2',3',5'-tris-O-(tert-butyldimethylsilyl)inosine | 110526-62-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 2',3',5'-tris-O-(tert-butyldimethylsilyl)inosine
• 英文别名: 2',3',5'-O-tris(tert-butyldimethyl)silylinosine；2',3',5'-Tris-o-(tert-butyldimethylsilyl)inosine；9-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-1H-purin-6-one
• CAS: 110526-62-0
• 化学式: C₂₈H₅₄N₄O₅Si₃
• 分子量: 611.017
• InChiKey: LBESGBZAXAHRJJ-PTGPVQHPSA-N

物化性质

• 熔点：
  249-250 °C(Solv: isopropyl ether (108-20-3); ethyl acetate (141-78-6))
• 沸点：
  620.8±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.07±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.82
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  96.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2',3',5'-tris-O-(tert-butyldimethylsilyl)inosine 在 phosphomolybdic acid 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 3.0h， 以90%的产率得到2',3'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)inosine
  参考文献：
  名称：

  甲醇磷钼酸区域选择性 5'-O-叔丁基二甲基甲硅烷基脱保护过甲硅烷基化核苷的实用方法

  摘要：

  在核苷/核苷酸化学中，全甲硅烷基化核苷的 5'-O-TBS 基团的区域选择性切割是 5' 位结构功能化的理想方法。然而，用于此目的的有效和实用的方法仍然有限。在我们的研究中，我们发现均相甲醇磷钼酸 (PMA) 可有效催化多种全甲硅烷基化核苷底物的 5'-O-TBS 基团的区域选择性脱保护，并可用于实际合成，规模可达 15 g。31P NMR 结果表明形成了阴离子簇，且均相 PMA 的路易斯酸度取决于有机溶剂。甲醇 PMA 的功效和显着的区域选择性是由于磷酸钼阴离子溶剂化后路易斯酸强度降低的结果。

  DOI：

  10.1055/s-0037-1610300
• 作为产物：
  描述：

  肌苷 在 咪唑 、 叔丁基二甲基氯硅烷 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 2',3',5'-tris-O-(tert-butyldimethylsilyl)inosine
  参考文献：
  名称：

  Practical synthesis of natural plant-growth regulator 2-azahypoxanthine, its derivatives, and biotin-labeled probes

  摘要：

  AHX衍生物及其探针分子。

  DOI：

  10.1039/c4ob00705k

文献信息

• Monitoring Poly(ADP-ribosyl)glycohydrolase Activity with a Continuous Fluorescent Substrate
  作者：Bryon S. Drown、Tomohiro Shirai、Johannes Gregor Matthias Rack、Ivan Ahel、Paul J. Hergenrother

  DOI：10.1016/j.chembiol.2018.09.008

  日期：2018.12

  monomers from their protein targets. Existing methods for monitoring these hydrolases rely on detection of the natural substrate, PAR, commonly achieved via radioisotopic labeling. Here we disclose a general substrate for monitoring PARG activity, TFMU-ADPr, which directly reports on total PAR hydrolase activity via release of a fluorophore; this substrate has excellent reactivity, generality (processed by

  翻译后修饰（PTM）和信号分子聚（ADP-核糖）（PAR）对多种生物过程都有影响。此PTM受一系列ADP-核糖基糖水解酶（PARG酶）调控，该酶可将聚合物裂解和/或将单体从其蛋白质靶标中释放出来。监测这些水解酶的现有方法依赖于通常通过放射性同位素标记实现的天然底物PAR的检测。在这里，我们公开了用于监测PARG活性的通用底物TFMU-ADPr，其通过荧光团的释放直接报告总PAR水解酶活性。这种底物具有出色的反应性，通用性（由主要的PARG酶处理），稳定性和可用性。第二种底物TFMU-IDPr仅从酶ARH3选择性报告PARG活性。在全细胞裂解物实验中使用这些探针揭示了霍乱毒素可抑制ARH3的机制。TFMU-ADPr和TFMU-IDPr是用于评估体外小分子抑制剂和探索ADP-核糖基分解代谢酶调控的多功能工具。
• [EN] FLUORESCENT SUBSTRATES FOR POLY(ADP-RIBOSYL) HYDROLASES<br/>[FR] SUBSTRATS FLUORESCENTS POUR POLY(ADP-RIBOSYL) HYDROLASES
  申请人：UNIV ILLINOIS

  公开号：WO2020055753A1

  公开（公告）日：2020-03-19

  The post-translational modification (PTM) and signaling molecule poly(ADP-ribose) (PAR) has an impact on diverse biological processes. PTM is regulated by a series of ADP-ribosyl glycohydrolases (PARG enzymes) that cleave polymers and/or liberate monomers from their protein targets. Disclosed herein is a substrate for monitoring PARG activity, TFMU-ADPr, which directly reports on total PAR hydrolase activity via release of a fluorophore; this substrate has excellent reactivity, generality, stability, and usability. A second substrate, TFMU-IDPr, selectively reports on PARG activity only from the enzyme ARH3. Use of these probes in whole-cell lysate experiments has revealed a mechanism by which ARH3 is inhibited by cholera toxin. TFMU-ADPr and TFMU-IDPr are versatile tools for assessing small-molecule inhibitors in vitro and probing the regulation of ADP-ribosyl catabolic enzymes.

