O^2'_,O3'_,O5'-tris-(tert-butyl-dimethyl-silanyl)-adenosine | 64911-28-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: O^2'_,O3'_,O5'-tris-(tert-butyl-dimethyl-silanyl)-adenosine
• 英文别名: 2',3',5'-tris-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosine；2’,3’,5’-tris-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosine；2',3',5'-tri-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosine；9-((2R,3R,4R,5R)-3,4-Bis((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-9H-purin-6-amine；9-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]purin-6-amine
• CAS: 64911-28-0
• 化学式: C₂₈H₅₅N₅O₄Si₃
• 分子量: 610.032
• InChiKey: YZHKRXBIMOGRMG-PTGPVQHPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.11
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  O^2'_,O3'_,O5'-tris-(tert-butyl-dimethyl-silanyl)-adenosine 在 氨基磺酰氯 、 水 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基乙酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 ((2R,3R,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-bis((tert-butyldimethylsilyl)oxy)tetrahydrofuran-2-yl)methyl sulfamate
  参考文献：
  名称：

  碱基取代的5'- O-（N-异亮氨酰）氨磺酰基核苷类似物作为潜在的抗菌剂

  摘要：

  氨基酰基氨磺酰基腺苷是体外相应的原核和真核tRNA合成酶的众所周知的纳摩尔抑制剂。受Cubist Pharmaceuticals含芳基四唑的化合物和天然抗生素albomycin中发现的修饰碱基的启发，氨磺酰化腺苷的选择性问题促使我们研究腺嘌呤碱基在药理上的重要性。因此，我们合成并评估了几种异亮氨酰氨磺酰基核苷类似物，它们具有尿嘧啶，胞嘧啶，次黄嘌呤，鸟嘌呤，1，3-二氮杂腺嘌呤（苯并咪唑）或4-硝基苯并咪唑作为杂环碱基。基于微霉素C的结构和抗菌活性，我们还制备了它们的六肽基缀合物，以提高它们的吸收潜力。我们进一步在体外和细胞分析中将它们的抗菌活性与母体异亮氨酰氨磺酰基腺苷（Ile-SA）进行了比较。令人惊讶地，发现含有尿嘧啶类似物的最强的体外抑制作用16楼。不幸的是，由于低吸收，仅发现非常弱的生长抑制特性。根据先前的文献发现对结果进行讨论。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2014.03.040
• 作为产物：
  描述：

  2',3',5'-tri-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosine N1-oxide 在 联硼酸频那醇酯 、 乙二胺 作用下， 以 二乙二醇二甲醚 为溶剂， 反应 3.0h， 以87%的产率得到O^2'_,O3'_,O5'-tris-(tert-butyl-dimethyl-silanyl)-adenosine
  参考文献：
  名称：

  用二硼试剂还原胺 N-氧化物

  摘要：

  通过使用二硼试剂，主要是双(频哪醇)-和在某些情况下双(儿茶酚)二硼[(pinB) 2和(catB) 2，可以轻松还原烷基氨基-、苯胺基-和吡啶基-N-氧化物， 分别]。在合适的温度下，在合适的溶剂中简单地混合胺N-氧化物和二硼试剂时，还原发生。烷基氨基-和苯胺基-N-氧化物发生极快的还原，而吡啶基-N-氧化物还原较慢。该反应耐受多种官能团，如羟基、硫醇和氰基，以及卤素。值得注意的是，敏感的核苷N-氧化物也被有效地减少。烷基氨基-和吡啶基-N-氧化物被还原的不同速率已用于逐步还原( S )-(-)-尼古丁的N , N'-二氧化物。由于观察到(pinB) 2不受氧化胺中水合水的影响，因此评估了使用水作为溶剂的可行性。这些反应也进行得非常好，产生了高产率。与与 (pinB) 2的反应相反，三乙基硼烷还原烷基氨基-N-氧化物，但吡啶N-氧化物即使在升高的温度下也没有进行有效的还原。最后，通过1 H

  DOI：

  10.1021/jo201192c

文献信息

• Monitoring Poly(ADP-ribosyl)glycohydrolase Activity with a Continuous Fluorescent Substrate
  作者：Bryon S. Drown、Tomohiro Shirai、Johannes Gregor Matthias Rack、Ivan Ahel、Paul J. Hergenrother

