(3R,4S,5R)-5-allyl-4-(benzyloxy)-5-((benzyloxy)methyl)tetrahydrofuran-2,3-diyl diacetate | 945382-94-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (3R,4S,5R)-5-allyl-4-(benzyloxy)-5-((benzyloxy)methyl)tetrahydrofuran-2,3-diyl diacetate
• CAS: 945382-94-5
• 化学式: C₂₆H₃₀O₇
• 分子量: 454.52
• InChiKey: XVFFPSPDXRFAAT-BTUDYTORSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.95
• 重原子数：
  33.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  80.29
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3R,4S,5R)-5-allyl-4-(benzyloxy)-5-((benzyloxy)methyl)tetrahydrofuran-2,3-diyl diacetate 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 氨 、 三正丁基氢锡 作用下， 以 甲醇 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 3.25h， 生成 (1R,3R,4R,5S,7S)-7-benzyloxy-1-benzyloxymethyl-5-methyl-3-(thymin-1-yl)-2-oxa-bicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  五元和六元构象锁定 2',4'-碳环核糖胸苷：合成、结构和生化研究

  摘要：

  两个不寻常的反应，包括 5-己烯基或 6-庚烯基自由基环化在 C4' 的远距离双键和 C2' 的胸苷核呋喃糖环的自由基中心已被用作合成 North 型构象限制顺式的关键步骤高产率的 LNA（碳环-LNA-T）和 ENA（碳环-ENA-T）的稠合双环五元和六元碳环类似物。它们的结构已通过长程 1H-13C NMR 相关 (HMBC)、TOCSY、COSY 和 NOE 实验得到明确证实。随后将碳环-LNA-T 和碳环-ENA-T 掺入反义寡核苷酸 (AON) 中，以表明它们将修饰的 AON/RNA 异源双链的 Tm 提高了 3.5-5 摄氏度和 1.5 摄氏度/碳环修饰-LNA-T 和碳环-ENA-T，分别。而发现碳环-LNA-T、碳环-ENA-T、氮杂-ENA-T和LNA-T修饰的AON/RNA双链体的相对RNase H切割率与天然对应物非常相似，无论AON 链中的类型和位点修饰，与天然的相比，将碳环-LNA

  DOI：

  10.1021/ja071106y
• 作为产物：
  描述：

  (3aR,5R,6S,6aR)-6-(benzyloxy)-5-((benzyloxy)methyl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxole-5-carbaldehyde 在 正丁基锂 、 草酰氯 、 三氟甲磺酸 、 溶剂黄146 、 二甲基亚砜 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 正己烷 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 (3R,4S,5R)-5-allyl-4-(benzyloxy)-5-((benzyloxy)methyl)tetrahydrofuran-2,3-diyl diacetate
  参考文献：
  名称：

  五元和六元构象锁定 2',4'-碳环核糖胸苷：合成、结构和生化研究

  摘要：

  两个不寻常的反应，包括 5-己烯基或 6-庚烯基自由基环化在 C4' 的远距离双键和 C2' 的胸苷核呋喃糖环的自由基中心已被用作合成 North 型构象限制顺式的关键步骤高产率的 LNA（碳环-LNA-T）和 ENA（碳环-ENA-T）的稠合双环五元和六元碳环类似物。它们的结构已通过长程 1H-13C NMR 相关 (HMBC)、TOCSY、COSY 和 NOE 实验得到明确证实。随后将碳环-LNA-T 和碳环-ENA-T 掺入反义寡核苷酸 (AON) 中，以表明它们将修饰的 AON/RNA 异源双链的 Tm 提高了 3.5-5 摄氏度和 1.5 摄氏度/碳环修饰-LNA-T 和碳环-ENA-T，分别。而发现碳环-LNA-T、碳环-ENA-T、氮杂-ENA-T和LNA-T修饰的AON/RNA双链体的相对RNase H切割率与天然对应物非常相似，无论AON 链中的类型和位点修饰，与天然的相比，将碳环-LNA

  DOI：

  10.1021/ja071106y

文献信息

• Carba-LNA-^5MeC/A/G/T Modified Oligos Show Nucleobase-Specific Modulation of 3′-Exonuclease Activity, Thermodynamic Stability, RNA Selectivity, and RNase H Elicitation: Synthesis and Biochemistry
  作者：RamShankar Upadhayaya、Sachin Gangadhar Deshpande、Qing Li、Ramakant Asaram Kardile、Aftab Yusuf Sayyed、Eknath Kamalakar Kshirsagar、Rahul Vilas Salunke、Shailesh Satish Dixit、Chuanzheng Zhou、András Földesi、Jyoti Chattopadhyaya

  DOI：10.1021/jo200073q

  日期：2011.6.3

  found to be degraded 4 times faster than cLNA-A and G modified counterparts. By appropriately choosing the carba-LNA modification sites in AON strands, the digestion of AON:RNA can be either totally repressed or be limited to cleavage at specific sites or at a single site only (similar to that of catalytic RNAzyme or DNAzyme). Considering all physico- and biochemical aspects of cLNA modified oligos

  使用分子内5-外-5-己烯基作为关键的环化步骤，我们先前报道了羰基-LNA胸腺嘧啶（cLNA-T）的明确合成，随后将其掺入反义寡核苷酸（AON）中并研究了它们的生化特性[ J.上午 化学 Soc。2007年，129（26），8362–8379]。这些掺入cLNA-T的寡核苷酸对AON：RNA异源双链体的特异性RNA亲和力为+ 3.5–5°C /修饰，与LNA（锁定核酸）的亲和力相当。然而，与LNA修饰的对应物相比，这些修饰的寡核苷酸在血清中显示出显着增强的核酸酶稳定性（约100倍），而不会损害任何RNase H募集能力。我们在此报告了5-甲基胞嘧啶-1-基（MeC），cLNA的9-腺嘌呤基（A）和9-胍基（G）衍生物及其寡核苷酸，并报告了其作为潜在的RNA导向抑制剂的生化特性。在一系列等序的碳氧-LNA修饰的AON中，我们在这里显示所有cLNA修饰的AON被发现具有RNA选择性，但是7'-
• WO2008/111908
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