N2-苯乙酰鸟嘌呤核苷 | 132628-16-1

• 物质功能分类: 生物化工 - 核苷类药物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: N2-苯乙酰鸟嘌呤核苷
• 中文别名: 苯乙酰鸟嘌呤核苷；N2-苯乙酰鸟苷；N2-苯乙酰基-D-鸟苷
• 英文名称: 2-N-phenylacetylguanosine
• 英文别名: N2-Phenylacetyl guanosine；N-[9-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-6-oxo-1H-purin-2-yl]-2-phenylacetamide
• CAS: 132628-16-1
• 化学式: C₁₈H₁₉N₅O₆
• 分子量: 401.379
• InChiKey: IRSCBAKCFOLZNC-IWCJZZDYSA-N

物化性质

• 熔点：
  189℃
• 密度：
  1.73

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.1
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  158
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  8

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H315,H319,H335

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N2-苯乙酰鸟嘌呤核苷 在 咪唑 、 四氮唑 、 二氯乙酸 、 4-二甲氨基吡啶 、 2,4,6-三甲基苯磺酰氯 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 39.36h， 生成 6-S-(2-cyanoethyl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2-N-phenylacetyl-6-thioguanosine 3',5'-bisphosphate tetrakis(2-cyanoethyl) ester
  参考文献：
  名称：

  合成4-硫代尿苷，6-硫代肌苷和6-硫代鸟苷3'，5'-O-二磷酸酯作为RNA连接的供体分子，并将其应用于可光活化TMG封端的U1 snRNA片段的合成。

  摘要：

  通过显着改进的方法以高收率合成了4-硫代尿苷，6-硫鸟嘌呤和6-硫代肌苷3'，5'-双磷酸酯（9、20和28）。在前两种化合物中，尿苷和2-N-苯基乙酰鸟苷通过瞬时O-三甲基甲硅烷基化反应转化为相应的4-和6-O-苯磺酰基中间体（2和13），然后使它们与2-反应。氰基乙硫醇在N-甲基吡咯烷存在下分别得到4-硫代尿苷（3）和2-N-苯基乙酰基-6-硫代鸟苷衍生物（14）。这些硫代核苷衍生物的原位二甲氧基三苯甲基化从1和11产生5'掩蔽的产物4和15的高总收率。6-S-（2-氰乙基）-5'-O-（4,4'-二甲氧基三苯甲基）- 6-硫代肌苷（23）通过5'的取代合成 -O-三苯甲基化的6-氯嘌呤核糖苷衍生物22与2-氰基乙硫醇。这些S-（2-氰基乙基）硫代核苷被转化为2'-O-（叔丁基二甲基甲硅烷基）核糖核苷3'-亚磷酰胺衍生物7、18和26或3'，5'-双磷酸酯衍生物8、19和27用DBU处

  DOI：

  10.1021/jo991432z
• 作为产物：
  描述：

  鸟苷 在 吡啶 、 水 作用下， 反应 24.25h， 生成 N2-苯乙酰鸟嘌呤核苷
  参考文献：
  名称：

  制备N 2-苯乙酰基-D-鸟苷的改进方法

  摘要：

  本发明一种制备N 2 -苯乙酰基-D-鸟苷的改进方法，向三甲基硅基保护的D-鸟苷中，加入苯乙酰氯、1-羟基苯并三唑、乙腈和吡啶的反应溶液，进行苯乙酰化反应，反应完毕后，将反应体系加入到水中淬灭反应；然后浓缩，蒸干溶剂，加水结晶，得粗品，粗品经后处理得N 2 -苯乙酰基-D-鸟苷。本发明改进方法淬灭反应时，采用将反应体系加入到水中的方法，减少了副产物的生成，选择性好，大大提高了产物收率和纯度；反应过程中不使用氨水，防止产物在氨水存在下的分解，提高了产物的纯度和产率；缩短了反应时间，简化了淬灭反应后的产物处理，制备过程不产生氨气，后处理过程产生的废水较少并且易于处理，更加有利于环保，适合工业化生产。