  DOI：10.1016/j.chembiol.2018.09.008

  日期：2018.12

  monomers from their protein targets. Existing methods for monitoring these hydrolases rely on detection of the natural substrate, PAR, commonly achieved via radioisotopic labeling. Here we disclose a general substrate for monitoring PARG activity, TFMU-ADPr, which directly reports on total PAR hydrolase activity via release of a fluorophore; this substrate has excellent reactivity, generality (processed by

  翻译后修饰（PTM）和信号分子聚（ADP-核糖）（PAR）对多种生物过程都有影响。此PTM受一系列ADP-核糖基糖水解酶（PARG酶）调控，该酶可将聚合物裂解和/或将单体从其蛋白质靶标中释放出来。监测这些水解酶的现有方法依赖于通常通过放射性同位素标记实现的天然底物PAR的检测。在这里，我们公开了用于监测PARG活性的通用底物TFMU-ADPr，其通过荧光团的释放直接报告总PAR水解酶活性。这种底物具有出色的反应性，通用性（由主要的PARG酶处理），稳定性和可用性。第二种底物TFMU-IDPr仅从酶ARH3选择性报告PARG活性。在全细胞裂解物实验中使用这些探针揭示了霍乱毒素可抑制ARH3的机制。TFMU-ADPr和TFMU-IDPr是用于评估体外小分子抑制剂和探索ADP-核糖基分解代谢酶调控的多功能工具。
• [EN] FLUORESCENT SUBSTRATES FOR POLY(ADP-RIBOSYL) HYDROLASES<br/>[FR] SUBSTRATS FLUORESCENTS POUR POLY(ADP-RIBOSYL) HYDROLASES
  申请人：UNIV ILLINOIS

  公开号：WO2020055753A1

  公开（公告）日：2020-03-19

  The post-translational modification (PTM) and signaling molecule poly(ADP-ribose) (PAR) has an impact on diverse biological processes. PTM is regulated by a series of ADP-ribosyl glycohydrolases (PARG enzymes) that cleave polymers and/or liberate monomers from their protein targets. Disclosed herein is a substrate for monitoring PARG activity, TFMU-ADPr, which directly reports on total PAR hydrolase activity via release of a fluorophore; this substrate has excellent reactivity, generality, stability, and usability. A second substrate, TFMU-IDPr, selectively reports on PARG activity only from the enzyme ARH3. Use of these probes in whole-cell lysate experiments has revealed a mechanism by which ARH3 is inhibited by cholera toxin. TFMU-ADPr and TFMU-IDPr are versatile tools for assessing small-molecule inhibitors in vitro and probing the regulation of ADP-ribosyl catabolic enzymes.

  翻译结果：翻译后修饰（PTM）和信号分子聚腺苷二磷酸核糖（PAR）对多种生物过程产生影响。PTM受一系列ADP核糖水解酶（PARG酶）调控，这些酶从它们的蛋白靶标中切割聚合物和/或释放单体。本文披露了一种用于监测PARG活性的底物，TFMU-ADPr，它通过释放荧光团直接报告总PAR水解酶活性；该底物具有出色的反应性、普适性、稳定性和可用性。第二种底物TFMU-IDPr，只选择性地报告来自酶ARH3的PARG活性。在全细胞裂解液实验中使用这些探针揭示了一种由霍乱毒素抑制ARH3的机制。TFMU-ADPr和TFMU-IDPr是评估体外小分子抑制剂和探究ADP核糖降解酶调控的多功能工具。
• Solventless Protocol for Efficient Bis-<i>N</i>-Boc Protection of Adenosine, Cytidine, and Guanosine Derivatives
  作者：Siddharth A. Sikchi、Philip G. Hultin

  DOI：10.1021/jo060430t

  日期：2006.8.1

  A solvent-free reaction employing a simple low-energy ball mill apparatus converts the amino groups of adenosine, 2-deoxyadenosine, cytidine, 2-deoxycytidine, guanosine, and 2-deoxyguanosine as well as some of their ribosyl O-protected derivatives to the corresponding bis-N-Boc carbamates. In the case of guanosine compounds, the carbonyl group of the base moiety was also blocked as its O-Boc enol carbonate

