1,3,4,6-tetra-O-acetyl-2-deoxy-2-trifluoroacetylamino-D-glucopyranose | 137766-83-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1,3,4,6-tetra-O-acetyl-2-deoxy-2-trifluoroacetylamino-D-glucopyranose
• 英文别名: 2-deoxy-1,3,4,6-tetra-O-acetyl-2-trifluoroacetamido-D-glucopyranose；2-deoxy-2-trifluoroacetamido-1,3,4,6-tetra-O-acetyl-α,β-D-glucopyranoside；1,3,4,6-tetra-O-acetyl-2-trifluoroacetamido-2-deoxy-D-glucopyranose；1,3,4,6-tetra-O-acetyl-2-deoxy-2-trifluoroacetamido-D-glucopyranose；2-deoxy-2-[(trifluoroacetyl)amino]-D-glucopyranose-1,3,4,6-tetraacetate；2-trifluoracetamido-2-deoxy-1,3,4,6-tetra-O-acetyl-D-glucopyranose；[(2R,3S,4R,5R)-3,4,6-triacetoxy-5-[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]tetrahydropyran-2-yl]methyl acetate；[(2R,3S,4R,5R)-3,4,6-triacetyloxy-5-[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]oxan-2-yl]methyl acetate
• CAS: 137766-83-7
• 化学式: C₁₆H₂₀F₃NO₁₀
• 分子量: 443.331
• InChiKey: XSSGVGGOUZKLAR-GNMOMJPPSA-N

物化性质

• 沸点：
  495.2±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.40±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  144
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,3,4,6-tetra-O-acetyl-2-deoxy-2-trifluoroacetylamino-D-glucopyranose 在 palladium on activated charcoal ammonium hydroxide 、 正丁基锂 、 氢气 、 乙酸肼 、 N,N'-羰基二咪唑 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 正己烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 51.45h， 生成 尿苷二磷酸酯葡萄糖胺
  参考文献：
  名称：

  Chemoenzymatic synthesis of thio-nod factor intermediates — Enzymatic transfer of glucosamine on thiochitobiose derivatives

  摘要：

  本研究报道了用化学酶法合成结瘤因子硫代类似物的过程，在这些类似物中，非还原端葡糖胺残基可用于在游离 NH2 基上引入脂肪酸分子。我们介绍了 UDP-GlcNH2 的化学合成及其在牛半乳糖基转移酶（EC 2.4.1.90）将 GlcNH2 酶促转移到壳寡糖、硫代壳寡糖和烯丙基硫代壳寡糖的非还原端 N-乙酰葡糖胺残基的 O-4 上的应用。利用 TLC 和 MALDI MS 对壳寡糖和硫代壳寡糖的酶促反应进行了跟踪，结果表明这些二糖约有 50% 转化为所需产物。然而，这些还原性三糖不能完全不含盐分，并在离子交换色谱中降解。因此，我们研究了非还原性烯丙基硫代几丁质类似物的酶促转移。我们在此描述了这种硫代二糖的化学合成及其非还原端氨基葡萄糖残基 O-4 上 GlcNH2 的酶促转移，从而得到所需的烯丙基硫代三糖。这种硫代异糖的纯度为 41%，并通过 1H NMR (HSQC) 和 HRMS 进行了表征。

  DOI：

  10.1139/v06-043
• 作为产物：
  描述：

  2-氨基-2-脱氧葡萄糖盐酸盐 在 吡啶 、 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 2.5h， 生成 1,3,4,6-tetra-O-acetyl-2-deoxy-2-trifluoroacetylamino-D-glucopyranose
  参考文献：
  名称：

  [EN] GLYCOMIMETIC LIGANDS
  [FR] LIGANDS GLYCOMIMÉTIQUES

  摘要：

  Described herein are glycan compounds and particles comprising glycan compounds. The compounds and particles described herein are useful in methods of treating immune and inflammatory-related diseases. or a pharmaceutically acceptable salt thereof

  公开号：

  WO2023129737A1

文献信息

• Study of the <i>N</i>⁷ Regioselective Glycosylation of 6-Chloropurine and 2,6-Dichloropurine with Tin and Titanium Tetrachloride
  作者：Lenka Tranová、Jakub Stýskala

  DOI：10.1021/acs.joc.1c01186

  日期：2021.10.1

  6-Chloropurine and 2,6-dichloropurine were regioselectively glycosylated at position 7 to give the corresponding peracetylated N7-nucleosides, which can be suitable for other purine transformations. In this work, we study the distribution of N7/N9-isomers produced via the Vorbrüggen method under different conditions, using an N-trimethylsilylated purine derivative and SnCl4 or TiCl4 as a catalyst. The main

