6-iodouridine | 105967-11-1

• 物质功能分类: 医药中间体 - 嘧啶类化合物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 6-iodouridine
• 英文别名: 1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-6-iodopyrimidine-2,4-dione
• CAS: 105967-11-1
• 化学式: C₉H₁₁IN₂O₆
• 分子量: 370.101
• InChiKey: CUJFLFNXVSOBKJ-YXZULKJRSA-N

物化性质

• 密度：
  2.27

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.6
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 海关编码：
  2934999090

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-iodouridine 在 咪唑 、 二氯乙酸 、 双(乙腈)氯化钯(II) 、 sodium periodate 、 copper(l) iodide 、 四氧化锇 、 碘苯二乙酸 、 四丁基氟化铵 、 碘 、 N-甲基吗啉氧化物 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 乙醚 、 环己烷 、 水 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 为溶剂， 反应 32.0h， 生成 6,1'-(1-oxaethano)uridine
  参考文献：
  名称：

  次碘酸盐反应条件下尿嘧啶核苷的面选择性6,1'-（1-oxo）ethano桥形成

  摘要：

  充分描述了在Heusler-Kalvoda和Suárez的低碘反应条件下以立体选择性方式合成具有异头酯原酸酯结构的新型螺尿嘧啶核苷。2'-deoxy-6-（羟甲基）尿苷2和2'-deoxy-6-[（1-羟基-1-甲基）乙基]尿苷4以43-68％的产率得到β-和α-螺代核苷，由于低选择性（），仲醇3a和3b的化学产率为68–79％，选择性明显好于（）。在该6-（羟基）尿苷同行的方向6-8，16-17，和19似乎不仅受2'-取代基的控制，而且受C6-侧链的C7-立体中心的手性的控制，就像在2'-脱氧尿苷系列中一样。该反应的过渡态的几何形状被假定基于环化产物的X射线晶体结构20 α和24 β。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(99)00232-x
• 作为产物：
  描述：

  尿嘧啶核苷 在 咪唑 、 硫酸 、 三氟乙酸 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 6-iodouridine
  参考文献：
  名称：

  一种有效的，具有抗疟疾活性的牙足苷5'-单磷酸脱羧酶的共价抑制剂。

  摘要：

  卵磷脂5'-单磷酸脱羧酶（ODCase）已经进化为在没有任何共价中间体的情况下催化了Orotidine 5'-单磷酸的脱羧反应。ODCase中的活性位点残基参与广泛的氢键网络。我们发现6-碘尿苷5'-单磷酸酯（6-碘-UMP）不可逆地抑制了嗜热自养甲烷杆菌和恶性疟原虫ODCase的催化活性。酶抑制剂复合物的质谱分析证实了抑制剂与ODCase的共价结合，伴随着两个质子和碘部分的损失。抑制剂和ODCase的复合物的X射线晶体结构（分辨率为1.6 A）清楚地显示了与活性位点Lys-72 [校正]残基形成的共价键。6-碘-UMP以时间和浓度依赖性方式抑制ODCase。6-碘尿苷（6-碘-UMP的核苷形式）显示出有效的抗血浆活性，对恶性疟原虫ItG和3D7分离株的IC50分别为4.4 +/- 1.3 microM和6.2 +/- 0.7 microM。6-碘尿苷5'-单磷酸酯是ODCase的新型共价

  DOI：

  10.1021/jm060827p

文献信息

• OLIGONUCLEOTIDE
  申请人：Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd.

  公开号：US20150376611A1

  公开（公告）日：2015-12-31

  The present invention provides an oligonucleotide having improved affinity for AGO2, and the like. The oligonucleotide has a nucleotide residue or a nucleoside residue represented by formula (I) wherein X 1 is an oxygen atom or the like, R 1 is formula (IIA) (wherein R 5A is halogen or the like, and R 6A is a hydrogen atom or the like) or formula (IVA) (wherein Y 3A is a nitrogen atom or the like, and Y 4A is CH or the like), or the like, R 2 is a hydrogen atom, hydroxy, halogen, or optionally substituted lower alkoxy, and R 3 is a hydrogen atom or the like} at the 5′ end thereof, and the nucleotide residue or the nucleoside residue binds to an adjacent nucleotide residue through the oxygen atom at position 3.

  本发明提供了一种具有改善对AGO2亲和力的寡核苷酸等。该寡核苷酸在其5'端具有由式(I)表示的核苷酸残基或核苷酸残基其中X 1 是氧原子或类似物，R 1 是式(IIA)（其中R 5A 是卤素或类似物，而R 6A 是氢原子或类似物）或式(IVA)（其中Y 3A 是氮原子或类似物，而Y 4A 是CH或类似物），或类似物，R 2 是氢原子、羟基、卤素或可选择地取代的较低烷氧基，而R 3 是氢原子或类似物}，并且该核苷酸残基或核苷酸残基通过位于位置3的氧原子与相邻核苷酸残基结合。
• OLIGONUCLEOTIDE HAVING NON-NATURAL NUCLEOTIDE AT 5'-TERMINAL THEREOF
  申请人：Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd.

  公开号：US20170354673A1

  公开（公告）日：2017-12-14

  An oligonucleotide having a nucleotide residue or a nucleoside residue represented by formula (I) wherein X 1 is an oxygen atom or the like, R 1 is formula (IIA) (wherein R 5A is halogen or the like, and R 6A is a hydrogen atom or the like), formula (IVA) (wherein Y 3A is a nitrogen atom or the like, and Y 4A is CH or the like), or the like, R 2 is a hydrogen atom, hydroxy, halogen, or optionally substituted lower alkoxy, and R 3 is a hydrogen atom or the like, or formula (VI) (wherein n2 is 1, 2 or 3)} at the 5′ end thereof, wherein the nucleotide residue or the nucleoside residue binds to an adjacent nucleotide residue through the oxygen atom at position 3, is provided.

