1,5-二磷酸-D-核酮糖 | 14689-84-0

• 物质功能分类: 有机原料 - 羧酸类化合物及衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: 1,5-二磷酸-D-核酮糖
• 中文别名: 1,5二磷酸核酮糖；D-核酮糖1,5-二磷酸酯
• 英文名称: D-ribose 1,5-bisphosphate
• 英文别名: ribose 1,5-bisphosphate；D-Ribofuranose, 1,5-bis(dihydrogen phosphate)；[(3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(phosphonooxymethyl)oxolan-2-yl] dihydrogen phosphate
• CAS: 14689-84-0
• 化学式: C₅H₁₂O₁₁P₂
• 分子量: 310.091
• InChiKey: AAAFZMYJJHWUPN-SOOFDHNKSA-N

物化性质

• 溶解度：
  H2O中可溶50mg/mL，澄清，无色至淡黄色

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.7
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  183
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  11

安全信息

• 安全说明：
  S22,S26,S36,S45

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5-phosphoribosyl 1-pyrophosphate 在 Escherichia coli PhnP 、 barium(II) acetate 、 sodium chloride 、 sodium hydroxide 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 0.25h， 生成 1,5-二磷酸-D-核酮糖
  参考文献：
  名称：

  发现可催化两个酯键顺序水解成磷的环状磷酸二酯酶

  摘要：

  细菌 CP 裂解酶途径负责在磷酸盐饥饿条件下未活化的有机膦酸盐的代谢。5-磷酸核糖-1-甲基膦酸酯-5-磷酸酯内的CP键裂解形成甲烷和5-磷酸-核糖-1,2-环磷酸酯（PRcP）是由自由基SAM酶PhnJ催化的。在大肠杆菌中，环状磷酸产物被 PhnP 水解为 1,5-二磷酸核糖。在这项研究中，我们描述了一种酶的发现和表征，该酶可以将环状磷酸二酯直接水解为邻二醇和无机磷酸盐。使用 PRcP，该酶水解核糖部分碳 1 处的磷酸酯，形成 2,5-二磷酸核糖，然后该中间体水解为 5-磷酸核糖和无机磷酸盐。核糖-1，5-二磷酸既不是该酶的中间体也不是底物。这种酶的直向同源物存在于人类病原体艰难梭菌和迟缓蛋壳菌中。我们建议将该酶称为环状磷酸二水解酶 (cPDH) 并命名为 PhnPP。

  DOI：

  10.1021/ja409376k

文献信息

• Discovery of a Cyclic Phosphodiesterase That Catalyzes the Sequential Hydrolysis of Both Ester Bonds to Phosphorus
  作者：Swapnil V. Ghodge、Jennifer A. Cummings、Howard J. Williams、Frank M. Raushel

  DOI：10.1021/ja409376k

  日期：2013.11.6

  The bacterial C-P lyase pathway is responsible for the metabolism of unactivated organophosphonates under conditions of phosphate starvation. The cleavage of the C-P bond within ribose-1-methylphosphonate-5-phosphate to form methane and 5-phospho-ribose-1,2-cyclic phosphate (PRcP) is catalyzed by the radical SAM enzyme PhnJ. In Escherichia coli the cyclic phosphate product is hydrolyzed to ribose-1

  细菌 CP 裂解酶途径负责在磷酸盐饥饿条件下未活化的有机膦酸盐的代谢。5-磷酸核糖-1-甲基膦酸酯-5-磷酸酯内的CP键裂解形成甲烷和5-磷酸-核糖-1,2-环磷酸酯（PRcP）是由自由基SAM酶PhnJ催化的。在大肠杆菌中，环状磷酸产物被 PhnP 水解为 1,5-二磷酸核糖。在这项研究中，我们描述了一种酶的发现和表征，该酶可以将环状磷酸二酯直接水解为邻二醇和无机磷酸盐。使用 PRcP，该酶水解核糖部分碳 1 处的磷酸酯，形成 2,5-二磷酸核糖，然后该中间体水解为 5-磷酸核糖和无机磷酸盐。核糖-1，5-二磷酸既不是该酶的中间体也不是底物。这种酶的直向同源物存在于人类病原体艰难梭菌和迟缓蛋壳菌中。我们建议将该酶称为环状磷酸二水解酶 (cPDH) 并命名为 PhnPP。