N²-acetyl-2',3',5'-tri-O-acetyl-O⁶-methylguanosine | 153248-54-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N²-acetyl-2',3',5'-tri-O-acetyl-O⁶-methylguanosine
• 英文别名: (2R,3R,4R,5R)-2-(2-acetamido-6-methoxy-9H-purin-9-yl)-5-(acetoxymethyl)tetrahydrofuran-3,4-diyl diacetate；[(2R,3R,4R,5R)-5-(2-acetamido-6-methoxypurin-9-yl)-3,4-diacetyloxyoxolan-2-yl]methyl acetate
• CAS: 153248-54-5
• 化学式: C₁₉H₂₃N₅O₉
• 分子量: 465.42
• InChiKey: VQSNFIIWNFAYAF-SCFUHWHPSA-N

物化性质

• 密度：
  1.55±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.6
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  170
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N²-acetyl-2',3',5'-tri-O-acetyl-O⁶-methylguanosine 在 吡啶 、 咪唑 、 氟化氢吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 19.75h， 生成 N-(9-((2R,3R,4R,5R)-3-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-6-methoxy-9H-purin-2-yl)acetamide
  参考文献：
  名称：

  Fingerprints of Modified RNA Bases from Deep Sequencing Profiles

  摘要：

  Posttranscriptional modifications of RNA bases are not only found in many noncoding RNAs but have also recently been identified in coding (messenger) RNAs as well. They require complex and laborious Methods to locate, and many still lack methods for localized detection. Here we test the ability of next-generation sequencing (NGS) to detect and distinguish between ten modified bases in synthetic RNAs. We compare ultradeep sequencing patterns of modified bases, including miscoding, insertions and deletions (indels), and truncations, to unmodified bases in the same contexts. The data show widely varied responses to modification, ranging from no response, to high levels of mutations, insertions, deletions, and truncations. The patterns are distinct for several of the modifications, and suggest the future use of ultradeep sequencing as a fingerprinting strategy for locating and identifying modifications in cellular RNAs.

  DOI：

  10.1021/jacs.7b07914
• 作为产物：
  描述：

  Acetic acid (2R,3R,4R,5R)-4-acetoxy-5-acetoxymethyl-2-(2-acetylamino-6-oxo-1,6-dihydro-purin-9-yl)-tetrahydro-furan-3-yl ester 在 1-甲基吡咯烷 、 4-二甲氨基吡啶 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 5.5h， 生成 N²-acetyl-2',3',5'-tri-O-acetyl-O⁶-methylguanosine
  参考文献：
  名称：

  O6-（烷基/芳烷基）鸟苷和2'-脱氧鸟苷衍生物：合成和增强氯乙基亚硝基脲抗肿瘤作用的能力。

  摘要：

  合成了一系列O6-（烷基/芳烷基）鸟苷和2'-脱氧鸟苷类似物，它们扩展到可能具有水溶性的全乙酰基和N2-乙酰基衍生物。每个都与N'-（2-氯乙基）-N- [2-（甲基磺酰基）乙基] -N'-亚硝基脲相关，以体外评估M4Beu黑色素瘤细胞增强该氯代乙基亚硝基脲的细胞毒性作用的能力。通常通过O6-烷基鸟嘌呤-DNA-烷基转移酶进行的修复而减少。结构活性分析表明，（i）苄基和4-卤代苄基是提供显着活性所需的O6-取代基，（ii）2'-脱氧鸟苷衍生物比鸟苷类似物具有更高的效力，（iii）乙酰化，尤其是在N2上位置，通常会产生具有中等能力的化合物，但可能会阻止此类核苷掺入DNA。因此，O6-（4-碘苄基）-N2-乙酰鸟苷（3b）和O6-苄基过乙酰基-2'-脱氧鸟苷（2a）以及O6-苄基-N2-乙酰鸟苷（1b）和O6-苄基-N2-乙酰基到目前为止，水溶性最高的-2'-脱氧鸟苷（2b）具有良好的特性，可用于通过静脉途径进行的进一步体内试验。

  DOI：

  10.1021/jm960881d

文献信息

• 2'-AZIDO SUBSTITUTED NUCLEOSIDE DERIVATIVES AND METHODS OF USE THEREOF FOR THE TREATMENT OF VIRAL DISEASES
  申请人：Girijavallabhan Vinay

  公开号：US20140206640A1

  公开（公告）日：2014-07-24

  The present invention relates to 2′-Azido Substituted Nucleoside Derivatives of Formula (I): and pharmaceutically acceptable salts thereof, wherein B, X, R 1 , R 2 and R 3 are as defined herein. The present invention also relates to compositions comprising at least one 2′-Azido Substituted Nucleoside Derivative, and methods of using the 2′-Azido Substituted Nucleoside Derivatives for treating or preventing HCV infection in a patient.

