4-C-[[(甲基磺酰基)氧基]甲基]-3-O-(苄基)-D-赤式-呋喃戊糖 1,2-二乙酸酯 5-甲烷磺酸酯 | 293751-03-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: 4-C-[[(甲基磺酰基)氧基]甲基]-3-O-(苄基)-D-赤式-呋喃戊糖 1,2-二乙酸酯 5-甲烷磺酸酯
• 中文别名: 4-C-[[(甲基磺酰基)氧基]甲基]-3-O-(苄基)-D-赤式-呋喃戊糖1,2-二乙酸酯5-甲烷磺酸酯
• 英文名称: 1,2-di-O-acetyl-3-O-benzyl-4-C-methanesulfonoxymethyl-5-O-methanesulfonyl-D-erythro-pentofuranose
• 英文别名: (3R,4S)-4-(Benzyloxy)-5,5-bis(((methylsulfonyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2,3-diyl diacetate；[(3R,4S)-2-acetyloxy-5,5-bis(methylsulfonyloxymethyl)-4-phenylmethoxyoxolan-3-yl] acetate
• CAS: 293751-03-8
• 化学式: C₁₉H₂₆O₁₂S₂
• 分子量: 510.54
• InChiKey: ZEVFGCXHAWLZAT-DVKDBIPTSA-N

物化性质

• 沸点：
  666.8±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.43±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  175
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-C-[[(甲基磺酰基)氧基]甲基]-3-O-(苄基)-D-赤式-呋喃戊糖 1,2-二乙酸酯 5-甲烷磺酸酯 在 吡啶 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 硫酸 、 氨 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 丙酮 、 乙腈 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 1-(3-O-benzyl-5-O-methanesulfonyl-4-C-methanesulfonyloxymethyl-β-D-threo-pentofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  2'-氨基-LNA胸腺嘧啶和5-甲基胞嘧啶核苷的大规模合成

  摘要：

  从起始糖1分十五步以几克级（50 g，70 mmol）合成了胸腺嘧啶中间体17，总收率为73％，仅需5个纯化步骤。关键的胸腺嘧啶中间体18从一步17中以96％的产率获得，而关键的5-甲基胞嘧啶中间体20从17中分两步以58％的产率获得。这种高效的大规模路线仅需要2个和3个新步骤即可分别从这些关键中间体获得N2'-官能化的胸腺嘧啶和5-甲基胞嘧啶氨基-LNA亚磷酰胺。

  DOI：

  10.1021/jo302036h
• 作为产物：
  描述：

  D-glucose 在 吡啶 、 sodium hypochlorite 、 sodium tetrahydroborate 、 sodium periodate 、 2,2,6,6-四甲基哌啶氧化物 、 磷酸 、 硫酸 、 四丁基硫酸氢铵 、 碳酸氢钠 、 溶剂黄146 、 potassium bromide 、 sodium hydroxide 、 zinc(II) chloride 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 水 、 乙酸乙酯 、 甲苯 为溶剂， 反应 24.83h， 生成 4-C-[[(甲基磺酰基)氧基]甲基]-3-O-(苄基)-D-赤式-呋喃戊糖 1,2-二乙酸酯 5-甲烷磺酸酯
  参考文献：
  名称：

  [EN] NOVEL PROCESS FOR MAKING ALLOFURANOSE FROM GLUCOFURANOSE
  [FR] NOUVEAU PROCÉDÉ DE FABRICATION D'ALLOFURANOSE À PARTIR DE GLUCOFURANOSE

  摘要：

  本发明涉及从描述和权利要求中定义的葡糖呋喃糖中制备阿洛呋喃糖。阿洛呋喃糖是合成寡核苷酸时的中间体，可用作药物。

  公开号：

  WO2019224172A1

文献信息

• Synthesis and biological evaluation of 2′,4′- and 3′,4′-bridged nucleoside analogues
  作者：K.C. Nicolaou、Shelby P. Ellery、Fatima Rivas、Karen Saye、Eric Rogers、Tyler J. Workinger、Mark Schallenberger、Rommel Tawatao、Ana Montero、Ann Hessell、Floyd Romesberg、Dennis Carson、Dennis Burton

