因此，与KIN59相比，在5'-O-三苯甲基肌氨酸的N（1）位上引入环丙基甲基或环己基甲基基团提高了对TPase的抑制活性10倍。此外，核糖5'-位的三苯甲基似乎对TPase抑制至关重要。

  DOI：

  10.1021/jm0605379
• 作为产物：
  描述：

  溴甲苯 、 2',3'-O-异丙叉肌苷 在 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 以71%的产率得到1-benzyl-5'-O-benzyl-2',3'-O-isopropylideneinosine
  参考文献：
  名称：

  5'-O-Tritylinosine及其类似物作为人胸苷磷酸化酶的变构抑制剂。

  摘要：

  基于我们先前的发现，即5'-O-三苯甲基肌氨酸（KIN59）可以作为血管生成酶胸苷磷酸化酶（TPase）的变构抑制剂，我们已经进行了合成和酶促评估，研究了一系列在位置修饰的核苷类似物嘌呤环的1、2或6，以及先导化合物KIN59的核糖部分的5'-位置。SAR研究表明，可以在KIN59上进行相当大的结构变异，而不会影响TPase抑制作用。因此，与KIN59相比，在5'-O-三苯甲基肌氨酸的N（1）位上引入环丙基甲基或环己基甲基基团提高了对TPase的抑制活性10倍。此外，核糖5'-位的三苯甲基似乎对TPase抑制至关重要。

  DOI：

  10.1021/jm0605379

文献信息

• 7,5′-<i>O</i>-Dibenzylinosines: Synthesis and Studies on Their Conformational Properties
  作者：Elena Casanova、María-Jesús Pérez-Pérez、Leire Aguado、María-Luisa Jimeno、Federico Gago、María-José Camarasa

  DOI：10.1080/15257770701490696

  日期：2007.11.26

  Reaction of 2',3'-O-isopropylidene inosine with benzyl bromide (1 h, rt) led to the 1,5'-O-dibenzylderivative 4, but by increasing the reaction time or the temperature, compound 4 is further transformed into the 1,7,5'-O-tribenzylinosine derivative 5. Similarly, the 7-methyl-1,5'-O-dibenzylderivative 6 has been synthesized from 4. The H-1-NMR spectra of 5 and 6 showed peculiar chemical shifts for geminal protons (H5' and H5 '' of the ribose, and the CH2 of the benzyl groups). Preliminary NAIR studies have been performed, including NOESY experiments that point toward the predominant existence of conformers that are stabilized by an electrostatic interaction between the positively charged imidazole of the base moiety and the high electron density of the 5'-benzyl substituent.
• 5‘-<i>O</i>-Tritylinosine and Analogues as Allosteric Inhibitors of Human Thymidine Phosphorylase
  作者：Elena Casanova、Ana-Isabel Hernández、Eva-María Priego、Sandra Liekens、María-José Camarasa、Jan Balzarini、María-Jesús Pérez-Pérez

  DOI：10.1021/jm0605379

  日期：2006.9.1

  On the basis of our previous findings that 5'-O-tritylinosine (KIN59) behaves as an allosteric inhibitor of the angiogenic enzyme thymidine phosphorylase (TPase), we have undertaken the synthesis and enzymatic evaluation of a novel series of nucleoside analogues modified at positions 1, 2, or 6 of the purine ring and at the 5'-position of the ribose moiety of the lead compound KIN59. SAR studies indicate

  基于我们先前的发现，即5'-O-三苯甲基肌氨酸（KIN59）可以作为血管生成酶胸苷磷酸化酶（TPase）的变构抑制剂，我们已经进行了合成和酶促评估，研究了一系列在位置修饰的核苷类似物嘌呤环的1、2或6，以及先导化合物KIN59的核糖部分的5'-位置。SAR研究表明，可以在KIN59上进行相当大的结构变异，而不会影响TPase抑制作用。因此，与KIN59相比，在5'-O-三苯甲基肌氨酸的N（1）位上引入环丙基甲基或环己基甲基基团提高了对TPase的抑制活性10倍。此外，核糖5'-位的三苯甲基似乎对TPase抑制至关重要。
• Intramolecular Cation−π Interactions As the Driving Force To Restrict the Conformation of Certain Nucleosides
  作者：Elena Casanova、Eva-María Priego、María-Luisa Jimeno、Leire Aguado、Ana Negri、Federico Gago、María-José Camarasa、María-Jesús Pérez-Pérez

  DOI：10.1021/jo902677s

  日期：2010.3.19

  Despite the well-established importance of intermolecular cation-pi interactions in molecular recognition, intramolecular cation-pi interactions have been less studied. Here we describe how the simultaneous presence of an aromatic ring at the 5'-position of an inosine derivative and a positively charged imidazolium ring in the purine base drive the conformation of the nucleoside toward a very major conformer in solution that is stabilized by an intramolecular cation-pi interaction. Therefore, the cation-pi interaction between imidazolium ions and aromatic rings can also be proposed in the design of small molecules where this type of interaction is desirable. The imidazolium ion can be obtained by a simple acidification of the pH of the media. So a simple change in pH can shift the conformational equilibrium from a random to a restricted conformation stabilized by an intramolecular cation-pi interaction. Thus the here described nucleosides can be considered as a new class of pH-dependent conformationally switchable molecules.