辅酶 A S-辛酸酯 | 1264-52-4

• 物质功能分类: 有机原料 - 羧酸类化合物及衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 中文名称: 辅酶 A S-辛酸酯
• 中文别名: 辛酰辅酶A；辅酶AS-辛酸酯
• 英文名称: octanoyl coenzyme A
• 英文别名: octanoyl-CoA；octanoyl-coenzyme A；S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] octanethioate
• CAS: 1264-52-4
• 化学式: C₂₉H₅₀N₇O₁₇P₃S
• 分子量: 893.74
• InChiKey: KQMZYOXOBSXMII-CECATXLMSA-N

物化性质

• 密度：
  1.71±0.1 g/cm3(Predicted)
• 碰撞截面：
  268.72 Ų [M-H]- [CCS Type: DT, Method: single field calibrated with Agilent tune mix (Agilent)]

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.6
• 重原子数：
  57
• 可旋转键数：
  26
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.72
• 拓扑面积：
  389
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  22

上下游信息

• 上游原料

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  辅酶 A	coenzyme A	85-61-0	C21H36N7O16P3S	767.541
  辅酶A,S-2-辛烯酸酯(7CI,9CI)	2-octenoyl-CoA	71629-68-0	C29H48N7O17P3S	891.724

• 下游产品

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  辅酶 A	coenzyme A	85-61-0	C21H36N7O16P3S	767.541
  辅酶A,S-2-辛烯酸酯(7CI,9CI)	2-octenoyl-CoA	71629-68-0	C29H48N7O17P3S	891.724

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  辅酶 A S-辛酸酯 在 3,3,3-膦三基三丙酸 、 OleA 、 sodium phosphate 、 还原型辅酶II(NADPH)四钠盐 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 生成 辅酶 A
  参考文献：
  名称：

  NADPH依赖的2-烷基-3-酮链烷酸还原酶参与嗜麦芽窄食单胞菌的烯烃生物合成的功能表征。

  摘要：

  OleD被证明在嗜麦芽窄食单胞菌的酰基硫酯的烯烃（烯烃）生成中起着关键的还原作用。编码OleD的基因与其他三个基因oleABC聚在一起，并且在各种产生烯烃的细菌中似乎都以与操纵子相同的方向转录。在这项研究中，合成了一系列链长和立体化学不同的底物，并用于阐明OleD的功能作用和底物特异性。我们证明OleD，这是NADP（H）依赖还原酶，是一个同型二聚体，它催化2-烷基-3-酮链烷酸的可逆立体定向还原。用顺-2-癸基-3-羟基十四烷酸观察到的最大催化效率，kcat / K m分别比顺-2-辛基-3-羟基十二酸和顺-2-己基-3-羟基癸酸高5倍和8倍。用顺-2-丁基-3-羟基辛酸和缺少2-烷基的化合物（例如3-酮癸酸和3-羟基癸酸）未观察到OleD活性，这表明2-烷基链对于酶的识别和催化是必要的。使用已知立体化学的底物非对映异构体对和4个对映体纯的2-己基-3-羟基癸酸异构体，OleD被证明对（2

  DOI：

  10.1021/bi201096w
• 作为产物：
  描述：

  辛酸 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 4.5h， 生成 辅酶 A S-辛酸酯
  参考文献：
  名称：

  Biosynthesis of Branched-chain Fatty Acid inBacilli: FabD (malonyl-CoA:ACP transacylase) Is Not Essential forIn VitroBiosynthesis of Branched-chain Fatty Acids

  摘要：

  研究发现，不完全纯化的无枝菌酸菌β-酮脂酰ACP合酶（Bacillus insolitus）在活性测定时不需要添加FabD（丙二酸单酰-CoA:ACP转酰酶，MAT）。因此，本研究探讨了杆状菌粗脂肪酸合成酶（FAS）体外支链脂肪酸（BCFA）生物合成中FabD蛋白的必要性。为了探索FabD在BCFA生物合成中的作用，通过免疫沉淀法从粗FAS中去除该蛋白。将枯草芽孢杆菌的His标签融合蛋白FabD在大肠杆菌中表达，并用其制备抗体。针对表达的融合蛋白免疫兔子得到的抗体能特异性地识别枯草芽孢杆菌粗FAS中的FabD。免疫沉淀法效力评估显示，经抗体处理的粗FAS中仅残留极少量的FabD蛋白。然而，从粗FAS中完全去除FabD并未使其BCFA生物合成失活，仅使其活性降低，对于酰基-CoA引物降至对照组的50-60%，对于α-酮基-β-甲基戊酸引物降至80%。此外，FabD浓度与酶组分中MAT的特异性活性并不一定相关，表明存在另一种MAT活性的酶源。因此，本研究认为，FabD不是体外BCFA生物合成中MAT唯一的酶源，并暗示脂肪酸生物合成与其他代谢途径之间存在功能联系。