  具有由式(I)表示的核苷酸残基或核苷酸残基的寡核苷酸其中X1是氧原子或类似物，R1是式(IIA)（其中R5A是卤素或类似物，而R6A是氢原子或类似物），式(IVA)（其中Y3A是氮原子或类似物，而Y4A是CH或类似物），或类似物，R2是氢原子，羟基，卤素，或可选择地取代的较低烷氧基，而R3是氢原子或类似物，或式(VI)（其中n2为1、2或3）}在其5'端，其中核苷酸残基或核苷酸残基通过位于位置3的氧原子与相邻核苷酸残基结合。
• Synthesis and biological activities of 5-substituted 6-phenylthio and 6-iodouridines, a new class of antileukemic nucleosides.
  作者：Hiromichi Tanaka、Akira Matsuda、Shuji Iijima、Hiroyuki Hayakawa、Tadashi Miyasaka

  DOI：10.1248/cpb.31.2164

  日期：——

  A new class of 5, 6-disubstituted uridines, in which the C-6 position was occupied by phenylthio group or iodine, were synthesized via lithiation of the corresponding 5-substituted 2', 3'-O-isopropylidene-5'-O-methoxymethyluridines and subsequent electrophilic reactions. These newly-synthesized uridine derivatives exhibited antileukemic activities against mouse leukemia L5178Y cells in culture.

  合成了一类新的5, 6-二取代尿苷，其中C-6位点被苯硫基或碘取代，通过相应5-取代的2', 3'-O-异丙烯基-5'-O-甲氧甲基尿苷的锂化及后续的电亲核反应进行合成。这些新合成的尿苷衍生物在培养中表现出对小鼠白血病L5178Y细胞的抗白血病活性。
• Structure–Activity Relationships of C6-Uridine Derivatives Targeting <i>Plasmodia</i> Orotidine Monophosphate Decarboxylase
  作者：Angelica M. Bello、Ewa Poduch、Yan Liu、Lianhu Wei、Ian Crandall、Xiaoyang Wang、Christopher Dyanand、Kevin C. Kain、Emil F. Pai、Lakshmi P. Kotra

  DOI：10.1021/jm7010673

  日期：2008.2.1

  6-methyl uridine derivatives were studied as inhibitors of plasmodial ODCase. 6-Azidouridine 5'-monophosphate is a potent covalent inhibitor of P. falciparum ODCase. 6-Methyluridine exhibited weak antimalarial activity against P. falciparum 3D7 isolate. 6- N-Methylamino and 6- N, N-dimethylamino uridine derivatives exhibited moderate antimalarial activities.

  由疟原虫寄生虫引起的疟疾已再次成为一个主要问题，对人类健康造成致命影响，特别是由于对多种药物的耐药性。在疟原虫中，牛尿苷5'-单磷酸脱羧酶（ODCase）是尿苷5'-单磷酸从头合成的必需酶。在这些病原体中损害ODCase是开发新型疗法的一种有前途的策略。受我们最近发现6-碘尿苷是恶性疟原虫有效抑制剂的鼓励，我们研究了UMP各种C6衍生物的构效关系。针对恶性疟原虫评估了尿苷的6-氰基，6-叠氮基，6-氨基，6-甲基，6-N-甲基氨基和6-N，N-二甲基氨基衍生物。6-氰基，6-叠氮基，6-氨基，研究了6-甲基尿苷衍生物作为纤溶酶ODCase的抑制剂。6-Azidouridine 5'-monophosphate是恶性疟原虫ODCase的有效共价抑制剂。6-甲基尿苷对恶性疟原虫3D7分离株表现出弱的抗疟活性。6-N-甲基氨基和6-N，N-二甲基氨基尿苷衍生物表现出中等的抗疟活性。
• Antimalarial Activities of 6-Iodouridine and Its Prodrugs and Potential for Combination Therapy
  作者：Ian E. Crandall、Ewa Wasilewski、Angelica M. Bello、Asif Mohmmed、Pawan Malhotra、Emil F. Pai、Kevin C. Kain、Lakshmi P. Kotra

  DOI：10.1021/jm301678j

  日期：2013.3.28

  Plasmodium falciparum to almost all clinically used antimalarial drugs requires the development of new classes of antimalarials. 6-Iodouridine (15), a novel and potent inhibitor of orotidine 5′-monophosphate decarboxylase (ODCase), exhibited efficacy in a mouse model infected by P. chabaudi chabaudi. Compound 15 exhibited promising antimalarial activity against P. falciparum, including drug-resistant isolates

  恶性疟原虫对几乎所有临床使用的抗疟药的耐药性都需要开发新的抗疟药。6-碘尿苷（15）是一种新型，有效的乳清碱5'-单磷酸脱羧酶（ODCase）抑制剂，在被chabaudi chabaudi感染的小鼠模型中显示出功效。化合物15表现出对恶性疟原虫，包括耐药菌株的有希望的抗疟疾活性，并且用15攻击时未观察到寄生虫的快速耐药人群。尿苷提供了克服宿主中任何毒性的选择，但当用15处理时仍能抑制寄生虫负荷。在药物组合研究中，化合物15与青蒿素和阿奇霉素在体内显示出良好的疗效。15的丙酸酯显示出优异的抗疟功效。在新策略的背景下，讨论了15及其前药的抗疟活性以及联合治疗的潜力。