4-[(N)-1,1',2-trisnorsqualenoyl]-2',2'-difluoro-2'-deoxycytidine | 915978-82-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: 4-[(N)-1,1',2-trisnorsqualenoyl]-2',2'-difluoro-2'-deoxycytidine
• 英文别名: 4-(N)-trisnorsqualenoyl gemcitabine；4-(N)-squalenoyl gemcitabine；SQdFdC；(4E,8E,12E,16E)-N-[1-[(2R,4R,5R)-3,3-difluoro-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]-4,8,13,17,21-pentamethyldocosa-4,8,12,16,20-pentaenamide
• CAS: 915978-82-4
• 化学式: C₃₆H₅₃F₂N₃O₅
• 分子量: 645.831
• InChiKey: XHTNLZSBAIUJKQ-NDHRCRFUSA-N

物化性质

• 密度：
  1.12±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.2
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  112
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-[(N)-1,1',2-trisnorsqualenoyl]-2',2'-difluoro-2'-deoxycytidine 在 吡啶 、 四氮唑 、 甲醇 、 4-二甲氨基吡啶 、 甲酸 、 氟化氢吡啶 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 184.75h， 生成 [(2R,3R,5R)-4,4-difluoro-3-hydroxy-5-[2-oxo-4-[[(4E,8E,12E,16E)-4,8,13,17,21-pentamethyldocosa-4,8,12,16,20-pentaenoyl]amino]pyrimidin-1-yl]oxolan-2-yl]methyl bis(9H-fluoren-9-ylmethyl) phosphate
  参考文献：
  名称：

  角鲨烯酰吉西他滨单磷酸盐：纳米组件的合成、表征和生物学评价

  摘要：

  三烷基铵 4-(N)-1,1',2-trisnor-squalenoylgemcitabine monophosphate (SQdFdC-MP) 盐由 1,1',2-trisnor-squalenoylgemcitabine 通过亚磷酰胺型化学制备。这种两亲性分子在水溶液中自组装成大小约为 100 nm 的纳米组件。冷冻 TEM 和小角 X 射线散射 (SAXS) 研究表明 SQdFdC-MP 分子自组织成单层脂质体，膜厚约为 70 A。这种脂质体三烷基铵 SQdFdC-MP 制剂对白血病细胞显示出显着的抗癌活性. 这些结果表明带负电荷的核苷酸类似物的角鲨烯缀合物有效地渗透到肿瘤细胞中。此外，

  DOI：

  10.1002/ejoc.201100036
• 作为产物：
  描述：

  盐酸吉西他滨 、 4,8,13,17,21-五甲基-4,8,12,16,20-二十二碳五烯酸 在 氯甲酸乙酯 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 72.33h， 以55%的产率得到4-[(N)-1,1',2-trisnorsqualenoyl]-2',2'-difluoro-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  溶液中4-（N）-角鲨烯酰基吉西他滨的构象特征：核磁共振和分子动力学的组合研究

  摘要：

  核磁共振波谱学和分子建模技术相结合已被用来研究4-（N）-角鲨烯酰基吉西他滨（Sq-Gem）在溶液中的构象行为它的三维结构在很大程度上影响了医疗应用。NMR标量耦合常数（J耦合）已通过一维和二维方法进行了实验测量，随后与通过以下方法估算的理论值进行了比较：在甲醇溶液中通过分子动力学（MD）模拟获得并优化的最具代表性构象的DFT计算。遵循这种方法，我们发现在计算和实验NMR数据之间，对于柔性构筑的鲨烯酰基链被强烈折叠的主要构象，都具有良好的一致性。

  DOI：

  10.1039/c4nj02091j

文献信息

• Squalenoyl Gemcitabine Monophosphate: Synthesis, Characterisation of Nanoassemblies and Biological Evaluation
  作者：Joachim Caron、Elise Lepeltier、L. Harivardhan Reddy、Sinda Lepêtre-Mouelhi、Séverine Wack、Claudie Bourgaux、Patrick Couvreur、Didier Desmaële

  DOI：10.1002/ejoc.201100036

  日期：2011.5

  Trialkylammonium 4-(N)-1,1',2-trisnor-squalenoylgemcitabine monophosphate (SQdFdC-MP) salts were prepared from 1,1',2-trisnor-squalenoylgemcitabine by phosphoramidite-type chemistry. This amphiphilic molecule self-assembled into nanoassemblies of about 100 nm in size in aqueous solutions. Cryo-TEM and small-angle X-ray scattering (SAXS) investigations revealed that SQdFdC-MP molecules self-organized

  三烷基铵 4-(N)-1,1',2-trisnor-squalenoylgemcitabine monophosphate (SQdFdC-MP) 盐由 1,1',2-trisnor-squalenoylgemcitabine 通过亚磷酰胺型化学制备。这种两亲性分子在水溶液中自组装成大小约为 100 nm 的纳米组件。冷冻 TEM 和小角 X 射线散射 (SAXS) 研究表明 SQdFdC-MP 分子自组织成单层脂质体，膜厚约为 70 A。这种脂质体三烷基铵 SQdFdC-MP 制剂对白血病细胞显示出显着的抗癌活性. 这些结果表明带负电荷的核苷酸类似物的角鲨烯缀合物有效地渗透到肿瘤细胞中。此外，
• Conformational features of 4-(N)-squalenoyl-gemcitabine in solution: a combined NMR and molecular dynamics investigation
  作者：Ceruti Maurizio、Rocco Flavio、Di Pietro Maria Enrica、Tocci Elena、De Luca Giuseppina

  DOI：10.1039/c4nj02091j

  日期：——

  combination of NMR spectroscopy and molecular modelling techniques has been used to investigate the conformational behaviour in solution of 4-(N)-squalenoyl-gemcitabine (Sq-Gem), a promising anticancer new derivative whose pharmacological and biological properties and its use in the medical applications are heavily influenced by its three-dimensional structure. NMR scalar coupling constants (J-couplings) have

  核磁共振波谱学和分子建模技术相结合已被用来研究4-（N）-角鲨烯酰基吉西他滨（Sq-Gem）在溶液中的构象行为它的三维结构在很大程度上影响了医疗应用。NMR标量耦合常数（J耦合）已通过一维和二维方法进行了实验测量，随后与通过以下方法估算的理论值进行了比较：在甲醇溶液中通过分子动力学（MD）模拟获得并优化的最具代表性构象的DFT计算。遵循这种方法，我们发现在计算和实验NMR数据之间，对于柔性构筑的鲨烯酰基链被强烈折叠的主要构象，都具有良好的一致性。