  DOI：

  10.1271/bbb.67.2106

文献信息

• Repurposing the 3‐Isocyanobutanoic Acid Adenylation Enzyme SfaB for Versatile Amidation and Thioesterification
  作者：Mengyi Zhu、Lijuan Wang、Jing He

  DOI：10.1002/anie.202010042

  日期：2021.1.25

  molecules with novel skeletons, but also to identify the enzymes that catalyze diverse chemical reactions. Exploring the substrate promiscuity and catalytic mechanism of those biosynthetic enzymes facilitates the development of potential biocatalysts. SfaB is an acyl adenylate‐forming enzyme that adenylates a unique building block, 3‐isocyanobutanoic acid, in the biosynthetic pathway of the diisonitrile

  微生物天然产物的基因组挖掘使化学家不仅能够发现具有新颖骨架的生物活性分子，而且能够识别催化多种化学反应的酶。探索这些生物合成酶的底物混杂性和催化机理有助于开发潜在的生物催化剂。SfaB是一种形成酰基腺苷酸的酶，可在由硫链霉菌产生的二异腈自然产物SF2768的生物合成途径中，对独特的结构单元3-异氰基丁酸进行腺苷酸化。，并且该AMP连接酶被证明可以接受各种短链脂肪酸（SCFA）。在本文中，我们将SfaB重新用于催化那些SCFA与各种胺或硫醇亲核试剂之间的酰胺化或硫酯化反应，从而提供了另一种酶促方法来体外制备相应的酰胺和硫酯。
• Screening and Engineering the Synthetic Potential of Carboxylating Reductases from Central Metabolism and Polyketide Biosynthesis
  作者：Dominik M. Peter、Lennart Schada von Borzyskowski、Patrick Kiefer、Philipp Christen、Julia A. Vorholt、Tobias J. Erb

  DOI：10.1002/anie.201505282

  日期：2015.11.2

  Carboxylating enoyl‐thioester reductases (ECRs) are a recently discovered class of enzymes. They catalyze the highly efficient addition of CO2 to the double bond of α,β‐unsaturated CoA‐thioesters and serve two biological functions. In primary metabolism of many bacteria they produce ethylmalonyl‐CoA during assimilation of the central metabolite acetyl‐CoA. In secondary metabolism they provide distinct

  羧化烯酰硫酯还原酶（ECR）是最近发现的一类酶。它们催化高效添加CO 2与α，β-不饱和CoA-硫酯的双键结合，具有两个生物学功能。在许多细菌的初级代谢中，它们在吸收中央代谢物乙酰辅酶A的过程中会产生乙基丙二酰辅酶A。在次级代谢中，它们提供独特的α-羧基-酰基-硫代酯，以改变许多聚酮化合物天然产物的主链。使用各种可能的底物库系统评估了不同的ECR。我们鉴定了三个活性位点残基，以区分仅限于C4和C5-烯酰基-CoA的ECR和高度混杂的ECR，并成功地设计了一种选定的ECR作为原理证明。这项研究定义了ECR反应性的分子基础，从而可以预测和操纵天然产物多样化中的关键反应。
• Hepatic enzymatic synthesis and hydrolysis of CoA esters of solvent-derived oxa acids
  作者：Sree D. Panuganti、Jill M Penn、Kathleen H. Moore

  DOI：10.1002/jbt.10063

  日期：——

  glycol-derived solvents are oxidized to xenobiotic alkoxyacetic acids (3-oxa acids) by hepatic enzymes. The toxicity of these ubiquitous solvents has been associated with their oxa acid metabolites. For many xenobiotic carboxylic acids, the toxicity is associated with the CoA ester of the acid. In this study, related alkoxyacetic acids were evaluated as potential substrates for acyl-CoA synthetases