  本发明涉及式(I)的2'-叠氮基取代核苷衍生物及其药学上可接受的盐，其中B、X、R1、R2和R3如本文所定义。本发明还涉及包含至少一种2'-叠氮基取代核苷衍生物的组合物，以及使用这些2'-叠氮基取代核苷衍生物治疗或预防患者HCV感染的方法。
• Kinetics and mechanism of the defluorination of 8-fluoropurine nucleosides in basic and acidic media
  作者：Jie Liu、Jorge R. Barrio、Nagichettiar Satyamurthy

  DOI：10.1016/j.jfluchem.2006.06.006

  日期：2006.9

  protected 8-fluoroguanosine, 8-fluoroinosine and 8-fluoroadenosine derivatives were prepared by direct fluorination of acetyl-protected purine nucleosides with elemental fluorine in solvents such as chloroform, acetonitrile and nitromethane. Fluorination reactions conducted in chloroform medium gave better yields of 8-fluoropurines. The fluorination yields were slightly lower when acetonitrile or nitromethane

  为了研究C（8）-氟键在8-氟嘌呤核苷中的稳定性，通过在溶剂（例如氯仿）中用元素氟直接氟化乙酰基保护的嘌呤核苷，制备了一些受保护的8-氟鸟苷，8-氟肌苷和8-氟腺苷衍生物。 ，乙腈和硝基甲烷。在氯仿介质中进行的氟化反应产生了更好的8-氟嘌呤收率。当使用乙腈或硝基甲烷作为溶剂时，氟化收率略低，但是发现产品纯化要容易得多。对合成的受保护的氟核苷进行标准的碱性（NH 3（在甲醇或2-丙醇中）和在核苷化学相关的酸性（HCl在甲醇中）脱保护条件下，发生了有效的脱氟反应。使用19 F NMR光谱在拟一级反应条件下方便地跟踪这些脱氟反应的动力学。1 H NMR，LC-MS和质谱鉴定了动力学反应混合物的产物。基本介质中的脱氟反应速率常数（k obs）取决于C（8）处的电子密度，而酸性介质中的k obs数据由N 7的p K a确定。基于加减的机制（S N已提出将Ar）用于这些8-氟嘌呤核苷的脱氟反应。
• Ozonation of thionucleosides. A new chemical transformation of 4-thiouracil and 6-thioguanine nucleosides to cytosine and adenosine counterparts
  作者：Raffaele Saladino、Claudia Crestini、Francesca Occhionero、Rosario Nicoletti

  DOI：10.1016/0040-4020(95)00076-k

  日期：1995.3

  The ozonation of 4-thiopyrimidine and 6-thiopurine nucleosides in presence of amines afforded selectively and under mild experimental conditions several cytidine and adenosine nucleosides. The same reaction carried out in presence of alcohols afforded O4- or O6-alkylated derivatives of the nucleosides.

  在胺存在下对4-硫代嘧啶和6-硫代嘌呤核苷的臭氧化作用在温和的实验条件下选择性地提供了几个胞苷和腺苷核苷。在醇存在下进行相同的反应，得到核苷的O 4-或O 6-烷基化衍生物。
• Dimethyldioxirane oxidations: A new and efficient desulfurization of thiopyrimidine and thiopurine nucleosides.
  作者：Claudia Crestini、Raffaele Saladino、Roberta Bernini、Enrico Mincione

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)61566-6

  日期：1993.11

  Dimethyldioxirane reacts with 2′,3′,5′-tri-O-acetyl-4(3H)thiouridine 1 and 2-acetamido-6-thio-9-(2′,3′,5′-tri-O-acetyl-β-D-ribosyl)purine 2 to afford several interesting desulfurized products.

  二甲基二环氧乙烷与2'，3'，5'-三-O-乙酰基-4（3H）硫尿苷1和2-乙酰氨基-6-硫代9-（2'，3'，5'-三-O-乙酰基反应-β-D-核糖基）嘌呤2提供几种有趣的脱硫产物。
• Reaction of O6-methylguanosine with nitrite in the presence of carboxylic acid: synthesis of the purin-2-yl carboxylate
  作者：Tokumi Maruyama、Nobuyasu Moriwaka、Yosuke Demizu、Masami Ohtsuka

  DOI：10.1016/j.tetlet.2005.09.140

  日期：2005.11

  O6-Methylguanosine derivative was treated with sodium nitrite or isoamylnitrite in the presence of carboxylic acid to give the purin-2-yl carboxylate, an unusual product bearing a carboxylic group at the 2-position of the purine moiety.

  在羧酸存在下，用亚硝酸钠或亚硝酸异戊酯处理O6-甲基鸟苷衍生物，得到嘌呤-2-基羧酸盐，其为嘌呤部分2-位带有羧基的不寻常产物。