c(RGDfK[N₃]) | 868845-09-4

• 物质功能分类: 生物化工 - 多肽
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: c(RGDfK[N₃])
• 英文别名: cyclo[Arg-Gly-Asp-D-Phe-Lys(azide)]；C(RGDfK(N3))；2-[(2S,5R,8S,11S)-8-(4-azidobutyl)-5-benzyl-11-[3-(diaminomethylideneamino)propyl]-3,6,9,12,15-pentaoxo-1,4,7,10,13-pentazacyclopentadec-2-yl]acetic acid
• CAS: 868845-09-4
• 化学式: C₂₇H₃₉N₁₁O₇
• 分子量: 629.676
• InChiKey: DCAODRXYJRFPAR-HAGHYFMRSA-N

物化性质

• 熔点：
  199 °C (decomp)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.5
• 重原子数：
  45
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  262
• 氢给体数：
  8
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  c(RGDfK[N₃]) 在 copper(II) sulfate 、 sodium ascorbate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三[(1-苄基-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基]胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 0.36h， 生成
  参考文献：
  名称：

  用于开发肽 PET 成像探针的基于三嗪的工具箱：合成、微流体放射性标记和结构-活性评估

  摘要：

  本研究旨在开发一种基于三嗪的模块化平台，用于靶向 PET 成像。我们合成了单环或双环 (RGDfK) 连接的基于三嗪的偶联物，专门针对整联蛋白 α v β 3受体。核心分子可以很容易地连接到靶向肽和放射性标记的双功能螯合剂。间隔核心分子以 64–80% 的产率分 2 步或 3 步合成，随后与环 (RGDfK) 肽或双功能螯合剂的偶联反应使用“点击”化学或酰胺化反应完成。DOTA-TZ-Bis-cyclo(RGDfK) 13共轭物被64 Cu(OAc) 2成功放射性标记使用微流体方法，与传统放射性标记（SA ca. 850 vs 600 Ci/mmol）相比，具有更高的比活性和 95% 以上的标记产率。使用 I 125 - Echistatin结合测定发现二聚体环 (RGDfK) 肽显示出显着的二价效应，IC 50值为 178.5 ± 57.1 nM，与 DOTA-TZ-环 (RGDfK) 相比，其结合亲和力增强了

  DOI：

  10.1021/bc500034n
• 作为产物：
  描述：

  D-phenylalanine tert-butyl ester 在 2,4,6-三甲基吡啶 、 copper(ll) sulfate pentahydrate 、 triflic azide 、 叠氮磷酸二苯酯 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 碳酸氢钠 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 二乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 ((3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)oxy)tri(pyrrolidin-1-yl)phosphonium hexafluorophosphate(V) 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 c(RGDfK[N₃])
  参考文献：
  名称：

  实用的大规模合成环状RGD五肽，可通过“点击”化学进一步官能化

  摘要：

  阿多克一批的环[精氨酸-甘氨酸- Asp-的d -Phe赖氨酸]及其Ñ -ε叠氮基衍生物，使用无差向异构化，片段缩合经由溶液相合成来完成。d- Phe的C末端被保护为叔丁基酯。Fmoc（Arg，Gly，Asp，d -Phe）和Boc（Lys）基团用于保护所有N -α-末端。分别选择Ts和NO 2基团来保护胍基。大环化步骤（在d -Phe和l之间-Lys）在TBTU / HOBt或DPPA缩合条件下进行。最后，通过重氮转移反应将赖氨酸残基的ε-氨基选择性地转化为叠氮基。 RGD肽-溶液相合成-氨基酸-环化-重氮化合物

  DOI：

  10.1055/s-0030-1258396

文献信息

• An Organotrifluoroborate for Broadly Applicable One-Step¹⁸F-Labeling
  作者：Zhibo Liu、Maral Pourghiasian、Mark Alex Radtke、Joseph Lau、Jinhe Pan、Gemma M. Dias、Donald Yapp、Kuo-Shyan Lin、Francois Bénard、David M. Perrin

  DOI：10.1002/anie.201406258

  日期：2014.10.27

  A new zwitterionic organotrifluoroborate is appended to three radiosynthons that afford undergo facile bioconjugation to several clinically relevant peptides and one enzyme inhibitor. Molecularly complex bioconjugates are 18F‐labeled in a single aqueous step in rapid time (<15 min) without HPLC purification to afford tracers in good yields (>200 mCi, 20–40 %) at high specific activity (≥3 Ci/μmol)

