3-脱氮腺苷 | 6736-58-9

• 物质功能分类: 生物化工 - 核苷类药物 - 核苷中间体
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 咪唑[4，5-c]吡啶核糖核苷和核糖核苷酸
• 中文名称: 3-脱氮腺苷
• 中文别名: 3-氮杂腺苷；4-氨基-1-BETA-D-呋喃核糖基-1H-咪唑并[4,5-C]吡啶
• 英文名称: 3-deazaadenosine
• 英文别名: 3-DZA；4-amino-1-(β-D-ribofuranosyl)-1H-imidazo[4,5-c]pyridine；(2R,3R,4S,5R)-2-(4-aminoimidazo[4,5-c]pyridin-1-yl)-5-(hydroxymethyl)oxolane-3,4-diol
• CAS: 6736-58-9
• 化学式: C₁₁H₁₄N₄O₄
• 分子量: 266.257
• InChiKey: DBZQFUNLCALWDY-PNHWDRBUSA-N

物化性质

• 熔点：
  228-229°C
• 沸点：
  665.7±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.90±0.1 g/cm3 (20 ºC 760 Torr)
• 溶解度：
  H2O：10 mg/mL 加热至 60°C

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.6
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  127
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

安全信息

• 危险等级：
  6.1(a)
• 安全说明：
  S24/25
• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  29419090
• 包装等级：
  II
• 危险类别：
  6.1(a)
• 危险品运输编号：
  UN 2811
• 储存条件：
  2-8°C

制备方法与用途

生物活性

3-Deazaadenosine 是一种 S-腺苷高半胱氨酸水解酶 (S-adenosylhomocysteine hydrolase) 抑制剂，其 Ki 值为 3.9 µM；该化合物具有抗炎、抗增殖及抗 HIV 等活性。

靶点

• IC50: 0.15 (HIV-1, A012 病毒株), 0.20 µM (HIV-1, A018 病毒株)
• Ki: 3.9 µM (S-腺苷高半胱氨酸水解酶)

体外研究

3-Deazaadenosine 是 S-腺苷高半胱氨酸水解酶的抑制剂，Ki 值为 3.9 µM。该化合物表现出抗 HIV 的活性，并能抑制由 HIV-1 (A012 和 A018 病毒株) 感染的外周血单核细胞（PBMCs）中的 p24 抗原，其 IC50 值分别为 0.15 µM 和 0.20 µM。在 RAW 264.7 细胞中，3-Deazaadenosine (1-100 µM) 能抑制 LPS 引起的 TNF-α mRNA 表达、增加 NF-κB 的 DNA 结合活性，并导致 IκBα 的蛋白酶降解（而非 IκBβ）。在 100 µM 浓度下，3-Deazaadenosine 增强了 NF-κB 的核转位，但阻断了 LPS 引起的 NF-κB 转录活性；这种抑制作用可通过添加高半胱氨酸而增强。在 50 和 100 µM 浓度下，3-Deazaadenosine 剂量依赖性地抑制 Raf、ERK（蛋白依赖性激酶 1）、Akt 和 FoxO1a 的磷酸化。此外，50 µM 浓度的 3-Deazaadenosine 能通过干扰 Ras 信号通路抑制血管平滑肌细胞 (VSMC) 的增殖。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-脱氮腺苷 在 吡啶 、 三甲基氯硅烷 、 氨基磺酰氯 、 sodium methylate 、 对甲苯磺酸 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 2,2-二甲氧基丙烷 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基乙酰胺 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 5'-O-(N-L-leucyl)sulfamoyl-3-deaza-adenosine
  参考文献：
  名称：

  全家族分析的氨酰基-氨磺酰基-3-deazaadenosine类似物作为氨酰基-tRNA合成酶的抑制剂

  摘要：

  氨酰基-tRNA合成酶（aaRSs）是一种将氨基酸精确地与其同源tRNA相连的酶。如果可以鉴定出物种选择性抑制剂，则该过程对于蛋白质翻译至关重要，被认为是开发新型抗菌剂的可行目标。氨酰基氨磺酰酰基腺苷（aaSAs）是强直向同源物特异性aaRS抑制剂，在体外表现出纳摩尔亲和力，但吸收受限。继我们之前关于碱基部分取代的工作之后，我们评估了N 3的作用通过合成相应的3-脱氮杂腺苷类似物（aaS3DAs）将腺嘌呤定位在-位。一个典型的生物具有20种不同的aaRS，可以将其分为两个不同的结构类别。因此，我们通过氨基磺酸桥将六种不同的氨基酸（均等地靶向两种酶）偶联到3-deazaadenosine。在评估所获得的类似物的抑制能力时，注意到明显的类别偏倚，与等效的aaSA相比，针对II类酶的aaS3DA类似物的活性丧失。对可用晶体学结构的评估指出了保守水分子的存在，该分子对于II类酶中的碱基识别可能具有