  DOI：10.1016/j.bmc.2011.07.022

  日期：2011.9

  Most nucleosides in solution typically exist in equilibrium between two major sugar pucker forms, N-type and S-type, but bridged nucleosides can be locked into one of these conformations depending on their specific structure. While many groups have researched these bridged nucleosides for the purpose of determining their binding affinity for antisense applications, we opted to look into the potential

  溶液中的大多数核苷通常在两种主要的糖折叠形式（N型和S型）之间平衡存在，但桥接的核苷可以根据其特定结构锁定为这些构象之一。尽管许多研究小组已经研究了这些桥联的核苷，以确定它们对反义应用的结合亲和力，但我们选择研究这些构象锁定结构内的生物活性潜力。合成了一个小的2'，4'-和3'，4'-桥联核苷类似物文库，包括一个新颖的3'，4'-碳环桥联系统。测试了合成的化合物的抗菌，抗肿瘤和抗病毒活性，从而鉴定出具有这种生物活性的核苷。据我们所知，这些生物活性化合物代表2'，4'-桥联核苷的第一个实例，以证明这种特性。最有效的化合物核苷33对伪病毒SF162（IC（50）= 7.0μM）和HxB2（IC（50）= 2.4μM）表现出显着的抗病毒活性。这些发现使得桥接的核苷成为抗HIV研究领域中药物发现的可靠线索。
• A Simplified and Efficient Route to 2‘-<i>O</i>, 4‘-<i>C</i>-Methylene-Linked Bicyclic Ribonucleosides (Locked Nucleic Acid)
  作者：Alexei A. Koshkin、Jef Fensholdt、Henrik M. Pfundheller、Christian Lomholt

  DOI：10.1021/jo010732p

  日期：2001.12.1

  can be prepared from D-glucose in multigram scale. Four different nucleobases were stereoselectively coupled to 8 using a modified Vorbrüggen procedure to give the corresponding 4'-C-branched nucleoside derivatives. Subsequent ring closing furnished the protected LNA nucleosides. The 5'-O-mesyl groups were efficiently displaced by nucleophilic substitution using sodium benzoate. Saponification of the

  描述了一种合成锁核酸（LNA）单体的新型有效方法。通过聚合合成制备了含有胸腺嘧啶，4-N-乙酰基和4-N-苯甲酰基胞嘧啶，6-N-苯甲酰腺嘌呤和2-N-异丁酰鸟嘌呤作为核碱基的LNA 5'，3'-二醇。该方法基于使用常见的糖中间体1,2-二-O-乙酰基-3-O-苄基-4-C-甲磺酰氧基甲基-5-O-甲磺酰-D-赤型戊呋喃糖（8）可以从D-葡萄糖以克数制得。使用改良的Vorbrüggen程序将四个不同的核碱基立体选择性地偶联到8个核碱基上，得到相应的4'-C-支链核苷衍生物。随后的闭环提供了受保护的LNA核苷。使用苯甲酸钠通过亲核取代有效地置换了5'-O-甲磺酰基。将5'-苯甲酸酯皂化，然后催化除去3'-O-苄基，得到游离的LNA二醇。腺苷和胞苷的环外氨基被选择性地酰化，得到4-N-乙酰基或4-N-苯甲酰基-LNA-C和6-N-苯甲酰基-LNA-A。在制备2-N-异丁酰基-LNA-G期间，鸟
• Optimized synthesis of LNA uracil nucleosides
  作者：T. Santhosh Kumar、Pawan Kumar、Pawan K. Sharma、Patrick J. Hrdlicka

  DOI：10.1016/j.tetlet.2008.09.165

  日期：2008.12

  A short, very high yielding, and practical synthesis of LNA uracil diol 6 has been developed from the easily accessible glycosyl donor 1. The concluding O3′-debenzylation of 5 resulted in significant reduction of the uracil moiety with many typical debenzylation conditions, while catalytic transfer hydrogenation using Pd(OH)2/C and formic acid largely suppressed this undesired side reaction. Facile

