(1R,4S,5R)-1,4-bis(tert-butyldimethylsilyloxy)-3-oxocyclohexane-1,5-carbolactone | 862791-12-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 内酯类
• 英文名称: (1R,4S,5R)-1,4-bis(tert-butyldimethylsilyloxy)-3-oxocyclohexane-1,5-carbolactone
• 英文别名: (1R, 4S, 5R)-1,4-di(tert-butyldimethylsilyloxy)-3-oxocyclohexan-1,5-carbolactone；(1R,4S,5R)-1,4-di(tert-butyldimethylsilyloxy)-3-oxocyclohexane-1,5-carbolactone；(1R,4S,5R)-1,4-di(tert-butyldimethylsilyloxy)-3-oxocyclohexan-1,5-carbolactone；(1R,4S,5R)-1,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-6-oxabicyclo[3.2.1]octane-3,7-dione
• CAS: 862791-12-6
• 化学式: C₁₉H₃₆O₅Si₂
• 分子量: 400.663
• InChiKey: FFOYFXDUTFZGGA-CLCXKQKWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.43
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.89
• 拓扑面积：
  61.8
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1R,4S,5R)-1,4-bis(tert-butyldimethylsilyloxy)-3-oxocyclohexane-1,5-carbolactone 在 四丁基氟化铵 、 双(三甲基硅烷基)氨基钾 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 生成 (1R,4S,5R)-3-(benzo[b]tiophen-5-yl)methoxy-1,4-dihydroxy-cyclohex-2-en-1,5-carbolactone
  参考文献：
  名称：

  前药方法，以提高有效的结核分枝杆菌II型脱氢喹啉酶抑制剂的抗结核活性。

  摘要：

  的高亲和性可逆的竞争性抑制剂的合成中的结核分枝杆菌II型dehydroquinase，在一个必需酶的结核分枝杆菌的细菌被报告。此处报道的抑制剂是烯醇中间体的模拟物，研究了取代对C2的影响。结核分枝杆菌的晶体结构还描述了与三种报道的抑制剂复合的II型脱氢喹啉酶。结果表明，C2上的芳族取代基可通过阻止Arg108与柔性环的基本Tyr24的氢键相互作用（引发催化的残基）来阻止活性位点的封闭。还通过酯前药方法对报告的酸进行了化学修饰，以改善其在结核分枝杆菌中的内在化。丙酸酯被证明是实现最佳体外活性的最有效方法。

  DOI：

  10.1021/jm2006063
• 作为产物：
  描述：

  (1S,3R,4R,5R)-3-benzyloxy-1,4-dihydroxycyclohexane-1,5-carbolactone 在 palladium dihydroxide 吡啶 、 重铬酸吡啶 、 4 A molecular sieve 、 氢气 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 65.0h， 生成 (1R,4S,5R)-1,4-bis(tert-butyldimethylsilyloxy)-3-oxocyclohexane-1,5-carbolactone
  参考文献：
  名称：

  基于结构的设计，合成和结核分枝杆菌II型脱氢喹啉酶抑制剂的生物学评估。

  摘要：

  据报道，通过铃木（Suzuki）交联合成了已知抑制剂（1R，3R，4R）-1,3,4-三羟基环己基-5-en-1-羧酸的12个5-芳基类似物。发现这些化合物是针对结核分枝杆菌II型脱氢喹啉酶（the草酸途径的第三种酶）的可逆竞争性抑制剂。最有效的抑制剂3-硝基苯基衍生物的K（i）为54 nM，比已报道的抑制剂（1R，3R，4R）-5-氟-1,3,4-三羟基环己基-强180倍以上5-en-1-羧酸，比底物的K（M）低700倍以上，是已知的最有效的II型脱氢喹啉酶抑制剂。使用GOLD（2.2版）进行的对接研究表明，芳环与Arg19之间存在关键的静电结合相互作用，

  DOI：

  10.1021/jm0501836

文献信息

• Synthesis and Biological Evaluation of New Nanomolar Competitive Inhibitors of <i>Helicobacter pylori</i> Type II Dehydroquinase. Structural Details of the Role of the Aromatic Moieties with Essential Residues
  作者：Verónica F. V. Prazeres、Lorena Tizón、José M. Otero、Pablo Guardado-Calvo、Antonio L. Llamas-Saiz、Mark J. van Raaij、Luis Castedo、Heather Lamb、Alastair R. Hawkins、Concepción González-Bello