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2018.02.013
• 作为产物：
  描述：

  3,4-二氨基吡啶 在 hydrazine hydrate 、 氨 、 四氯化锡 、 间氯过氧苯甲酸 、 三氯氧磷 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 34.5h， 生成 3-脱氮腺苷
  参考文献：
  名称：

  全家族分析的氨酰基-氨磺酰基-3-deazaadenosine类似物作为氨酰基-tRNA合成酶的抑制剂

  摘要：

  氨酰基-tRNA合成酶（aaRSs）是一种将氨基酸精确地与其同源tRNA相连的酶。如果可以鉴定出物种选择性抑制剂，则该过程对于蛋白质翻译至关重要，被认为是开发新型抗菌剂的可行目标。氨酰基氨磺酰酰基腺苷（aaSAs）是强直向同源物特异性aaRS抑制剂，在体外表现出纳摩尔亲和力，但吸收受限。继我们之前关于碱基部分取代的工作之后，我们评估了N 3的作用通过合成相应的3-脱氮杂腺苷类似物（aaS3DAs）将腺嘌呤定位在-位。一个典型的生物具有20种不同的aaRS，可以将其分为两个不同的结构类别。因此，我们通过氨基磺酸桥将六种不同的氨基酸（均等地靶向两种酶）偶联到3-deazaadenosine。在评估所获得的类似物的抑制能力时，注意到明显的类别偏倚，与等效的aaSA相比，针对II类酶的aaS3DA类似物的活性丧失。对可用晶体学结构的评估指出了保守水分子的存在，该分子对于II类酶中的碱基识别可能具有

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2018.02.013

文献信息

• Nucleoside derivatives as inhibitors of RNA-dependent RNA viral polymerase
  申请人：——

  公开号：US20020147160A1

  公开（公告）日：2002-10-10

  The present invention provides nucleoside compounds and certain derivatives thereof which are inhibitors of RNA-dependent RNA viral polymerase. These compounds are inhibitors of RNA-dependent RNA viral replication and are useful for the treatment of RNA-dependent RNA viral infection. They are particularly useful as inhibitors of hepatitis C virus (HCV) NS5B polymerase, as inhibitors of HCV replication, and/or for the treatment of hepatitis C infection. The invention also describes pharmaceutical compositions containing such nucleoside compounds alone or in combination with other agents active against RNA-dependent RNA viral infection, in particular HCV infection. Also disclosed are methods of inhibiting RNA-dependent RNA polymerase, inhibiting RNA-dependent RNA viral replication, and/or treating RNA-dependent RNA viral infection with the nucleoside compounds of the present invention.

  本发明提供了核苷化合物及其某些衍生物，这些衍生物是RNA依赖性RNA病毒聚合酶的抑制剂。这些化合物是RNA依赖性RNA病毒复制的抑制剂，可用于治疗RNA依赖性RNA病毒感染。它们特别适用于作为丙型肝炎病毒（HCV）NS5B聚合酶的抑制剂，作为HCV复制的抑制剂，以及/或用于治疗丙型肝炎感染。本发明还描述了包含这种核苷化合物的药物组合物，单独使用或与其他对RNA依赖性RNA病毒感染，特别是HCV感染有效的制剂组合使用。还公开了使用本发明的核苷化合物抑制RNA依赖性RNA聚合酶、抑制RNA依赖性RNA病毒复制和/或治疗RNA依赖性RNA病毒感染的方法。
• Oligonucleotides having modified nucleoside units
  申请人：——

  公开号：US20040014957A1

  公开（公告）日：2004-01-22

  Disclosed are oligonucleotides and oligonucleosides that include one or more modified nucleoside units. The oligonucleotides and oligonucleosides are particularly useful as antisense agents, ribozymes, aptamer, siRNA agents, probes and primers or, when hybridized to an RNA, as a substrate for RNA cleaving enzymes including RNase H and dsRNase.

  披露的是包括一个或多个修饰核苷单元的寡核苷酸和寡核苷糖。这些寡核苷酸和寡核苷糖特别适用于作为反义剂、核酶、适配体、siRNA试剂、探针和引物，或者当它们与RNA杂交时，作为包括RNase H和dsRNase的RNA切割酶的底物。
• Synthesis of Nucleosides through Direct Glycosylation of Nucleobases with 5-<i>O</i>-Monoprotected or 5-Modified Ribose: Improved Protocol, Scope, and Mechanism
  作者：A. Michael Downey、Radek Pohl、Jana Roithová、Michal Hocek

  DOI：10.1002/chem.201604955

  日期：2017.3.17

  Simplifying access to synthetic nucleosides is of interest due to their widespread use as biochemical or anticancer and antiviral agents. Herein, a direct stereoselective method to access an expansive range of both natural and synthetic nucleosides up to a gram scale, through direct glycosylation of nucleobases with 5‐O‐tritylribose and other C5‐modified ribose derivatives, is discussed in detail.