  公开号：

  CN104211745B

文献信息

• Some observations relating to the use of 1-aryl-4-alkoxypiperidin-4-yl groups for the protection of the 2′-hydroxy functions in the chemical synthesis of oligoribonucleotides
  作者：Wayne Lloyd、Colin B. Reese、Quanlai Song、Anthony M. Vandersteen、Cristina Visintin、Pei-Zhou Zhang

  DOI：10.1039/a908149f

  日期：——

  The comparative rates of acid-catalysed removal of ten 1-aryl-4-methoxypiperidin-4-yl 8 (R = Me) [including the previously reported Ctmp 5 and Fpmp 6] protecting groups for the 2′-hydroxy functions in oligoribonucleotide synthesis are discussed. These studies have led to the development of the 1-(4-chlorophenyl)-4-ethoxypiperidin-4-yl (Cpep) protecting group 8 (R = Et, R1 = R2 = H, R3 = Cl) which is both more stable than the Ctmp and Fpmp groups at pH 0.5 and more labile at pH 3.75. The influence of the ribonucleoside aglycone on the stability of the 2′-O-Fpmp and 2′-O-Ctmp protecting groups both at low and high pH is examined.

  讨论了在寡核苷酸合成中，十个1-芳基-4-甲氧基哌啶-4-基（R = Me，包括先前报道的Ctmp 5和Fpmp 6）保护基对2'-羟基功能的酸催化去除的相对速率。这些研究导致开发了1-(4-氯苯基)-4-乙氧基哌啶-4-基（Cpep）保护基8（R = Et，R1 = R2 = H，R3 = Cl），其在pH 0.5下比Ctmp和Fpmp群更加稳定，而在pH 3.75下更加不稳定。研究了核苷酸基在低pH和高pH下对2'-O-Fpmp和2'-O-Ctmp保护基稳定性的影响。
• Use of the 1-(2-fluorophenyl)-4-methoxypiperidin-4-yl (Fpmp) protecting group in the solid-phase synthesis of oligo- and poly-ribonucleotides
  作者：M. Vaman Rao、Colin B. Reese、Volker Schehimann、Pak Sang Yu

  DOI：10.1039/p19930000043

  日期：——

  the use of building blocks in which two acid-labile groups, 1-(2-fluorophenyl)-4-methoxypiperidin-4-yl (Fpmp) and 9-phenylxanthen-9-yl (Px), respectively, are used to protect the 2′- and 5′-hydroxy functions of ribonucleoside building blocks. The adenine, cytosine and guanine base residues are protected with pivaloyl, benzoyl and phenylacetyl groups, respectively. 2-Cyanoethyl N,N-diisopropylphosphoramidites

  描述了一种寡核苷酸和多核糖核苷酸的固相合成方法。合成策略涉及使用结构单元，其中两个酸不稳定基团分别为1-（2-氟苯基）-4-甲氧基哌啶-4-基（Fpmp）和9-苯基黄嘌呤-9-基（Px）用于保护核糖核苷结构单元的2'-和5'-羟基功能。腺嘌呤，胞嘧啶和鸟嘌呤碱基残基分别被新戊酰基，苯甲酰基和苯乙酰基保护。在耦合步骤中使用了2-氰乙基N，N-二异丙基亚磷酰胺和5-（3-硝基苯基）-1 H-四唑用作活化剂。在链组装过程之后，从功能化的受控孔玻璃固相支持物中释放了2'-保护的寡核苷酸和多核糖核苷酸；它们是通过用0.01摩尔DM完全畅通之前后者稳定核糖核酸（RNA）序列纯化-3在室温下盐酸（pH值为2）20小时。酵母丙氨酸tRNA（3-mer，r [GGAGAGGUGUCCCCGGUUCGAUUCCGGACUCGUCCACCA]）序列的3'端十聚体（r [UCGUCCACCA]），九糖（r [AU
• Regioselective protection of the 2′-hydroxyl group of N-acyl-3′,5′-O-di(t-butyl)silanediylnucleoside derivatives by use of t-BuMgCl and 2-(trimethylsilyl)ethoxymethyl chloride
  作者：Takeshi Wada、Masanori Tobe、Takashi Nagayama、Kiyotaka Furusawa、Mitsuo Sekine