  使用简单的低能球磨仪进行的无溶剂反应将腺苷，2-脱氧腺苷，胞嘧啶核苷，2-脱氧胞苷，鸟苷和2-脱氧鸟苷的氨基以及它们的一些核糖基O保护的衍生物转化为相应的bis- N -Boc氨基甲酸酯。在鸟苷化合物的情况下，该碱基部分的羰基也被封闭为其O- Boc烯醇碳酸酯。使用瞬态原位O硅烷化的这种方法的一种变体允许制备bis- N-Boc核苷，其中糖羟基不受保护。除鸟苷化合物外，球磨反应迅速，方便且产率很高。这种高效的方法使用适合进一步合成操作的碱稳定且酸不稳定的基团保护这些核苷的氨基。
• Highly Selective Recognition of Adenine Nucleobases by Synthetic Hosts with a Linked Five-Six-Five-Membered Triheteroaromatic Structure and the Application to Potentiometric Sensing of the Adenine Nucleotide
  作者：Yosuke Hisamatsu、Keiko Hasada、Fumi Amano、Yasuhiro Tsubota、Yuko Wasada-Tsutsui、Naohiro Shirai、Shin-ichi Ikeda、Kazunori Odashima

  DOI：10.1002/chem.200600099

  日期：2006.10.5

  spectroscopy. This type of host displayed high selectivity in complexation, with an accompanying fluorescent response to lipophilized adenosine in CHCl(3). Furthermore, a remarkably selective potentiometric response was attained for adenosine 5'-monophosphate over 5'-GMP, 5'-CMP, and 5'-UMP by using an ion-selective electrode with a PVC-supported solvent polymeric membrane. This indicates recognition of water-soluble

  开发了一种腺嘌呤选择性宿主分子的新结构，该结构具有五六十五元杂芳族环和两个氨基甲酰基NH位的相关链接。这种结构为腺嘌呤核苷碱基提供了正确定向的互补氢键位点阵列，利用了Watson-Crick和Hoogsteen型相互作用。通过多个氢键与腺嘌呤核碱基的络合得到（1）1 H NMR光谱的支持。这种类型的宿主在络合中显示出高选择性，并伴随着对CHCl（3）中脂化腺苷的荧光反应。此外，通过使用带有PVC支撑的溶剂聚合物膜的离子选择电极，对5'-GMP，5'-CMP和5'-UMP的5'-单磷酸腺苷获得了显着的选择性电位响应。这表明通过膜-水界面识别了水溶性核苷酸客体。这些发现有望为生物系统中单核苷酸的人工传感系统的开发提供可靠的基础。
• Pd‐Catalyzed versus Uncatalyzed, PhI(OAc) ₂ ‐Mediated Cyclization Reactions of <i>N</i> ⁶ ‐([1,1′‐Biaryl]‐2‐yl)Adenine Nucleosides
  作者：Sakilam Satishkumar、Suresh Poudapally、Prasanna K. Vuram、Venkateshwarlu Gurram、Narender Pottabathini、Dellamol Sebastian、Lijia Yang、Padmanava Pradhan、Mahesh K. Lakshman

  DOI：10.1002/cctc.201700918

  日期：2017.11.9

  3,3‐hexafluoroisopropanol (HFIP). Thus, under Pd catalysis and in HFIP, reactions proceed to provide carbazolyl nucleoside analogues, with some differences. If reactions of N6‐biarylyl nucleoside substrates were conducted in MeCN, formation of aryl benzimidazopurinyl nucleoside derivatives was observed in many cases by C−N bond formation with the N1 ring nitrogen atom of the purine (carbazole and benzimidazole

  在这项工作中，我们通过Pd II / Pd IV氧化还原循环评估了N 6 -（[1,1'-联芳基] -2-基）腺嘌呤核苷与Pd（OAc）2和PhI（OAc）2的反应。底物很容易通过Pd / Xantphos催化的腺嘌呤核苷与2-bromo-1,1'-biaryls的反应而获得。在PhMe中，N 6-联芳基核苷通过与环外N 6的C-N键形成而得到C6-咔唑基核苷类似物氮原子。在Pd催化反应的溶剂筛选中，发现未催化的过程是可行的。据观察，咔唑基产物也可以在不存在金属催化剂的情况下，通过与PhI（OAc）2在1,1,1,3,3,3-六氟异丙醇（HFIP）中反应而获得。因此，在Pd催化下和在HFIP中，反应进行提供了咔唑基核苷类似物，但有一些区别。如果在MeCN中进行N 6-联芳基核苷底物的反应，则在许多情况下通过与嘌呤的N 1环氮原子形成CN键可观察到芳基苯并咪唑嘌呤基核苷衍生物的形成（咔唑和苯并咪唑异构体很容易通过色谱）。而Pd