PCI 34051; N-羟基-1-(4-甲氧基苄基)-1H-吲哚-6-甲酰胺 | 950762-95-5

• 物质功能分类: 生物化工 - 抑制剂 - 表观遗传学(Epigenetics)
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 中文名称: PCI 34051; N-羟基-1-(4-甲氧基苄基)-1H-吲哚-6-甲酰胺
• 中文别名: N-羟基-1-(4-甲氧基苄基)-1H-吲哚-6-甲酰胺；PCI34051;N-羟基-1-(4-甲氧基苄基)-1H-吲哚-6-甲酰胺
• 英文名称: N-hydroxy-1-(4-methoxybenzyl)-1H-indole-6-carboxamide
• 英文别名: PCI-34051；N-hydroxy-1-((4-methoxyphenyl)methyl)-1H-indole-6-carboxamide；N-hydroxy-1-[(4-methoxyphenyl)methyl]indole-6-carboxamide
• CAS: 950762-95-5
• 化学式: C₁₇H₁₆N₂O₃
• 分子量: 296.326
• InChiKey: AJRGHIGYPXNABY-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.25
• 溶解度：
  不溶于水；不溶于乙醇； DMSO 中≥14.8 mg/mL

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.4
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.12
• 拓扑面积：
  63.5
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  3

安全信息

• 危险品标志：
  Xn
• 安全说明：
  S26
• 危险类别码：
  R22,R36
• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

制备方法与用途

生物活性

PCI-34051是一种高效的、特异性的HDAC8抑制剂，在无细胞试验中的IC50值为10 nM。与HDAC1和6相比，其选择性高200多倍；而与HDAC2、3和10相比，则高出1000倍。PCI-34051能诱导半胱天冬酶依赖性的细胞凋亡。

靶点

Target	Value
HDAC8	10 nM

体外研究

PCI-34051在体外有效作用于HDAC8，其Ki值为10 nM。与其他I型组蛋白去乙酰化酶（如HDAC1）相比，它对HDAC8的选择性更高。与HDAC1和HDAC6相比，选择性高200倍；而与HDAC2、HDAC3和HDAC10相比，其选择性则高出1000倍。

在卵巢瘤细胞系OVCAR-3中，PCI-34051的GI50值为6 μM，处理后细胞死亡率为15%。当浓度低于25 μM时，在敏感细胞系中处理24小时而非更早时间点，不会观察到显著的微管蛋白去乙酰化或组蛋白乙酰化的改变。PCI-34051能诱导T细胞恶性肿瘤衍生细胞系的选择性细胞毒性作用，并诱导caspase依赖性的凋亡。

在使用5 μM PCI-34051处理后，通过检测caspase-3活性可以观察到，在12至48小时内活性水平有所提高。这与caspase活性增加一致，表明PCI-34051诱导了细胞凋亡。然而，它并未刺激Bid裂解，后者是外在凋亡通路的特征。

P116和J.RT3-T.5对PCI-34051敏感，而PLCγ1缺陷的J.gamma1系则显著降低了由PCI-34051诱导的细胞凋亡程度。此外，稳定的钙水平也强烈影响了PCI-34051诱导的细胞凋亡过程。研究还发现，PCI-34051能够促使细胞色素c从线粒体中释放。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  PCI 34051; N-羟基-1-(4-甲氧基苄基)-1H-吲哚-6-甲酰胺 、 methyl 5-methyl-1H-indole-6-carboxylate 、 碘化钾 、 sodium;hydride 、 4-甲氧基氯苄 在 乙酸乙酯 、 Brine 、 magnesium sulfate 、 hexanes EtOAc 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 disodium;carbonate 为溶剂， 反应 3.0h， 以to yield methyl 1-(4-methoxybenzyl)-5-methyl-1H-indole-6-carboxylate (99.0 mg, 0.320 mmol, 61%)的产率得到methyl 1-(4-methoxybenzyl)-5-methyl-1H-indole-6-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  COMPOUNDS, SUBSTRATES AND METHODS RELATED TO HISTONE DEACETYLASES

  摘要：

  本发明涉及用于鉴定化合物、肽和蛋白质作为组蛋白去乙酰化酶底物的方法。本发明还涉及公式I的化合物：F1-X1-L1-X2-P1-X3-G1（公式I）。本发明涉及通过ARID1A（BAF250A）介导的疾病或障碍的治疗。

  公开号：

  US20160060679A1
• 作为产物：
  描述：

  methyl 1-(4-methoxybenzyl)-1H-indole-6-carboxylate 在 sodium hydroxide 、 羟胺 、 盐酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 1.0h， 以84%的产率得到PCI 34051; N-羟基-1-(4-甲氧基苄基)-1H-吲哚-6-甲酰胺
  参考文献：
  名称：