  一种新的两性离子有机三氟硼酸酯被附加到三个放射性合成子上，这些合成子可以容易地与几种临床相关肽和一种酶抑制剂进行生物缀合。分子复杂的生物共轭物在短时间内（<15分钟）即可在单个水步骤中进行18 F标记，而无需进行HPLC纯化，以高比活度（≥3Ci /μmol）提供高产率（> 200 mCi，20–40％）的示踪剂）并> 98％的纯度。PET成像显示体内稳定性和肿瘤吸收。
• Efficient microwave-assisted synthesis of multivalent dendrimeric peptides using cycloaddition reaction (click) chemistry
  作者：Dirk T. S. Rijkers、G. Wilma van Esse、Remco Merkx、Arwin J. Brouwer、Hans J. F. Jacobs、Roland J. Pieters、Rob M. J. Liskamp

  DOI：10.1039/b507975f

  日期：——

  Multivalent dendrimeric peptides were synthesized via a microwave-assisted Huisgen 1,3-dipolar cycloaddition between azido peptides and dendrimeric alkynes in yields ranging from 46 to 96%.

  通过微波辅助的Huisgen 1,3-偶极环加成反应，在46%至96%的产率范围内合成了多价树枝状肽，该反应涉及叠氮肽与树枝状炔烃的反应。
• A Localized Tolerance in the Substrate Specificity of the Fluorinase Enzyme enables “Last-Step”¹⁸F Fluorination of a RGD Peptide under Ambient Aqueous Conditions
  作者：Stephen Thompson、Qingzhi Zhang、Mayca Onega、Stephen McMahon、Ian Fleming、Sharon Ashworth、James H. Naismith、Jan Passchier、David O'Hagan

  DOI：10.1002/anie.201403345

  日期：2014.8.18

  A strategy for last‐step 18F fluorination of bioconjugated peptides is reported that exploits an “Achilles heel” in the substrate specificity of the fluorinase enzyme. An acetylene functionality at the C‐2 position of the adenosine substrate projects from the active site into the solvent. The fluorinase catalyzes a transhalogenation of 5′‐chlorodeoxy‐2‐ethynyladenosine (ClDEA) to 5′‐fluorodeoxy‐2‐ethynyladenosine

  据报道，一种生物共轭肽最后一步18 F 氟化的策略利用了氟化酶底物特异性的“致命弱点”。腺苷底物 C-2 位的乙炔官能团从活性位点投射到溶剂中。氟化酶催化 5'-氯脱氧-2-乙炔基腺苷 (ClDEA) 转卤化为 5'-氟脱氧-2-乙炔基腺苷 (FDEA)。从乙炔的末端延伸聚乙二醇接头允许将生物共轭货物呈现给酶以进行18 F 标记。该方法使用[ 18 ]的水溶液(H 2 18 O)F] 氟化物由回旋加速器产生，具有同位素标记正电子发射断层扫描 (PET) 选择的肽的能力。
• Development of a novel radiotheranostic platform with a DOTA-based trifunctional chelating agent
  作者：Kazuma Nakashima、Shimpei Iikuni、Hiroyuki Watanabe、Masahiro Ono

  DOI：10.1039/d1cc00823d

  日期：——

  Radiotheranostics has attracted attention as a powerful strategy for treating cancer patients with precision medicine. We designed and synthesized a novel DOTA-based trifunctional agent, ADIBO-DOTADG-ALB (ADA), which allowed compounds with targeting ligands, radiometals, and an albumin binder to be readily prepared. ADA exhibited promising properties as a theranostic platform.

  放射治疗学作为一种利用精准医学治疗癌症患者的强大策略而备受关注。我们设计并合成了一种新型的基于 DOTA 的三功能试剂 ADIBO-DOTADG-ALB (ADA)，它可以很容易地制备具有靶向配体、放射性金属和白蛋白结合剂的化合物。ADA 表现出作为治疗诊断平台的有前途的特性。
• [18F]Si-RiboRGD: From Design and Synthesis to the Imaging of αvβ3 Integrins in Melanoma Tumors
  作者：Eric Amigues、Jürgen Schulz、Magali Szlosek-Pinaud、Philippe Fernandez、Sandrine Silvente-Poirot、Séverine Brillouet、Frédéric Courbon、Eric Fouquet

  DOI：10.1002/cplu.201200022

  日期：2012.5

  The winning combination: A new and promising 18F‐labeled RGD derivative has been efficiently prepared by exploiting the advantages of “click” chemistry and a one‐step labeling protocol where a silicon‐based building blocks was used (see figure). This derivative could be a new starting point for improved visualization of αvβ3‐positive tumors by positron emission tomography.

  获胜的组合：利用“点击”化学的优点和一步法标记协议（使用了基于硅的构建基块）的优势，已经有效地制备了一种新的，很有前途的18 F标记的RGD衍生物（见图）。该衍生物可以是用于改善的α的可视化的新起点v β 3个阳性肿瘤通过正电子发射断层摄影术。