  DOI：10.1021/jm9010466

  日期：2010.1.14

  novel antibiotics. Dehydroquinase is the third enzyme of the pathway, catalyzing the reversible dehydratation of 3-dehydroquinic acid to form 3-dehydroshikimic acid. Here we present the synthesis of novel inhibitors with high affinity for Helicobacter pylori type II dehydroquinase and efficient inhibition characteristics. The structure of Helicobacter pylori type II dehydroquinase in complex with the

  iki草酸途径对于许多病原体是必不可少的，但是在哺乳动物中是不存在的。因此，其途径中的酶是开发新型抗生素的合适靶标。脱氢喹啉酶是该途径的第三个酶，催化3-脱氢奎宁酸的可逆脱水形成3-脱氢shi草酸。在这里，我们提出了对幽门螺杆菌II型脱氢喹啉酶具有高亲和力和有效抑制特性的新型抑制剂的合成。幽门螺杆菌的结构与最有效的抑制剂配合使用的II型脱氢喹啉酶表明，芳香族官能团通过π堆积与催化的Tyr22相互作用，从而将Arg17侧链（对催化至关重要）从活性位点排出。因此，该结构解释了抑制剂的有利特性，并将有助于设计改良的抗生素。
• COMPETITIVE INHIBITORS OF TYPE II DEHYDROQUINASE ENZYME
  申请人：González Bello Cóncepcion

  公开号：US20110313032A1

  公开（公告）日：2011-12-22

  The present invention is directed to a compound of formula (I), its diastereoisomers, its enantiomers or its pharmaceutically acceptable salts or solvates, formula (I), to procedures of obtaining the same, to intermediates thereof, and use as competitive inhibitors of the third enzyme of the shikimic acid pathway, the type II dehydroquinase.

  本发明涉及一种化合物，其化学式为（I），其对映异构体，其对映体或其药学上可接受的盐或溶剂，化学式（I），以及获得该化合物的方法，其中间体，以及用作芪酸途径第三酶的竞争性抑制剂，即Ⅱ型脱氢奎尼酸酶。
• Competitive inhibitors of type ii dehydroquinase enzyme
  申请人：UNIVERSIDADE DE SANTIAGO DE COMPOSTELA

  公开号：EP2202230A1

  公开（公告）日：2010-06-30

  The present invention is directed to a compound of formula I, its diastcrcoisomcrs, its enantiomers or its pharmaceutically acceptable salts or solvates, to procedures of obtaining the same, to intermediates thereof, and use as competitive inhibitors of the third enzyme of the shikimic acid pathway, the type 11 dehydroquinase.

  本发明涉及一种I式化合物，其对映异构体，其对映体或其药学上可接受的盐或溶剂，以及获取该化合物的方法，其中该化合物可用作芽孢杆菌酸途径的第三酶，即11型脱氢奎尼酸酶的竞争性抑制剂。
• [EN] ESTER DERIVATIVES AS COMPETITIVE INHIBITORS OF TYPE II DEHYDROQUINASE ENZYME<br/>[FR] DÉRIVÉS D'ESTER EN TANT QU'INHIBITEURS COMPÉTITIFS D'ENZYME DÉSHYDROQUINASE DE TYPE II
  申请人：UNIV SANTIAGO COMPOSTELA

  公开号：WO2010146125A1

  公开（公告）日：2010-12-23

  The present invention is directed to a compound of formula I, its diastereoisomers, its enantiomers or its pharmaceutically acceptable salts or solvates, to procedures of obtaining the same, and use as competitive inhibitors of the third enzyme of the shikimic acid pathway, the type II dehydroquinase.

  本发明涉及公式I的化合物，其对映异构体，其对映体或其药学上可接受的盐或溶剂，以及获得相同的程序，并用作芽孢酸途径的第三酶，即II型去氢奎尼酸酶的竞争性抑制剂。
• Insights into substrate binding and catalysis in bacterial type I dehydroquinase
  作者：María Maneiro、Antonio Peón、Emilio Lence、José M. Otero、Mark J. Van Raaij、Paul Thompson、Alastair R. Hawkins、Concepción González-Bello

  DOI：10.1042/bj20140614

  日期：2014.9.15

  Structural, biochemical and computational studies to study substrate binding and the role of the conserved residues of the DHQ1 (type I dehydroquinase) enzyme active site are reported in the present paper. The crystal structure of DHQ1 from Salmonella typhi in complex with (2R)-2-methyl-3-dehydroquinic acid, a substrate analogue, was solved at 1.5 Å. The present study reveals a previously unknown key role for conserved Glu46, Phe145 and Met205 and Gln236, Pro234 and Ala233 residues, with the latter three being located in the flexible substrate-covering loop. Gln236 was shown to be responsible for the folding of this loop and for the dramatic reduction of its flexibility, which triggers active site closure. Glu46 was found to be key in bringing the substrate close to the lysine/histidine catalytic pocket to initiate catalysis. The present study could be useful in the rational design of inhibitors of this challenging and recognized target for the development of novel herbicides and antimicrobial agents.

  本文报告了对底物结合以及 DHQ1（I 型脱氢对苯二酚酶）酶活性位点保守残基作用的结构、生物化学和计算研究。本研究揭示了保守残基 Glu46、Phe145 和 Met205 以及 Gln236、Pro234 和 Ala233 先前未知的关键作用，其中后三个残基位于灵活的底物覆盖环中。研究表明，Gln236 负责该环路的折叠，并使其灵活性急剧下降，从而引发活性位点关闭。研究发现，Glu46 是使底物靠近赖氨酸/组氨酸催化袋以启动催化的关键。本研究有助于针对这一具有挑战性的公认靶点合理设计抑制剂，以开发新型除草剂和抗菌剂。