(2R,3S,4S,6R,7R/S,8E,10R,11R)-S-2-acetamidoethyl-3,11-dihydroxy-2,4,6,10-tetramethyl-7-oxotridec-8-enethioate | 858371-92-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: (2R,3S,4S,6R,7R/S,8E,10R,11R)-S-2-acetamidoethyl-3,11-dihydroxy-2,4,6,10-tetramethyl-7-oxotridec-8-enethioate
• 英文别名: (2R,3S,4S,6R,10R,11R,8E)-S-2-Ethanamidoethyl 3,11-dihydroxy-2,4,6,10-tetramethyl-7-oxotridec-8-enethioate；S-(2-acetamidoethyl) (E,2R,3S,4S,6R,10R,11R)-3,11-dihydroxy-2,4,6,10-tetramethyl-7-oxotridec-8-enethioate
• CAS: 858371-92-3
• 化学式: C₂₁H₃₇NO₅S
• 分子量: 415.594
• InChiKey: GAYVQFBZZSAYQS-LXDBCWTRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.76
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3S,4S,6R,7R/S,8E,10R,11R)-S-2-acetamidoethyl-3,11-dihydroxy-2,4,6,10-tetramethyl-7-oxotridec-8-enethioate 在 2-乙烯基吡啶 、 recombinant pikromycin thioesterase mutant S₁₄₈C 作用下， 以 aq. phosphate buffer 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 0.33h， 生成 10-去氧微甘菊内酯
  参考文献：
  名称：

  匹克霉素硫酯酶中的单个活性位点突变产生更有效的大环化催化剂

  摘要：

  天然产物类似物的大内酯化对生物合成组装和合成化学提出了重大挑战。在上一篇论文中，我们发现了吡克霉素（Pik）系统中处理非天然底物的硫酯酶（TE）结构域催化瓶颈，阻止了差向异构化大环内酯的形成。在这里，我们进行分子动力学模拟，显示差向异构化的六酮化合物被容纳在 Pik TE 活性位点内；然而，底物的内在构象偏好导致主要是非生产性构象，与观察到的水解一致。因此，我们设计了立体选择性 Pik TE，以产生一种变体 (TES148C)，该变体具有改进的反应动力学和非天然差向异构化六酮化合物的功能获得处理。 TES148C 模型和 TEWT 反应坐标图的量子力学比较揭示了从逐步加成-消除 (TEWT) 到较低能量协同酰基取代 (TES148C) 的机制变化，解释了功能的获得和反应动力学的改进。最后，我们将 S148C 突变引入聚酮合酶模块 (PikAIII-TE)，以提高底物灵活性，从而能够生产非对映体大环内酯。

  DOI：

  10.1021/jacs.7b06436
• 作为产物：
  描述：

  (2R,4S)-5-(4-methoxybenzyloxy)-2,4-dimethylpentanal 在 chromium dichloride 、 4-二甲氨基吡啶 、 manganese(IV) oxide 、 lithium hydroxide 、 N-甲基吲哚酮 、 四丙基高钌酸铵 、 三氟甲磺酸二丁硼 、 水 、 双氧水 、 氟化氢吡啶 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌 、 nickel dichloride 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 154.25h， 生成 (2R,3S,4S,6R,7R/S,8E,10R,11R)-S-2-acetamidoethyl-3,11-dihydroxy-2,4,6,10-tetramethyl-7-oxotridec-8-enethioate
  参考文献：
  名称：

  聚酮化合物大环内酯 10-脱氧甲炔内酯的化学酶法合成

  摘要：

  聚酮合酶衍生的皮克霉素硫酯酶 (Pik TE)​​ 具有独特的催化 12 和 14 元大环内酯环化的能力。在这项研究中，天然六酮链延长中间体作为其 N-乙酰半胱胺 (NAC) 硫酯的全合成已经实现，其与 Pik TE 的反应证明了 Pik TE 催化其大环内酯化成天然产物 10-脱氧甲炔内酯。使用 Pik TE 对六酮链中间体进行稳态动力学分析。完成了对非天然六酮化合物类似物的初步底物特异性研究，证明了全合成在获得高级聚酮化合物中间体方面的重要性。结果表明 Pik TE 对微小的底物修饰敏感，

  DOI：

  10.1021/ja0504340

文献信息

• Biochemical Investigation of Pikromycin Biosynthesis Employing Native Penta- and Hexaketide Chain Elongation Intermediates
  作者：Courtney C. Aldrich、Brian J. Beck、Robert A. Fecik、David H. Sherman

