N-(3-甲基丁基)腺苷 | 17659-78-8

• 物质功能分类: 生物化工 - 核酸类
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: N-(3-甲基丁基)腺苷
• 英文名称: CM224
• 英文别名: 6-Isopentylamino-9-β-D-ribofuranosyl purine；N6-Isopentyladenosine；N⁶-(3-methyl-butyl)-adenosine；N-Isopentyladenosine；(2R,3S,4R,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-[6-(3-methylbutylamino)purin-9-yl]oxolane-3,4-diol
• CAS: 17659-78-8
• 化学式: C₁₅H₂₃N₅O₄
• 分子量: 337.379
• InChiKey: AYGMJXUCSYBOMJ-SDBHATRESA-N

物化性质

• 沸点：
  632.9±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.57

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.3
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  126
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

制备方法与用途

N-(3-甲基丁基)腺苷是一种腺苷类似物，主要作为平滑肌血管扩张剂使用，并已被证实能抑制癌症的发展。其常用的产品包括磷酸腺苷、阿卡地辛（HY-13417）、氯法拉滨（HY-A0005）、磷酸氟达拉滨（HY-B0028）和维达拉宾（HY-B0277）。

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2’,3’,5’-三乙酰肌苷 在 氯化亚砜 、 氨 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 氯仿 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 40.0h， 生成 N-(3-甲基丁基)腺苷
  参考文献：
  名称：

  组蛋白甲基转移酶DOT1L含腺苷抑制剂的合成及构效关系研究

  摘要：

  组蛋白 3-赖氨酸 79 (H3K79) 甲基转移酶 DOT1L 已被发现是具有 MLL（混合谱系白血病）基因易位的急性白血病的药物靶点。总共设计和合成了 55 种含腺苷的化合物，其中鉴定了几种有效的 DOT1L 抑制剂，K i值低至 0.5 nM。与其他三种组蛋白甲基转移酶相比，这些化合物还显示出高选择性（> 4500 倍）。讨论了这些化合物对 DOT1L 的抑制活性的构效关系 (SAR)。强效 DOT1L 抑制剂对 MLL 易位白血病细胞系 MV4;11 和 THP1 的增殖具有选择性活性，EC 504–11 μM 的值。等温滴定量热研究表明，两种代表性抑制剂以高亲和力与 DOT1L:核小体复合物结合，仅与酶辅因子 SAM（S-腺苷-1-甲硫氨酸）竞争，而不与底物核小体竞争。

  DOI：

  10.1021/jm300917h

文献信息

• N6-Alkyladenosines: Synthesis and evaluation of in vitro anticancer activity
  作者：Roberta Ottria、Silvana Casati、Erika Baldoli、Jeanette A.M. Maier、Pierangela Ciuffreda

  DOI：10.1016/j.bmc.2010.09.030

  日期：2010.12

  between structure and biological activity of iPA. The structures of the compounds were confirmed by standard studies of 1H NMR, MS and elemental analysis. These molecules were then evaluated for their anti-proliferative activity on bladder cancer cells. We found that some of these compounds possess anti-proliferative activity but have no effect on cell invasion and metalloprotease activity.

  合成了一系列在N 6位上不同取代的腺苷类似物，以继续我们对iPA的结构与生物学活性之间关系的研究。化合物的结构通过1 H NMR，MS和元素分析的标准研究确认。然后评估这些分子对膀胱癌细胞的抗增殖活性。我们发现其中一些化合物具有抗增殖活性，但对细胞侵袭和金属蛋白酶活性没有影响。
• N6-isopentenyladenosine a new potential anti-angiogenic compound that targets human microvascular endothelial cells <i>in vitro</i>
  作者：Sara Castiglioni、Valentina Romeo、Silvana Casati、Roberta Ottria、Cristiana Perrotta、Pierangela Ciuffreda、Jeanette A. M. Maier

  DOI：10.1080/15257770.2018.1503673

  日期：2018.10.3

  significant reduction of cell viability, upregulated p21 and promoted caspase-3 cleavage in a dose dependent manner leading to apoptotic cell death as detected by FACS analysis. To understand structure-function relationship of N6-isopentenyladenosine, we investigated the effect of some N6-isopentenyladenosine analogs. Our results suggest that N6-isopentenyladenosine and some of its derivatives are potentially

  摘要 N6-异戊烯基腺苷是一种对正常细胞和肿瘤细胞具有抗增殖和促凋亡作用的非典型核苷。考虑到血管生成在各种疾病中的作用，我们研究了 N6-异戊烯基腺苷对人微血管内皮细胞（血管生成的主角）的细胞毒作用。我们的结果表明，N6-异戊烯基腺苷以剂量依赖性方式诱导细胞活力的显着降低，上调 p21 并促进 caspase-3 切割，导致 FACS 分析检测到的细胞凋亡。为了了解 N6-异戊烯基腺苷的结构-功能关系，我们研究了一些 N6-异戊烯基腺苷类似物的作用。
• Single nucleotide detection device
  申请人：Base4 Innovation Limited