  [EN] INDOLE DERIVATIVES AS INHIBITORS OF HISTONE DEACETYLASE
  [FR] DÉRIVÉS D'INDOLE EN TANT QU'INHIBITEURS DE L'HISTONE DÉSACÉTYLASE

  摘要：

  公开号：

  WO2007109178A3

文献信息

• [EN] ISOFORM-SELECTIVE LYSINE DEACETYLASE INHIBITORS<br/>[FR] INHIBITEURS DE LYSINE DÉSACÉTYLASE SÉLECTIFS ENVERS LES ISOFORMES
  申请人：UNIV WASHINGTON

  公开号：WO2016179398A1

  公开（公告）日：2016-11-10

  Isoform-selective lysine deacetylase inhibitors are described. Inhibitors of the lysine deacetylase enzyme are useful as antitumor drugs and for treating addiction, asthma, cardio-vascular disease, immunosuppression, neurodegenerative diseases, sepsis, sickle-cell disease, uveal melanoma and termination of viral latency, particularly HIV-1 latency.

  描述了选择性异构体赖氨酸去乙酰化酶抑制剂。赖氨酸去乙酰化酶的抑制剂可用作抗肿瘤药物，治疗成瘾、哮喘、心血管疾病、免疫抑制、神经退行性疾病、败血症、镰刀细胞病、葡萄膜黑色素瘤以及终止病毒潜伏，尤其是HIV-1潜伏。
• [EN] SUBSTITUTED INDOLES WITH INHIBITORY ACTIVITY<br/>[FR] INDOLES SUBSTITUÉS AYANT UNE ACTIVITÉ INHIBITRICE
  申请人：UNIV PITTSBURGH COMMONWEALTH SYS HIGHER EDUCATION

  公开号：WO2021243018A1

  公开（公告）日：2021-12-02

  Disclosed are substituted indole compounds and compositions. The substituted indole compounds and compositions can be used for treating or preventing acute renal failure in a subject. The compounds and compositions can also be used for treating an infectious disease or cancer.

  本文披露了替代吲哚化合物和组合物。这些替代吲哚化合物和组合物可用于治疗或预防受试者的急性肾衰竭。这些化合物和组合物还可用于治疗传染病或癌症。
• INDOLE DERIVATIVES AS INHIBITORS OF HISTONE DEACETYLASE
  申请人：Buggy J. Joseph

  公开号：US20070281934A1

  公开（公告）日：2007-12-06

  Described herein are compounds and pharmaceutical compositions containing such compounds, which inhibit the activity of histone deacetylase 8 (HDAC8). Also described herein are methods of using such HDAC8 inhibitors, alone and in combination with other compounds, for treating diseases or conditions that would benefit from inhibition of HDAC8 activity.

  本文介绍了一些化合物和含有这些化合物的药物组合物，这些化合物可以抑制组蛋白去乙酰化酶8（HDAC8）的活性。本文还介绍了使用这些HDAC8抑制剂的方法，单独或与其他化合物联合使用，用于治疗需要抑制HDAC8活性的疾病或病情。
• SELECTIVE INHIBITORS OF HISTONE DEACETYLASE
  申请人：Verner Erik

  公开号：US20110081409A1

  公开（公告）日：2011-04-07

  Described herein are compounds and pharmaceutical compositions containing such compounds, which inhibit the activity of histone deacetylase 8 (HDAC8). Also described herein are methods of using such HDAC8 inhibitors, alone and in combination with other compounds, for treating diseases or conditions that would benefit from inhibition of HDAC8 activity.

  本文描述了一些化合物和含有这些化合物的药物组合物，这些化合物可以抑制组蛋白去乙酰化酶8（HDAC8）的活性。本文还描述了使用这些HDAC8抑制剂的方法，单独或与其他化合物联合使用，用于治疗需要抑制HDAC8活性的疾病或症状。
• Indole derivatives as inhibitors of histone deacetylase
  申请人：Pharmacylics, Inc.

  公开号：US08338416B2

  公开（公告）日：2012-12-25

  Described herein are compounds and pharmaceutical compositions containing such compounds, which inhibit the activity of histone deacetylase 8 (HDAC8). Also described herein are methods of using such HDAC8 inhibitors, alone and in combination with other compounds, for treating diseases or conditions that would benefit from inhibition of HDAC8 activity.

  本文描述了一些化合物及其制药组合物，这些化合物可以抑制组蛋白去乙酰化酶8（HDAC8）的活性。同时，本文还描述了使用这些HDAC8抑制剂的方法，单独或与其他化合物联合使用，用于治疗需要抑制HDAC8活性的疾病或病情。