1-[4-C-allyl-3,5-di-O-benzyl-2-O-acetyl-β-D-ribofuranosyl]-thymine | 945382-96-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1-[4-C-allyl-3,5-di-O-benzyl-2-O-acetyl-β-D-ribofuranosyl]-thymine
• 英文别名: 1-[4-c-Allyl-3,5-di-o-benzyl-2-o-acetyl-beta-d-ribofuranosyl]-thymine；[(2R,3R,4S,5R)-2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-phenylmethoxy-5-(phenylmethoxymethyl)-5-prop-2-enyloxolan-3-yl] acetate
• CAS: 945382-96-7
• 化学式: C₂₉H₃₂N₂O₇
• 分子量: 520.582
• InChiKey: LKWVVHCJWVQUEM-ABMPEJCWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.34
• 拓扑面积：
  103
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[4-C-allyl-3,5-di-O-benzyl-2-O-acetyl-β-D-ribofuranosyl]-thymine 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 氨 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 1-[4-C-allyl-3,5-di-O-benzyl-2-O-phenoxythiocarbonyl-β-D-ribofuranosyl]-thymine
  参考文献：
  名称：

  五元和六元构象锁定 2',4'-碳环核糖胸苷：合成、结构和生化研究

  摘要：

  两个不寻常的反应，包括 5-己烯基或 6-庚烯基自由基环化在 C4' 的远距离双键和 C2' 的胸苷核呋喃糖环的自由基中心已被用作合成 North 型构象限制顺式的关键步骤高产率的 LNA（碳环-LNA-T）和 ENA（碳环-ENA-T）的稠合双环五元和六元碳环类似物。它们的结构已通过长程 1H-13C NMR 相关 (HMBC)、TOCSY、COSY 和 NOE 实验得到明确证实。随后将碳环-LNA-T 和碳环-ENA-T 掺入反义寡核苷酸 (AON) 中，以表明它们将修饰的 AON/RNA 异源双链的 Tm 提高了 3.5-5 摄氏度和 1.5 摄氏度/碳环修饰-LNA-T 和碳环-ENA-T，分别。而发现碳环-LNA-T、碳环-ENA-T、氮杂-ENA-T和LNA-T修饰的AON/RNA双链体的相对RNase H切割率与天然对应物非常相似，无论AON 链中的类型和位点修饰，与天然的相比，将碳环-LNA

  DOI：

  10.1021/ja071106y
• 作为产物：
  描述：

  2-((3aR,5R,6S,6aR)-6-(benzyloxy)-5-((benzyloxy)methyl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxol-5-yl)acetaldehyde 在 正丁基锂 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 三氟甲磺酸 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 、 正己烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 2.25h， 生成 1-[4-C-allyl-3,5-di-O-benzyl-2-O-acetyl-β-D-ribofuranosyl]-thymine
  参考文献：
  名称：

  五元和六元构象锁定 2',4'-碳环核糖胸苷：合成、结构和生化研究

  摘要：

  两个不寻常的反应，包括 5-己烯基或 6-庚烯基自由基环化在 C4' 的远距离双键和 C2' 的胸苷核呋喃糖环的自由基中心已被用作合成 North 型构象限制顺式的关键步骤高产率的 LNA（碳环-LNA-T）和 ENA（碳环-ENA-T）的稠合双环五元和六元碳环类似物。它们的结构已通过长程 1H-13C NMR 相关 (HMBC)、TOCSY、COSY 和 NOE 实验得到明确证实。随后将碳环-LNA-T 和碳环-ENA-T 掺入反义寡核苷酸 (AON) 中，以表明它们将修饰的 AON/RNA 异源双链的 Tm 提高了 3.5-5 摄氏度和 1.5 摄氏度/碳环修饰-LNA-T 和碳环-ENA-T，分别。而发现碳环-LNA-T、碳环-ENA-T、氮杂-ENA-T和LNA-T修饰的AON/RNA双链体的相对RNase H切割率与天然对应物非常相似，无论AON 链中的类型和位点修饰，与天然的相比，将碳环-LNA

  DOI：

  10.1021/ja071106y

文献信息

• FIVE- AND SIX-MEMBERED CONFORMATIONALLY LOCKED 2',4'-CARBOCYCLIC RIBO-THYMIDINES FOR THE TREATMENT OF INFECTIONS AND CANCER
  申请人：Chattopadhyaya Jyoti

  公开号：US20100087387A1

  公开（公告）日：2010-04-08

  Compounds (1, 2, 3, 4) according to the formulae shown below: (Formula 1, 2, 3, 4). For General Formula1-4:N=1-Thyminyl,9-Adeninyl,9-Guaninyl,1-Cytosinyl, 5-methyl-1-cytosinyl, 5-trifluoromethyl-1-cytosinyl, 5-fluoro-1-cytosinyl, 5-fluoro-1-cytosinyl, 5-trifluoromethyl-1-Uracilyl or Formula (A) (12a/12b) wherein for 12a: n=1, Q=CH 3 (R) [5-membered carbocyclic with C7′ in R configuration], 12b: n=1, Q=CH 3 (S) [5-membered carbocyclic with C7′ in S configuration].

  根据下面所示的公式，化合物（1、2、3、4）：（公式1、2、3、4）。对于一般的公式1-4：N = 1-胸腺嘧啶基，9-腺嘌呤基，9-鸟嘌呤基，1-胞嘧啶基，5-甲基-1-胞嘧啶基，5-三氟甲基-1-胞嘧啶基，5-氟-1-胞嘧啶基，5-氟-1-胞嘧啶基，5-三氟甲基-1-尿嘧啶基或公式（A）（12a / 12b），其中对于12a：n = 1，Q = CH3（R）[C7'以R构型的5元环碳环]，12b：n = 1，Q = （S）[C7'以S构型的5元环碳环]。
• Five- and six-membered conformationally locked 2′,4′-carbocyclic ribo-thymidines for the treatment of infections and cancer
  申请人：Chattopadhyaya Jyoti

  公开号：US08461124B2

  公开（公告）日：2013-06-11

  Conformationally locked 2′,4′-carbocylic nucleosides with improved thermal and nuclease stability are disclosed. Oligonucleotides incorporating the locked nucleosides, and methods of treating disease states, are also disclosed.

  本文披露了构象锁定的2′,4′-环状核苷酸，具有改善的热稳定性和核酸酶稳定性。同时，本文还披露了包含锁定核苷酸的寡核苷酸以及治疗疾病状态的方法。
• WO2008/111908
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• US8461124B2
  申请人：——

  公开号：US8461124B2

  公开（公告）日：2013-06-11