  公开号：EP2857524A1

  公开（公告）日：2015-04-08

  The present invention provides a microfluidic nucleic acid sequencing device characterised by comprising: • a first zone for containing the nucleic acid to be sequenced and an enzyme for pyrophosphorolysing the nucleic acid progressively into its constituent nucleotide triphosphates; • first and second microfluidic pathways for respectively introducing a first aqueous stream into the first chamber and removing a second ordered aqueous stream of the nucleotide triphosphates; • a second zone connected to said second microfluidic pathway comprising a droplet head for creating microdroplets of the second aqueous stream in a water-immiscible carrier solvent, at least some of which contain a single nucleotide triphosphate; • third and fourth microfluidic pathways for respectively introducing the carrier solvent into the second chamber and removing a first stream of the microdroplets in the carrier solvent therefrom; • at least one contact means to contact the single nucleotide triphosphate in each microdroplet in the first stream with one or more of a pyrophosphatase, a ligase, a polymerase, a fluorophore-labelled capture system selective for at least one of the nucleotide triphosphate types characteristic of the nucleic acid and an exonuclease or polymerase having exonuclease activity and • a fluorescence-detection system attached to said fourth microfluidic pathway comprising a light source adapted to impinge on each droplet in the first stream of microdroplets in turn and a detector to detect fluorescence emitted therefrom. The present invention also provides the use of the microfluidic sequencing device to sequence DNA or RNA.

  本发明提供了一种微流控核酸测序装置，其特征在于包括 - 第一区，用于容纳待测序的核酸和一种酶，该酶用于将核酸逐步焦磷酸化为其组成核苷酸三磷酸酯； - 第一和第二微流体通道，分别用于将第一水流引入第一腔室，并移除核苷酸三磷酸酯的第二有序水流； - 与所述第二微流控通路相连的第二区，包括一个液滴头，用于在不溶于水的载体溶剂中产生第二水流的微液滴，其中至少有一些微液滴含有单个核苷酸三磷酸酯； - 第三和第四微流体通路，分别用于将载体溶剂引入第二腔室，并从其中移除载体溶剂中的第一微滴流； - 至少一个接触装置，用于将第一液流中每个微滴中的单核苷酸三磷酸与焦磷酸酶、连接酶、聚合酶、选择性捕获核酸特征的至少一种核苷酸三磷酸类型的荧光标记捕获系统以及具有外切酶活性的外切酶或聚合酶中的一种或多种接触，以及 - 连接到所述第四微流体通路的荧光检测系统，该系统包括一个光源，适于依次照射第一微液滴流中的每个液滴，以及一个检测器，用于检测由此发出的荧光。 本发明还提供了利用微流体测序装置对 DNA 或 RNA 进行测序的方法。
• IMPROVED DROPLET SEQUENCING APPARATUS AND METHOD
  申请人：Base4 Innovation Limited

  公开号：EP3207982A1

  公开（公告）日：2017-08-23

  A first apparatus for sequencing a polynucleotide analyte is provided and comprises; • a first zone in which a stream of single nucleotide phosphates is generated by progressive pyrophosphorolysis of a molecule of the analyte attached to a particle and exposed to a flowing aqueous medium; • a second zone in which a corresponding stream of aqueous droplets is generated from the aqueous medium and the nucleotide stream and wherein at least some of the droplets contain a single nucleotide triphosphate and • a third zone in which each droplet is stored and optionally interrogated to reveal a property characteristic of the single nucleotide it may contain. It is characterised in that the first zone includes at least one chemically-modified substrate adapted to bind temporarily to a particle having at least two different regions adapted to bind respectively to the substrate and to the analyte. Suitably the particles comprise at least one metal coated first region(s) and at least one second region(s) comprised of reactive sites to which the analyte can be attached. In one embodiment the two regions each comprise hemispheres of a substantially spherical bead.

  提供了对多核苷酸分析物进行测序的第一种装置，该装置包括 - 第一区，在该区中，通过对附着在颗粒上并暴露于流动水介质中的被分析物分子进行渐进式热磷解，产生单个核苷酸磷酸盐流； - 第二区，在该区中，由水介质和核苷酸流产生相应的水液滴流，其中至少有一些液滴含有单核苷酸三磷酸酯，以及 - 第三区，在该区中储存每个液滴，并可选择对其进行检测，以揭示其可能包含的单核苷酸的特性。 其特征在于，第一区包括至少一种化学修饰基质，可暂时与颗粒结合，颗粒至少有两个不同区域，可分别与基质和分析物结合。 合适的颗粒包括至少一个有金属涂层的第一区域和至少一个由可附着分析物的反应位点组成的第二区域。在一个实施方案中，这两个区域分别包括一个基本球形珠子的半球。
• Single nucleotide detection method
  申请人：BASE4 INNOVATION LTD

  公开号：US10480024B2

  公开（公告）日：2019-11-19

  A method for determining the sequence of nucleotide bases in a polynucleotide analyte is provided. It is characterised by the steps of (1) generating a stream of single nucleotide bases from the analyte; (2) producing captured molecules by reacting each single nucleotide base with a capture system; (3) amplifying at least part of the captured molecule to produce a plurality of amplicons characteristic of the single nucleotide base; (4) labelling the amplicons with a corresponding probe having a characteristic detectable element and (5) detecting a property characteristic of the detectable element.

  提供了一种确定多核苷酸分析物中核苷酸碱基序列的方法。其特征在于以下步骤：(1) 从分析物中产生单核苷酸碱基流；(2) 通过使每个单核苷酸碱基与捕获系统反应产生捕获分子；(3) 扩增捕获分子的至少一部分，以产生具有单核苷酸碱基特征的多个扩增子；(4) 用具有特征可检测元素的相应探针标记扩增子；(5) 检测可检测元素的特征属性。