  翻译结果：翻译后修饰（PTM）和信号分子聚腺苷二磷酸核糖（PAR）对多种生物过程产生影响。PTM受一系列ADP核糖水解酶（PARG酶）调控，这些酶从它们的蛋白靶标中切割聚合物和/或释放单体。本文披露了一种用于监测PARG活性的底物，TFMU-ADPr，它通过释放荧光团直接报告总PAR水解酶活性；该底物具有出色的反应性、普适性、稳定性和可用性。第二种底物TFMU-IDPr，只选择性地报告来自酶ARH3的PARG活性。在全细胞裂解液实验中使用这些探针揭示了一种由霍乱毒素抑制ARH3的机制。TFMU-ADPr和TFMU-IDPr是评估体外小分子抑制剂和探究ADP核糖降解酶调控的多功能工具。
• Microwave-Assisted Direct Amination: Rapid Access to Multi-Functionalized N6-Substituted Adenosines
  作者：Trent D. Ashton、Peter J. Scammells

  DOI：10.1071/ch07340

  日期：——

  Analogues of adenosine have a range of interesting biological activities and potential therapeutic applications. A method for the efficient preparation of highly functionalized N6-substituted adenosines has been developed from the corresponding tert-butyldimethylsilyl-protected inosine. The key step in this procedure is a microwave-assisted amination reaction between an appropriately substituted inosine and an amine in the presence of PyBroP. High yields of desired N6-substituted adenosines were achieved with hindered amines and the reaction was also found to accommodate a range of substituents on the inosine precursor.

  腺苷的类似物具有一系列有趣的生物活性和潜在的治疗用途。从相应的叔丁基二甲基硅基保护肌苷出发，我们开发出了一种高效制备高官能度 N6 取代腺苷的方法。该方法的关键步骤是在 PyBroP 的存在下，在适当取代的肌苷和胺之间进行微波辅助胺化反应。使用受阻胺可以获得高产率的所需 N6 取代腺苷，而且该反应还能适应肌苷前体上的一系列取代基。
• Base substituted 5′-O-(N-isoleucyl)sulfamoyl nucleoside analogues as potential antibacterial agents
  作者：Bharat Gadakh、Gaston Vondenhoff、Eveline Lescrinier、Jef Rozenski、Mathy Froeyen、Arthur Van Aerschot

  DOI：10.1016/j.bmc.2014.03.040

  日期：2014.5

  and evaluated several isoleucyl-sulfamoyl nucleoside analogues with either uracil, cytosine, hypoxanthine, guanine, 1,3-dideaza-adenine (benzimidazole) or 4-nitro-benzimidazole as the heterocyclic base. Based on the structure and antibacterial activity of microcin C, we also prepared their hexapeptidyl conjugates in an effort to improve their uptake potential. We further compared their antibacterial

  氨基酰基氨磺酰基腺苷是体外相应的原核和真核tRNA合成酶的众所周知的纳摩尔抑制剂。受Cubist Pharmaceuticals含芳基四唑的化合物和天然抗生素albomycin中发现的修饰碱基的启发，氨磺酰化腺苷的选择性问题促使我们研究腺嘌呤碱基在药理上的重要性。因此，我们合成并评估了几种异亮氨酰氨磺酰基核苷类似物，它们具有尿嘧啶，胞嘧啶，次黄嘌呤，鸟嘌呤，1，3-二氮杂腺嘌呤（苯并咪唑）或4-硝基苯并咪唑作为杂环碱基。基于微霉素C的结构和抗菌活性，我们还制备了它们的六肽基缀合物，以提高它们的吸收潜力。我们进一步在体外和细胞分析中将它们的抗菌活性与母体异亮氨酰氨磺酰基腺苷（Ile-SA）进行了比较。令人惊讶地，发现含有尿嘧啶类似物的最强的体外抑制作用16楼。不幸的是，由于低吸收，仅发现非常弱的生长抑制特性。根据先前的文献发现对结果进行讨论。
• Azide−Tetrazole Equilibrium of C-6 Azidopurine Nucleosides and Their Ligation Reactions with Alkynes
  作者：Mahesh K. Lakshman、Manish K. Singh、Damon Parrish、Raghavan Balachandran、Billy W. Day

  DOI：10.1021/jo902342z

  日期：2010.4.16

  nucleosides, access to the azido derivatives could be readily attained via displacement of BtO− from the O6-(benzotriazol-1-yl)inosine nucleosides by azide anion. Use of diphenylphosphoryl azide/DBU as a simple route to the acetyl-protected azido nucleosides was also evaluated, but this proved to be inferior. Since these azido nucleosides can exist in an azide·tetrazole equilibrium, the effect of solvent

  已经开发了C-6叠氮嘌呤核糖核苷和2'-脱氧核糖核苷的简便合成方法。对于甲硅烷基和乙酰基保护的以及未受保护的核苷，获得了叠氮基的衍生物，可以很容易地通过BTO的位移达到-从ø 6 -叠氮阴离子（苯并三唑-1-基）肌苷核苷。还评估了使用二苯基磷酰基叠氮化物/ DBU作为获得乙酰基保护的叠氮核苷的简单途径，但事实证明这是较差的。由于这些叠氮基核苷可以在叠氮化物·四唑平衡中存在，因此研究了溶剂极性对该平衡的影响。随后，对Cu介导的叠氮化物-炔（“点击”）连接进行了详细分析。双相CH 2 Cl 2 / H事实证明，2 O介质最适合连接反应，从而抑制了竞争中不希望的叠氮化物还原。有趣的是，尽管在CD 2 Cl 2和CD 2 Cl 2 / D 2中四唑基异构体占主导（约80％）。O，Cu催化的点击反应与甲硅烷基保护的核糖核苷和2'-脱氧核糖核苷顺利进行，从而导致C-6三唑基产物的收率非常好。因此，反应