内质网 (ER) 是一种细胞器,通过与其他细胞器的相互作用来执行各种基本的细胞功能。尽管具有重要作用,但由于这些蛋白质的不稳定性质,用于分析 ER 蛋白质的组成和动力学的
化学工具仍然非常有限。在这里,我们开发了 ER 可定位的反应分子(称为 ERM)作为以 ER 为重点的
化学蛋白质组学的工具。ERMs 可以自发地定位在活细胞的 ER 中,并用结合的亲和力和成像标签选择性地标记 ER 相关蛋白,从而实现标签介导的 ER 蛋白富集和
液相色谱串联质谱 (LC-MS/MS) 鉴定。使用这种方法,我们对 HeLa 细胞的 ER 进行了蛋白质组学分析,并新分配了三种蛋白质,即 PAICS、TXNL1 和 P
PIA,作为 ER 相关蛋白。ERM 探针可以与我们小组先前开发的细胞核和线粒体可定位反应分子同时使用,这使得在单个
生物样品中实现正交细胞器
化学蛋白质组学成为可能。此外,通过将 ER 特异性标记与基于