  从容易获得的糖基供体1已经开发出短的，非常高的产率和实用的LNA尿嘧啶二醇6的合成。最后的O3'-脱苄基化反应5导致尿嘧啶部分在许多典型的脱苄基反应条件下显着降低，而使用Pd（OH）2 / C和甲酸的催化转移氢化反应则大大抑制了这种不良反应。轻松获得6个将允许全面探索基于RNA的LNA技术应用，包括聚合酶催化的LNA修饰RNA链的合成。
• LNA guanine and 2,6-diaminopurine. Synthesis, characterization and hybridization properties of LNA 2,6-diaminopurine containing oligonucleotides
  作者：Christoph Rosenbohm、Daniel Sejer Pedersen、Miriam Frieden、Flemming R. Jensen、Susan Arent、Sine Larsen、Troels Koch

  DOI：10.1016/j.bmc.2004.02.008

  日期：2004.5

  LNA guanine and 2,6-diaminopurine (D) phosphoramidites have been synthesized as building blocks for antisense oligonucleotides (ON). The effects of incorporating LNA D into ON were investigated. As expected, LNA D containing ON showed increased affinity towards complementary DNA (Delta Tm +1.6 to +3.0 degrees C) and RNA (Delta Tm +2.6 to +4.6 degrees C) ON. To evaluate if LNA D containing ON have an

  LNA鸟嘌呤和2,6-二氨基嘌呤（D）亚磷酰胺已合成为反义寡核苷酸（ON）的构件。研究了将LNA D掺入ON的效果。不出所料，含有ON的LNA D对互补DNA（ΔTm +1.6至+3.0摄氏度）和RNA（ΔTm +2.6至+4.6摄氏度）ON表现出更高的亲和力。为了评估含有ON的LNA D与含有ON的互补LNA A相比是否具有增强的错配敏感性，进行了针对单个错配DNA和RNA ON的热变性实验。在完全LNA修饰的ON中，用LNA D取代一个LNA A残基，导致对DNA ON的错配敏感性更高（Delta Delta Tm -4至> -17摄氏度）。观察到朝向单个错配的RNA ON的相同趋势（Delta Delta Tm Da = -8.7摄氏度，Dg = -4。
• Highly Efficient Synthesis of Allopurinol Locked Nucleic Acid Monomer by C6 Deamination of 8-Aza-7-bromo-7-deazaadenine Locked Nucleic Acid Monomer
  作者：Erik Pedersen、Tamer Kosbar、Mamdouh Sofan、Laila Abou-Zeid、Mohamed Waly

  DOI：10.1055/s-0033-1338531

  日期：——

  of the synthesis, the bromine was removed together with a benzyl protecting group by catalytic reduction with ammonium formate to give the required LNA monomers. An allopurinol locked nucleic acid (LNA) monomer was prepared by a novel strategy through C6 deamination of the corresponding 8-aza-7-bromo-7-deazaadenine LNA monomer with aqueous sodium hydroxide. An 8-aza-7-deazaadenine LNA monomer was also

  摘要 通过用相应的8-aza-7-bromo-7-deazaadenine LNA单体用氢氧化钠进行C6脱氨，通过一种新颖的策略制备别嘌呤醇锁定的核酸（LNA）单体。还通过修改新的合成途径合成了8-氮杂-7-脱氮杂腺嘌呤LNA单体。通过起始原料8-氮杂-7-溴-7-脱氮杂腺嘌呤中的7-溴原子的空间位阻防止了8-位的N-糖基化。在合成的最后步骤中，通过用甲酸铵催化还原除去溴和苄基保护基，得到所需的LNA单体。 通过用相应的8-aza-7-bromo-7-deazaadenine LNA单体用氢氧化钠进行C6脱氨，通过一种新颖的策略制备别嘌呤醇锁定的核酸（LNA）单体。还通过修改新的合成途径合成了8-氮杂-7-脱氮杂腺嘌呤LNA单体。通过起始原料8-氮杂-7-溴-7-脱氮杂腺嘌呤中的7-溴原子的空间位阻防止了8-位的N-糖基化。在合成的最后步骤中，通过用甲酸铵催化还原除去溴和苄基保护基，得到所需的LNA单体。