  许多乙二醇衍生的溶剂被肝酶氧化为异种烷氧基乙酸（3-氧杂酸）。这些普遍存在的溶剂的毒性与其草酸代谢产物有关。对于许多异种生物羧酸而言，毒性与该酸的CoA酯有关。在这项研究中，相关的烷氧基乙酸被评估为在从大鼠肝脏分离的线粒体，过氧化物酶体和微粒体级分中发现的酰基辅酶A合成酶的潜在底物。同样，化学合成的氧杂酰基辅酶A被用作与相同大鼠肝部分相关的酰基辅酶A水解酶的底物。通过紫外可见分光光度法将异种生物被氧取代的底物的活性与类似的生理性脂肪族底物进行了比较。所有溶剂衍生的草酸都是酰基辅酶A合成酶的合理底物，尽管它们的活性通常低于相应的生理酸。与所有底物（特别是氧代酰基辅酶A）的酰基辅酶A合成酶活性相比，酰基辅酶A水解酶活性降低。这些研究表明，这些异源羧酸可被转化为反应性酰基辅酶A部分，这些部分将持续存在于脂质合成，β氧化，蛋白质酰化和氨基酸结合附近的细胞区域。这些异生物质酰基辅酶A与这些过程的相互
• Expanding the chemical space of polyketides through structure-guided mutagenesis of Vitis vinifera stilbene synthase
  作者：Namita Bhan、Brady F. Cress、Robert J. Linhardt、Mattheos Koffas

  DOI：10.1016/j.biochi.2015.05.019

  日期：2015.8

  pharmaceutical properties. Type III polyketide synthases (PKS) that generate aromatic PK polyketides have been studied extensively for their substrate promiscuity and product diversity. Stilbene synthase-like (STS) enzymes are unique in the type III PKS class as they possess a hydrogen bonding network, furnishing them with thioesterase-like properties, resulting in aldol condensation of the polyketide intermediates

  几种天然聚酮化合物（PKs）与重要的药物特性有关。生成芳香族PK聚酮化合物的III型聚酮化合物合酶（PKS）已针对其底物混杂和产物多样性进行了广泛研究。Stilbene合成酶样（STS）酶在III型PKS类中是独特的，因为它们具有氢键网络，使其具有硫酯酶样的特性，导致形成的聚酮化合物中间体发生醛醇缩合。相反，查耳酮合酶（CHS）缺乏这种氢键网络，主要导致形成的聚酮化合物中间体发生克莱森缩合。我们已经尝试通过创建结构引导的葡萄（Vitis vinifera）STS突变体来扩展此类有趣的化合物类别的化学空间。进一步，我们利用先前建立的工作流程，快速将野生型反应产物与突变体产生的产物进行比较，并通过使用LC-MS和LC-MS / MS数据的XCMS分析来鉴定新的PK。基于这种方法，我们能够通过探索野生型酶的底物滥交以及使用非天然底物的所有突变体来生成15个以前未报告的PK分子。这些结构是STS特
• [EN] METHOD FOR SYNTHESISING AMIDES<br/>[FR] PROCÉDÉ DE SYNTHÈSE D'AMIDES
  申请人：GLAXOSMITHKLINE IP DEV LTD

  公开号：WO2018029097A1

  公开（公告）日：2018-02-15

  The present invention relates to a method for synthesising amides that is of general applicability. The method may be performed in vitro or in vivo. Cell lines for use in the in vivo methods also form aspects of the invention. The method for synthesising a non-natural amide comprises: a. reaction of a carboxylic acid with a naturally occurring CoA ligase or a variant thereof; and b. reaction of the product of step a with an amine in the presence of a naturally occurring acyltransferase or a variant thereof; with the proviso that where the CoA ligase and acyltransferase are both naturally occurring, they are not derived from the same source species and do not act sequentially in a metabolic pathway; and with the proviso that the non-natural product is not N-(E)-p-coumaroyl-3-hydroxyanthranilic acid or N-(E)-p-caffeoyl-3-hydroxyanthranilic acid. Further, a method for producing an active pharmaceutical ingredient by the aforementioned method and host cells for carrying out said methods are envisaged.

  本发明涉及一种合成酰胺的方法，具有普遍适用性。该方法可以在体外或体内进行。用于体内方法的细胞系也构成本发明的方面之一。合成非天然酰胺的方法包括：a. 将羧酸与天然存在的辅酶A连接酶或其变体反应；b. 在天然存在的酰基转移酶或其变体存在下，将步骤a的产物与胺反应；但辅酶A连接酶和酰基转移酶若均为天然存在，则不能来自相同源物种且不能在代谢途径中依次作用；并且非天然产物不是N-(E)-对香豆酰-3-羟基蒽醌酸或N-(E)-对咖啡酰-3-羟基蒽醌酸。此外，还可以通过上述方法生产活性药物成分的方法和用于执行该方法的宿主细胞。