  DOI：10.1021/ja042592h

  日期：2005.6.1

  the pikromycin (Pik) polyketide synthase to generate 12- and 14-membered ring macrolactones presents an opportunity to explore the fundamental processes underlying polyketide synthesis, specifically the mechanistic details of chain extension, keto group processing, acyl chain release, and macrocyclization. We have synthesized the natural pentaketide and hexaketide chain elongation intermediates as N-acetyl

  pikromycin (Pik) 聚酮化合物合成酶生成 12 和 14 元环大环内酯的独特能力为探索聚酮化合物合成的基本过程提供了机会，特别是链延伸、酮基加工、酰基链释放和大环化。我们合成了天然五肽和六酮链延长中间体作为 N-乙酰半胱胺 (NAC) 硫酯，并将它们用作与工程化 PikAIII+TE 以及与天然 PikAIII（模块 5）和 PikAIV（模块 6）组合进行体外转化的底物) 多功能蛋白质。这项研究直接证明了这些单体模块在催化一个或两个扩链反应、酮基加工步骤、酰基-ACP 释放、环化生成10-脱氧甲炔内酯和萘内酯。结果揭示了 Pik 单体对其天然聚酮化合物底物的极大偏好，并提供了与先前使用非天然二酮 NAC 硫酯底物的研究的重要比较分析。
• Linear Aglycones Are the Substrates for Glycosyltransferase DesVII in Methymycin Biosynthesis:  Analysis and Implications
  作者：Chai-Lin Kao、Svetlana A. Borisova、Hak Joong Kim、Hung-wen Liu

  DOI：10.1021/ja058433v

  日期：2006.5.1

  The two essential structural components of macrolide antibiotics are the polyketide aglycone and the appended sugars. The aglycone formation is catalyzed by polyketide synthase (PKS), and glycosylation is catalyzed by an appropriate glycosyltransferase. Although it has been shown that glycosylation occurs after the cyclic aglycone is released from PKS, it is not known whether the acyl carrier protein

  大环内酯类抗生素的两个基本结构成分是聚酮苷元和附加糖。苷元的形成由聚酮合酶 (PKS) 催化，糖基化由适当的糖基转移酶催化。虽然已经表明糖基化发生在环状苷元从 PKS 释放后，但尚不清楚与酰基载体蛋白 (ACP) 结合的线性聚酮链是否也可以被相应的糖基转移酶处理。为了探索这种可能性，以线性形式化学合成了作为 N-乙酰半胱胺 (NAC) 硫酯的糖苷配基 10-脱氧甲炔内酯，它是甲霉素和新甲霉素的前体。随后在专用糖基转移酶 DesVII 和激活剂 DesVIII 存在下与 TDP-d-desosamine 孵育，产生极性更强的产物，其高分辨率质量与预期的糖基化产物一致。该研究首次证明大环内酯糖基转移酶也可以识别和加工其大环内酯底物的线性前体，但活性降低但可测量。
• Frontiers and Opportunities in Chemoenzymatic Synthesis
  作者：Jonathan D. Mortison、David H. Sherman

  DOI：10.1021/jo101124n

  日期：2010.11.5

  Natural product biosynthetic pathways have evolved enzymes with myriad activities that represent an expansive array of chemical transformations for constructing secondary metabolites. Recently, harnessing the biosynthetic potential of these enzymes through chemoenzymatic synthesis has provided a powerful tool that often rivals the most sophisticated methodologies in modern synthetic chemistry and provides new opportunities for accessing chemical diversity. Herein, we describe our research efforts with enzymes from a broad collection of biosynthetic systems, highlighting recent progress in this exciting field.
• Macrolactonization to 10-deoxymethynolide catalyzed by the recombinant thioesterase of the picromycin/methymycin polyketide synthase
  作者：Weiguo He、Jiaquan Wu、Chaitan Khosla、David E. Cane

  DOI：10.1016/j.bmcl.2005.09.077

  日期：2006.1

  The recombinant thioesterase (TE) domain of the picromycin/methymycin synthase (PICS) catalyzes the macrolactonization of 3, the N-acetylcysteamine thioester of seco-10-deoxymethynolide to generate 10-deoxymethynolide (1) with high efficiency. By contrast, 4, the 7-dihydro derivative of seco-thioester 3, undergoes exclusive hydrolysis by PICS TE to seco-acid 5. The recombinant TE domain of 6-deoxyerythronolide B synthase (DEBS TE) shows the same reaction specificity as PICS TE, but with significantly lower activity. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Chain Elongation, Macrolactonization, and Hydrolysis of Natural and Reduced Hexaketide Substrates by the Picromycin/Methymycin Polyketide Synthase
  作者：Jiaquan Wu、Weiguo He、Chaitan Khosla、David E. Cane

  DOI：10.1002/anie.200502246

  日期：2005.11.25