5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2',3'-O-isopropylidene-8-bromoinosine | 1256503-22-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2',3'-O-isopropylidene-8-bromoinosine
• 英文别名: 5'-O-TBDPS-2',3'-O-isopropylidene-8-bromoinosine；9-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-8-bromo-1H-purin-6-one
• CAS: 1256503-22-6
• 化学式: C₂₉H₃₃BrN₄O₅Si
• 分子量: 625.594
• InChiKey: CHQUWLCGAMASSH-HUBRGWSESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.88
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  96.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2',3'-O-isopropylidene-8-bromoinosine 在 氨 、 对甲苯磺酸 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 丙酮 为溶剂， 反应 13.5h， 生成 N1-(2",3"-O-isopropylidene-β-D-ribofuranosyl)-5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2',3'-O-isopropylidene-8-bromoinosine
  参考文献：
  名称：

  环状腺苷 5'-二磷酸核糖受体激动剂的全合成

  摘要：

  稳定的环状腺苷 5'-二磷酸核糖 (cADPR) 类似物是化学生物学工具，可以探测这种新兴的强效第二信使的 Ca 2+释放机制和构效关系。然而，由于难以产生敏感的N 1-核糖基连接，因此无法获得具有完整“北”核糖的类似物。我们报告了膜渗透性、水解稳定的 cADPR 受体激动剂 8-Br- N 1-cIDPR 通过受保护的 8-溴肌苷的区域选择性和立体选择性N 1-核糖基化的首次全合成。

  DOI：

  10.1021/jo202319f
• 作为产物：
  描述：

  2',3'-异丙叉腺苷 在 咪唑 、 disodium hydrogenphosphate 、 溴 、 sodium nitrite 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 、 溶剂黄146 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2',3'-O-isopropylidene-8-bromoinosine
  参考文献：
  名称：

  环状腺苷 5'-二磷酸核糖受体激动剂的全合成

  摘要：

  稳定的环状腺苷 5'-二磷酸核糖 (cADPR) 类似物是化学生物学工具，可以探测这种新兴的强效第二信使的 Ca 2+释放机制和构效关系。然而，由于难以产生敏感的N 1-核糖基连接，因此无法获得具有完整“北”核糖的类似物。我们报告了膜渗透性、水解稳定的 cADPR 受体激动剂 8-Br- N 1-cIDPR 通过受保护的 8-溴肌苷的区域选择性和立体选择性N 1-核糖基化的首次全合成。

  DOI：

  10.1021/jo202319f

文献信息

• Trifluoromethylated cyclic-ADP-ribose mimic: synthesis of 8-trifluoromethyl-N1-[(5′′-O-phosphorylethoxy)methyl]-5′-O-phosphorylinosine-5′,5′′-cyclic pyrophosphate (8-CF3-cIDPRE) and its calcium release activity in T cells
  作者：Min Dong、Tanja Kirchberger、Xiangchen Huang、Zhen Jun Yang、Liang Ren Zhang、Andreas H. Guse、Li He Zhang

  DOI：10.1039/c0ob00090f

  日期：——

  A convenient trifluoromethylation method was firstly applied to the synthesis of 8- CF3-purine nucleosides. On the basis of this method, new protection and deprotection strategies were developed for the successful synthesis of the trifluoromethylated cyclic-ADP-ribose mimic, 8-CF3-cIDPRE 1. Using intact, fura-2-loaded Jurkat T cells compound 1 and 2′,3′-O-isopropylidene 8-CF3-cIDPRE 14 were characterized as membrane-permeant cADPR agonists. Contrary to the 8-substituted cADPR analogues that mainly act as antagonists of cADPR in cells, 8-substituted cIDPRE derivatives were shown to be Ca2+ mobilizing agonists. Here we report that even compound 1, the 8-substituted cIDPRE with the strong electron withdrawing CF3 group, behaves as an agonist in T cells. Interestingly, also the partially protected 2′,3′-O-isopropylidene 8-CF3-cIDPRE activated Ca2+ signaling indicating only a minor role for the hydroxyl groups of the southern ribose of cADPR for its biological activity. To our knowledge 8-CF3-cIDPRE 1 is the first reported fluoro substituted cADPR mimic and 8-CF3-cIDPRE 1 and compound 14 are promising molecular probes for elucidating the mode of action of cADPR.

  首先应用了一种便捷的三氟甲基化方法合成8-三氟甲基嘌呤核苷。在此基础上,研发了新颖的保护和去保护策略,顺利合成了三氟甲基化环状ADP核糖模拟物,即8-CF\(}_3}\)-cIDPRE 1。利用完整、装载了fura-2的Jurkat T细胞,化合物1和2′,3′-O-异亚丙基-8-CF\(}_3}\)-cIDPRE 14被鉴定为膜渗透性cADPR激动剂。与主要作为细胞内cADPR拮抗剂的8-取代cADPR类似物相反,8-取代cIDPRE衍生物显示为钙动员激动剂。本文报道,即使化合物1,即含有强吸电子CF\(}_3}\)基团的8-取代cIDPRE,在T细胞中亦表现激动剂性质。有趣的是,部分保护的2′,3′-O-异亚丙基-8-CF\(}_3}\)-cIDPRE也激活了钙信号,表明cADPR南侧核糖上的羟基对其生物活性仅有微小作用。据我们所知,8-CF\(}_3}\)-cIDPRE 1是首个报道的含氟cADPR模拟物,而8-CF\(}_3}\)-cIDPRE 1及化合物14则是阐明cADPR作用机制的有前景的分子探针。
• Total Synthesis of a Cyclic Adenosine 5′-Diphosphate Ribose Receptor Agonist
  作者：Joanna M. Swarbrick、Barry V. L. Potter

  DOI：10.1021/jo202319f

  日期：2012.5.4

  cyclic adenosine 5′-diphosphate ribose (cADPR) analogues are chemical biology tools that can probe the Ca2+ release mechanism and structure–activity relationships of this emerging potent second messenger. However, analogues with an intact “northern” ribose have been inaccessible due to the difficulty of generating the sensitive N1-ribosyl link. We report the first total synthesis of the membrane permeant

  稳定的环状腺苷 5'-二磷酸核糖 (cADPR) 类似物是化学生物学工具，可以探测这种新兴的强效第二信使的 Ca 2+释放机制和构效关系。然而，由于难以产生敏感的N 1-核糖基连接，因此无法获得具有完整“北”核糖的类似物。我们报告了膜渗透性、水解稳定的 cADPR 受体激动剂 8-Br- N 1-cIDPR 通过受保护的 8-溴肌苷的区域选择性和立体选择性N 1-核糖基化的首次全合成。