6-iodouridine 5'-monophosphate | 931581-04-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: 6-iodouridine 5'-monophosphate
• 英文别名: 6-iodo-UMP；6IUMP；6-iodo-uridine-5'-O-monophosphate；[(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-(6-iodo-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
• CAS: 931581-04-3
• 化学式: C₉H₁₂IN₂O₉P
• 分子量: 450.081
• InChiKey: VVCMFHKXDUPDFB-YXZULKJRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.3
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  166
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-iodouridine 5'-monophosphate 在 氨 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 6-iodouridine 5'-monophosphate diammonium salt
  参考文献：
  名称：

  WO2008/83465

  摘要：

  公开号：
• 作为产物：
  描述：

  尿嘧啶核苷 在 吡啶 、 咪唑 、 硫酸 、 水 、 三氟乙酸 、 lithium diisopropyl amide 、 三氯氧磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 6-iodouridine 5'-monophosphate
  参考文献：
  名称：

  一种有效的，具有抗疟疾活性的牙足苷5'-单磷酸脱羧酶的共价抑制剂。

  摘要：

  卵磷脂5'-单磷酸脱羧酶（ODCase）已经进化为在没有任何共价中间体的情况下催化了Orotidine 5'-单磷酸的脱羧反应。ODCase中的活性位点残基参与广泛的氢键网络。我们发现6-碘尿苷5'-单磷酸酯（6-碘-UMP）不可逆地抑制了嗜热自养甲烷杆菌和恶性疟原虫ODCase的催化活性。酶抑制剂复合物的质谱分析证实了抑制剂与ODCase的共价结合，伴随着两个质子和碘部分的损失。抑制剂和ODCase的复合物的X射线晶体结构（分辨率为1.6 A）清楚地显示了与活性位点Lys-72 [校正]残基形成的共价键。6-碘-UMP以时间和浓度依赖性方式抑制ODCase。6-碘尿苷（6-碘-UMP的核苷形式）显示出有效的抗血浆活性，对恶性疟原虫ItG和3D7分离株的IC50分别为4.4 +/- 1.3 microM和6.2 +/- 0.7 microM。6-碘尿苷5'-单磷酸酯是ODCase的新型共价

  DOI：

  10.1021/jm060827p

文献信息

• OLIGONUCLEOTIDE
  申请人：Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd.

  公开号：US20150376611A1

  公开（公告）日：2015-12-31

  The present invention provides an oligonucleotide having improved affinity for AGO2, and the like. The oligonucleotide has a nucleotide residue or a nucleoside residue represented by formula (I) wherein X 1 is an oxygen atom or the like, R 1 is formula (IIA) (wherein R 5A is halogen or the like, and R 6A is a hydrogen atom or the like) or formula (IVA) (wherein Y 3A is a nitrogen atom or the like, and Y 4A is CH or the like), or the like, R 2 is a hydrogen atom, hydroxy, halogen, or optionally substituted lower alkoxy, and R 3 is a hydrogen atom or the like} at the 5′ end thereof, and the nucleotide residue or the nucleoside residue binds to an adjacent nucleotide residue through the oxygen atom at position 3.

  本发明提供了一种具有改善对AGO2亲和力的寡核苷酸等。该寡核苷酸在其5'端具有由式(I)表示的核苷酸残基或核苷酸残基其中X 1 是氧原子或类似物，R 1 是式(IIA)（其中R 5A 是卤素或类似物，而R 6A 是氢原子或类似物）或式(IVA)（其中Y 3A 是氮原子或类似物，而Y 4A 是CH或类似物），或类似物，R 2 是氢原子、羟基、卤素或可选择地取代的较低烷氧基，而R 3 是氢原子或类似物}，并且该核苷酸残基或核苷酸残基通过位于位置3的氧原子与相邻核苷酸残基结合。
• OLIGONUCLEOTIDE HAVING NON-NATURAL NUCLEOTIDE AT 5'-TERMINAL THEREOF
  申请人：Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd.

  公开号：US20170354673A1

  公开（公告）日：2017-12-14

  An oligonucleotide having a nucleotide residue or a nucleoside residue represented by formula (I) wherein X 1 is an oxygen atom or the like, R 1 is formula (IIA) (wherein R 5A is halogen or the like, and R 6A is a hydrogen atom or the like), formula (IVA) (wherein Y 3A is a nitrogen atom or the like, and Y 4A is CH or the like), or the like, R 2 is a hydrogen atom, hydroxy, halogen, or optionally substituted lower alkoxy, and R 3 is a hydrogen atom or the like, or formula (VI) (wherein n2 is 1, 2 or 3)} at the 5′ end thereof, wherein the nucleotide residue or the nucleoside residue binds to an adjacent nucleotide residue through the oxygen atom at position 3, is provided.