  DOI：10.1016/0040-4039(95)00130-5

  日期：1995.3

  Regioselective 2′-O-protection of N-protected 3′,5′-O-di(t-butyl)silanediylribonucleoside derivatives with the 2-(trimethylsilyl)ethoxymethyl (SEM) group has been achieved by use of t-BuMgCl and 2-(trimethylsilyl)ethoxymethyl chloride. The former was used as a base. The 2′-O-SEM protected ribonucleoside derivatives were converted via a three-step reaction into the corresponding phosphoramidite building

  通过使用t -BuMgCl和2实现了N保护的3'，5'- O-二（叔丁基）硅烷二基核糖核苷衍生物具有2-（三甲基甲硅烷基）乙氧基甲基（SEM）基团的区域选择性2'- O-保护。-（三甲基甲硅烷基）乙氧基甲基氯。前者被用作基础。通过三步反应将2'- O- SEM保护的核糖核苷衍生物以良好的总收率转化为相应的亚磷酰胺结构单元。
• Exploring specificity of glycosyltransferases: synthesis of new sugar nucleotide related molecules as putative donor substrates
  作者：Amira Khaled、Olga Piotrowska、Katarzyna Dominiak、Claudine Augé

  DOI：10.1016/j.carres.2007.11.009

  日期：2008.2

  with an IC50 value of 7 mM. In the second approach, we prepared sugar nucleotide mimics having the diphosphate bridge replaced by the oxycarbonylaminosulfonyl linker. The surrogate of GDP-Fuc was synthesized as a 9:1 alpha/beta anomeric mixture, in 40% yield, starting from chlorosulfonyl isocyanate, perbenzylated l-fucopyranose, and a guanosine derivative, protected on the exocyclic amine and secondary

  我们研究了糖基转移酶在两个互补方向上对供体底物的特异性。首先，我们准备了简单的N-乙酰基-α-D-氨基葡萄糖1-二磷酸酯：甲基-（2-乙酰氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡萄糖基）-二磷酸酯，苄基-（2-乙酰氨基-2-脱氧-α-磷酸酯D-吡喃葡萄糖基）-二磷酸酯，4-苯基丁基-（2-乙酰氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡萄糖基）-二磷酸酯，通过将相应的活化烷基磷酸酯与N-乙酰基-α-D-葡糖胺1-偶联磷酸盐。在脑膜炎奈瑟氏菌N-乙酰氨基葡萄糖氨基转移酶（LgtA）催化的反应中，作为N-乙酰氨基葡萄糖的供体，测试了这些二磷酸以及2-乙酰氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡萄糖1-二磷酸的活性。评估为抑制剂，只有2-乙酰氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡萄糖1-二磷酸酯显示出一定的抑制活性，IC50值为7 mM。在第二种方法中，我们准备了糖核苷酸模拟物，其二磷酸桥被氧羰基氨基磺酰基接头取代。GDP-Fuc的替代
• 3,3′-Oxybis(dimethoxytrityl chloride) (O-DMTCl): synthesis and applications of a novel bifunctional protecting group
  作者：Natsuhisa Oka、Yogesh S. Sanghvi、Emmanuel A. Theodorakis

  DOI：10.1016/j.bmcl.2004.03.097

  日期：2004.6

  3,3(')- Oxybis(dimethoxytrityl chloride) (O-DMTCl) was synthesized as a novel, acid-labile bifunctional protecting reagent. The reactions of O-DMTCl with base-protected ribonucleosides afforded unexpectedly 2('),5(')-cyclic protected ribonucleosides in addition to the expected 3('),5(')-cyclic protected ribonucleosides in good yields.

  合成了3,3（'）-氧代双（二甲氧基三苯甲基氯）（O-DMTC1）作为新型的，酸不稳定的双功能保护剂。O-DMTC1与碱基保护的核糖核苷的反应，除了预期的3（'），5（'）-环保护的核糖核苷以外，还意外地提供了2（'），5（'）-环保护的核糖核苷。