  6-氯嘌呤和 2,6-二氯嘌呤在 7 位进行区域选择性糖基化，得到相应的全乙酰化N 7 -核苷，可适用于其他嘌呤转化。在这项工作中，我们使用N-三甲基甲硅烷基化嘌呤衍生物和 SnCl 4或 TiCl 4作为催化剂，研究了在不同条件下通过 Vorbrüggen 方法产生的N 7 / N 9 -异构体的分布。主要努力致力于扭转大多数糖基化反应在N 9处不利的主要选择性位置，从而确定使糖基化对所需N 7异构体的区域选择性最大化的条件。
• Pseudoenantiomeric glycoclusters: synthesis and testing of heterobivalency in carbohydrate–protein interactions
  作者：Jasna Brekalo、Guillaume Despras、Thisbe K. Lindhorst

  DOI：10.1039/c9ob00124g

  日期：——

  ligands to obtain a library of pseudoenantiomeric glycoclusters. They all have an α-d-mannosyl residue in common as a specific ligand for lectins FimH and ConA, while they differ in the second carbohydrate portion, consisting of a β-d-glucosyl, a β-d-galactosyl or a β-d-glucosaminyl residue as unspecific ligands. The synthesised heteroclusters were tested in standard binding-inhibition assays investigating

  多价碳水化合物与蛋白质的相互作用是细胞识别过程中的关键事件，并且已经通过合成糖模拟物进行了广泛研究。迄今为止，在多价结构的设计中经常考虑化合价，即与多价支架连接的配体的多重性，但是这些研究并未在分子水平上导致对聚糖识别的结论性理解。在这项工作中，我们通过设计第一个杂二价非对映异构糖簇为碳水化合物-凝集素识别研究增加了一个新的方面，以便研究杂多价和相对配体取向的影响。将分别衍生自d-丝氨酸和l-丝氨酸的两个对映体支架用两个不同的碳水化合物配体糖基化以获得假对映体糖簇库。它们都具有作为凝集素FimH和ConA特异性配体的α-d-甘露糖基残基，而它们在第二个碳水化合物部分（由β-d-葡萄糖基，β-d-半乳糖基或β- d-氨基葡萄糖残基为非特异性配体。在研究FimH介导的细菌粘附和ConA与甘露糖基化表面结合的标准结合抑制试验中测试了合成的异源团簇。观察到两种含假对映异构体葡萄糖的糖簇作为FimH
• Synthesis of cationic glucosamino nucleic acids for stabilizing oligonucleotides
  作者：Yoshiaki Kitamura、Shuichi Moribe、Yukio Kitade

  DOI：10.1016/j.bmcl.2018.08.024

  日期：2018.10

  Glucosamino nucleic acids (GANAs) bearing a β-N-glycoside bond between carbon 1 of the glucosamine and the nucleobase nitrogen were synthesized and incorporated into oligonucleotides (4′,6′-GANA and 3′,6′-GANA). The thermal stability of oligonucleotide duplexes containing the GANA zwitterionic nucleotides was also investigated.

  合成了在葡糖胺的碳1和核碱基氮之间带有β- N-糖苷键的葡糖氨基核酸（GANA），并将其掺入寡核苷酸（4'，6'-GANA和3'，6'-GANA）中。还研究了含有GANA两性离子核苷酸的寡核苷酸双链体的热稳定性。
• The crystal structure of an inverting glycoside hydrolase family 9 exo-β-<scp>D</scp>-glucosaminidase and the design of glycosynthase
  作者：Yuji Honda、Sachiko Arai、Kentaro Suzuki、Motomitsu Kitaoka、Shinya Fushinobu