  具有由式(I)表示的核苷酸残基或核苷酸残基的寡核苷酸其中X1是氧原子或类似物，R1是式(IIA)（其中R5A是卤素或类似物，而R6A是氢原子或类似物），式(IVA)（其中Y3A是氮原子或类似物，而Y4A是CH或类似物），或类似物，R2是氢原子，羟基，卤素，或可选择地取代的较低烷氧基，而R3是氢原子或类似物，或式(VI)（其中n2为1、2或3）}在其5'端，其中核苷酸残基或核苷酸残基通过位于位置3的氧原子与相邻核苷酸残基结合。
• Pyrimidine Derivatives As Anticancer Agents
  申请人：Kotra Lakshmi P.

  公开号：US20100056468A1

  公开（公告）日：2010-03-04

  The present invention includes methods of treating or preventing cancer by administering an effective amount of 6-substituted pyrimidine derivatives of the Formula I to a subject need thereof:

  本发明涉及通过向需要该治疗的受体施用公式I的6-取代嘧啶衍生物的有效量来治疗或预防癌症的方法：
• ODCASE INHIBITORS AS ANTI-VIRALS AND ANTIBIOTICS
  申请人：Kotra Lakshmi P.

  公开号：US20100087388A1

  公开（公告）日：2010-04-08

  The present invention includes the utility of anti-viral and/or antibacterial effective amounts of 6-substituted nucleoside derivatives of formula (I) (e.g. 6-iodouridine and 6-iodouridine monophosphate) in the treatment or prevention of viral infections (e.g. Flavivridae, Bunyaviridae, or Togaviridae, or viral infections of hepatitis C, hepatitis B, herpes, influenza, HIV, polio, Coxsackie A/B, rhino, small pox, Ebola, West Nile, or corona virus) and/or bacterial infections (e.g. H. pylori, S. Aureus, B. anthracis, Mycobacterial tuberculosis, M. leprae, M. avium, P. aueruginosa, Streptococcal species, and Pneumocystis carinii ).

  本发明涉及式（I）的6-取代核苷衍生物（例如6-碘尿嘧啶和6-碘尿苷酸单磷酸盐）的抗病毒和/或抗细菌有效量的实用性，用于治疗或预防病毒感染（例如黄病毒科、布尼亚病毒科、托加病毒科或丙型肝炎、乙型肝炎、疱疹、流感、艾滋病毒、脊髓灰质炎、柯萨奇A/B病毒、鼻病毒、天花、埃博拉、西尼罗河或冠状病毒）和/或细菌感染（例如幽门螺杆菌、金黄色葡萄球菌、炭疽杆菌、结核分枝杆菌、麻风分枝杆菌、非结核分枝杆菌、铜绿假单胞菌、链球菌属和肺孢子菌）。
• Oligonucleotide having non-natural nucleotide at 5′-terminal thereof
  申请人：Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd.

  公开号：US10342819B2

  公开（公告）日：2019-07-09

  An oligonucleotide having a nucleotide residue or a nucleoside residue represented by formula (I) wherein X1 is an oxygen atom or the like, R1 is formula (IIA) (wherein R5A is halogen or the like, and R6A is a hydrogen atom or the like), formula (IVA) (wherein Y3A is a nitrogen atom or the like, and Y4A is CH or the like), or the like, R2 is a hydrogen atom, hydroxy, halogen, or optionally substituted lower alkoxy, and R3 is a hydrogen atom or the like, or formula (VI) (wherein n2 is 1, 2 or 3)} at the 5′ end thereof, wherein the nucleotide residue or the nucleoside residue binds to an adjacent nucleotide residue through the oxygen atom at position 3, is provided.

  具有由式(I)代表的核苷酸残基或核苷残基的寡核苷酸其中X1是氧原子或类似物，R1是式(IIA)（其中R5A是卤素或类似物，R6A是氢原子或类似物），式(IVA)（其中Y3A是氮原子或类似物，Y4A是CH或类似物），或类似物、R2是氢原子、羟基、卤素或任选取代的低级烷氧基，R3是氢原子或类似物，或式（VI）（其中n2是1、2或3）}在其5′端，其中核苷酸残基或核苷残基通过位置3的氧原子与相邻的核苷酸残基结合。