  由于合成核苷广泛用作生化或抗癌和抗病毒剂，因此简化对合成核苷的获取备受关注。本文介绍了一种直接立体选择性方法，可通过将核碱基与5- O-三苯甲基核糖和其他C的直接糖基化作用，以达到克级的广泛范围的天然和合成核苷详细讨论了5-修饰的核糖衍生物。反应在改良的Mitsunobu反应条件下通过原位形成的1,2-脱水糖（称为“脱水酶”）的亲核环氧化物开环进行。描述了合成多种核苷和其他1取代核糖苷衍生物时的反应范围。另外，提供了对该关键糖基供体中间体形成的机理的见解。
• Structure–Activity Relationship of Purine and Pyrimidine Nucleotides as Ecto-5′-Nucleotidase (CD73) Inhibitors
  作者：Anna Junker、Christian Renn、Clemens Dobelmann、Vigneshwaran Namasivayam、Shanu Jain、Karolina Losenkova、Heikki Irjala、Sierra Duca、Ramachandran Balasubramanian、Saibal Chakraborty、Frederik Börgel、Herbert Zimmermann、Gennady G. Yegutkin、Christa E. Müller、Kenneth A. Jacobson

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b00164

  日期：2019.4.11

  Cluster of differentiation 73 (CD73) converts adenosine 5'-monophosphate to immunosuppressive adenosine, and its inhibition was proposed as a new strategy for cancer treatment. We synthesized 5'- O-[(phosphonomethyl)phosphonic acid] derivatives of purine and pyrimidine nucleosides, which represent nucleoside diphosphate analogues, and compared their CD73 inhibitory potencies. In the adenine series

  分化簇73（CD73）将5'-单磷酸腺苷转化为免疫抑制腺苷，其抑制作用被提出作为一种新的癌症治疗策略。我们合成了嘌呤和嘧啶核苷的5'-O-[（膦酰基甲基）膦酸]衍生物，它们代表核苷二磷酸类似物，并比较了它们对CD73的抑制作用。在腺嘌呤系列中，大多数核糖修饰和1-deaza和3-deaza都是有害的，但可以容忍7-deaza。耐受尿嘧啶被N3-甲基取代，但不能被较大的基团或2-硫代取代。不容许1，2-二膦酰基-乙基修饰。N4-（芳基）烷氧基-胞嘧啶衍生物，特别是具有庞大的苄氧基取代基的化合物，显示出增强的效力。最有效的抑制剂是5' -5-氟尿苷（4l），N4-苯甲酰基胞苷（7f），N4- [O-（4-苄氧基）]胞苷（9h）和N4- [O的O-[（膦酰基甲基）膦酸]衍生物-（4-萘-2-基甲氧基）]-胞苷（9e）（在人CD73上Ki值为5-10 nM）。在两种尿苷二磷酸激活的P2Y受体亚型上
• [EN] PURINE AND PYRIMIDINE NUCLEOTIDES AS ECTO-5'-NUCLEOTIDASE INHIBITORS<br/>[FR] NUCLÉOTIDES DE PURINE ET DE PYRIMIDINE EN TANT QU'INHIBITEURS DE L'ECTO-5'-NUCLÉOTIDASE
  申请人：US HEALTH

  公开号：WO2020037275A1

  公开（公告）日：2020-02-20

  Disclosed is a compound of formula (I), wherein Q, U, T, A, a, b, c, and n are as defined herein. Also disclosed are methods of inhibiting ecto‑5'‑nucleotidase, inhibiting suppression of an antitumor immune response, inhibiting tumor growth of a cancerous tumor, inhibiting metastasis of cancer in a mammal afflicted with cancer, synergistically enhancing a response of a mammal afflicted with cancer undergoing treatment with an immunotherapeutic anti‑cancer agent, potentiating an activity of an inhibitor of nicotinamide phosphoribosyltransferase in a mammal undergoing treatment of a mammal with the inhibitor, and treating preeclampsia in a mammal in need thereof, comprising administering to an animal an effective amount of a compound of formula (I).

  揭示了一种具有式（I）的化合物，其中Q、U、T、A、a、b、c和n的定义如本文所述。还揭示了抑制外源性5'-核苷酸酶、抑制抗肿瘤免疫应答抑制、抑制癌症肿瘤生长、抑制哺乳动物患有癌症的转移、在接受免疫治疗抗癌剂治疗的患有癌症的哺乳动物的反应协同增强、在接受抑制剂治疗的哺乳动物中增强烟酰胺磷酸核糖转移酶的活性、以及治疗患有妊高症的哺乳动物的方法，包括向动物投与式（I）化合物的有效量。