  DOI：10.1042/bj20150966

  日期：2016.2.15

  Exo-β-D-glucosaminidase (EC 3.2.1.165) from Photobacterium profundum (PpGlcNase) is an inverting GH (glycoside hydrolase) belonging to family 9. We have determined the three-dimensional structure of PpGlcNase to describe the first structure–function relationship of an exo-type GH9 glycosidase. PpGlcNase has a narrow and straight active-site pocket, in contrast with the long glycan-binding cleft of a GH9 endoglucanase. This is because PpGlcNase has a long loop, which blocks the position corresponding to subsites −4 to −2 of the endoglucanase. The pocket shape of PpGlcNase explains its substrate preference for a β1,4-linkage at the non-reducing terminus. Asp139, Asp143 and Glu555 in the active site were located near the β-O1 hydroxy group of GlcN (D-glucosamine), with Asp139 and Asp143 holding a nucleophilic water molecule for hydrolysis. The D139A, D143A and E555A mutants significantly decreased hydrolytic activity, indicating their essential role. Of these mutants, D139A exclusively exhibited glycosynthase activity using α-GlcN-F (α-D-glucosaminyl fluoride) and GlcN as substrates, to produce (GlcN)2. Using saturation mutagenesis at Asp139, we obtained D139E as the best glycosynthase. Compared with the wild-type, the hydrolytic activity of D139E was significantly suppressed (&lt;0.1%), and the F−-release activity also decreased (&lt;3%). Therefore the glycosynthase activity of D139E was lower than that of glycosynthases created previously from other inverting GHs. Mutation at the nucleophilic water holder is a general strategy for creating an effective glycosynthase from inverting GHs. However, for GH9, where two acidic residues seem to share the catalytic base role, mutation of Asp139 might inevitably reduce F−-release activity.

  深色光杆菌（Photobacterium profundum）的外β-D-葡糖苷酶（EC 3.2.1.165）（PpGlcNase）是一种属于第 9 家族的倒置型 GH（糖苷水解酶）。我们测定了 PpGlcNase 的三维结构，首次描述了外型 GH9 糖苷酶的结构-功能关系。PpGlcNase 有一个狭窄而笔直的活性位点口袋，与 GH9 内聚糖酶的长聚糖结合裂隙形成鲜明对比。这是因为 PpGlcNase 有一个长环，挡住了与内切葡聚糖酶的-4 至-2 子位点相对应的位置。PpGlcNase 的口袋形状解释了它对非还原末端的 β1,4-连接底物的偏好。活性位点中的 Asp139、Asp143 和 Glu555 位于 GlcN（D-氨基葡萄糖）的 β-O1 羟基附近，其中 Asp139 和 Asp143 有一个亲核水分子用于水解。D139A、D143A 和 E555A 突变体大大降低了水解活性，表明它们起着至关重要的作用。在这些突变体中，D139A 只表现出以 α-GlcN-F（α-D-葡萄糖氨酰氟）和 GlcN 为底物生成 (GlcN)2 的糖合成酶活性。通过对 Asp139 进行饱和突变，我们获得了 D139E 作为最佳糖合成酶。与野生型相比，D139E的水解活性明显受到抑制（0.1%），F--释放活性也有所下降（3%）。因此，D139E 的糖合成酶活性低于之前由其他倒置 GHs 生成的糖合成酶。在亲核水座上发生突变是利用倒置 GHs 制造有效糖合成酶的一般策略。然而，对于 GH9 来说，两个酸性残基似乎共同起着催化碱基的作用，因此 Asp139 的突变可能会不可避免地降低 F 释放活性。
• Cell-Surface Glyco-Engineering by Exogenous Enzymatic Transfer Using a Bifunctional CMP-Neu5Ac Derivative
  作者：Chantelle J. Capicciotti、Chengli Zong、M. Osman Sheikh、Tiantian Sun、Lance Wells、Geert-Jan Boons

  DOI：10.1021/jacs.7b05358

  日期：2017.9.27

  CMP-Neu5Ac derivative that is modified at C-5 by a bifunctional entity composed of a complex synthetic heparan sulfate (HS) oligosaccharide and biotin. It is shown that recombinant ST6GAL1 can readily transfer the modified sialic acid to N-glycans of glycoprotein acceptors of living cells resulting in long-lived display. The HS oligosaccharide is functionally active, can restore protein binding, and

  允许长期展示定义明确的功能活跃的分子的细胞表面工程策略对于引起所需的细胞反应和理解生物学过程具有高度吸引力。当前用于外源引入合成生物分子的方法学常常导致短暂的展示，或者需要进行基因操作以促进膜附着。在本文中，我们报告了一种基于CMP-Neu5Ac衍生物的细胞表面工程化策略，该衍生物在C-5处被由复杂的合成硫酸乙酰肝素（HS）寡糖和生物素组成的双功能实体修饰。结果表明，重组ST6GAL1可以很容易地将修饰的唾液酸转移到N上-活细胞糖蛋白受体的-聚糖导致长寿展示。HS寡糖具有功能活性，可以恢复蛋白质结合，并激活HS缺陷细胞的细胞信号转导事件。细胞表面工程方法学可以轻松地适应任何细胞类型，并且高度适用于各种复杂的生物分子。